More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_7420 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_7420  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
503 aa  955    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.0090372  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2021  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50.2 
 
 
522 aa  368  1e-100  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0398286  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1591  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.58 
 
 
518 aa  362  9e-99  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.543872  normal  0.457937 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5339  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50.71 
 
 
509 aa  344  2e-93  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.992663  normal  0.953855 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4938  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.78 
 
 
521 aa  344  2.9999999999999997e-93  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000107301 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4762  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.08 
 
 
521 aa  342  7e-93  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.109676  normal  0.504386 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4882  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.99 
 
 
521 aa  342  9e-93  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2027  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.35 
 
 
526 aa  333  5e-90  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1981  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.35 
 
 
526 aa  333  5e-90  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0924311  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1961  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.14 
 
 
526 aa  332  1e-89  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.80009  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62010  putative iron ABC transporter, permease protein  46.15 
 
 
512 aa  328  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0428593 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0606  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.54 
 
 
536 aa  323  4e-87  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0530  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  46.36 
 
 
521 aa  322  9.999999999999999e-87  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.162719 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4672  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.15 
 
 
521 aa  320  3e-86  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.548778 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3649  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.59 
 
 
500 aa  313  4.999999999999999e-84  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.974086  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2838  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  43.53 
 
 
531 aa  310  5e-83  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4827  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.61 
 
 
534 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.232577  normal  0.0312056 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2857  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.95 
 
 
536 aa  305  9.000000000000001e-82  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.145655  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1836  ABC Fe+3 transporter, inner membrane subunit  45.4 
 
 
534 aa  305  9.000000000000001e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.374127  normal  0.533271 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2520  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.12 
 
 
530 aa  303  3.0000000000000004e-81  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.034918  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3782  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.24 
 
 
526 aa  295  1e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.865045 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1349  iron(III) ABC transporter, permease protein  42.86 
 
 
528 aa  293  6e-78  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1462  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.86 
 
 
528 aa  292  7e-78  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2711  iron(III)-transport system permease  42.86 
 
 
528 aa  292  1e-77  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0924971  normal  0.0430816 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5749  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.07 
 
 
533 aa  291  1e-77  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.97601 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1430  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.67 
 
 
511 aa  289  7e-77  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000545483 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8129  iron ABC transporter, permease protein  45.44 
 
 
502 aa  289  7e-77  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.161316 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3949  ABC Fe3+ transporter, inner membrane subunit  47.05 
 
 
532 aa  288  1e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.305187  normal  0.0483056 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2429  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.55 
 
 
527 aa  285  1.0000000000000001e-75  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4111  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.87 
 
 
526 aa  285  1.0000000000000001e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.43356  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0735  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.77 
 
 
530 aa  282  1e-74  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06270  ABC-type Fe3+ transport system, permease component  43.42 
 
 
515 aa  281  2e-74  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0952696  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2535  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.14 
 
 
527 aa  278  1e-73  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.604854  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6135  ABC transporter membrane spanning protein  38.49 
 
 
513 aa  269  7e-71  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1665  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.71 
 
 
515 aa  265  1e-69  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000100634  normal  0.0519495 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2417  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.46 
 
 
536 aa  260  4e-68  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0253396  normal  0.609444 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1174  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.64 
 
 
528 aa  254  2.0000000000000002e-66  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3362  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.75 
 
 
511 aa  254  3e-66  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.269197  normal  0.697364 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1358  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.13 
 
 
525 aa  253  8.000000000000001e-66  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.41308  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2920  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.72 
 
 
525 aa  249  6e-65  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.905105  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2293  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.79 
 
 
557 aa  242  1e-62  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1721  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.47 
 
 
530 aa  241  2e-62  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.353247  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2889  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.24 
 
 
543 aa  240  4e-62  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2271  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.09 
 
 
523 aa  238  2e-61  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000425777 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3092  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.44 
 
 
514 aa  236  6e-61  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.923953  normal  0.633646 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2276  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.67 
 
 
541 aa  228  2e-58  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3172  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.92 
 
 
540 aa  221  3e-56  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1463  ABC transporter related protein  35.5 
 
 
1057 aa  199  7e-50  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1924  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.62 
 
 
540 aa  195  2e-48  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0167  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.53 
 
 
536 aa  185  2.0000000000000003e-45  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.556719  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2723  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.35 
 
 
530 aa  175  1.9999999999999998e-42  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.5168 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0122  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.17 
 
 
559 aa  174  2.9999999999999996e-42  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6602  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.2 
 
 
530 aa  171  3e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.442605 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0134  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.9 
 
 
558 aa  162  1e-38  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0921183  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1875  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.56 
 
 
545 aa  161  3e-38  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0741  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.42 
 
 
550 aa  155  2e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1481  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.39 
 
 
557 aa  153  5e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.673481  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00163  putative ABC-type transport system, permease component  33.26 
 
 
507 aa  149  9e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.452019  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1797  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.06 
 
 
557 aa  149  1.0000000000000001e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.406299 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0163  putative iron(III) ABC transporter, fused inner membrane subunits  33.26 
 
 
557 aa  149  1.0000000000000001e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002575  ferric iron ABC transporter permease protein  27.85 
 
 
541 aa  148  2.0000000000000003e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.500484  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0782  iron-uptake permease inner membrane protein  26.36 
 
 
555 aa  144  4e-33  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.297135  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3753  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.06 
 
 
554 aa  144  4e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.104442 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2575  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.45 
 
 
568 aa  144  5e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0287363 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0454  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.62 
 
 
562 aa  143  6e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.587106  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03434  hypothetical protein  27.57 
 
 
541 aa  143  7e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0177  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.17 
 
 
553 aa  143  8e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.445803 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1198  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  31.47 
 
 
545 aa  142  9.999999999999999e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0551  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.42 
 
 
567 aa  141  1.9999999999999998e-32  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0768  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  31.73 
 
 
558 aa  140  4.999999999999999e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1189  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.27 
 
 
549 aa  140  6e-32  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.217598  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2094  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.77 
 
 
562 aa  139  1e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1597  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.73 
 
 
528 aa  139  1e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1092  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.17 
 
 
558 aa  137  4e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2589  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.17 
 
 
546 aa  136  9e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.677105  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4446  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.57 
 
 
550 aa  135  9.999999999999999e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0298  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.88 
 
 
589 aa  134  3e-30  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0166577  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0997  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.26 
 
 
543 aa  134  3e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000511547 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0116  iron ABC transporter, permease protein  25.35 
 
 
518 aa  134  5e-30  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1381  iron ABC transporter permease  31.64 
 
 
570 aa  134  5e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1530  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.9 
 
 
550 aa  134  5e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.714891  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1182  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.74 
 
 
565 aa  133  9e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.086066  normal  0.404722 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1510  ABC transporter, permease protein  31.63 
 
 
570 aa  133  9e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.896954  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1181  iron ABC transporter permease  31.63 
 
 
570 aa  133  9e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.881727  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0689  iron ABC transporter permease  31.63 
 
 
570 aa  133  9e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.000577033  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0463  iron ABC transporter permease  31.63 
 
 
570 aa  133  9e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0729  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.25 
 
 
562 aa  133  9e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1209  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.25 
 
 
562 aa  133  9e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.193935  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1377  iron ABC transporter permease  32.18 
 
 
570 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.300501  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4317  ABC spermidine/putrescine transporter, inner membrane subunit  30.37 
 
 
562 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.946485  normal  0.426161 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0169  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.79 
 
 
566 aa  132  1.0000000000000001e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1778  iron compound ABC transporter, permease protein, putative  31.48 
 
 
568 aa  132  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.370129  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0894  ABC-type transport system, permease component  29.75 
 
 
553 aa  132  2.0000000000000002e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000205423  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2857  iron compound ABC transporter, permease protein, putative  30.86 
 
 
548 aa  131  3e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.133702  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0441  putative iron ABC transporter, permease protein  23.53 
 
 
533 aa  131  3e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.388151  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0138  iron(III) ABC transporter, permease protein  28.35 
 
 
541 aa  130  6e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000182315  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1092  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.22 
 
 
558 aa  130  6e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.867638  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3763  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.38 
 
 
582 aa  130  7.000000000000001e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1345  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.32 
 
 
506 aa  130  8.000000000000001e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.48497  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4632  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.38 
 
 
548 aa  129  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.62056  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>