More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_0532 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_0532  hypothetical protein  100 
 
 
303 aa  582  1.0000000000000001e-165  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2674  hypothetical protein  35.59 
 
 
301 aa  141  9.999999999999999e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4000  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.43 
 
 
306 aa  119  4.9999999999999996e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0808  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.19 
 
 
324 aa  118  9.999999999999999e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2409  hypothetical protein  29.18 
 
 
288 aa  117  1.9999999999999998e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.517139  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2089  hypothetical protein  29.55 
 
 
304 aa  113  4.0000000000000004e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.920786  normal  0.915824 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0444  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.57 
 
 
324 aa  110  3e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2061  hypothetical protein  32.51 
 
 
305 aa  108  1e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.359774  normal  0.0842357 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0568  DMT superfamily drug/metabolite efflux pump  30.9 
 
 
311 aa  108  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0349448  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5882  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.89 
 
 
299 aa  106  6e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0661  hypothetical protein  34.83 
 
 
365 aa  103  3e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36480  DMT(drug/metabolite transporter) superfamily permease  32.2 
 
 
316 aa  103  4e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.171631  normal  0.909358 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2873  hypothetical protein  30.8 
 
 
298 aa  101  1e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.604973  normal  0.0800404 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1054  hypothetical protein  33.58 
 
 
306 aa  100  3e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.378299  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33450  membrane protein  32.38 
 
 
314 aa  100  4e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.284433 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0972  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.85 
 
 
306 aa  100  4e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.032769  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1995  O-acetylserine/cysteine export protein  34.84 
 
 
299 aa  99  9e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.787719  normal  0.155418 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63190  hypothetical protein  37.01 
 
 
297 aa  98.6  1e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0057  hypothetical protein  31.58 
 
 
303 aa  97.1  3e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1118  hypothetical protein  32.97 
 
 
305 aa  96.7  5e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.65286  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1606  hypothetical protein  33.87 
 
 
298 aa  96.3  5e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.627423 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2401  hypothetical protein  29.45 
 
 
296 aa  95.9  7e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2545  hypothetical protein  29.45 
 
 
296 aa  95.1  1e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2380  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.84 
 
 
324 aa  94  2e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3217  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.39 
 
 
293 aa  94  3e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.182093  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4262  hypothetical protein  29.37 
 
 
298 aa  92.4  8e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.896317 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2147  O-acetylserine/cysteine export protein  32.06 
 
 
299 aa  91.7  1e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.758199  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1085  DMT superfamliy efflux pump  26.62 
 
 
312 aa  91.7  1e-17  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.164203 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2113  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.71 
 
 
299 aa  90.5  3e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000340267  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5501  hypothetical protein  37.14 
 
 
297 aa  90.5  3e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.413095  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3681  hypothetical protein  27.18 
 
 
297 aa  90.9  3e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.60204  normal  0.770543 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1741  O-acetylserine/cysteine export protein  31.6 
 
 
299 aa  90.1  4e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.457568  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2125  O-acetylserine/cysteine export protein  31.6 
 
 
299 aa  90.1  4e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.290399  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1622  O-acetylserine/cysteine export protein  31.6 
 
 
299 aa  90.1  4e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00179242  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2564  hypothetical protein  32.23 
 
 
292 aa  90.1  4e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1953  hypothetical protein  32.23 
 
 
293 aa  89.7  5e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0201428  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0363  hypothetical protein  32.62 
 
 
294 aa  89.7  6e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.1109  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2499  putative transporter  32.62 
 
 
294 aa  89.7  6e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0112  putative transporter  32.62 
 
 
294 aa  89.7  6e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0697635  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0663  putative transporter  32.62 
 
 
294 aa  89.7  6e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.391495  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2588  hypothetical protein  32.23 
 
 
293 aa  89.4  7e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0344975  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0732  hypothetical protein  31.11 
 
 
343 aa  89  9e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0721  hypothetical protein  30.8 
 
 
294 aa  89  9e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0361886  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0354  hypothetical protein  26.18 
 
 
307 aa  89  9e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01492  cysteine and O-acetyl-L-serine efflux system  31.25 
 
 
299 aa  88.6  1e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0660711  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2872  hypothetical protein  31.07 
 
 
326 aa  88.6  1e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5896  hypothetical protein  32.36 
 
 
321 aa  88.6  1e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.557426 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01503  hypothetical protein  31.25 
 
 
299 aa  88.6  1e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0763437  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1631  O-acetylserine/cysteine export protein  31.71 
 
 
299 aa  89  1e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0826395  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2910  hypothetical protein  31.07 
 
 
294 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.743017  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0905  putative transporter  32.26 
 
 
294 aa  87.8  2e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2817  hypothetical protein  31.07 
 
 
294 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.813656  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0908  putative transporter  32.26 
 
 
294 aa  87.8  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0518  hypothetical protein  29.2 
 
 
293 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2539  hypothetical protein  30.71 
 
 
300 aa  84  0.000000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.662204  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1376  hypothetical protein  26.21 
 
 
318 aa  84  0.000000000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2376  hypothetical protein  31.43 
 
 
295 aa  83.6  0.000000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0860299  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0925  hypothetical protein  26.57 
 
 
304 aa  83.2  0.000000000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.986628  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0239  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.07 
 
 
296 aa  81.6  0.00000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1818  O-acetylserine/cysteine export protein  30.2 
 
 
300 aa  81.3  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1630  O-acetylserine/cysteine export protein  30.2 
 
 
299 aa  80.9  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1622  O-acetylserine/cysteine export protein  30.2 
 
 
300 aa  80.9  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1653  O-acetylserine/cysteine export protein  30.2 
 
 
299 aa  80.9  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00898793  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0228  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.35 
 
 
296 aa  80.1  0.00000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6025  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.34 
 
 
319 aa  80.5  0.00000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.32908  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3131  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.73 
 
 
295 aa  79.3  0.00000000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1689  O-acetylserine/cysteine export protein  29.87 
 
 
300 aa  79.3  0.00000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3459  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.75 
 
 
295 aa  78.6  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.171474  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3679  putative integral membrane protein  32.85 
 
 
301 aa  77.8  0.0000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.998633  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3173  hypothetical protein  32.58 
 
 
297 aa  77  0.0000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.846514  normal  0.1324 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0075  hypothetical protein  25.09 
 
 
294 aa  77  0.0000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2340  hypothetical protein  28.57 
 
 
303 aa  76.3  0.0000000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3898  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.54 
 
 
300 aa  75.9  0.0000000000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2647  hypothetical protein  25.78 
 
 
298 aa  75.5  0.0000000000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.176077 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2552  hypothetical protein  26.92 
 
 
293 aa  75.1  0.000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1080  hypothetical protein  29.43 
 
 
300 aa  75.1  0.000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3425  hypothetical protein  29.45 
 
 
297 aa  74.3  0.000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2612  hypothetical protein  33.82 
 
 
322 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2483  hypothetical protein  33.82 
 
 
293 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0867101 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3261  hypothetical protein  29.6 
 
 
308 aa  73.2  0.000000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.923223 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0745  DMT superfamily drug/metabolite efflux pump  30.22 
 
 
300 aa  72.4  0.000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3391  membrane protein  27.17 
 
 
300 aa  72  0.00000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.483764  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5105  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.6 
 
 
349 aa  70.1  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.910123  normal  0.400388 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3034  hypothetical protein  29.79 
 
 
298 aa  70.1  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.317947  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4020  DMT family permease  30.82 
 
 
330 aa  69.7  0.00000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000861601  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4164  hypothetical protein  25.86 
 
 
298 aa  69.3  0.00000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1125  hypothetical protein  27.34 
 
 
310 aa  69.3  0.00000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.837099 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2143  putative transmembrane protein  30.96 
 
 
302 aa  67.8  0.0000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3033  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.11 
 
 
286 aa  67.8  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0835297  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0519  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.03 
 
 
307 aa  67.8  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7634  DMT family permease  28.93 
 
 
317 aa  67  0.0000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.48827 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4763  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.62 
 
 
314 aa  67.4  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2545  hypothetical protein  29.6 
 
 
299 aa  67  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.281765  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3309  hypothetical protein  35.25 
 
 
316 aa  66.6  0.0000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.249061  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2022  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.87 
 
 
312 aa  66.2  0.0000000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0230  hypothetical protein  29.82 
 
 
299 aa  66.2  0.0000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.331874 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0519  hypothetical protein  28.47 
 
 
301 aa  65.9  0.0000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0144274 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2049  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.71 
 
 
308 aa  65.9  0.0000000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.172716 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1917  permease of the drug/metabolite transporter  25.15 
 
 
364 aa  65.9  0.0000000009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0216  hypothetical protein  28.62 
 
 
296 aa  65.1  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.030228  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>