More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_2215 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012803  Mlut_15950  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  62.98 
 
 		 550 aa  645    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0452  ABC transporter related  72.84 
 
 		 544 aa  749    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.15449  normal  0.299549 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1055  ABC transporter related  75.92 
 
 		 542 aa  795    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.242614  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6901  ABC transporter, ATP-binding protein  77.61 
 
 		 545 aa  826    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4164  ABC transporter related protein  72.61 
 
 		 544 aa  690    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.226942  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2215  ABC transporter related  100 
 
 		 545 aa  1066    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.242507  normal  0.0157835 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19010  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  66 
 
 		 555 aa  686    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0660652 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0806  ABC transporter related  62.68 
 
 		 569 aa  632  1e-180  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0923  ABC transporter related  61.28 
 
 		 553 aa  628  1e-179  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0053  ABC transporter related protein  66.97 
 
 		 548 aa  628  1e-179  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00894848 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0995  ABC transporter related  62.23 
 
 		 550 aa  616  1e-175  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5841  ABC transporter-related protein  62.48 
 
 		 548 aa  612  9.999999999999999e-175  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.334221  normal  0.657499 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0507  ABC transporter related protein  63.69 
 
 		 549 aa  610  1e-173  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5299  ABC transporter related  60.58 
 
 		 553 aa  610  1e-173  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.121259  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5678  ABC transporter related  60.58 
 
 		 553 aa  610  1e-173  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5388  ABC transporter related  60.58 
 
 		 553 aa  610  1e-173  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.378232 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3420  ABC transporter related protein  60.58 
 
 		 554 aa  582  1.0000000000000001e-165  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.859354  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4909  ABC transporter related  58.47 
 
 		 551 aa  578  1.0000000000000001e-163  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00241613 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2670  ABC transporter related  59.92 
 
 		 537 aa  551  1e-155  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.205252  normal  0.299253 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0493  ABC transporter related  53.52 
 
 		 537 aa  469  1.0000000000000001e-131  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5697  ABC transporter related protein  43.4 
 
 		 543 aa  329  9e-89  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.425489  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0453  ABC transporter related protein  35.16 
 
 		 552 aa  273  4.0000000000000004e-72  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0407  ABC transporter related  32.59 
 
 		 634 aa  270  4e-71  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.499009 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14070  ABC transporter related  32.61 
 
 		 640 aa  256  1.0000000000000001e-66  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0328486  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3394  ABC transporter related  34.16 
 
 		 575 aa  254  4.0000000000000004e-66  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.232814 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0941  ATPase  36.7 
 
 		 569 aa  253  7e-66  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0067  ABC transporter related  34.76 
 
 		 581 aa  248  1e-64  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0493  ABC transporter related  31.02 
 
 		 630 aa  245  9.999999999999999e-64  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0236  ABC transporter, ATP-binding protein  31.76 
 
 		 658 aa  244  3.9999999999999997e-63  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.281236  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0722  ABC transporter-like  35.53 
 
 		 564 aa  244  3.9999999999999997e-63  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.112137  normal  0.972889 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0248  ABC transporter ATP-binding protein  31.58 
 
 		 658 aa  241  2e-62  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0234  ABC transporter, ATP-binding protein  31.58 
 
 		 658 aa  241  2e-62  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0393194  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5031  ABC transporter, ATP-binding protein  31.63 
 
 		 644 aa  241  2e-62  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0210373  normal  0.641963 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0288  ABC transporter, ATP-binding protein  31.58 
 
 		 658 aa  241  2.9999999999999997e-62  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0284  ABC transporter, ATP-binding protein  31.58 
 
 		 662 aa  241  2.9999999999999997e-62  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.541093  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2551  ABC transporter-like protein protein  35.84 
 
 		 564 aa  241  2.9999999999999997e-62  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0262  ABC transporter ATP-binding protein  31.58 
 
 		 640 aa  241  2.9999999999999997e-62  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00579905  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1536  ABC transporter related  32.61 
 
 		 540 aa  241  2.9999999999999997e-62  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.28069e-34 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0312  ABC transporter, ATP-binding protein  31.58 
 
 		 644 aa  240  4e-62  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0790869  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1721  ABC transporter-related protein  33.7 
 
 		 548 aa  240  5.999999999999999e-62  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0293  ABC transporter, ATP-binding protein  31.58 
 
 		 659 aa  239  6.999999999999999e-62  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0524615  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0628  ABC transporter related  35.53 
 
 		 567 aa  239  8e-62  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0261051  normal  0.0724506 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2704  ABC transporter related protein  32.43 
 
 		 540 aa  238  2e-61  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00040333  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0241  ABC transporter related  31.4 
 
 		 658 aa  238  2e-61  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.348865  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0900  ABC transporter related  30.6 
 
 		 666 aa  238  2e-61  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0247  ABC transporter-related protein  32.12 
 
 		 659 aa  238  2e-61  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1792  ABC transporter related  33.52 
 
 		 548 aa  238  3e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2617  ABC transporter related  31.23 
 
 		 543 aa  237  3e-61  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0118157  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2157  ABC transporter, duplicated ATPase subunits  33.39 
 
 		 548 aa  237  4e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.428099  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2470  ABC transporter related  34.71 
 
 		 620 aa  236  8e-61  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0276149  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3313  ABC transporter related  33.58 
 
 		 636 aa  236  1.0000000000000001e-60  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000905191  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2093  ABC transporter, ATP-binding protein  32.21 
 
 		 545 aa  234  2.0000000000000002e-60  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.206027  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0222  ABC transporter related  31.91 
 
 		 644 aa  233  5e-60  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0192  ABC transporter related  33.33 
 
 		 540 aa  233  9e-60  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.566668 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4025  ABC transporter related  30.91 
 
 		 543 aa  232  1e-59  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000600083  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0741  ABC transporter related  31.94 
 
 		 545 aa  232  2e-59  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0595182  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0135  ABC transporter related  33.33 
 
 		 540 aa  232  2e-59  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.216593 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1467  ABC transporter related  29.63 
 
 		 639 aa  231  3e-59  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0576  ABC transporter related  32.64 
 
 		 540 aa  231  3e-59  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2696  ABC transporter related  34.54 
 
 		 659 aa  231  3e-59  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1631  ABC transporter related  33.39 
 
 		 545 aa  231  4e-59  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.987433 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2524  ABC transporter-related protein  31.46 
 
 		 544 aa  231  4e-59  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.107445  normal  0.0506858 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0224  ABC transporter related  33.15 
 
 		 540 aa  230  4e-59  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0719  ABC transporter related  30.8 
 
 		 672 aa  230  5e-59  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.76998  hitchhiker  0.00730908 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1101  ABC transporter related protein  33.33 
 
 		 641 aa  229  7e-59  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0093  ABC transporter ATP-binding protein  29.58 
 
 		 536 aa  229  8e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.785822  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01041  ABC transporter, ATP binding component  29.8 
 
 		 541 aa  229  1e-58  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.15596  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01021  ABC transporter, ATP binding component  30.18 
 
 		 541 aa  228  2e-58  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.663375  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26480  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain protein  34.48 
 
 		 539 aa  228  2e-58  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.460594  normal  0.379064 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2173  ABC-type transport system, ATPase component  31.83 
 
 		 549 aa  228  2e-58  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1739  ABC transporter related  33.71 
 
 		 540 aa  228  2e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6484  ABC transporter related  31.44 
 
 		 540 aa  228  3e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1500  ABC transporter related  32.53 
 
 		 630 aa  228  3e-58  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.384495  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1860  ABC transporter related  32.28 
 
 		 637 aa  227  4e-58  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.155598  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0378  ABC transporter related  32.53 
 
 		 630 aa  227  4e-58  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09590  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  31.05 
 
 		 709 aa  227  5.0000000000000005e-58  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.000107882  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4309  ABC transporter ATP-binding protein  31.78 
 
 		 540 aa  227  5.0000000000000005e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.167754 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2884  ABC transporter related  29.55 
 
 		 634 aa  226  7e-58  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.314966  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0106  ABC transporter related  29.12 
 
 		 544 aa  226  1e-57  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4837  ABC transporter related protein  37.27 
 
 		 551 aa  225  2e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1626  ABC transporter related  32.3 
 
 		 619 aa  224  4e-57  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1763  ABC transporter, ATP-binding protein  31.01 
 
 		 546 aa  224  4e-57  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.208486  normal  0.0362941 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3309  ABC transporter related  31.64 
 
 		 542 aa  224  4e-57  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000132577  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0130  ABC transporter related  30.88 
 
 		 685 aa  224  4.9999999999999996e-57  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.906602  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0750  ABC transporter related  34.88 
 
 		 537 aa  223  6e-57  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0351  ABC transporter related  29.38 
 
 		 645 aa  223  7e-57  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2397  ABC transporter related  34.32 
 
 		 649 aa  223  7e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06770  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain protein  30.2 
 
 		 668 aa  223  8e-57  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  0.00000102079  normal  0.871828 
 
 
-
 
NC_002936  DET0224  ABC transporter, ATP-binding protein  30.32 
 
 		 663 aa  222  9.999999999999999e-57  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1455  ABC transporter ATP-binding protein  31.44 
 
 		 572 aa  222  9.999999999999999e-57  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1915  ABC transporter ATPase  29.66 
 
 		 518 aa  221  3e-56  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2910  ABC transporter related  33.7 
 
 		 537 aa  221  3.9999999999999997e-56  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.53858 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0949  ABC transporter related  31.2 
 
 		 540 aa  220  3.9999999999999997e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0136  ABC transporter ATPase  30.83 
 
 		 518 aa  221  3.9999999999999997e-56  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01571  ABC transporter, ATP binding component  30.92 
 
 		 572 aa  221  3.9999999999999997e-56  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0136  ABC transporter, ATP-binding protein  30.97 
 
 		 518 aa  220  5e-56  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.997167  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1259  ABC transporter ATPase  32.96 
 
 		 512 aa  220  7e-56  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01001  ABC transporter, ATP binding component  29.82 
 
 		 540 aa  219  7.999999999999999e-56  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4079  ABC transporter related  31.78 
 
 		 540 aa  219  8.999999999999998e-56  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.148831 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_200  ABC transporter, ATP-binding protein  29.96 
 
 		 663 aa  219  1e-55  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>