More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_3630 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014151  Cfla_3630  extracellular solute-binding protein family 5  100 
 
 
522 aa  1068    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0676  4-phytase  49.31 
 
 
541 aa  495  1e-139  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12610  ABC-type oligopeptide transport system, periplasmic component  40.52 
 
 
586 aa  373  1e-102  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.183632 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3311  extracellular solute-binding protein family 5  38.55 
 
 
560 aa  369  1e-101  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0952  4-phytase  41.88 
 
 
554 aa  366  1e-100  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1079  extracellular solute-binding protein family 5  41.52 
 
 
552 aa  358  9.999999999999999e-98  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.133059  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4176  4-phytase  37.07 
 
 
534 aa  336  7e-91  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00061687 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0565  oligopeptide ABC transporter periplasmic protein  37.88 
 
 
546 aa  333  4e-90  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3796  4-phytase  36.93 
 
 
533 aa  330  5.0000000000000004e-89  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.207613  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11050  ABC-type oligopeptide transport system, periplasmic component  38.66 
 
 
552 aa  324  3e-87  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.273822  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2822  extracellular solute-binding protein  35.77 
 
 
547 aa  316  8e-85  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.630772  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1125  4-phytase  36.38 
 
 
585 aa  314  2.9999999999999996e-84  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.2304 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8934  ABC-type oligopeptide transport system periplasmic component-like protein  34.47 
 
 
543 aa  304  3.0000000000000004e-81  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3150  ABC-type oligopeptide transport system periplasmic component-like protein  36.42 
 
 
537 aa  301  2e-80  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.447408  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2540  4-phytase  32.94 
 
 
561 aa  300  5e-80  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000102543 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3915  extracellular solute-binding protein family 5  36.19 
 
 
543 aa  299  8e-80  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13696  periplasmic dipeptide-binding lipoprotein dppA  37.17 
 
 
541 aa  289  7e-77  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.17104 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3823  4-phytase  34.62 
 
 
541 aa  277  3e-73  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2462  4-phytase  34.16 
 
 
543 aa  274  3e-72  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.36886  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0252  oligopeptide ABC transporter periplasmic protein  33.74 
 
 
546 aa  273  8.000000000000001e-72  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.213679  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2461  4-phytase  33.95 
 
 
543 aa  270  5e-71  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.792128  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4213  extracellular solute-binding protein  31.03 
 
 
543 aa  265  2e-69  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0562482  normal  0.0711224 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0486  extracellular solute-binding protein  32.79 
 
 
542 aa  263  4.999999999999999e-69  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.410451 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3657  4-phytase  37.24 
 
 
536 aa  262  1e-68  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4381  extracellular solute-binding protein  31.25 
 
 
543 aa  261  3e-68  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000255213 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5516  extracellular solute-binding protein family 5  31.58 
 
 
528 aa  249  7e-65  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.581672 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4144  extracellular solute-binding protein family 5  31 
 
 
527 aa  233  6e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.482132  hitchhiker  0.00782841 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26170  ABC-type oligopeptide transport system, periplasmic component  37.28 
 
 
537 aa  206  6e-52  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.369222  normal  0.443852 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2012  ABC-type dipeptide transport system periplasmic component-like protein  24.89 
 
 
545 aa  151  3e-35  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_512  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, periplasmic component  28.77 
 
 
530 aa  148  2.0000000000000003e-34  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.135113  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0547  extracellular solute-binding protein  28.33 
 
 
531 aa  148  3e-34  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2285  extracellular solute-binding protein family 5  28.48 
 
 
556 aa  143  7e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.946227  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0009  extracellular solute-binding protein family 5  26.64 
 
 
544 aa  142  1.9999999999999998e-32  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.327799  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1984  extracellular solute-binding protein family 5  28.7 
 
 
556 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0573  oligopeptide-binding protein, putative  29.24 
 
 
530 aa  139  1e-31  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1461  extracellular solute-binding protein  28.1 
 
 
542 aa  139  2e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0157801  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2834  extracellular solute-binding protein family 5  27.37 
 
 
526 aa  138  2e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.360597 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2435  extracellular solute-binding protein  29.03 
 
 
549 aa  138  2e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.882532  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0008  extracellular solute-binding protein family 5  26.75 
 
 
544 aa  139  2e-31  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00260142  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1851  4-phytase  29.03 
 
 
546 aa  138  3.0000000000000003e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  decreased coverage  0.00963288  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1581  periplasmic oligopeptide-binding protein  28.6 
 
 
543 aa  136  8e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.197291  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2405  extracellular solute-binding protein family 5  27.17 
 
 
558 aa  135  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000000900492  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1897  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  27.33 
 
 
558 aa  135  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.340522  normal  0.197408 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3851  extracellular solute-binding protein family 5  27.44 
 
 
530 aa  135  1.9999999999999998e-30  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000180183  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1135  4-phytase  26.78 
 
 
520 aa  134  3e-30  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00134056  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1412  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  27.11 
 
 
543 aa  134  3.9999999999999996e-30  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.706367  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01217  oligopeptide transporter subunit  27.11 
 
 
543 aa  134  6e-30  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.584763  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1391  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  27.11 
 
 
543 aa  134  6e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.768286  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01227  hypothetical protein  27.11 
 
 
543 aa  134  6e-30  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.595865  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2742  extracellular solute-binding protein family 5  22.95 
 
 
541 aa  134  6e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1352  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  27.11 
 
 
543 aa  134  6e-30  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0153639  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2385  extracellular solute-binding protein  27.11 
 
 
558 aa  133  6e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.190524  hitchhiker  0.0000021243 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1729  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  27.11 
 
 
558 aa  133  6e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.654548  normal  0.238122 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1399  periplasmic oligopeptide-binding protein  28.39 
 
 
543 aa  133  6.999999999999999e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.530492  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1874  periplasmic oligopeptide-binding protein  28.39 
 
 
543 aa  133  6.999999999999999e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1937  periplasmic oligopeptide-binding protein  28.39 
 
 
543 aa  133  6.999999999999999e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.26638 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1880  periplasmic oligopeptide-binding protein  28.17 
 
 
543 aa  130  4.0000000000000003e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.558162 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2195  extracellular solute-binding protein family 5  27.13 
 
 
547 aa  130  7.000000000000001e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.337162  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2702  extracellular solute-binding protein  27.43 
 
 
545 aa  129  2.0000000000000002e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.108728  hitchhiker  0.000845971 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3103  extracellular solute-binding protein family 5  26.28 
 
 
526 aa  128  3e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.529212  normal  0.177978 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2438  extracellular solute-binding protein  28.27 
 
 
526 aa  128  3e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1448  extracellular solute-binding protein family 5  27.34 
 
 
535 aa  128  3e-28  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1798  murein tripeptide ABC transporter, periplasmic murein peptide-binding protein  25.76 
 
 
538 aa  127  5e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1906  extracellular solute-binding protein  25.76 
 
 
538 aa  127  5e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2389  murein tripeptide ABC transporter periplasmic murein peptide-binding protein  25.76 
 
 
538 aa  127  5e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.536818  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2302  extracellular solute-binding protein  25.67 
 
 
544 aa  126  7e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.00365913  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2999  extracellular solute-binding protein  28.22 
 
 
549 aa  126  8.000000000000001e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.305947  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1770  extracellular solute-binding protein family 5  26.85 
 
 
560 aa  125  1e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1803  periplasmic murein peptide-binding protein  25.98 
 
 
537 aa  126  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00501366 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1792  periplasmic murein peptide-binding protein  26.2 
 
 
537 aa  125  1e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1471  periplasmic murein peptide-binding protein  25.76 
 
 
537 aa  125  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.857837  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1865  periplasmic murein peptide-binding protein  25.98 
 
 
537 aa  125  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.529105  normal  0.987558 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1483  extracellular solute-binding protein  26.4 
 
 
542 aa  125  2e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1653  periplasmic murein peptide-binding protein  25.98 
 
 
537 aa  125  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0552012 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1905  putative oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  24.28 
 
 
542 aa  124  3e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4685  extracellular solute-binding protein  26.69 
 
 
532 aa  124  3e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.192999  normal  0.292705 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01307  murein tripeptide (L-ala-gamma-D-glutamyl-meso-DAP) transporter subunit  25.98 
 
 
537 aa  124  4e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.466837  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2316  extracellular solute-binding protein family 5  25.98 
 
 
537 aa  124  4e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.151568  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1977  periplasmic murein peptide-binding protein  25.98 
 
 
537 aa  124  4e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.526776 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1569  periplasmic murein peptide-binding protein  25.98 
 
 
537 aa  124  4e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2295  extracellular solute-binding protein  25.98 
 
 
537 aa  124  4e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1446  periplasmic murein peptide-binding protein  25.98 
 
 
537 aa  124  4e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01317  hypothetical protein  25.98 
 
 
537 aa  124  4e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.441272  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1542  periplasmic murein peptide-binding protein  25.98 
 
 
537 aa  124  4e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1683  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein, oppA-like  24.28 
 
 
542 aa  124  6e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1666  extracellular solute-binding protein  24.21 
 
 
501 aa  123  9.999999999999999e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1983  putative oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  24.47 
 
 
542 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.776942  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2454  extracellular solute-binding protein  23.81 
 
 
528 aa  123  9.999999999999999e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.269908  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0209  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  23.87 
 
 
536 aa  122  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3653  extracellular solute-binding protein family 5  25.61 
 
 
513 aa  122  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0310608  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1804  periplasmic murein peptide-binding protein  25.55 
 
 
537 aa  122  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.048276  normal  0.542022 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1709  oligopeptide ABC transporter, substrate-binding protein  24.37 
 
 
542 aa  122  1.9999999999999998e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.173972  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0865  extracellular solute-binding protein  27.04 
 
 
544 aa  122  1.9999999999999998e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2961  extracellular solute-binding protein  25.45 
 
 
541 aa  122  1.9999999999999998e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2385  extracellular solute-binding protein family 5  26.43 
 
 
594 aa  121  3e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3599  extracellular solute-binding protein  25.42 
 
 
525 aa  121  3e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.1646  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0680  extracellular solute-binding protein family 5  26.56 
 
 
535 aa  121  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3198  putative binding protein  26.56 
 
 
535 aa  121  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4331  putative binding protein  26.56 
 
 
535 aa  120  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02842  hypothetical protein  26.56 
 
 
535 aa  121  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.81173  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>