71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_3090 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_3090  protein of unknown function DUF35  100 
 
 		 335 aa  676    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.736409  normal  0.697465 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3983  protein of unknown function DUF35  57.59 
 
 		 309 aa  362  3e-99  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.411104  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1482  nucleic-acid-binding protein containing a Zn- ribbon-like protein  58.44 
 
 		 295 aa  355  7.999999999999999e-97  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2732  hypothetical protein  50.81 
 
 		 319 aa  297  2e-79  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2642  hypothetical protein  50.16 
 
 		 329 aa  285  9e-76  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.13056  normal  0.212134 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3818  protein of unknown function DUF35  49.19 
 
 		 320 aa  275  5e-73  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.704476  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2839  hypothetical protein  48.54 
 
 		 319 aa  276  5e-73  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.11529  normal  0.0470778 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5220  hypothetical protein  44.05 
 
 		 330 aa  271  9e-72  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.146278  normal  0.27671 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13554  hypothetical protein  46.62 
 
 		 334 aa  268  1e-70  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000150735 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1538  hypothetical protein  44.08 
 
 		 332 aa  266  2.9999999999999995e-70  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5016  hypothetical protein  44.86 
 
 		 338 aa  266  4e-70  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4722  hypothetical protein  43.61 
 
 		 338 aa  260  2e-68  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4634  hypothetical protein  43.61 
 
 		 338 aa  260  2e-68  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.185588  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3964  protein of unknown function DUF35  44.87 
 
 		 329 aa  253  2.0000000000000002e-66  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2783  protein of unknown function DUF35  26.75 
 
 		 165 aa  70.9  0.00000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.103009  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0269  hypothetical protein  30.25 
 
 		 165 aa  69.3  0.00000000009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.000709024  normal  0.121609 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0674  protein of unknown function DUF35  32.67 
 
 		 178 aa  69.3  0.0000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1310  hypothetical protein  52.83 
 
 		 151 aa  63.5  0.000000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.120998 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2762  hypothetical protein  31.45 
 
 		 158 aa  60.8  0.00000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.10983  normal  0.416635 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0397  hypothetical protein  30.97 
 
 		 177 aa  58.9  0.0000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1758  hypothetical protein  34.02 
 
 		 130 aa  58.2  0.0000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.799098  normal  0.109738 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3784  protein of unknown function DUF35  24.82 
 
 		 165 aa  57.4  0.0000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  hitchhiker  0.0099748  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0268  hypothetical protein  33.33 
 
 		 141 aa  57  0.0000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.00125281  normal  0.120379 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0836  hypothetical protein  34.19 
 
 		 189 aa  57  0.0000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2788  hypothetical protein  34.34 
 
 		 132 aa  56.2  0.0000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.159844  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1501  hypothetical protein  26.79 
 
 		 133 aa  56.2  0.0000008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5254  hypothetical protein  32.65 
 
 		 133 aa  56.2  0.0000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0458  hypothetical protein  32.48 
 
 		 182 aa  54.7  0.000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0436  protein of unknown function DUF35  31.43 
 
 		 128 aa  53.9  0.000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.686015  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0899  hypothetical protein  34.95 
 
 		 131 aa  53.5  0.000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.312493  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0766  hypothetical protein  35.79 
 
 		 135 aa  53.1  0.000007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.48862  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2932  hypothetical protein  33.33 
 
 		 137 aa  53.1  0.000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.241273  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0387  hypothetical protein  31.96 
 
 		 129 aa  52.8  0.000007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.448785  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0892  hypothetical protein  31.48 
 
 		 142 aa  52.8  0.000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.204366  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1438  3-hydroxybutyryl-CoA epimerase  33.68 
 
 		 576 aa  52  0.00001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.410853  normal  0.0151032 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2351  hypothetical protein  29.52 
 
 		 130 aa  52  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.387375  normal  0.674763 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1979  protein of unknown function DUF35  30 
 
 		 137 aa  50.4  0.00004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0353441  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5005  hypothetical protein  30.77 
 
 		 129 aa  50.1  0.00005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.264526  normal  0.0828633 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1880  hypothetical protein  25.83 
 
 		 137 aa  50.4  0.00005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0682045 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1687  hypothetical protein  27.27 
 
 		 137 aa  50.1  0.00006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0475632  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3114  hypothetical protein  27.62 
 
 		 130 aa  49.3  0.00009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0274298  normal  0.392807 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5500  hypothetical protein  34.34 
 
 		 132 aa  48.9  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5096  hypothetical protein  33.65 
 
 		 128 aa  48.1  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1832  hypothetical protein  32.38 
 
 		 138 aa  48.1  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0184205  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3587  hypothetical protein  25.83 
 
 		 137 aa  48.1  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.400148 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3606  protein of unknown function DUF35  26.92 
 
 		 130 aa  47.8  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.215549  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2662  hypothetical protein  30.65 
 
 		 136 aa  47.8  0.0003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8196  hypothetical protein  27.45 
 
 		 319 aa  47  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4786  hypothetical protein  30.77 
 
 		 144 aa  47  0.0005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.259655  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1241  hypothetical protein  37.04 
 
 		 137 aa  46.6  0.0006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0148077  normal  0.0127741 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2010  hypothetical protein  30.34 
 
 		 137 aa  46.2  0.0007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.392361  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3511  hypothetical protein  30.77 
 
 		 131 aa  46.2  0.0008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3652  hypothetical protein  30.48 
 
 		 136 aa  46.2  0.0009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.92305  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4045  hypothetical protein  28.8 
 
 		 141 aa  46.2  0.0009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.589309 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1511  hypothetical protein  32.11 
 
 		 317 aa  45.4  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2934  hypothetical protein  29.03 
 
 		 144 aa  45.4  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.431872  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0149  hypothetical protein  32.32 
 
 		 129 aa  45.4  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4153  hypothetical protein  30.48 
 
 		 132 aa  45.4  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.280027  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2015  hypothetical protein  27.78 
 
 		 136 aa  44.7  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.196649  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0340  protein of unknown function DUF35  30 
 
 		 134 aa  45.1  0.002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.0000262786  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2821  hypothetical protein  31.82 
 
 		 315 aa  44.7  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.875118  normal  0.0237416 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5278  hypothetical protein  28 
 
 		 135 aa  45.1  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3806  hypothetical protein  30.3 
 
 		 132 aa  43.9  0.004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4760  hypothetical protein  31.19 
 
 		 318 aa  43.9  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.247642  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4674  hypothetical protein  31.19 
 
 		 318 aa  43.9  0.004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3600  hypothetical protein  27.05 
 
 		 140 aa  43.5  0.005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0665674  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5301  hypothetical protein  26.42 
 
 		 143 aa  43.1  0.006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.653983 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0597  protein of unknown function DUF35  43.64 
 
 		 490 aa  43.1  0.007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2363  hypothetical protein  30.11 
 
 		 130 aa  43.1  0.008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0032  hypothetical protein  30.09 
 
 		 138 aa  42.7  0.009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.662095  normal  0.14279 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3828  hypothetical protein  28.3 
 
 		 132 aa  42.7  0.01  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>