More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_0199 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007514  Cag_0199  glucokinase, putative  100 
 
 
326 aa  667    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0335  ROK family protein  63.5 
 
 
327 aa  399  9.999999999999999e-111  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2184  ROK family protein  60.24 
 
 
328 aa  379  1e-104  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000268105  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2372  ROK family protein  60.24 
 
 
332 aa  370  1e-101  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.26662  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0225  glucokinase, putative  57.36 
 
 
329 aa  335  7e-91  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2241  ROK family protein  54.29 
 
 
330 aa  320  3e-86  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2015  ROK family protein  52.94 
 
 
330 aa  313  3.9999999999999997e-84  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.217755 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1690  ROK family protein  42.11 
 
 
332 aa  252  7e-66  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4056  ROK family protein  33.85 
 
 
302 aa  160  3e-38  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1116  ROK family protein  31.08 
 
 
320 aa  159  6e-38  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0146441  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2875  ROK domain-containing protein  32.82 
 
 
303 aa  159  7e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0985025 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3865  glucokinase  32.02 
 
 
347 aa  158  2e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3092  glucokinase  35.26 
 
 
352 aa  155  8e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5352  ROK family protein  33.54 
 
 
298 aa  154  2e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0049  ROK family glucokinase  29.48 
 
 
315 aa  154  2e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00642511  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16050  glucokinase  32.11 
 
 
322 aa  154  2.9999999999999998e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0018  ROK family protein  30.49 
 
 
321 aa  153  4e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0097  ROK family protein  29.81 
 
 
319 aa  152  5.9999999999999996e-36  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0832  glucokinase  34.16 
 
 
315 aa  151  1e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.618047 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3649  ROK family protein  31.78 
 
 
297 aa  151  1e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0076  putative glucokinase  31.82 
 
 
315 aa  152  1e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0098  glucose kinase  31.82 
 
 
315 aa  152  1e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2309  glucokinase  31.99 
 
 
323 aa  151  1e-35  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00114411  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3703  ROK family protein  31.78 
 
 
297 aa  151  1e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.428812  normal  0.261316 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2265  ROK  31.37 
 
 
311 aa  147  3e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1856  NagC family Transcriptional regulator  32.82 
 
 
316 aa  145  7.0000000000000006e-34  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2512  ROK family protein  35.69 
 
 
340 aa  145  8.000000000000001e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.615457  normal  0.876353 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1566  ROK family protein  31.91 
 
 
322 aa  144  2e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4867  ROK family protein  30.96 
 
 
389 aa  143  3e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5161  glucokinase, ROK family  31.89 
 
 
342 aa  143  4e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.515306 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2754  ROK family protein  34.06 
 
 
332 aa  142  6e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3188  ROK family protein  29.45 
 
 
318 aa  142  9.999999999999999e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00496766  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2550  ROK family protein  30.53 
 
 
297 aa  140  3e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1441  glucokinase, ROK family  30.56 
 
 
314 aa  140  3.9999999999999997e-32  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.255203  normal  0.184628 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1825  ROK family glucokinase  35.2 
 
 
323 aa  139  8.999999999999999e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.064318  normal  0.188614 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0046  glucokinase  29.19 
 
 
335 aa  139  8.999999999999999e-32  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00210983  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0049  ROK family protein  30.91 
 
 
336 aa  138  1e-31  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.331576  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6562  ROK family protein  30.58 
 
 
321 aa  138  1e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_49  transcriptional regulator/sugar kinase  30.6 
 
 
334 aa  137  2e-31  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0340377  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1217  ROK family protein  27.1 
 
 
316 aa  137  2e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0086  glucokinase, ROK family  37.12 
 
 
313 aa  136  4e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2075  ROK family protein  32 
 
 
328 aa  136  4e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000214155  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0195  glucokinase, ROK family  36.7 
 
 
317 aa  136  5e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1094  ROK family protein  30.86 
 
 
332 aa  135  8e-31  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.000124678  hitchhiker  0.000000000129961 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2111  xylose repressor  31.89 
 
 
302 aa  135  9.999999999999999e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.044241  normal  0.767119 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2991  ROK family glucokinase  33.64 
 
 
327 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.922063  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2069  glucokinase, ROK family  31.37 
 
 
315 aa  134  1.9999999999999998e-30  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.222452  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5226  ROK family protein  30.37 
 
 
321 aa  133  3.9999999999999996e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.515111  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1363  ROK family protein  30.75 
 
 
314 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0520337  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1323  ROK family protein  30.75 
 
 
314 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000170604  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0992  ROK family glucokinase  26.88 
 
 
312 aa  129  5.0000000000000004e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0037  ROK family protein  27.02 
 
 
317 aa  129  7.000000000000001e-29  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3960  ROK family protein  30.46 
 
 
302 aa  129  9.000000000000001e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.884061  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4283  glucokinase  33.33 
 
 
327 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4343  glucokinase  33.33 
 
 
327 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0471  glucokinase  33.44 
 
 
322 aa  127  2.0000000000000002e-28  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4165  glucokinase  33.33 
 
 
327 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.131693  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4004  glucokinase  33.33 
 
 
327 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4014  glucokinase  33.33 
 
 
327 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0552724  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4487  glucokinase  33.33 
 
 
327 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.693624  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4377  glucokinase  33.33 
 
 
327 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0857  glucokinase  33.33 
 
 
327 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4396  glucokinase  33.33 
 
 
327 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1821  ROK family protein  30.67 
 
 
318 aa  127  3e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0661  ROK family protein  32.41 
 
 
321 aa  126  6e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0887  N-acylmannosamine kinase  29.05 
 
 
317 aa  125  7e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8260  ROK family protein  30.98 
 
 
393 aa  125  7e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00405696 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1197  ROK family protein  29.66 
 
 
314 aa  125  7e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4116  ROK family glucokinase  33.02 
 
 
327 aa  125  9e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0552  glucokinase, ROK family  30.86 
 
 
316 aa  125  1e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4339  glucokinase  29.75 
 
 
316 aa  125  1e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0920  glucokinase  31.97 
 
 
323 aa  125  1e-27  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.635044  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1181  ROK family protein  31.03 
 
 
336 aa  125  1e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1875  glucokinase  28.88 
 
 
302 aa  124  2e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.173781  hitchhiker  0.00131381 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2378  glucokinase, ROK family  33.33 
 
 
318 aa  124  3e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0273  glucokinase  32.3 
 
 
361 aa  123  5e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.878639  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0329  ROK family glucokinase  35.08 
 
 
312 aa  123  5e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1507  ROK (repressor, ORF, kinase) family protein  33.33 
 
 
319 aa  121  9.999999999999999e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000453151  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3047  glucokinase, ROK family  32.61 
 
 
315 aa  122  9.999999999999999e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00154361  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0088  ROK family protein  27.47 
 
 
313 aa  121  1.9999999999999998e-26  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0217  ROK family protein  28.62 
 
 
395 aa  120  3e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1061  ROK family glucokinase  27.59 
 
 
312 aa  120  3e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.204957  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5489  ROK family protein  30.82 
 
 
321 aa  120  3e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.269543 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1760  ROK family protein  30.03 
 
 
425 aa  120  3e-26  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.533551  normal  0.0181472 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5156  ROK family protein  30.86 
 
 
304 aa  120  3e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00561428  normal  0.212192 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0259  transcriptional regulator  31.11 
 
 
336 aa  120  4.9999999999999996e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1141  ROK family protein  27.33 
 
 
308 aa  119  4.9999999999999996e-26  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2885  ROK family protein  29.97 
 
 
409 aa  119  6e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0894  ROK family protein  27.91 
 
 
300 aa  119  6e-26  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4562  ROK family protein  26.6 
 
 
414 aa  119  7e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3238  putative glucokinase, ROK family  33.13 
 
 
360 aa  119  7.999999999999999e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0755996  normal  0.0350926 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0770  glucose kinase  32.22 
 
 
322 aa  119  9e-26  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000145403  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0676  glucokinase  30.31 
 
 
321 aa  118  9.999999999999999e-26  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0799  glucokinase, ROK family  25.31 
 
 
317 aa  118  9.999999999999999e-26  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3275  ROK family protein  28.21 
 
 
372 aa  119  9.999999999999999e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.545553  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1308  ROK family glucokinase  32.81 
 
 
313 aa  118  1.9999999999999998e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.301963  normal  0.189583 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2133  ROK family protein  27.69 
 
 
417 aa  117  3e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000789832 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16120  glucokinase  30.86 
 
 
320 aa  117  3e-25  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0534228  normal  0.671814 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1639  glucokinase  33.44 
 
 
324 aa  117  3e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00474414  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1326  ROK family protein  30.49 
 
 
306 aa  117  3e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0533007  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>