69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_4739 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_4739  OHCU decarboxylase  100 
 
 		 231 aa  424  1e-118  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1332  OHCU decarboxylase  49.37 
 
 		 197 aa  133  1.9999999999999998e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00269507 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0114  OHCU decarboxylase  43.55 
 
 		 193 aa  131  6.999999999999999e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2536  OHCU decarboxylase  48.1 
 
 		 166 aa  114  2.0000000000000002e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.630582  normal  0.368039 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0261  xanthine permease  43.18 
 
 		 825 aa  112  5e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0840  putative bifunctional allantoicase/OHCU decarboxylase  42.93 
 
 		 516 aa  103  2e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0720  Oxo-4-hydroxy-4-carboxy-5-ureidoimidazoline decarboxylase  41.48 
 
 		 182 aa  101  8e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2960  OHCU decarboxylase  48.12 
 
 		 169 aa  100  1e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1825  OHCU decarboxylase  38.75 
 
 		 177 aa  101  1e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3569  OHCU decarboxylase  39.62 
 
 		 166 aa  101  1e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1144  putative urate oxidase, N-terminal  41.88 
 
 		 163 aa  100  2e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.347521  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3454  putative OHCU decarboxylase  38.12 
 
 		 165 aa  98.6  7e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08270  OHCU decarboxylase  38.61 
 
 		 165 aa  97.4  2e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.836682  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5680  putative bifunctional allantoicase/OHCU decarboxylase  38.59 
 
 		 520 aa  96.3  3e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5938  OHCU decarboxylase  43.06 
 
 		 164 aa  95.9  5e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2069  hypothetical protein  44.85 
 
 		 179 aa  95.5  6e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5276  putative OHCU decarboxylase  40 
 
 		 165 aa  95.5  6e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.358826  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3732  putative OHCU decarboxylase  36.71 
 
 		 165 aa  94  2e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2771  putative bifunctional allantoicase/OHCU decarboxylase  41.89 
 
 		 198 aa  94  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.107822  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0938  putative urate oxidase, N-terminal  45.95 
 
 		 166 aa  90.1  3e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.456105  normal  0.914947 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6772  putative OHCU decarboxylase  31.93 
 
 		 168 aa  88.6  7e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1915  putative OHCU decarboxylase  34.13 
 
 		 188 aa  88.2  9e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.000496427  normal  0.213147 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2781  OHCU decarboxylase  39.63 
 
 		 196 aa  80.5  0.00000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.132757  hitchhiker  0.0000130828 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4869  putative OHCU decarboxylase  27.61 
 
 		 169 aa  74.7  0.000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4866  putative OHCU decarboxylase  33.12 
 
 		 173 aa  72.8  0.000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4780  putative OHCU decarboxylase  33.12 
 
 		 173 aa  72.8  0.000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.358879  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5166  putative OHCU decarboxylase  32.5 
 
 		 173 aa  71.6  0.000000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.3304  normal  0.0722696 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5382  putative OHCU decarboxylase  29.81 
 
 		 172 aa  69.7  0.00000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.364924  hitchhiker  0.0064281 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2427  hypothetical protein  33.59 
 
 		 139 aa  67.8  0.0000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02518  uricase-like protein  34.33 
 
 		 138 aa  65.5  0.0000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0449  chitin deacetylase  35.25 
 
 		 475 aa  58.5  0.00000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0347  hypothetical protein  37.14 
 
 		 475 aa  58.5  0.00000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.399937  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0363  hypothetical protein  37.14 
 
 		 475 aa  58.5  0.00000009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.851897  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5365  urate catabolism protein  36.44 
 
 		 478 aa  57.4  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.805332  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4618  chitin deacetylase  35.24 
 
 		 471 aa  56.6  0.0000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.253154 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1407  putative OHCU decarboxylase  28.57 
 
 		 173 aa  56.2  0.0000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2438  hypothetical protein  30.3 
 
 		 172 aa  53.1  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3851  hypothetical protein  33.33 
 
 		 171 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0750718  normal  0.787846 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4287  hypothetical protein  33.33 
 
 		 171 aa  49.7  0.00004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1581  hypothetical protein  33.33 
 
 		 171 aa  49.7  0.00004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.288278  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1036  putative bifunctional OHCU decarboxylase/allantoate amidohydrolase  30.49 
 
 		 589 aa  48.9  0.00007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1927  hypothetical protein  28.05 
 
 		 170 aa  47.8  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0837  OHCU decarboxylase  24.39 
 
 		 166 aa  48.1  0.0001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.653813  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3613  hypothetical protein  32.41 
 
 		 171 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00378889  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5068  urate catabolism protein  36.08 
 
 		 478 aa  47.8  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0360334 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2328  OHCU decarboxylase  27.44 
 
 		 173 aa  47.4  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.256627 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3795  polysaccharide deacetylase  33.33 
 
 		 470 aa  47.8  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0520356 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1423  putative bifunctional OHCU decarboxylase/allantoate amidohydrolase  29.03 
 
 		 591 aa  46.6  0.0003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.202034 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6199  hypothetical protein  32.73 
 
 		 169 aa  46.2  0.0004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.270855 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1299  hypothetical protein  27.44 
 
 		 173 aa  46.2  0.0004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.255273  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1115  putative bifunctional OHCU decarboxylase/allantoate amidohydrolase  30.49 
 
 		 589 aa  46.6  0.0004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.845935  normal  0.677429 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3708  hypothetical protein  33.33 
 
 		 173 aa  46.2  0.0005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.129355  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3151  OHCU decarboxylase  34.62 
 
 		 166 aa  45.8  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.791841 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2841  hypothetical protein  29.01 
 
 		 178 aa  45.4  0.0007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2121  hypothetical protein  30.49 
 
 		 173 aa  43.9  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.205363  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21120  hypothetical protein  34.62 
 
 		 171 aa  44.3  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.959154  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1938  OHCU decarboxylase  29.07 
 
 		 174 aa  44.3  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0640799  normal  0.0392315 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5850  hypothetical protein  29.09 
 
 		 170 aa  43.9  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.107994  hitchhiker  0.000262716 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2759  hypothetical protein  33.96 
 
 		 176 aa  43.9  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.659678  normal  0.346788 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3290  chitin deacetylase  31.48 
 
 		 482 aa  44.3  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.187371  normal  0.839044 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0881  hypothetical protein  30.6 
 
 		 173 aa  43.1  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0178119  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1308  hypothetical protein  27.63 
 
 		 173 aa  43.1  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.029445 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2887  OHCU decarboxylase  34.62 
 
 		 166 aa  43.1  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0785509 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3475  polysaccharide deacetylase  31.43 
 
 		 471 aa  43.1  0.004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.40619  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3347  hypothetical protein  31.07 
 
 		 169 aa  43.1  0.004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.943196  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6115  hypothetical protein  26.16 
 
 		 173 aa  42.4  0.006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1962  hypothetical protein  26.16 
 
 		 173 aa  42.4  0.006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1986  hypothetical protein  26.16 
 
 		 173 aa  42  0.008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.523648 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3035  chitin deacetylase  32.71 
 
 		 471 aa  41.6  0.01  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>