72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_2777 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_2777  hypothetical protein  100 
 
 		 337 aa  698    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.668338  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2531  hypothetical protein  32.46 
 
 		 372 aa  185  8e-46  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2417  hypothetical protein  32.11 
 
 		 338 aa  182  1e-44  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.479744  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2369  hypothetical protein  32.52 
 
 		 323 aa  180  2e-44  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.366253  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2349  hypothetical protein  32 
 
 		 417 aa  179  4e-44  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1966  hypothetical protein  33.23 
 
 		 329 aa  179  4.999999999999999e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1878  hypothetical protein  34.16 
 
 		 330 aa  178  9e-44  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2108  hypothetical protein  35.91 
 
 		 354 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2050  hypothetical protein  36.09 
 
 		 365 aa  169  6e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2097  hypothetical protein  36.09 
 
 		 365 aa  169  6e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2288  protein of unknown function DUF58  35.8 
 
 		 365 aa  169  8e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.523334  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2276  hypothetical protein  34.42 
 
 		 365 aa  165  8e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4562  hypothetical protein  34.42 
 
 		 365 aa  165  8e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2243  hypothetical protein  33.23 
 
 		 361 aa  164  3e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.760307  normal  0.435241 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1898  hypothetical protein  34.58 
 
 		 342 aa  163  4.0000000000000004e-39  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2624  hypothetical protein  32.82 
 
 		 329 aa  162  6e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.681677  normal  0.0502315 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2068  hypothetical protein  29.39 
 
 		 349 aa  162  1e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.604941 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2249  hypothetical protein  31.06 
 
 		 327 aa  160  3e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.497774  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2449  hypothetical protein  30 
 
 		 318 aa  159  7e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.340294  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1855  hypothetical protein  33.53 
 
 		 361 aa  159  9e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.270651  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1777  hypothetical protein  33.23 
 
 		 361 aa  157  2e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2280  hypothetical protein  29.91 
 
 		 317 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2151  hypothetical protein  34.19 
 
 		 346 aa  152  1e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2127  hypothetical protein  34.37 
 
 		 334 aa  151  2e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2054  hypothetical protein  30.43 
 
 		 318 aa  145  1e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.285922  normal  0.509055 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1576  hypothetical protein  28.34 
 
 		 339 aa  142  6e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0183217  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26920  hypothetical protein  27.73 
 
 		 318 aa  133  5e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1490  hypothetical protein  29.91 
 
 		 326 aa  129  6e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.00153565  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1884  hypothetical protein  30.25 
 
 		 323 aa  129  6e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.65449  normal  0.844493 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1944  hypothetical protein  26.5 
 
 		 353 aa  128  2.0000000000000002e-28  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1838  hypothetical protein  28.3 
 
 		 317 aa  124  2e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1675  hypothetical protein  26.26 
 
 		 353 aa  120  3.9999999999999996e-26  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02556  hypothetical protein  28.28 
 
 		 374 aa  119  7.999999999999999e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2075  protein of unknown function DUF58  25.57 
 
 		 315 aa  116  5e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0220521  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0467  hypothetical protein  25.25 
 
 		 321 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1863  hypothetical protein  27.03 
 
 		 316 aa  107  4e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1872  hypothetical protein  26.95 
 
 		 316 aa  103  5e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3625  hypothetical protein  24.38 
 
 		 316 aa  101  1e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3378  protein of unknown function DUF58  25.45 
 
 		 323 aa  99.4  7e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.476103  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1218  hypothetical protein  24.07 
 
 		 355 aa  96.7  6e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.892265  normal  0.23692 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0820  hypothetical protein  23.74 
 
 		 323 aa  94.7  2e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3969  protein of unknown function DUF58  24.7 
 
 		 357 aa  90.9  3e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.068653 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2385  hypothetical protein  24.23 
 
 		 344 aa  90.9  3e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3855  protein of unknown function DUF58  24.7 
 
 		 357 aa  90.9  3e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1324  protein of unknown function DUF58  23.34 
 
 		 344 aa  89.4  8e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.12431  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2518  hypothetical protein  24.07 
 
 		 316 aa  89.4  8e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.451759  normal  0.113037 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0727  protein of unknown function DUF58  23.23 
 
 		 302 aa  89.4  8e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03012  hypothetical protein  23.72 
 
 		 352 aa  87.8  2e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.606349 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2530  hypothetical protein  23.4 
 
 		 341 aa  87  4e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3147  hypothetical protein  24.56 
 
 		 337 aa  84.7  0.000000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.210354 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5566  hypothetical protein  23.79 
 
 		 346 aa  82.8  0.000000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.708703  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2097  hypothetical protein  23.56 
 
 		 372 aa  80.1  0.00000000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3010  protein of unknown function DUF58  21.88 
 
 		 333 aa  76.3  0.0000000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.29026  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2815  hypothetical protein  22.96 
 
 		 341 aa  74.7  0.000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.682313  normal  0.278413 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2162  hypothetical protein  21.19 
 
 		 339 aa  73.9  0.000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0151001  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2304  protein of unknown function DUF58  24.1 
 
 		 341 aa  74.3  0.000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02437  hypothetical protein  24.6 
 
 		 318 aa  67  0.0000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1211  hypothetical protein  22.16 
 
 		 319 aa  65.9  0.0000000009  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1117  hypothetical protein  22.16 
 
 		 319 aa  65.9  0.0000000009  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1793  transglutaminase-like protein  21.67 
 
 		 943 aa  62.8  0.000000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.634482  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2913  hypothetical protein  21.9 
 
 		 362 aa  62  0.00000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.278272 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2043  protein of unknown function DUF58  25.56 
 
 		 267 aa  62  0.00000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3276  hypothetical protein  21.97 
 
 		 294 aa  60.8  0.00000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.864378  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0863  protein of unknown function DUF58  22.36 
 
 		 314 aa  59.3  0.00000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.344005  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1244  hypothetical protein  20.82 
 
 		 336 aa  59.3  0.0000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0164654  normal  0.183066 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2963  protein of unknown function DUF58  25.15 
 
 		 275 aa  56.6  0.0000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.023693 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1320  protein of unknown function DUF58  25.15 
 
 		 275 aa  56.6  0.0000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.5057  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2677  hypothetical protein  24.17 
 
 		 429 aa  48.9  0.0001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4966  protein of unknown function DUF58  22.06 
 
 		 450 aa  47  0.0005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000197556  hitchhiker  0.000000000000243349 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0817  protein of unknown function DUF58  21.29 
 
 		 552 aa  47  0.0005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0493  protein of unknown function DUF58  21.03 
 
 		 398 aa  45.4  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0623  hypothetical protein  26.19 
 
 		 419 aa  43.1  0.006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>