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for query gene Ccur_13540 on replicon NC_013170
Organism: Cryptobacterium curtum DSM 15641



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Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013170  Ccur_13540  arabinose efflux permease family protein  100 
 
 
463 aa  907    Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23950  arabinose efflux permease family protein  58.54 
 
 
456 aa  484  1e-135  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.297919  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2800  major facilitator superfamily MFS_1  48.01 
 
 
586 aa  377  1e-103  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0579957  hitchhiker  0.00000851422 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2528  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.6 
 
 
590 aa  326  7e-88  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1857  major facilitator transporter  37.12 
 
 
566 aa  318  1e-85  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.906774  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1574  major facilitator transporter  36.88 
 
 
565 aa  318  2e-85  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000345614  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1778  major facilitator transporter  28.44 
 
 
474 aa  158  2e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000929318  normal  0.0431251 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0420  major facilitator superfamily MFS_1  29.5 
 
 
460 aa  147  3e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0958  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.95 
 
 
511 aa  133  6.999999999999999e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.026733  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4300  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  29.31 
 
 
504 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0326  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.2 
 
 
539 aa  127  4.0000000000000003e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2058  major facilitator transporter  29.37 
 
 
471 aa  125  1e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.469976  normal  0.844529 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3171  Mdr  27.9 
 
 
507 aa  124  3e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1939  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.24 
 
 
537 aa  123  6e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.926976  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4004  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.57 
 
 
498 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.074494 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3147  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  25.46 
 
 
541 aa  121  3e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1176  major facilitator superfamily MFS_1  24.22 
 
 
450 aa  119  9.999999999999999e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0522954 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4474  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.65 
 
 
627 aa  119  9.999999999999999e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.137997  normal  0.105025 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3910  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.74 
 
 
513 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000020213  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3742  multidrug-efflux transporter  25.74 
 
 
513 aa  119  1.9999999999999998e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000625397  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3758  multidrug-efflux transporter  25.74 
 
 
513 aa  119  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000783495  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4018  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  25.74 
 
 
513 aa  119  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4216  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.74 
 
 
513 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000209346  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11276  drug-transport integral membrane protein  28.35 
 
 
579 aa  119  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.201451 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3984  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.34 
 
 
646 aa  118  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.086459  normal  0.10455 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3186  drug transport protein, putative  26.15 
 
 
507 aa  117  3e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1134  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  25.74 
 
 
513 aa  117  3e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000000214385  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4105  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  25.3 
 
 
513 aa  118  3e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00176585  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0574  multidrug resistance protein B; sugar (and other) transporter  25.53 
 
 
537 aa  117  5e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0573  multidrug-efflux transporter  25.53 
 
 
537 aa  117  5e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0295676  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4122  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  25.49 
 
 
513 aa  117  5e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000107671  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0720  putative multidrug resistance protein  25.53 
 
 
537 aa  117  5e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.55065e-20 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3970  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.09 
 
 
646 aa  117  5e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4044  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.09 
 
 
646 aa  117  5e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0731  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.53 
 
 
537 aa  117  6e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4051  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.49 
 
 
513 aa  117  6e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000130909  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0630  multidrug-efflux transporter  25.53 
 
 
476 aa  117  6e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0118993  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0792  putative multidrug resistance protein  25.53 
 
 
537 aa  117  6e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000149033  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2221  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.72 
 
 
609 aa  116  6.9999999999999995e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.667625  normal  0.81194 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2703  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.74 
 
 
511 aa  116  7.999999999999999e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.445725  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3298  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  25.46 
 
 
538 aa  116  7.999999999999999e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1015  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.54 
 
 
561 aa  116  7.999999999999999e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0033  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.94 
 
 
541 aa  116  8.999999999999998e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0695  putative multidrug resistance protein  25.06 
 
 
537 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0299481  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2717  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.11 
 
 
509 aa  115  1.0000000000000001e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00105313 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0169  major facilitator superfamily MFS_1  28.61 
 
 
496 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3005  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.76 
 
 
512 aa  115  2.0000000000000002e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.216237  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0558  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.37 
 
 
538 aa  114  4.0000000000000004e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000222683  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1235  major facilitator superfamily MFS_1  28.51 
 
 
491 aa  114  5e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.839802 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4163  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.3 
 
 
676 aa  113  8.000000000000001e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4643  putative multidrug resistance protein  24.82 
 
 
537 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00119486  unclonable  1.5256899999999999e-25 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2724  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.21 
 
 
515 aa  112  1.0000000000000001e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.701538  normal  0.0103293 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3829  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.18 
 
 
513 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000236934  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1258  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.95 
 
 
485 aa  112  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.645684 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0577  EmrB/QacA family drug resistance transporter  24.17 
 
 
537 aa  111  3e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4220  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.05 
 
 
510 aa  111  3e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.663619  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4014  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.83 
 
 
504 aa  111  3e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.223084 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4140  major facilitator superfamily MFS_1  26.37 
 
 
512 aa  110  4.0000000000000004e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.347022  normal  0.239769 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4479  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.22 
 
 
505 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.244863 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3811  major facilitator superfamily MFS_1  28.46 
 
 
512 aa  110  4.0000000000000004e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1102  major facilitator superfamily MFS_1  29.93 
 
 
512 aa  110  5e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000316091 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0331  MFS family transporter  30.99 
 
 
515 aa  109  8.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0740  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.54 
 
 
615 aa  109  9.000000000000001e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.0000446229  decreased coverage  0.00171071 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2608  multidrug resistance protein B  27.37 
 
 
511 aa  108  2e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000057385  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4406  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.74 
 
 
514 aa  108  2e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.853367 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2437  major facilitator transporter  27.25 
 
 
494 aa  108  2e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.516021  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1947  multidrug ABC transporter, permease  25.82 
 
 
582 aa  108  2e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.128457  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4798  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  25.71 
 
 
518 aa  107  3e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3139  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.64 
 
 
504 aa  107  4e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1670  multidrug resistance protein B  25.32 
 
 
582 aa  107  5e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.11549  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08840  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.35 
 
 
592 aa  107  5e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0457  major facilitator superfamily permease  26.71 
 
 
487 aa  107  5e-22  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000000209922  normal  0.207287 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0160  major facilitator superfamily MFS_1  28.12 
 
 
496 aa  107  6e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0154454 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3767  major facilitator superfamily MFS_1  28.16 
 
 
491 aa  106  7e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.952675  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2916  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.46 
 
 
511 aa  105  1e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0905383  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1646  multidrug ABC transporter, permease  25.06 
 
 
582 aa  105  1e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5139  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.82 
 
 
519 aa  105  1e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.306727  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2685  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.32 
 
 
511 aa  105  2e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0846353  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0999  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.44 
 
 
486 aa  105  2e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00068647  hitchhiker  0.00553022 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3850  major facilitator superfamily MFS_1  29.32 
 
 
491 aa  105  2e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.330919  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2683  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.23 
 
 
511 aa  105  3e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000215764  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2877  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.23 
 
 
511 aa  105  3e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0363154  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4177  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.72 
 
 
522 aa  104  3e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3511  multidrug resistance protein B  25.32 
 
 
582 aa  104  3e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1911  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.63 
 
 
585 aa  104  4e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1781  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.03 
 
 
483 aa  104  4e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.787219  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1058  major facilitator transporter  28.26 
 
 
471 aa  103  4e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.111803  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2880  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  27.23 
 
 
511 aa  103  5e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00104329 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1199  putative multidrug transporter  26.72 
 
 
477 aa  103  5e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.467724  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1916  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.46 
 
 
478 aa  103  6e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0782092  hitchhiker  0.00395657 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03040  putative MFS transporter  30.17 
 
 
501 aa  103  6e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.479989  hitchhiker  0.0000743098 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0550  tRNA-guanine transglycosylase, various specificities  26.54 
 
 
1062 aa  103  7e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2956  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.48 
 
 
521 aa  103  7e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.210467 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2046  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.16 
 
 
495 aa  103  7e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.838973  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2050  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.92 
 
 
516 aa  103  8e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.851205  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3300  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.88 
 
 
501 aa  103  9e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.17007  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3372  EmrB/QacA family drug resistance transporter  24.81 
 
 
476 aa  103  9e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000356155  n/a   
 
 
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NC_003909  BCE_4851  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.32 
 
 
478 aa  102  1e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.16573  n/a   
 
 
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NC_005957  BT9727_2632  multidrug resistance protein B  27.23 
 
 
511 aa  102  1e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000173688  n/a   
 
 
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NC_006274  BCZK4459  multidrug resistance protein B  25.06 
 
 
478 aa  102  1e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0324211  n/a   
 
 
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