More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_0179 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU0541  DNA polymerase I  41.33 
 
 		 891 aa  669    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1794  DNA polymerase type I  42.17 
 
 		 926 aa  684    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2573  DNA polymerase I  41.26 
 
 		 906 aa  643    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1092  DNA polymerase I  40 
 
 		 932 aa  658    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.416306  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3902  DNA polymerase I  40.75 
 
 		 892 aa  654    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000292646  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1172  DNA polymerase I  42.87 
 
 		 893 aa  697    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0113  DNA polymerase I  41.11 
 
 		 896 aa  645    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0099  DNA polymerase I  41.36 
 
 		 896 aa  646    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1283  DNA polymerase I  42.84 
 
 		 893 aa  702    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1688  DNA polymerase I  39.75 
 
 		 940 aa  648    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0592  DNA polymerase I  42.61 
 
 		 891 aa  695    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000108203  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1645  DNA polymerase A  63.64 
 
 		 945 aa  1191    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0540  DNA polymerase I  59.24 
 
 		 936 aa  1087    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.560108  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0179  DNA polymerase A  100 
 
 		 924 aa  1906    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2983  DNA polymerase I  41.56 
 
 		 892 aa  639    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1096  DNA polymerase I  40.13 
 
 		 963 aa  668    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0889452  normal  0.949667 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0473  DNA polymerase I  62.16 
 
 		 943 aa  1158    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0494  DNA polymerase I  59.09 
 
 		 950 aa  1084    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.958979 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0227  DNA polymerase I  41.02 
 
 		 934 aa  643    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.774927  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0323  hypothetical protein  40.41 
 
 		 936 aa  673    Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.875781 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0346  DNA polymerase I  40.3 
 
 		 892 aa  642    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.335360000000001e-24 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0655  DNA polymerase I  64.83 
 
 		 944 aa  1219    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0712  DNA polymerase I  40 
 
 		 939 aa  675    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00016  DNA polymerase I  39.83 
 
 		 930 aa  652    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3657  DNA polymerase I  41.14 
 
 		 946 aa  681    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2421  DNA polymerase I  40.45 
 
 		 904 aa  645    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0819967  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4214  DNA polymerase I  40.93 
 
 		 939 aa  701    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.305733  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0365  DNA polymerase I  40.3 
 
 		 892 aa  646    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1617  DNA polymerase I  39 
 
 		 949 aa  665    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.310116  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2798  DNA polymerase I  42.03 
 
 		 888 aa  659    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3261  DNA polymerase I  39.94 
 
 		 911 aa  641    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.155363 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1349  DNA polymerase I  42.54 
 
 		 924 aa  714    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.38206  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2835  DNA polymerase I  41.73 
 
 		 893 aa  674    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.333743  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0536  DNA polymerase I  59.42 
 
 		 946 aa  1122    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02590  DNA polymerase I  39.28 
 
 		 956 aa  657    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3941  DNA polymerase I  41.66 
 
 		 924 aa  635  1e-180  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0554  DNA polymerase A  40.58 
 
 		 903 aa  634  1e-180  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.266566  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0044  DNA polymerase I  39.49 
 
 		 939 aa  632  1e-180  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00167336  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4419  DNA polymerase I  40.02 
 
 		 915 aa  634  1e-180  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.251272  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0087  DNA polymerase I  39.72 
 
 		 903 aa  632  1e-180  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2409  DNA polymerase I  39.09 
 
 		 934 aa  631  1e-179  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000078353  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2573  DNA polymerase I  40.45 
 
 		 892 aa  629  1e-179  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000431166  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0015  DNA polymerase I  38.84 
 
 		 928 aa  631  1e-179  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.853211  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1938  DNA polymerase I  40.11 
 
 		 945 aa  629  1e-178  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.632824  normal  0.0549057 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0319  DNA polymerase I  40.02 
 
 		 926 aa  628  1e-178  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0073  DNA polymerase I  39.64 
 
 		 926 aa  627  1e-178  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.800167  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0548  DNA polymerase I  39.45 
 
 		 928 aa  626  1e-178  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.965006  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0353  DNA polymerase I  40.02 
 
 		 926 aa  628  1e-178  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1500  DNA polymerase I  40.02 
 
 		 926 aa  628  1e-178  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.530484  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1696  DNA polymerase I  40.02 
 
 		 926 aa  628  1e-178  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4517  DNA polymerase I  39.37 
 
 		 929 aa  622  1e-177  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.21603  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4227  DNA polymerase I  39.6 
 
 		 929 aa  625  1e-177  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0477521  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0096  DNA-directed DNA polymerase  39.79 
 
 		 933 aa  624  1e-177  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00741762  hitchhiker  0.000000822051 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0605  DNA polymerase I  39.58 
 
 		 926 aa  625  1e-177  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.503998  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2860  DNA polymerase I  39.57 
 
 		 912 aa  624  1e-177  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.129264  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2546  DNA polymerase I  39.81 
 
 		 923 aa  624  1e-177  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.809446  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4827  DNA polymerase I  40.28 
 
 		 917 aa  624  1e-177  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.00421235  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1711  DNA polymerase I  39.7 
 
 		 943 aa  619  1e-176  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.338945  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2403  DNA polymerase I  39.81 
 
 		 923 aa  622  1e-176  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0851  DNA polymerase I  39.81 
 
 		 923 aa  622  1e-176  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.280687  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6788  DNA polymerase I  40.45 
 
 		 913 aa  621  1e-176  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0147599  hitchhiker  0.00000170009 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0718  DNA polymerase I  37.71 
 
 		 951 aa  620  1e-176  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3967  DNA polymerase I  39.33 
 
 		 931 aa  620  1e-176  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.000137661  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1612  DNA polymerase I  40.28 
 
 		 902 aa  621  1e-176  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03749  DNA polymerase I  40.19 
 
 		 928 aa  617  1e-175  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.000312835  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4123  DNA polymerase I  40.19 
 
 		 928 aa  617  1e-175  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000018502  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001917  DNA polymerase I  39.6 
 
 		 928 aa  615  1e-175  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000349897  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4152  DNA polymerase I  40.19 
 
 		 928 aa  617  1e-175  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000213441  hitchhiker  0.000146367 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3813  DNA polymerase I  40.66 
 
 		 939 aa  617  1e-175  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.273799  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0093  DNA-directed DNA polymerase  39.43 
 
 		 923 aa  617  1e-175  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00183207  normal  0.0262318 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00572  DNA polymerase I  39.64 
 
 		 930 aa  618  1e-175  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4337  DNA polymerase I  40.19 
 
 		 928 aa  617  1e-175  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  0.0000000000947993  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4246  DNA polymerase I  40.19 
 
 		 928 aa  615  1e-175  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000118244  normal  0.166094 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5306  DNA polymerase I  40.19 
 
 		 928 aa  617  1e-175  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.0000330989  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4382  DNA polymerase I  40.19 
 
 		 928 aa  617  1e-175  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000170331  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1429  DNA polymerase I  39.07 
 
 		 942 aa  617  1e-175  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0044  DNA polymerase I  40.26 
 
 		 911 aa  615  1e-175  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.812891  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03698  hypothetical protein  40.19 
 
 		 928 aa  617  1e-175  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.000500829  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4164  DNA polymerase I  39.07 
 
 		 928 aa  616  1e-175  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0170728  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3185  fused DNA polymerase 5'->3' exonuclease and 3'->5' polymerase and 3'->5' exonuclease  38.93 
 
 		 938 aa  615  1e-175  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.994376  normal  0.149667 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4978  DNA polymerase I  39.1 
 
 		 936 aa  612  9.999999999999999e-175  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0163  DNA polymerase A  39.89 
 
 		 906 aa  613  9.999999999999999e-175  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2218  DNA polymerase I  40.45 
 
 		 917 aa  615  9.999999999999999e-175  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0060  DNA polymerase I  38.05 
 
 		 945 aa  612  9.999999999999999e-175  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0959551  hitchhiker  0.000000934143 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4088  DNA polymerase I  40.08 
 
 		 928 aa  614  9.999999999999999e-175  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000478192  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0358  DNA polymerase I  40.38 
 
 		 910 aa  615  9.999999999999999e-175  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.681988  normal  0.0403702 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2834  DNA polymerase I  39.81 
 
 		 913 aa  613  9.999999999999999e-175  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4290  DNA polymerase I  38.3 
 
 		 921 aa  609  1e-173  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000095151  hitchhiker  0.000000056057 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3906  DNA polymerase I  38.4 
 
 		 922 aa  612  1e-173  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000887796  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3655  DNA polymerase I  40.21 
 
 		 917 aa  611  1e-173  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.498636  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4231  DNA polymerase I  39.49 
 
 		 928 aa  610  1e-173  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.000000696994  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2846  DNA polymerase I  39.42 
 
 		 943 aa  610  1e-173  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.411951  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4345  DNA polymerase I  38.19 
 
 		 935 aa  610  1e-173  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000790678  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0568  DNA polymerase I  39.29 
 
 		 905 aa  610  1e-173  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4327  DNA polymerase I  39.45 
 
 		 928 aa  610  1e-173  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.44762 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3769  DNA polymerase I  40.11 
 
 		 917 aa  611  1e-173  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.662383  hitchhiker  0.00614094 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4210  DNA polymerase I  39.45 
 
 		 928 aa  610  1e-173  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.0026674  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4493  DNA polymerase I  40.21 
 
 		 917 aa  611  1e-173  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4388  DNA polymerase I  39.55 
 
 		 928 aa  611  1e-173  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00514081  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3872  DNA polymerase I  40.21 
 
 		 917 aa  611  1e-173  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>