290 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_3424 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011898  Ccel_3424  Methyltransferase type 11  100 
 
 
203 aa  416  9.999999999999999e-116  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2052  Methyltransferase type 12  44.85 
 
 
211 aa  114  6.9999999999999995e-25  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0648  hypothetical protein  27.41 
 
 
212 aa  84.3  0.000000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0360  methyltransferase type 12  24.24 
 
 
201 aa  77  0.0000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0321  methyltransferase type 12  26.19 
 
 
210 aa  68.2  0.00000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.034044  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0884  hypothetical protein  30.53 
 
 
217 aa  65.9  0.0000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11537  hypothetical protein  32.52 
 
 
166 aa  65.1  0.0000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.574774 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1292  methyltransferase type 12  28.97 
 
 
209 aa  60.1  0.00000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0941  trans-aconitate 2-methyltransferase  32.52 
 
 
256 aa  59.3  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.842807  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3058  methyltransferase type 12  24.42 
 
 
208 aa  58.5  0.00000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6593  methyltransferase type 12  25 
 
 
206 aa  57  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4212  methyltransferase type 11  38.36 
 
 
282 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.329369  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4154  methyltransferase type 11  38.36 
 
 
282 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.538399  hitchhiker  0.00787832 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000529  hypothetical protein  25.37 
 
 
207 aa  56.2  0.0000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.338352  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3362  methyltransferase type 11  36.99 
 
 
282 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0826191  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0462  methyltransferase type 11  25 
 
 
215 aa  55.8  0.0000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0703  hypothetical protein  24.44 
 
 
221 aa  55.8  0.0000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.220568  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2207  trans-aconitate 2-methyltransferase  28.18 
 
 
260 aa  55.5  0.0000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0144  SAM-binding motif-containing protein  22.99 
 
 
216 aa  55.1  0.0000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1276  trans-aconitate 2-methyltransferase  27.4 
 
 
271 aa  55.1  0.0000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.281343  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2206  hypothetical protein  25.41 
 
 
195 aa  54.7  0.0000009  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00459198  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0827  trans-aconitate 2-methyltransferase  30.08 
 
 
256 aa  54.7  0.0000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.934205 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2430  trans-aconitate 2-methyltransferase  29.73 
 
 
268 aa  54.3  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1653  trans-aconitate 2-methyltransferase  28.57 
 
 
252 aa  54.3  0.000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.217982  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0157  SAM-binding motif-containing protein  23.4 
 
 
216 aa  54.3  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1664  Methyltransferase type 11  31.76 
 
 
271 aa  53.5  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1876  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  34.21 
 
 
282 aa  53.5  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.183068  normal  0.315435 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1433  trans-aconitate 2-methyltransferase  30.63 
 
 
259 aa  53.9  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2481  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase ubie  39.02 
 
 
235 aa  52.8  0.000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.817194 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0164  hypothetical protein  28.73 
 
 
195 aa  53.1  0.000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.789241  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1719  trans-aconitate 2-methyltransferase  31.4 
 
 
255 aa  52.8  0.000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0157  biotin biosynthesis protein BioC  28.85 
 
 
290 aa  52.8  0.000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.322 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3451  trans-aconitate 2-methyltransferase  27.78 
 
 
256 aa  52.8  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1955  methyltransferase type 11  27.87 
 
 
268 aa  52.4  0.000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05357  hypothetical protein  25.62 
 
 
204 aa  52  0.000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3310  SAM-binding motif-containing protein  25.54 
 
 
215 aa  52  0.000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0193155  normal  0.377357 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1719  trans-aconitate 2-methyltransferase  31.71 
 
 
252 aa  52  0.000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.335531  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11556  methyltransferase  32.1 
 
 
347 aa  52  0.000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5272  trans-aconitate 2-methyltransferase  29.41 
 
 
257 aa  52  0.000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.167219  normal  0.0637205 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  30.48 
 
 
225 aa  52  0.000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0810  hypothetical protein  27.27 
 
 
239 aa  51.6  0.000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2136  trans-aconitate 2-methyltransferase  31.4 
 
 
256 aa  51.6  0.000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.000208135  decreased coverage  0.00294275 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1778  trans-aconitate 2-methyltransferase  27.59 
 
 
265 aa  51.6  0.000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.525506  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01476  trans-aconitate 2-methyltransferase  31.71 
 
 
252 aa  51.2  0.000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2127  Trans-aconitate 2-methyltransferase  31.71 
 
 
252 aa  51.2  0.000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.10768  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01487  hypothetical protein  31.71 
 
 
252 aa  51.2  0.000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2139  trans-aconitate 2-methyltransferase  31.71 
 
 
252 aa  51.2  0.000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1455  trans-aconitate 2-methyltransferase  30.23 
 
 
255 aa  50.8  0.00001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2370  methyltransferase type 11  28.57 
 
 
219 aa  50.8  0.00001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00258532 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1410  trans-aconitate 2-methyltransferase  30.23 
 
 
255 aa  50.8  0.00001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1737  Methyltransferase type 11  32.63 
 
 
283 aa  51.2  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0817864  normal  0.19788 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0608  Trans-aconitate 2-methyltransferase  30.85 
 
 
262 aa  51.2  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0288273  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1408  membrane-associated protein  26.21 
 
 
213 aa  51.2  0.00001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10301  trans-aconitate 2-methyltransferase  29.25 
 
 
261 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0338576  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4432  methyltransferase type 11  40.85 
 
 
284 aa  50.8  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1175  Methyltransferase type 12  30.48 
 
 
245 aa  50.8  0.00001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5330  trans-aconitate 2-methyltransferase  29.41 
 
 
260 aa  51.2  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.270812  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1690  trans-aconitate 2-methyltransferase  31.71 
 
 
243 aa  51.2  0.00001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00892197  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10909  conserved hypothetical protein  28.7 
 
 
333 aa  50.1  0.00002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00364748  normal  0.0877124 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0252  Methyltransferase type 12  24.52 
 
 
227 aa  50.1  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.965523  hitchhiker  0.00106675 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2481  trans-aconitate 2-methyltransferase  27.78 
 
 
256 aa  50.4  0.00002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0101749  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0807  Methyltransferase type 11  30.25 
 
 
200 aa  50.4  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11260  trans-aconitate methyltransferase  27.96 
 
 
307 aa  50.1  0.00002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.22553  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0780  Methyltransferase type 11  30.25 
 
 
200 aa  50.4  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2173  Methyltransferase type 11  36 
 
 
252 aa  50.1  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4086  methyltransferase type 11  25.23 
 
 
249 aa  50.4  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.315577  normal  0.173874 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0176  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  32.14 
 
 
220 aa  49.3  0.00003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4083  Trans-aconitate 2-methyltransferase  26.85 
 
 
257 aa  49.7  0.00003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.30188 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06540  putative biotin synthesis protein BioC  31.13 
 
 
274 aa  50.1  0.00003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2809  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase ubie  36.14 
 
 
235 aa  49.3  0.00003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3312  hypothetical protein  29.21 
 
 
211 aa  49.7  0.00003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.644401 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2132  trans-aconitate 2-methyltransferase  30.49 
 
 
252 aa  49.7  0.00003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.523623  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0834  hypothetical protein  26.97 
 
 
239 aa  49.3  0.00004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1327  trans-aconitate methyltransferase, putative  30.34 
 
 
256 aa  49.3  0.00004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13820  trans-aconitate 2-methyltransferase  26.09 
 
 
255 aa  49.3  0.00004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.328183  normal  0.535788 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4403  SAM-binding motif-containing protein  22.38 
 
 
218 aa  49.3  0.00004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0174  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  37.21 
 
 
220 aa  48.9  0.00005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0992  Trans-aconitate 2-methyltransferase  26.36 
 
 
294 aa  48.9  0.00005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4324  Methyltransferase type 11  32.58 
 
 
286 aa  48.5  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1601  trans-aconitate 2-methyltransferase  30.49 
 
 
252 aa  48.5  0.00006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.767111  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1011  putative biotin synthesis protein BioC  37.5 
 
 
269 aa  48.5  0.00006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4085  biotin biosynthesis protein BioC  31.03 
 
 
267 aa  48.5  0.00007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1146  Methyltransferase type 11  33.78 
 
 
251 aa  48.5  0.00007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.114976  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1142  trans-aconitate 2-methyltransferase  27.91 
 
 
258 aa  48.1  0.00008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4226  putative biotin synthesis protein BioC  37.5 
 
 
269 aa  48.1  0.00008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4194  methyltransferase type 12  25.54 
 
 
211 aa  48.1  0.00008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3407  type 11 methyltransferase  30.95 
 
 
202 aa  48.1  0.00008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1765  trans-aconitate 2-methyltransferase  26.44 
 
 
264 aa  48.1  0.00008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.736943  hitchhiker  0.00277995 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4002  methyltransferase type 11  27.78 
 
 
276 aa  48.1  0.00009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.268063  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0212  hypothetical protein  34.33 
 
 
231 aa  47.8  0.0001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1313  biotin biosynthesis protein BioC  32.5 
 
 
255 aa  47.8  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.110955  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0393  methyltransferase protein  31.31 
 
 
246 aa  47.8  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0079  Methyltransferase type 12  28.67 
 
 
524 aa  47.4  0.0001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.995415  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4335  trans-aconitate 2-methyltransferase  30.77 
 
 
254 aa  47.4  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2709  methyltransferase type 11  27.1 
 
 
204 aa  47.4  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.690891  normal  0.954825 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2595  methyltransferase type 11  27.1 
 
 
204 aa  47.4  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.133869  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3454  methyltransferase type 11  25.52 
 
 
270 aa  47.4  0.0001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3612  methyltransferase type 11  33.33 
 
 
256 aa  47.8  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4126  trans-aconitate 2-methyltransferase  24.62 
 
 
256 aa  47.8  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.613741  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3033  thioesterase  40.43 
 
 
829 aa  46.6  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.862159  normal  0.955907 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>