248 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_2117 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_2117  TrkA-N domain protein  100 
 
 		 569 aa  1120    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0022  TrkA-N domain-containing protein  35.61 
 
 		 553 aa  244  1.9999999999999999e-63  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.377987  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0242  TrkA domain-containing protein  36.03 
 
 		 668 aa  238  2e-61  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.570475 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0283  TrkA domain-containing protein  35.65 
 
 		 639 aa  235  2.0000000000000002e-60  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.244298  normal  0.293547 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2939  TrkA-N  27.5 
 
 		 749 aa  127  8.000000000000001e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0858519 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2853  TrkA-N  28.27 
 
 		 561 aa  120  9e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2794  TrkA-N domain protein  25.57 
 
 		 568 aa  116  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3306  TrkA-N domain protein  25.57 
 
 		 568 aa  116  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.484589 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4032  TrkA-N  25.74 
 
 		 565 aa  112  1.0000000000000001e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.341469 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3105  TrkA-N  28.08 
 
 		 683 aa  105  2e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.716552 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4290  TrkA domain-containing protein  39.39 
 
 		 606 aa  95.1  3e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.286091  decreased coverage  0.00534263 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4226  TrkA-N domain protein  24.14 
 
 		 682 aa  94  6e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3336  TrkA domain-containing protein  28.76 
 
 		 359 aa  90.1  1e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.819763  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4477  TrkA-N domain protein  25 
 
 		 676 aa  88.2  4e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.124156 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0931  TrkA domain-containing protein  35.56 
 
 		 605 aa  86.3  0.000000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.18233  normal  0.866463 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4414  TrkA-N domain protein  25.56 
 
 		 676 aa  86.3  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0471  TrkA domain-containing protein  25.95 
 
 		 325 aa  79  0.0000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0210  TrkA-N domain protein  27.43 
 
 		 460 aa  74.7  0.000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.196542  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1751  TrkA domain-containing protein  27.68 
 
 		 332 aa  74.7  0.000000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2518  TrkA-N domain protein  26.67 
 
 		 362 aa  73.2  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2769  TrkA-N domain protein  35.76 
 
 		 565 aa  73.2  0.00000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3909  TrkA domain-containing protein  26.98 
 
 		 355 aa  72.4  0.00000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0877338 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1634  TrkA domain-containing protein  25.73 
 
 		 339 aa  68.9  0.0000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.853014  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1694  TrkA domain-containing protein  26.43 
 
 		 332 aa  69.7  0.0000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.249596  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0064  TrkA-N domain protein  32.11 
 
 		 337 aa  68.6  0.0000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2888  TrkA-N  26.09 
 
 		 357 aa  68.2  0.0000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3004  TrkA-N domain-containing protein  26.19 
 
 		 354 aa  67  0.0000000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0453  TrkA-N domain protein  26.98 
 
 		 346 aa  65.9  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3794  TrkA-N domain protein  25.37 
 
 		 350 aa  65.1  0.000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.434274  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3877  TrkA-N domain protein  25.37 
 
 		 350 aa  65.1  0.000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.705897 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3731  hypothetical protein  30.19 
 
 		 338 aa  65.1  0.000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.00000000000159336  normal  0.309617 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6759  K+ transport systems NAD-binding component-like protein  32.42 
 
 		 221 aa  63.5  0.000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0519804 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1539  sodium/hydrogen exchanger  36.72 
 
 		 662 aa  62.8  0.00000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.183073  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2663  sodium/hydrogen exchanger  29.75 
 
 		 668 aa  61.6  0.00000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2039  TrkA-N domain protein  30.71 
 
 		 350 aa  62  0.00000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1045  TrkA domain-containing protein  26.29 
 
 		 350 aa  61.6  0.00000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000596347  hitchhiker  0.00364441 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3347  TrkA-N  25.75 
 
 		 352 aa  60.8  0.00000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.220422  normal  0.349567 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0618  VIC family potassium channel protein  32.14 
 
 		 351 aa  61.2  0.00000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3283  TrkA-N  29.3 
 
 		 332 aa  61.2  0.00000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.825743  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4030  TrkA domain-containing protein  34.48 
 
 		 364 aa  60.8  0.00000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.702941  normal  0.742816 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0556  TrkA domain-containing protein  25.45 
 
 		 346 aa  59.7  0.0000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2971  TrkA domain-containing protein  23.92 
 
 		 350 aa  60.1  0.0000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08671  VIC family potassium channel protein  23.72 
 
 		 351 aa  59.7  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5153  TrkA-N domain protein  27.89 
 
 		 355 aa  59.3  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000053583 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0567  hypothetical protein  33.33 
 
 		 564 aa  58.9  0.0000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13070  K+ transport system, NAD-binding component  35.05 
 
 		 233 aa  59.3  0.0000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.00265603  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1162  TrkA-like protein  33.62 
 
 		 386 aa  59.3  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.30388 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4906  TrkA-N domain protein  32.76 
 
 		 368 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0415092 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4504  TrkA domain-containing protein  33.62 
 
 		 364 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0117  TrkA-N domain protein  25.79 
 
 		 345 aa  59.3  0.0000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1520  TrkA domain-containing protein  26.06 
 
 		 324 aa  58.5  0.0000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.639077  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1654  TrkA domain-containing protein  23.62 
 
 		 335 aa  58.9  0.0000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.190782  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3710  TrkA-N  29.33 
 
 		 364 aa  58.5  0.0000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.360814  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4046  TrkA domain-containing protein  33.62 
 
 		 364 aa  58.5  0.0000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.809582 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4658  TrkA domain-containing protein  29.33 
 
 		 364 aa  58.5  0.0000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.677832  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00100  potassium channel protein  25 
 
 		 335 aa  58.5  0.0000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.377928  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2212  TrkA domain-containing protein  28.18 
 
 		 347 aa  58.2  0.0000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.217414  normal  0.271729 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5641  TrkA domain-containing protein  29.33 
 
 		 364 aa  58.2  0.0000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.289182 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07711  VIC family potassium channel protein  24.17 
 
 		 351 aa  57.8  0.0000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.584573  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0715  VIC family potassium channel protein  24.17 
 
 		 351 aa  57.8  0.0000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.4714  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0757  sodium/hydrogen exchanger  26.48 
 
 		 664 aa  57.4  0.0000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.199528  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5075  potassium channel protein  23.41 
 
 		 334 aa  57.4  0.0000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000793674  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5092  potassium channel protein  23.41 
 
 		 334 aa  57.4  0.0000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00108262  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0683  potassium channel protein  35.42 
 
 		 341 aa  57.4  0.0000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0922  TrkA domain-containing protein  23.35 
 
 		 335 aa  57  0.0000008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07731  VIC family potassium channel protein  24.17 
 
 		 351 aa  57  0.0000008  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2999  TrkA-N domain protein  30 
 
 		 388 aa  57  0.0000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5573  potassium uptake protein, TrkA family  24.03 
 
 		 330 aa  56.2  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1968  potassium-efflux system protein  29.46 
 
 		 661 aa  57  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1636  sodium/hydrogen exchanger  29.46 
 
 		 661 aa  57  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000235169 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3915  TrkA domain-containing protein  31.25 
 
 		 330 aa  56.6  0.000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.557122  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1132  hypothetical protein  32.46 
 
 		 564 aa  55.5  0.000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14401  K+ transport system, NAD-binding component  25.64 
 
 		 352 aa  55.8  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000716154 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1744  VIC family potassium channel protein  30.19 
 
 		 352 aa  55.8  0.000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1976  sodium/hydrogen exchanger  28.92 
 
 		 666 aa  56.2  0.000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0132674  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5489  potassium uptake protein, TrkA family  24.03 
 
 		 330 aa  55.8  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1528  TrkA domain-containing protein  37.62 
 
 		 347 aa  55.5  0.000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.857437  normal  0.417483 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1196  TrkA-N domain protein  25.78 
 
 		 569 aa  55.1  0.000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0633  TrkA-N domain protein  29.25 
 
 		 248 aa  55.5  0.000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1744  TrkA-N domain protein  24.26 
 
 		 368 aa  55.5  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.844821 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2406  TrkA domain-containing protein  31.71 
 
 		 214 aa  55.1  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.716891  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1529  TrkA-N domain protein  29.17 
 
 		 395 aa  55.1  0.000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.479554  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0539  antiporter-2, CPA2 family monovalent cation/proton antiporter  35.19 
 
 		 658 aa  54.7  0.000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1256  TrkA-N domain protein  27.68 
 
 		 350 aa  54.7  0.000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.430368  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2168  TrkA-N domain protein  25.55 
 
 		 531 aa  55.1  0.000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1024  TrkA domain-containing protein  23.12 
 
 		 335 aa  55.1  0.000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.282206 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0403  VIC family potassium channel protein  25.23 
 
 		 346 aa  53.9  0.000008  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.133961  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1184  TrkA-N domain protein  29.61 
 
 		 218 aa  53.5  0.00001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5545  TrkA-N domain protein  35.64 
 
 		 341 aa  53.1  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.789205 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2149  sodium/hydrogen exchanger  32.84 
 
 		 567 aa  53.1  0.00001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5187  TrkA domain-containing protein  28.46 
 
 		 330 aa  53.1  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1293  TrkA domain-containing protein  33.62 
 
 		 326 aa  52.4  0.00002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1025  putative potassium channel protein  33.62 
 
 		 326 aa  52.4  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1323  TrkA-N domain protein  29.29 
 
 		 346 aa  52.8  0.00002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1460  TrkA domain-containing protein  32.76 
 
 		 413 aa  52.8  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2566  TrkA-N  28.12 
 
 		 366 aa  52.4  0.00002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.353731  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3072  TrkA domain-containing protein  29.76 
 
 		 214 aa  52.4  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0542  TrkA domain-containing protein  33.62 
 
 		 326 aa  52.4  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06531  putative potassium channel, VIC family protein  29.59 
 
 		 359 aa  52.4  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0270  putative potassium channel protein  33.62 
 
 		 326 aa  52.4  0.00002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.435171  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>