More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_5418 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_5418  transcriptional regulator, ArsR family  100 
 
 		 124 aa  253  4e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.697465 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8614  transcriptional regulator, ArsR family  74.36 
 
 		 123 aa  178  2e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00781131  normal  0.130567 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2949  regulatory protein, ArsR  61.16 
 
 		 126 aa  144  4.0000000000000006e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.394398  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02010  transcriptional regulator, ArsR family  58.72 
 
 		 125 aa  130  6e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0435  ArsR family transcriptional regulator  61.54 
 
 		 123 aa  129  1.0000000000000001e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1556  ArsR family transcriptional regulator  58.65 
 
 		 125 aa  129  2.0000000000000002e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.157609  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0345  ArsR family transcriptional regulator  56.19 
 
 		 127 aa  123  7e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3423  transcriptional regulator, ArsR family  58.59 
 
 		 119 aa  121  3e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3175  ArsR family transcriptional regulator  59.06 
 
 		 126 aa  121  3e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.164371  hitchhiker  0.000124748 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0222  transcriptional regulator, ArsR family  54.21 
 
 		 116 aa  120  5e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1722  transcriptional regulator, ArsR family  54.24 
 
 		 116 aa  120  9e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.416614 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1658  regulatory protein, ArsR  59.34 
 
 		 183 aa  116  9.999999999999999e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.214352  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0126  regulatory protein, ArsR  55.45 
 
 		 125 aa  114  5e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5422  transcriptional regulator, ArsR family  54.55 
 
 		 112 aa  114  6.9999999999999995e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.424313 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2695  regulatory protein ArsR  57.14 
 
 		 123 aa  113  8.999999999999998e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.260827  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4496  putative transcriptional regulator, ArsR family  51.52 
 
 		 113 aa  113  1.0000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.698258  normal  0.92567 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1441  ArsR family transcriptional regulator  53.7 
 
 		 120 aa  112  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.541049 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0131  ArsR family transcriptional regulator  54.46 
 
 		 125 aa  112  2.0000000000000002e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000212185 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2685  regulatory protein ArsR  55.91 
 
 		 120 aa  111  3e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0240981  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0794  regulatory protein ArsR  56.99 
 
 		 120 aa  111  4.0000000000000004e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3223  regulatory protein, ArsR  51.64 
 
 		 122 aa  110  6e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.741691  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4155  transcriptional regulator, ArsR family  56.67 
 
 		 104 aa  110  7.000000000000001e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12660  ArsR family transcriptional regulator  56.7 
 
 		 126 aa  109  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000762014  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4967  putative transcriptional regulator, ArsR family  54.64 
 
 		 115 aa  109  1.0000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.968943  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8609  transcriptional regulator, ArsR family  54.55 
 
 		 118 aa  108  2.0000000000000002e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0122509  normal  0.498066 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4613  ArsR family transcriptional regulator  52.48 
 
 		 120 aa  107  8.000000000000001e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.296682 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4499  putative transcriptional regulator, ArsR family  63.29 
 
 		 105 aa  103  5e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4523  ArsR family transcriptional regulator  52.75 
 
 		 125 aa  101  4e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4610  ArsR family transcriptional regulator  52.75 
 
 		 125 aa  101  4e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0501  regulatory protein ArsR  50 
 
 		 127 aa  101  4e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0567681  normal  0.0228507 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4906  ArsR family transcriptional regulator  52.75 
 
 		 125 aa  101  4e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0563  ArsR family transcriptional regulator  49.49 
 
 		 132 aa  100  5e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0211  ArsR family transcriptional regulator  50.5 
 
 		 125 aa  100  5e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1856  transcriptional regulator, ArsR family  47.57 
 
 		 137 aa  100  5e-21  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3347  transcriptional regulator, ArsR family  50 
 
 		 120 aa  99.4  1e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6418  transcriptional regulator, ArsR family  50 
 
 		 124 aa  99.4  2e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4723  transcriptional regulator, ArsR family  44.34 
 
 		 131 aa  99.4  2e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.383157  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3375  transcriptional regulator, ArsR family  45.22 
 
 		 129 aa  98.2  3e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0206443  hitchhiker  0.00373778 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2665  transcriptional regulator, ArsR family  47.06 
 
 		 127 aa  98.6  3e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.374254  normal  0.232487 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0590  transcriptional regulator, ArsR family  45 
 
 		 117 aa  98.6  3e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.506747 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3742  ArsR family transcriptional regulator  44.25 
 
 		 116 aa  97.8  4e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.102941  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14690  transcriptional regulator, ArsR family  48.04 
 
 		 116 aa  97.8  4e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2662  transcriptional regulator, ArsR family  47.71 
 
 		 337 aa  96.7  9e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.459906 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14660  protein-tyrosine-phosphatase  48.15 
 
 		 336 aa  95.5  2e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0384  transcriptional regulator, ArsR family  48.48 
 
 		 127 aa  95.1  3e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3657  transcriptional regulator, ArsR family  45.1 
 
 		 127 aa  93.2  1e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3239  ArsR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 136 aa  92.8  1e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.366453 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3653  transcriptional regulator, ArsR family  50 
 
 		 347 aa  92  3e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0388  transcriptional regulator, ArsR family  51.25 
 
 		 349 aa  90.9  5e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3217  regulatory protein, ArsR  48.86 
 
 		 95 aa  90.5  6e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18440  predicted transcriptional regulator  48.28 
 
 		 108 aa  87.8  5e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.347123 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0103  transcriptional regulator, ArsR family  50 
 
 		 124 aa  87.4  5e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2579  transcriptional regulator, ArsR family  45.26 
 
 		 120 aa  85.5  2e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12658  ArsR family transcriptional regulator  39.82 
 
 		 119 aa  85.1  3e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000059483  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0367  transcriptional regulator, ArsR family  51.39 
 
 		 337 aa  85.1  3e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2679  regulatory protein ArsR  39.45 
 
 		 120 aa  84.7  4e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.00320886  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0788  regulatory protein ArsR  38.74 
 
 		 120 aa  84.3  5e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1223  regulatory protein, ArsR  44.21 
 
 		 131 aa  84.3  5e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0337905  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1652  regulatory protein, ArsR  41.28 
 
 		 119 aa  84  7e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.000800297  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0112  ArsR family transcriptional regulator  40 
 
 		 119 aa  83.6  8e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3014  ArsR family transcriptional regulator  43.4 
 
 		 119 aa  83.2  0.000000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0824395  normal  0.0135705 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26420  transcriptional regulator, ArsR family  49.35 
 
 		 109 aa  82  0.000000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.169574 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31180  transcriptional regulator, ArsR family  39.22 
 
 		 121 aa  82.4  0.000000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2999  ArsR family transcriptional regulator  43.4 
 
 		 130 aa  82.4  0.000000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3045  ArsR family transcriptional regulator  43.4 
 
 		 119 aa  82.4  0.000000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5239  transcriptional regulator, ArsR family  46.34 
 
 		 97 aa  82  0.000000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0441839  normal  0.647362 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20610  transcriptional regulator, ArsR family  38.24 
 
 		 121 aa  82  0.000000000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2310  ArsR family transcriptional regulator  44.71 
 
 		 121 aa  81.3  0.000000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3471  regulatory protein, ArsR  45 
 
 		 135 aa  80.1  0.000000000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.508363 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4825  regulatory protein, ArsR  39.45 
 
 		 128 aa  77.8  0.00000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.114611  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0492  transcriptional regulator, ArsR family  37.72 
 
 		 123 aa  74.3  0.0000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.483938  hitchhiker  0.00309358 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1062  transcriptional regulator, ArsR family  43.84 
 
 		 103 aa  72.8  0.000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.736924 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0822  ArsR family transcriptional regulator  42.05 
 
 		 118 aa  73.2  0.000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0688  ArsR family transcriptional regulator  43.9 
 
 		 112 aa  72.4  0.000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.812814  normal  0.550052 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3638  regulatory protein, ArsR  48.05 
 
 		 134 aa  72.4  0.000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6661  putative transcriptional regulator, ArsR family  48.68 
 
 		 93 aa  72  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.500493  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9265  putative transcriptional regulator, ArsR family  40.59 
 
 		 122 aa  71.6  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.569899 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0493  transcriptional regulator  44.74 
 
 		 117 aa  71.2  0.000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.877737 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1390  transcriptional regulator, ArsR family  40.24 
 
 		 137 aa  71.2  0.000000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.0000534285  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1211  transcriptional regulator, ArsR family  44.93 
 
 		 117 aa  71.2  0.000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3335  transcriptional regulator, ArsR family  36.46 
 
 		 110 aa  70.9  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0936  regulator of arsenical resistance  43.28 
 
 		 113 aa  70.9  0.000000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2922  ArsR family transcriptional regulator  40.79 
 
 		 101 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0200183  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3204  arsenical resistance operon repressor  40.79 
 
 		 101 aa  70.1  0.00000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2774  ArsR family transcriptional regulator  42.22 
 
 		 108 aa  70.1  0.00000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.111393  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_11041  regulatory proteins, ArsR family protein  44.32 
 
 		 92 aa  70.1  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.74054 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0727  transcriptional regulator, ArsR family  38.82 
 
 		 119 aa  70.1  0.00000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3189  arsenical resistance operon repressor  42.11 
 
 		 101 aa  70.1  0.00000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2670  transcriptional regulator, ArsR family  47.37 
 
 		 120 aa  70.1  0.00000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00021786  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1930  arsenic resistance transcriptional regulator  49.28 
 
 		 128 aa  69.3  0.00000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.406567  unclonable  0.000000264829 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3210  arsenical resistence operon repressor ArsR  40.79 
 
 		 101 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.14764  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1925  putative transcriptional regulator, ArsR family  46.38 
 
 		 117 aa  68.9  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.26024  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2974  arsenical resistance operon repressor  40.79 
 
 		 101 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00402764  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2966  arsenical resistance operon repressor  40.79 
 
 		 101 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2901  arsenical resistance operon repressor  40.79 
 
 		 101 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3199  arsenical resistance operon repressor  40.79 
 
 		 101 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3836  regulatory protein, ArsR  45.07 
 
 		 102 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0754  transcriptional regulator, ArsR family  36.25 
 
 		 119 aa  68.9  0.00000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.68435  normal  0.0266624 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2351  ArsR family transcriptional regulator  45.07 
 
 		 102 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.666716  hitchhiker  0.00040257 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3224  arsenical resistance operon repressor  40.79 
 
 		 101 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.336922  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>