More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_1757 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_1757  ABC transporter related  100 
 
 		 279 aa  554  1e-157  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.543445  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1874  ABC transporter related protein  41.74 
 
 		 236 aa  163  3e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.546444 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3400  ABC transporter related protein  46.59 
 
 		 252 aa  143  3e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0345809  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4648  ABC transporter ATP-binding protein  31.32 
 
 		 277 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5003  ABC transporter ATP-binding protein  31.32 
 
 		 277 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4887  putative ABC transporter, ATP-binding protein  31.32 
 
 		 277 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4863  putative ABC transporter, ATP-binding protein  30.42 
 
 		 277 aa  120  3e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4483  ABC transporter, ATP-binding protein  35.45 
 
 		 277 aa  119  3.9999999999999996e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4501  ABC transporter, ATP-binding protein  30.94 
 
 		 277 aa  119  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4581  ABC transporter related  30.19 
 
 		 277 aa  119  3.9999999999999996e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3196  copper transport ATP-binding protein NosF  32.87 
 
 		 298 aa  119  3.9999999999999996e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.361058  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2133  ABC transporter related  40.15 
 
 		 278 aa  115  6e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0145479  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3424  ABC transporter-related protein  33.33 
 
 		 297 aa  115  6e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4497  ABC transporter related  37.04 
 
 		 262 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00850  zinc ABC transporter, ATP binding protein  33.92 
 
 		 257 aa  114  2.0000000000000002e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2217  ABC transporter related  34.25 
 
 		 327 aa  113  3e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3076  ABC transporter related  31.94 
 
 		 310 aa  113  4.0000000000000004e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.591298  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0537  ABC transporter related  28.5 
 
 		 256 aa  111  1.0000000000000001e-23  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0061  ABC transporter-like  35.36 
 
 		 261 aa  109  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0430  ABC transporter related  34.16 
 
 		 301 aa  109  4.0000000000000004e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3144  ABC transporter related  30.71 
 
 		 301 aa  109  5e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0118  zinc ABC transporter ATP-binding protein  34.92 
 
 		 257 aa  109  6e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.550689  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0501  ABC transporter-related protein  30.1 
 
 		 300 aa  108  8.000000000000001e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2353  ABC transporter related  33.17 
 
 		 301 aa  107  2e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2141  high-affinity zinc transporter ATPase  30.47 
 
 		 253 aa  107  2e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00000000523948  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2418  high-affinity zinc transporter ATPase  30.47 
 
 		 253 aa  107  2e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000136386  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2028  high-affinity zinc transporter ATPase  30.47 
 
 		 253 aa  107  2e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000463637  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0133  ABC transporter related  34.39 
 
 		 257 aa  107  2e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.875214  normal  0.6393 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4344  ABC transporter related  34.38 
 
 		 310 aa  107  2e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3402  ABC transporter-related protein  31.55 
 
 		 322 aa  106  3e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00371017  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0497  ABC transporter related  31.07 
 
 		 348 aa  106  3e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2521  ABC transporter related  41.48 
 
 		 284 aa  107  3e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.436198 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0135  ABC transporter related  34.39 
 
 		 257 aa  106  4e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01829  high-affinity zinc transporter ATPase  35.03 
 
 		 251 aa  106  5e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0411834  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0954  high-affinity zinc transporter ATPase  34.69 
 
 		 251 aa  106  5e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00228329  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1950  high-affinity zinc transporter ATPase  35.03 
 
 		 251 aa  106  5e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.00957136  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01817  hypothetical protein  35.03 
 
 		 251 aa  106  5e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0235132  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3534  ABC transporter related  31.07 
 
 		 348 aa  106  5e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3153  hypothetical protein  37.69 
 
 		 244 aa  106  5e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.641023 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1426  ABC transporter for copper ATP-binding protein  29.61 
 
 		 303 aa  106  5e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1774  high-affinity zinc transporter ATPase  35.03 
 
 		 251 aa  106  5e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000214201  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1782  ABC transporter related protein  34.69 
 
 		 251 aa  105  6e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000959495  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2088  high-affinity zinc transporter ATPase  34.69 
 
 		 251 aa  105  6e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000249071  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1328  high-affinity zinc transporter ATPase  34.69 
 
 		 251 aa  105  6e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0117105  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2594  high-affinity zinc transporter ATPase  34.69 
 
 		 251 aa  105  6e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000469162  normal  0.96409 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0496  ABC transporter related  31.03 
 
 		 348 aa  105  6e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.630223  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5266  zinc ABC transporter, ATP-binding protein  35 
 
 		 264 aa  105  9e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2742  ABC transporter related  31.53 
 
 		 292 aa  104  1e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.145736  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0451  ABC transporter related  27.64 
 
 		 234 aa  104  1e-21  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000589964  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0487  copper ABC transporter, ATP-binding protein  29.06 
 
 		 332 aa  103  2e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2774  high-affinity zinc transporter ATPase  34.44 
 
 		 252 aa  103  2e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000747902  hitchhiker  0.00672934 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0277  ABC transporter  34.62 
 
 		 262 aa  103  2e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4734  copper ABC transporter, ATP-binding protein  28.8 
 
 		 304 aa  103  3e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3568  ABC zinc transporter, ATPase subunit ZnuC  37.13 
 
 		 243 aa  103  3e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0089  ABC transporter related  36.27 
 
 		 307 aa  103  3e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3251  ABC transporter related  37.13 
 
 		 243 aa  103  3e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0932587 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0904  ABC transporter-like protein  31.05 
 
 		 293 aa  103  3e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.212918  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5110  ABC transporter related  33.86 
 
 		 257 aa  103  4e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.155841 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3358  ABC transporter related  28.86 
 
 		 344 aa  103  4e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.348903  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2741  ABC transporter related protein  26.99 
 
 		 297 aa  102  6e-21  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.585521  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1761  ABC transporter related  32.69 
 
 		 350 aa  102  7e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.298772 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4469  ABC transporter related  29.58 
 
 		 302 aa  102  7e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2106  high-affinity zinc transporter ATPase  36.93 
 
 		 251 aa  102  7e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.187807  normal  0.509686 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1232  high-affinity zinc transporter ATPase  36.93 
 
 		 251 aa  102  7e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00921374  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2051  high-affinity zinc transporter ATPase  36.93 
 
 		 251 aa  102  7e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00817466  normal  0.126914 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1356  high-affinity zinc transporter ATPase  36.93 
 
 		 268 aa  102  8e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00420991 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2143  ABC transporter related  32.23 
 
 		 252 aa  102  8e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00407664  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2046  high-affinity zinc transporter ATPase  36.93 
 
 		 251 aa  102  9e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.744627  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6301  zinc transport protein ZnuC  36.11 
 
 		 269 aa  101  1e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2110  high-affinity zinc transporter ATPase  32.67 
 
 		 252 aa  101  1e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.03365  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72580  zinc transporter  36.11 
 
 		 269 aa  101  1e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.705546  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2252  ABC transporter related  31.75 
 
 		 252 aa  101  1e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0584903  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0989  ABC transporter related  29.34 
 
 		 331 aa  102  1e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00029019  normal  0.847424 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4217  ABC transporter related  34.52 
 
 		 299 aa  101  1e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.175008  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3646  ABC transporter related protein  35.02 
 
 		 212 aa  102  1e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0104951 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2859  ABC transporter related  33.66 
 
 		 301 aa  100  2e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2366  ABC transporter related  29.29 
 
 		 299 aa  100  2e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1826  high-affinity zinc transporter ATPase  32.18 
 
 		 252 aa  100  2e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.11011  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4138  ABC transporter related  38.27 
 
 		 254 aa  100  2e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.19179 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2411  ABC transporter related  29.29 
 
 		 299 aa  100  2e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0293991  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2323  copper ABC transporter, ATP-binding protein  33.86 
 
 		 304 aa  100  3e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.797197  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0253  copper ABC transporter, ATP-binding protein  31.55 
 
 		 331 aa  100  3e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0095  ABC transporter related  28.83 
 
 		 451 aa  100  3e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4448  ABC transporter related  28.06 
 
 		 327 aa  100  3e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0277  copper ABC transporter, ATP-binding protein  31.55 
 
 		 316 aa  100  4e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.122603  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0511  ABC transporter related  31.47 
 
 		 302 aa  99.8  4e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1728  ABC transporter related  35.29 
 
 		 260 aa  100  4e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.968489  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0214  ABC transporter related  29.61 
 
 		 303 aa  99.8  4e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000423562  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0487  ABC transporter related  28 
 
 		 325 aa  99.4  6e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2678  ABC transporter related protein  32.71 
 
 		 301 aa  99.4  6e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.448412  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2427  high-affinity zinc transporter ATPase  32.03 
 
 		 251 aa  99.4  6e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.000130602  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4751  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  34.26 
 
 		 269 aa  98.2  1e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.00318924  hitchhiker  0.00202738 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1115  ABC transporter-like protein  29.44 
 
 		 292 aa  98.6  1e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.894559  normal  0.173515 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3568  ABC transporter related  35.6 
 
 		 214 aa  98.2  1e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.738958  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0660  ABC transporter related  32.04 
 
 		 313 aa  98.2  1e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.946314  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004107  zinc ABC transporter ATP-binding protein ZnuC  29.68 
 
 		 262 aa  97.8  2e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2191  ABC transporter related  25.23 
 
 		 249 aa  97.8  2e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000419302  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28190  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  35.08 
 
 		 311 aa  97.4  2e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3387  ABC transporter related  30.97 
 
 		 323 aa  97.8  2e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1795  ABC transporter related  30.47 
 
 		 294 aa  97.8  2e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.881236  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>