More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_3601 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_3601  transcriptional regulator, LacI family  100 
 
 		 358 aa  707    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0229751  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4925  transcriptional regulator, LacI family  90.5 
 
 		 358 aa  636    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.344925  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3594  transcriptional regulator, LacI family  59.7 
 
 		 339 aa  353  2.9999999999999997e-96  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1296  LacI family transcription regulator  40.12 
 
 		 334 aa  203  4e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1083  transcriptional regulator, LacI family  40.3 
 
 		 335 aa  194  3e-48  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0310257  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1242  LacI family transcription regulator  34.23 
 
 		 340 aa  189  7e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1766  transcriptional regulator, LacI family  37.16 
 
 		 340 aa  189  7e-47  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0293304  normal  0.0298236 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1322  transcriptional regulator, LacI family  39.58 
 
 		 336 aa  189  7e-47  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1842  transcriptional regulator, LacI family  37.65 
 
 		 323 aa  181  1e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.312267  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10110  transcriptional regulator  37.72 
 
 		 342 aa  179  5.999999999999999e-44  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.625648 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2405  LacI family transcriptional regulator  37.16 
 
 		 333 aa  179  7e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.475476 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5557  transcriptional regulator, LacI family  38.37 
 
 		 327 aa  179  8e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.687181  normal  0.634318 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2169  transcriptional regulator, LacI family  37.95 
 
 		 337 aa  175  9e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4934  transcriptional regulator, LacI family  35.63 
 
 		 336 aa  172  9e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.129155  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01470  transcriptional regulator  34.88 
 
 		 351 aa  172  1e-41  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2988  transcriptional regulator, LacI family  36.83 
 
 		 328 aa  164  3e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.922053  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4675  transcriptional regulator, LacI family  34.93 
 
 		 335 aa  162  6e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0183  transcriptional regulator, LacI family  32.74 
 
 		 344 aa  162  7e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2612  transcriptional regulator, LacI family  32.34 
 
 		 342 aa  161  1e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.109106  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1191  transcriptional regulator, LacI family  35.26 
 
 		 336 aa  161  2e-38  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.218553  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14510  transcriptional regulator, LacI family  30.84 
 
 		 333 aa  156  6e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000207214  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0414  regulatory protein LacI  39.81 
 
 		 333 aa  156  7e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.265718 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13620  transcriptional regulator  32.43 
 
 		 333 aa  139  7e-32  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6905  transcriptional regulator, LacI family  31.65 
 
 		 334 aa  138  1e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00908765  hitchhiker  0.00367965 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1317  transcriptional regulator, LacI family  36.57 
 
 		 353 aa  138  2e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0582  alanine racemase  29.03 
 
 		 337 aa  137  3.0000000000000003e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000548778  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6588  LacI family transcription regulator  34.12 
 
 		 342 aa  134  1.9999999999999998e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4931  transcriptional regulator, LacI family  33.04 
 
 		 340 aa  131  2.0000000000000002e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.699714  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2870  transcriptional regulator, LacI family  29.91 
 
 		 342 aa  131  2.0000000000000002e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4628  transcriptional regulator, LacI family  31.18 
 
 		 332 aa  130  3e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.656687 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7709  LacI family transcription regulator  30 
 
 		 337 aa  130  5.0000000000000004e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3308  LacI family transcription regulator  30.06 
 
 		 346 aa  128  1.0000000000000001e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.608255  normal  0.781204 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22540  transcriptional regulator, LacI family  27.22 
 
 		 332 aa  127  4.0000000000000003e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1515  transcriptional regulator, LacI family  28.06 
 
 		 339 aa  125  1e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5394  transcriptional regulator LacI family  29.75 
 
 		 345 aa  124  2e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  decreased coverage  0.00772538  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3464  LacI family transcription regulator  31.31 
 
 		 340 aa  124  2e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0848  transcriptional regulator, LacI family  30.34 
 
 		 334 aa  124  2e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.985148  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3179  transcriptional regulator, LacI family  30.84 
 
 		 355 aa  124  3e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.588941  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5490  transcriptional regulator, LacI family  31.3 
 
 		 337 aa  123  4e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.932078  normal  0.122051 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0879  transcriptional regulator, LacI family  29.46 
 
 		 346 aa  123  5e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0496177  normal  0.310275 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01800  transcriptional regulator  30.86 
 
 		 341 aa  122  7e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3847  transcriptional regulator, LacI family  33.12 
 
 		 337 aa  122  9.999999999999999e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.150933  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0634  transcriptional regulator, LacI family  30.08 
 
 		 334 aa  122  9.999999999999999e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2575  transcriptional regulator, LacI family  27.43 
 
 		 340 aa  121  9.999999999999999e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000166441  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4506  global transcriptional regulator, catabolite control protein A  27.43 
 
 		 332 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0038285  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0161  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  27.03 
 
 		 336 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1922  LacI family transcription regulator  31.04 
 
 		 339 aa  120  3e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.704174  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0449  catabolite control protein A  27.68 
 
 		 332 aa  120  3e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.486602 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0944  transcriptional regulator, LacI family  28.57 
 
 		 346 aa  120  3e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.12331  normal  0.110635 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04570  transcriptional regulator, LacI family  27.99 
 
 		 335 aa  120  3e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1725  transcriptional regulator, LacI family  28.41 
 
 		 338 aa  120  3e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4061  maltose operon transcriptional repressor  26.83 
 
 		 343 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3383  LacI family transcription regulator  32.05 
 
 		 342 aa  120  3.9999999999999996e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4790  catabolite control protein A  27.68 
 
 		 332 aa  119  6e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2204  transcriptional regulator, LacI family  29.69 
 
 		 337 aa  119  6e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2854  LacI family transcription regulator  33.2 
 
 		 391 aa  119  7e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1014  transcriptional regulatory DNA-binding repressor transcription regulator protein  30.06 
 
 		 347 aa  119  7.999999999999999e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.106948  normal  0.302245 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3767  maltose operon transcriptional repressor  26.52 
 
 		 343 aa  119  7.999999999999999e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1277  LacI family transcription regulator  31.41 
 
 		 344 aa  119  7.999999999999999e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0780915  normal  0.320448 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4813  catabolite control protein A  27.98 
 
 		 332 aa  119  9e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4134  maltose operon transcriptional repressor  26.52 
 
 		 340 aa  119  9e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3919  maltose operon transcriptional repressor  26.52 
 
 		 343 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3751  maltose operon transcriptional repressor  26.52 
 
 		 343 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4410  catabolite control protein A  27.14 
 
 		 332 aa  118  9.999999999999999e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4226  maltose operon transcriptional repressor  26.52 
 
 		 343 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4028  maltose operon transcriptional repressor  26.52 
 
 		 343 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0768  LacI family transcription regulator  31.36 
 
 		 332 aa  118  9.999999999999999e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0915061  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4795  catabolite control protein A  27.14 
 
 		 332 aa  118  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0699  transcriptional regulator, LacI family  27.58 
 
 		 341 aa  118  9.999999999999999e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4575  catabolite control protein A  27.14 
 
 		 332 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4427  catabolite control protein A  27.14 
 
 		 332 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4929  catabolite control protein A  27.14 
 
 		 332 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3342  global transcriptional regulator, catabolite control protein A  27.68 
 
 		 332 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000152618  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3838  LacI family transcription regulator  26.96 
 
 		 343 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4116  maltose operon transcriptional repressor  26.52 
 
 		 340 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.271073  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1870  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  25.37 
 
 		 337 aa  118  1.9999999999999998e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.796705  normal  0.714887 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1653  HTH-type transcriptional regulator  29.53 
 
 		 354 aa  117  3.9999999999999997e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.117705  hitchhiker  0.0000123229 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2219  transcriptional regulator, LacI family  32.16 
 
 		 343 aa  117  3.9999999999999997e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000733875  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5078  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  32.84 
 
 		 337 aa  117  3.9999999999999997e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0397942  normal  0.741474 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4121  transcriptional regulator, LacI family  28.22 
 
 		 343 aa  117  3.9999999999999997e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.944766 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4811  catabolite control protein A  27.38 
 
 		 332 aa  117  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3233  alanine racemase  31.29 
 
 		 340 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.16314  normal  0.588082 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6569  transcriptional regulator, LacI family  27.16 
 
 		 347 aa  116  5e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0434919  normal  0.571175 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3227  LacI family transcription regulator  29.45 
 
 		 362 aa  116  6e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1123  maltose operon transcriptional repressor  26.22 
 
 		 343 aa  116  6e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0501  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  30.36 
 
 		 335 aa  116  6e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0579669  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3896  LacI family transcription regulator  30.21 
 
 		 339 aa  116  6.9999999999999995e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4170  transcriptional repressor RbsR  28.85 
 
 		 341 aa  116  6.9999999999999995e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000181496  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4523  transcriptional repressor RbsR  28.74 
 
 		 331 aa  116  6.9999999999999995e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00220391  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2268  transcriptional regulator, LacI family  29.59 
 
 		 339 aa  116  7.999999999999999e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.580288  hitchhiker  0.000512159 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4888  LacI family transcription regulator  32.84 
 
 		 336 aa  115  1.0000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.630665  normal  0.338127 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1959  LacI family transcription regulator  31.18 
 
 		 340 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.108871  normal  0.0393336 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1945  LacI family transcription regulator  29.63 
 
 		 344 aa  115  1.0000000000000001e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4417  transcriptional regulator, LacI family  31.38 
 
 		 351 aa  115  1.0000000000000001e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.728292  normal  0.68385 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6046  LacI family transcription regulator  29.88 
 
 		 338 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.0000000234203  hitchhiker  0.00000507453 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0952  LacI family transcription regulator  26.43 
 
 		 341 aa  115  1.0000000000000001e-24  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2910  transcriptional regulator, LacI family  30.03 
 
 		 333 aa  115  1.0000000000000001e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0171477 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5761  transcriptional regulator, LacI family  31.31 
 
 		 363 aa  115  1.0000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.230872  normal  0.079116 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7027  LacI family transcription regulator  30.86 
 
 		 353 aa  115  1.0000000000000001e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.777473  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4919  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  30.67 
 
 		 349 aa  115  1.0000000000000001e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.35548 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>