197 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_0878 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011898  Ccel_0878  hypothetical protein  100 
 
 
329 aa  675    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0057402  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2575  hypothetical protein  70.87 
 
 
336 aa  468  1.0000000000000001e-131  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.225151  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4555  NMT1/THI5 like domain protein  59.28 
 
 
337 aa  423  1e-117  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1836  ABC-type nitrate/sulfonate/taurine/bicarbonate transport systems, periplasmic component  57.66 
 
 
340 aa  402  1e-111  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2293  membrane lipoprotein lipid attachment site  50.91 
 
 
336 aa  363  2e-99  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4514  ABC transporter, substrate-binding protein  48.8 
 
 
335 aa  334  1e-90  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0337  putative ABC transporter, substrate-binding protein  48.2 
 
 
335 aa  334  1e-90  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4921  putative ABC transporter, substrate-binding protein  48.8 
 
 
335 aa  334  1e-90  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4901  putative ABC transporter, substrate-binding protein  48.5 
 
 
335 aa  333  2e-90  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4533  ABC transporter, substrate-binding protein  47.9 
 
 
335 aa  331  1e-89  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3454  ABC transporter, substrate-binding protein  47.45 
 
 
334 aa  331  1e-89  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4613  NMT1/THI5-like domain-containing protein  47.9 
 
 
335 aa  330  2e-89  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4900  putative ABC transporter, substrate-binding protein  47.01 
 
 
335 aa  328  6e-89  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1347  NMT1/THI5-like domain-containing protein  48.93 
 
 
330 aa  327  1.0000000000000001e-88  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4675  ABC transporter substrate-binding protein  47.15 
 
 
338 aa  326  3e-88  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5036  ABC transporter substrate-binding protein  48.12 
 
 
325 aa  320  1.9999999999999998e-86  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.647768  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11510  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, periplasmic component  46.06 
 
 
336 aa  320  1.9999999999999998e-86  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000048144  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4935  ABC transporter, substrate-binding protein, putative  48.44 
 
 
325 aa  319  5e-86  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2782  ABC transporter substrate-binding protein  46.36 
 
 
332 aa  314  9.999999999999999e-85  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3350  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  32.06 
 
 
364 aa  179  4.999999999999999e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000374426  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1474  hypothetical protein  32.23 
 
 
332 aa  171  1e-41  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000000729086  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2556  ABC-type nitrate/sulfonate/taurine/bicarbonate transport systems, periplasmic component  28.05 
 
 
365 aa  150  3e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0652  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  58.14 
 
 
261 aa  102  1e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2778  NMT1/THI5 like domain protein  23.84 
 
 
325 aa  84.3  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3213  NMT1/THI5-like domain-containing protein  27.51 
 
 
338 aa  80.5  0.00000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.581977  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1964  NMT1/THI5-like domain-containing protein  25 
 
 
344 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0999952  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2748  extracellular solute-binding protein  26.75 
 
 
340 aa  78.2  0.0000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.715028  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3279  hypothetical protein  25.43 
 
 
332 aa  72.8  0.000000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.000646762  normal  0.0750217 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2334  putative signal peptide protein  27.27 
 
 
344 aa  72.8  0.000000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.643163  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2254  extracellular solute-binding protein  25 
 
 
336 aa  71.2  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2357  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  22.44 
 
 
345 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0182931  normal  0.0423673 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2258  NMT1/THI5 like domain protein  25.47 
 
 
340 aa  70.1  0.00000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3159  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  23.08 
 
 
346 aa  69.7  0.00000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.338207 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1830  NMT1/THI5 like domain protein  22.44 
 
 
345 aa  69.7  0.00000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.223893  normal  0.1806 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0619  NMT1/THI5 like domain protein  24.4 
 
 
339 aa  69.3  0.00000000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1675  putative signal peptide protein  24.63 
 
 
371 aa  68.6  0.0000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.88323 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1390  NMT1/THI5 like domain protein  23.05 
 
 
346 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.530017  hitchhiker  0.00234319 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0955  NMT1/THI5-like domain-containing protein  22.05 
 
 
345 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0830268  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2105  extracellular solute-binding protein  26.03 
 
 
347 aa  68.2  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.109451  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1431  extracellular solute-binding protein  24.24 
 
 
332 aa  68.2  0.0000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.633528 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2272  putative signal peptide protein  24.91 
 
 
349 aa  67.8  0.0000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.863816  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2122  extracellular solute-binding protein  24.56 
 
 
347 aa  67.4  0.0000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0485775  normal  0.0522703 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2648  putative signal peptide protein  23.81 
 
 
353 aa  67.4  0.0000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00493903 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1198  signal peptide protein  23.19 
 
 
349 aa  66.6  0.0000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0284  ABC transporter, periplasmic binding protein, putative  25.36 
 
 
346 aa  67  0.0000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1180  putative ABC transporter, periplasmic protein  22.37 
 
 
323 aa  66.2  0.0000000007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0494  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  25.46 
 
 
333 aa  64.7  0.000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.547109  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1032  putative aliphatic sulfonate binding protein precursor  25.53 
 
 
327 aa  64.3  0.000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1057  extracellular solute-binding protein family 3  23.81 
 
 
332 aa  63.9  0.000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.227515  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0465  ABC transporter, substrate-binding protein, aliphatic sulphonates  30.13 
 
 
347 aa  63.9  0.000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.176308  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1934  NLPA lipoprotein  25.41 
 
 
329 aa  62.8  0.000000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1042  NMT1/THI5 like domain protein  22 
 
 
349 aa  62.4  0.000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.778479 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1134  NMT1/THI5 like domain protein  22 
 
 
349 aa  62.4  0.00000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0977895  normal  0.576381 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3589  NMT1/THI5-like domain-containing protein  25.2 
 
 
346 aa  62  0.00000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1172  aliphatic sulfonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  25.71 
 
 
358 aa  62.4  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.811616  normal  0.138153 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1460  twin-arginine translocation pathway signal  24.6 
 
 
348 aa  60.8  0.00000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.00145692  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3083  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  24.57 
 
 
328 aa  61.2  0.00000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.261971  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2108  extracellular solute-binding protein  27.31 
 
 
341 aa  59.7  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1981  ABC transporter, substrate-binding protein, aliphatic sulphonates  25.07 
 
 
335 aa  58.9  0.0000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0169392  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4038  NMT1/THI5 like domain protein  24.21 
 
 
334 aa  58.9  0.0000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.21044  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4150  NMT1/THI5 like domain protein  24.21 
 
 
334 aa  58.9  0.0000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6066  ABC transporter substrate-binding protein  26.84 
 
 
342 aa  58.2  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0938445  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3333  extracellular solute-binding protein  24.45 
 
 
341 aa  57.8  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.686225  normal  0.192968 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3512  NMT1/THI5-like domain-containing protein  23.97 
 
 
345 aa  57.4  0.0000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2920  putative sulfonate ABC transporter, sulfonate-binding protein  25.66 
 
 
328 aa  57  0.0000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.10374e-18 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2960  sulfonate ABC transporter, sulfonate-binding protein, putative  25.85 
 
 
328 aa  55.8  0.0000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.641077  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2255  NMT1/THI5 like domain protein  26.12 
 
 
340 aa  55.5  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.387928  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0806  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like  23.7 
 
 
328 aa  55.5  0.000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.488938  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2713  sulfonate ABC transporter sulfonate-binding protein  25.66 
 
 
328 aa  54.7  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.38086  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2921  sulfonate ABC transporter sulfonate-binding protein  25.66 
 
 
328 aa  54.7  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3327  ABC transporter substrate binding protein  25.64 
 
 
303 aa  55.1  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.419883  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2641  alkanesulfonates-binding protein  25.85 
 
 
328 aa  54.3  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.245447  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3116  ABC transporter, substrate-binding protein  24.91 
 
 
336 aa  54.3  0.000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.60563  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1814  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  24.1 
 
 
322 aa  54.3  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.641284  normal  0.673988 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3594  NMT1/THI5-like domain-containing protein  23.48 
 
 
340 aa  54.3  0.000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3118  ABC transporter, substrate-binding protein  26.09 
 
 
336 aa  53.9  0.000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.671223  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2701  NMT1/THI5-like domain-containing protein  24.22 
 
 
331 aa  53.5  0.000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5343  putative ABC transporter, substrate-binding protein  24.12 
 
 
337 aa  53.1  0.000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.524159 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1486  NMT1/THI5 like domain protein  24.28 
 
 
355 aa  53.1  0.000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4301  aliphatic sulfonates family ABC transporter, periplsmic ligand-binding protein  24.89 
 
 
365 aa  53.1  0.000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.389589  hitchhiker  0.0000586034 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5063  putative ABC transporter, substrate-binding protein  24.12 
 
 
337 aa  53.1  0.000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7652  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, inner membrane subunit  23.1 
 
 
332 aa  52.8  0.000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.422947  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4091  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  23.55 
 
 
387 aa  52.8  0.000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  decreased coverage  0.00248715  normal  0.783031 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0212  hypothetical protein  23.61 
 
 
325 aa  52.4  0.00001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.0000000728433  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2664  alkanesulfonates-binding protein  24.78 
 
 
328 aa  52.4  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.760849  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4888  NMT1/THI5 like domain protein  32.84 
 
 
343 aa  52  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0260  extracellular solute-binding protein  25.57 
 
 
331 aa  52  0.00001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.388479  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3602  conserved hypothetical signal peptide protein  21.37 
 
 
349 aa  52.4  0.00001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3391  putative signal peptide protein  20.08 
 
 
328 aa  52  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4931  putative sulfonate/nitrate transport system substrate-binding protein  25.41 
 
 
325 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.658628 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2967  putative sulfonate ABC transporter, sulfonate-binding protein  25.51 
 
 
328 aa  51.2  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.588828  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0036  NMT1/THI5-like domain-containing protein  25 
 
 
334 aa  51.2  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3878  membrane lipoprotein lipid attachment site  22.45 
 
 
339 aa  51.6  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1529  putative substrate-binding component of ABC transporter  23.4 
 
 
348 aa  51.6  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2312  putative sulfonate ABC transporter, sulfonate-binding protein  24.43 
 
 
328 aa  50.8  0.00003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.355114  hitchhiker  0.0000000431055 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34350  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, periplasmic component  23.47 
 
 
297 aa  50.8  0.00003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0117  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  25.19 
 
 
347 aa  50.8  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3571  ABC transporter, substrate-binding protein, aliphatic sulphonates  25.82 
 
 
357 aa  50.4  0.00004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0925  NMT1/THI5 like domain protein  32.86 
 
 
311 aa  50.1  0.00005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0676609  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2165  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, periplasmic ligand binding protein  24.81 
 
 
345 aa  50.1  0.00005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>