58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_4404 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_4404  DNA ligase  100 
 
 		 292 aa  609  1e-173  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2401  DNA ligase  49.13 
 
 		 304 aa  278  7e-74  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.980486 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2191  DNA ligase  52.12 
 
 		 302 aa  274  2.0000000000000002e-72  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.163072  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2268  DNA ligase  51.74 
 
 		 302 aa  273  3e-72  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.819174  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1886  DNA ligase  50.57 
 
 		 315 aa  266  2.9999999999999995e-70  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0219866  normal  0.840695 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2439  DNA ligase  50.19 
 
 		 309 aa  265  5e-70  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.488176  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1838  DNA ligase  50.19 
 
 		 315 aa  265  5.999999999999999e-70  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00105408  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2204  DNA ligase  50.19 
 
 		 311 aa  264  1e-69  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1852  DNA ligase  49.81 
 
 		 315 aa  264  1e-69  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0107738  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1748  DNA ligase  51.44 
 
 		 309 aa  263  3e-69  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1484  DNA ligase  47.14 
 
 		 282 aa  257  2e-67  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.159526  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2639  DNA ligase  47.84 
 
 		 281 aa  248  1e-64  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00943925  normal  0.0523485 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1587  DNA ligase  47.66 
 
 		 270 aa  248  1e-64  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.382464  normal  0.257911 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2511  DNA ligase  44.91 
 
 		 291 aa  243  3.9999999999999997e-63  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0073  DNA ligase  45.36 
 
 		 279 aa  242  5e-63  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.555561  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003526  ATP-dependent DNA ligase  43.07 
 
 		 281 aa  239  5.999999999999999e-62  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1148  DNA ligase  44.57 
 
 		 282 aa  238  8e-62  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.269751  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1157  DNA ligase  43.97 
 
 		 279 aa  238  9e-62  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00148017  normal  0.132142 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1235  DNA ligase  44.53 
 
 		 279 aa  237  2e-61  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0812  DNA ligase  45.68 
 
 		 306 aa  234  9e-61  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.35337  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1990  DNA ligase  45.31 
 
 		 288 aa  233  2.0000000000000002e-60  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00542431 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0077  DNA ligase  42.42 
 
 		 298 aa  231  9e-60  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.285949  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3497  DNA ligase  42.74 
 
 		 337 aa  231  1e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.105029 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1359  DNA ligase  46.22 
 
 		 290 aa  231  1e-59  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2739  DNA ligase  44.58 
 
 		 283 aa  231  1e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3695  DNA ligase  41.13 
 
 		 295 aa  228  6e-59  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2712  DNA ligase  46.5 
 
 		 303 aa  227  2e-58  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0226859 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0584  DNA ligase  43.7 
 
 		 272 aa  226  3e-58  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.000000250691  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2019  DNA ligase  41 
 
 		 295 aa  225  9e-58  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03421  DNA ligase  36.77 
 
 		 317 aa  219  3.9999999999999997e-56  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2251  DNA ligase  41.32 
 
 		 375 aa  213  2.9999999999999995e-54  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2761  DNA ligase  41.32 
 
 		 326 aa  211  7.999999999999999e-54  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2416  DNA ligase  40.89 
 
 		 306 aa  209  6e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2043  DNA ligase  40.4 
 
 		 282 aa  209  6e-53  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.0000183031  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1665  DNA ligase  40.4 
 
 		 282 aa  208  7e-53  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1841  DNA ligase  39.6 
 
 		 282 aa  208  9e-53  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.867286  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1366  DNA ligase  36.82 
 
 		 284 aa  208  9e-53  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.332373  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1395  DNA ligase  40.08 
 
 		 272 aa  206  3e-52  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.168291  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1324  DNA ligase  41.06 
 
 		 269 aa  206  5e-52  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1436  DNA ligase  36.63 
 
 		 298 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.532256  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1225  DNA ligase  40.24 
 
 		 302 aa  196  3e-49  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0877468  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0036  DNA ligase  37.3 
 
 		 312 aa  194  1e-48  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1796  DNA ligase (ATP)  39.26 
 
 		 271 aa  189  5e-47  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1995  DNA ligase  41.39 
 
 		 282 aa  188  9e-47  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0244293  normal  0.371724 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0782  DNA ligase  37.2 
 
 		 275 aa  188  1e-46  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.200091  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2369  DNA ligase  36.78 
 
 		 279 aa  188  1e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.815308  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1672  DNA ligase  36.58 
 
 		 266 aa  182  6e-45  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0465  DNA ligase  34.98 
 
 		 275 aa  178  1e-43  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.51001  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1648  PBCV-1 DNA ligase  26.25 
 
 		 306 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.176774  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0294  ATP-dependent DNA ligase  27.68 
 
 		 845 aa  53.1  0.000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07110  ATP-dependent DNA ligase  30.43 
 
 		 847 aa  47.4  0.0003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0128  ATP-dependent DNA ligase  24.62 
 
 		 831 aa  46.6  0.0005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0520  ATP-dependent DNA ligase  26.67 
 
 		 828 aa  46.2  0.0006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18891  ATP-dependent DNA ligase  37.84 
 
 		 437 aa  45.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.986725  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18701  ATP-dependent DNA ligase  36.49 
 
 		 437 aa  44.7  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.570895  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1772  ATP-dependent DNA ligase  28.33 
 
 		 437 aa  44.7  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18701  ATP-dependent DNA ligase  24.66 
 
 		 412 aa  43.5  0.005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5079  ATP-dependent DNA ligase  28.91 
 
 		 901 aa  43.5  0.005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.795218  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>