More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccur_04450 on replicon NC_013170
Organism: Cryptobacterium curtum DSM 15641



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013522  Taci_0723  threonyl-tRNA synthetase  54.73 
 
 		 631 aa  642    Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000476694  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1228  threonyl-tRNA synthetase  57.62 
 
 		 635 aa  693    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000338672  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16370  threonyl-tRNA synthetase /Ser-tRNA(Thr) hydrolase  78.84 
 
 		 586 aa  988    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.12349 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2401  threonyl-tRNA synthetase  53.83 
 
 		 634 aa  671    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.162517  normal  0.284009 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1612  threonyl-tRNA synthetase  54.24 
 
 		 635 aa  657    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000178172  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0185  threonyl-tRNA synthetase  53.66 
 
 		 639 aa  675    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000179764  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1384  threonyl-tRNA synthetase  53.66 
 
 		 635 aa  647    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.000000717334  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1759  threonyl-tRNA synthetase  53.37 
 
 		 633 aa  646    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000991077  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1669  threonyl-tRNA synthetase  54.37 
 
 		 637 aa  644    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000137846  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2665  threonyl-tRNA synthetase  53.08 
 
 		 584 aa  657    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000220787  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0627  threonyl-tRNA synthetase  77.13 
 
 		 588 aa  975    Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04450  threonyl-tRNA synthetase /Ser-tRNA(Thr) hydrolase  100 
 
 		 586 aa  1220    Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0386598  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2057  threonyl-tRNA synthetase  55.06 
 
 		 634 aa  659    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000136416  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1319  hypothetical protein  61.54 
 
 		 586 aa  788    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1664  threonyl-tRNA synthetase  53.62 
 
 		 640 aa  645    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000605435  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1089  threonyl-tRNA synthetase  54.42 
 
 		 635 aa  667    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00500732  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1372  threonyl-tRNA synthetase  57.2 
 
 		 635 aa  672    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000383369  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2419  threonyl-tRNA synthetase  51.75 
 
 		 640 aa  634  1e-180  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2405  threonyl-tRNA synthetase  51.31 
 
 		 639 aa  633  1e-180  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2161  threonyl-tRNA synthetase  51.31 
 
 		 639 aa  633  1e-180  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.820955  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2145  threonyl-tRNA synthetase  51.13 
 
 		 639 aa  632  1e-180  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2973  threonyl-tRNA synthetase  51.4 
 
 		 640 aa  632  1e-180  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.617243 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2354  threonyl-tRNA synthetase  51.58 
 
 		 640 aa  634  1e-180  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2489  threonyl-tRNA synthetase  50.79 
 
 		 639 aa  632  1e-180  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.952507  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1327  threonyl-tRNA synthetase  52.5 
 
 		 636 aa  631  1e-179  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0393085  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2222  threonyl-tRNA synthetase  51.13 
 
 		 639 aa  631  1e-179  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2193  threonyl-tRNA synthetase  50.43 
 
 		 639 aa  629  1e-179  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2388  threonyl-tRNA synthetase  51.13 
 
 		 639 aa  631  1e-179  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1767  threonyl-tRNA synthetase  49.66 
 
 		 640 aa  631  1e-179  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.143728  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0725  threonyl-tRNA synthetase  52.02 
 
 		 638 aa  624  1e-177  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0608  threonyl-tRNA synthetase  51.07 
 
 		 634 aa  610  1e-173  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.769524  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0189  threonyl-tRNA synthetase  50.78 
 
 		 640 aa  609  1e-173  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000114049  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0187  threonyl-tRNA synthetase  50.43 
 
 		 640 aa  606  9.999999999999999e-173  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00194489  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2823  threonyl-tRNA synthetase  49.65 
 
 		 643 aa  598  1e-170  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000177582  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0392  threonyl-tRNA synthetase  48.21 
 
 		 633 aa  598  1e-169  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3194  threonyl-tRNA synthetase  50.55 
 
 		 637 aa  592  1e-168  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1824  threonyl-tRNA synthetase  50.26 
 
 		 636 aa  593  1e-168  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000392835  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0707  threonyl-tRNA synthetase  49.3 
 
 		 644 aa  581  1e-164  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00542671  normal  0.896215 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1450  threonyl-tRNA synthetase  49.56 
 
 		 643 aa  580  1e-164  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1667  threonyl-tRNA synthetase  47.64 
 
 		 642 aa  570  1e-161  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.301446  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0912  threonyl-tRNA synthetase  48.78 
 
 		 638 aa  572  1e-161  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2243  threonyl-tRNA synthetase  50.91 
 
 		 644 aa  568  1e-160  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.00594301  hitchhiker  0.00373508 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0984  threonyl-tRNA synthetase  48.35 
 
 		 644 aa  567  1e-160  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.234013 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2003  threonyl-tRNA synthetase  48.16 
 
 		 635 aa  566  1e-160  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00562927  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2614  threonyl-tRNA synthetase  50.91 
 
 		 644 aa  568  1e-160  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0424  threonyl-tRNA synthetase  48.94 
 
 		 644 aa  565  1e-160  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000699319  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2219  threonyl-tRNA synthetase  48.08 
 
 		 635 aa  566  1e-160  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00166056  normal  0.0562711 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0835  threonyl-tRNA synthetase  48.81 
 
 		 640 aa  562  1.0000000000000001e-159  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2136  threonyl-tRNA synthetase  46.91 
 
 		 644 aa  563  1.0000000000000001e-159  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.0000000263348  hitchhiker  0.00165189 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2639  threonyl-tRNA synthetase  47.72 
 
 		 644 aa  563  1.0000000000000001e-159  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.3159  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1411  threonyl-tRNA synthetase  47.1 
 
 		 645 aa  561  1e-158  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000074774  normal  0.343495 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003716  threonyl-tRNA synthetase  47.99 
 
 		 642 aa  559  1e-158  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000263633  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02079  threonyl-tRNA synthetase  48.16 
 
 		 642 aa  561  1e-158  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2061  threonyl-tRNA synthetase  46.17 
 
 		 641 aa  561  1e-158  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.399726  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0108  threonyl-tRNA synthetase  46.18 
 
 		 643 aa  558  1e-157  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0942  threonyl-tRNA synthetase  47.48 
 
 		 642 aa  556  1e-157  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000484442  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3623  threonyl-tRNA synthetase  46.8 
 
 		 643 aa  558  1e-157  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.263576  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2417  threonyl-tRNA synthetase  46.42 
 
 		 644 aa  558  1e-157  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.00010604  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0768  threonyl-tRNA synthetase  47.43 
 
 		 641 aa  558  1e-157  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.67512  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1515  threonyl-tRNA synthetase  47.44 
 
 		 636 aa  551  1e-156  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00436769  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1990  threonyl-tRNA synthetase  46.83 
 
 		 636 aa  552  1e-156  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0457996  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0797  threonyl-tRNA synthetase  47.39 
 
 		 652 aa  553  1e-156  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2230  threonyl-tRNA synthetase  47.36 
 
 		 636 aa  554  1e-156  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00712554 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2098  threonyl-tRNA synthetase  46.07 
 
 		 644 aa  554  1e-156  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000824061  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2677  threonyl-tRNA synthetase / Ser-tRNA(Thr) hydrolase  46.76 
 
 		 638 aa  553  1e-156  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.123605 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1976  threonyl-tRNA synthetase  46.43 
 
 		 640 aa  552  1e-156  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.30647  normal  0.0664699 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1577  threonyl-tRNA synthetase  45.98 
 
 		 636 aa  553  1e-156  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.219126  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0427  threonyl-tRNA synthetase  47.09 
 
 		 640 aa  552  1e-156  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0436469  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0028  threonyl-tRNA synthetase  48.52 
 
 		 603 aa  554  1e-156  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2997  threonyl-tRNA synthetase  48.5 
 
 		 644 aa  550  1e-155  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0033  threonyl-tRNA synthetase  45.72 
 
 		 641 aa  551  1e-155  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.611945  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1140  threonyl-tRNA synthetase  47.28 
 
 		 644 aa  548  1e-155  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.000099925  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1760  threonyl-tRNA synthetase  46.6 
 
 		 642 aa  550  1e-155  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.000746645  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2628  threonyl-tRNA synthetase  48.37 
 
 		 645 aa  549  1e-155  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000255721  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10531  threonyl-tRNA synthetase  46.06 
 
 		 638 aa  551  1e-155  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.487806  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2661  threonyl-tRNA synthetase  46.86 
 
 		 644 aa  551  1e-155  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000386283  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2308  threonyl-tRNA synthetase  46.85 
 
 		 636 aa  551  1e-155  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.304156  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0870  threonyl-tRNA synthetase  46.55 
 
 		 635 aa  548  1e-154  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0202  threonyl-tRNA synthetase  47.71 
 
 		 635 aa  545  1e-154  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00540019  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0693  threonyl-tRNA synthetase  46.9 
 
 		 638 aa  547  1e-154  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.287981  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1577  threonyl-tRNA synthetase  48.26 
 
 		 635 aa  545  1e-154  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.704052  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2909  threonyl-tRNA synthetase  46.61 
 
 		 636 aa  546  1e-154  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1712  threonyl-tRNA synthetase  47.71 
 
 		 635 aa  545  1e-154  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.713127  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1096  threonyl-tRNA synthetase  47.71 
 
 		 635 aa  545  1e-154  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.869704  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1275  threonyl-tRNA synthetase  47.09 
 
 		 635 aa  546  1e-154  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.966183  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1890  threonyl-tRNA synthetase  47.71 
 
 		 635 aa  545  1e-154  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.190857  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1418  threonyl-tRNA synthetase  46.58 
 
 		 638 aa  545  1e-154  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000102997  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06531  threonyl-tRNA synthetase  44.37 
 
 		 640 aa  548  1e-154  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1160  threonyl-tRNA synthetase  46.74 
 
 		 635 aa  546  1e-154  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.139321  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2854  threonyl-tRNA synthetase  45.71 
 
 		 635 aa  548  1e-154  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0336987 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1539  threonyl-tRNA synthetase  47.71 
 
 		 635 aa  545  1e-154  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1735  threonyl-tRNA synthetase  47.71 
 
 		 635 aa  545  1e-154  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.261137  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0963  threonyl-tRNA synthetase  47.71 
 
 		 635 aa  545  1e-154  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0747512  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4707  threonyl-tRNA synthetase  45.59 
 
 		 645 aa  543  1e-153  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000334194  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4307  threonyl-tRNA synthetase  45.59 
 
 		 645 aa  543  1e-153  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00228432  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4318  threonyl-tRNA synthetase  45.59 
 
 		 645 aa  543  1e-153  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0311311  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1647  threonyl-tRNA synthetase  47.27 
 
 		 635 aa  544  1e-153  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0710025 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4691  threonyl-tRNA synthetase  45.59 
 
 		 645 aa  543  1e-153  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.88699e-59 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4820  threonyl-tRNA synthetase  45.59 
 
 		 645 aa  543  1e-153  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00851939  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4701  threonyl-tRNA synthetase  45.59 
 
 		 645 aa  542  1e-153  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000566692  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>