More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_1533 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008261  CPF_1533  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  100 
 
 
230 aa  461  1e-129  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0016393  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1326  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  97.76 
 
 
224 aa  434  1e-121  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00202855  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1012  ABC transporter-related protein  46.58 
 
 
264 aa  229  4e-59  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3404  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  44.54 
 
 
240 aa  226  2e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0452934  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1477  ABC transporter related  44.1 
 
 
242 aa  224  8e-58  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2805  ABC transporter related protein  44.1 
 
 
242 aa  222  3e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0234  ABC transporter related  44.25 
 
 
243 aa  221  6e-57  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1940  ABC transporter related  47.39 
 
 
263 aa  221  8e-57  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00554331  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2857  ABC transporter related  44.54 
 
 
244 aa  220  1.9999999999999999e-56  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.969115 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3408  ABC transporter ATP-binding protein  43.61 
 
 
253 aa  219  3e-56  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.711353 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1137  ABC transporter related  46.72 
 
 
240 aa  219  3e-56  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0546952  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1053  ABC transporter related  44.54 
 
 
242 aa  218  6e-56  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2367  ABC transporter related  42.79 
 
 
252 aa  218  6e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5537  ABC transporter related  44.49 
 
 
255 aa  218  7e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.772431 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2587  ABC transporter related  44.98 
 
 
240 aa  218  8.999999999999998e-56  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.163007  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0349  ABC transporter related  47.6 
 
 
240 aa  217  1e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2289  ABC transporter related  45.45 
 
 
240 aa  217  1e-55  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000025555  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3930  ABC transporter related  45.73 
 
 
267 aa  216  2e-55  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.101996  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0611  ATPase  43.81 
 
 
248 aa  216  2e-55  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.355376  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0377  ABC transporter-like  45.3 
 
 
244 aa  216  2e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.250088 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1064  ABC transporter related  42.36 
 
 
252 aa  216  2e-55  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.737495 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2847  ABC transporter-related protein  45.41 
 
 
240 aa  216  2.9999999999999998e-55  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.174952  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1042  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  45.41 
 
 
241 aa  216  2.9999999999999998e-55  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2055  ABC transporter related protein  44.1 
 
 
244 aa  216  2.9999999999999998e-55  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0917  ABC transporter related  45.41 
 
 
241 aa  215  4e-55  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.966911 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0880  ABC transporter related  45.41 
 
 
241 aa  215  4e-55  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.152128  normal  0.31511 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1920  ABC transporter related  44.54 
 
 
249 aa  215  4e-55  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2934  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  45.41 
 
 
250 aa  215  5e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0125  ABC transporter related protein  44.1 
 
 
246 aa  215  5e-55  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.525287  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1125  ABC transporter-like protein  41.05 
 
 
250 aa  215  5e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.849135  normal  0.168368 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3519  ABC transporter related protein  45.95 
 
 
240 aa  215  5e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0469  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  47.6 
 
 
240 aa  215  5.9999999999999996e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1473  ABC transporter related  45.41 
 
 
243 aa  215  5.9999999999999996e-55  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0234902  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0502  ABC transporter related  41.74 
 
 
244 aa  215  5.9999999999999996e-55  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0314  hypothetical protein  43.48 
 
 
255 aa  215  5.9999999999999996e-55  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000509196  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0468  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  47.6 
 
 
240 aa  215  5.9999999999999996e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0949  ABC transporter related  44.54 
 
 
241 aa  214  8e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0984  ABC transporter related  44.54 
 
 
241 aa  214  8e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13310  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  42.86 
 
 
255 aa  214  9e-55  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05528  arginine transporter ATP-binding subunit  45.5 
 
 
247 aa  214  9.999999999999999e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0973  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  44.98 
 
 
240 aa  214  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000128228  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0403  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  47.6 
 
 
240 aa  214  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0354  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  47.6 
 
 
240 aa  214  9.999999999999999e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0337  glutamine transport, ATP-binding protein  47.6 
 
 
240 aa  214  9.999999999999999e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.410517  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0340  glutamine transport, ATP-binding protein  47.6 
 
 
240 aa  214  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.474686  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3012  phosphate ABC transporter ATPase  42.74 
 
 
269 aa  214  9.999999999999999e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0453567  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0417  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  48.03 
 
 
240 aa  214  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4262  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  44.98 
 
 
240 aa  214  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00783268  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0955  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  44.59 
 
 
240 aa  214  9.999999999999999e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.170507  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0368  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  47.6 
 
 
240 aa  214  9.999999999999999e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4837  ABC transporter related  45.37 
 
 
244 aa  214  9.999999999999999e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0177235  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0403  ABC transporter related  40.17 
 
 
245 aa  214  9.999999999999999e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.3347 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2504  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  44.64 
 
 
250 aa  214  9.999999999999999e-55  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.020525  normal  0.777652 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0864  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  44.59 
 
 
240 aa  214  9.999999999999999e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_14241  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  42.92 
 
 
248 aa  214  9.999999999999999e-55  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3055  ABC transporter related  44.98 
 
 
241 aa  214  9.999999999999999e-55  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00427883  hitchhiker  0.00805011 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0976  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  44.59 
 
 
240 aa  214  9.999999999999999e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.345768  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0892  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  44.59 
 
 
240 aa  214  9.999999999999999e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0239276  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_6012  ABC transporter related  42.48 
 
 
251 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.469772  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0923  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  44.59 
 
 
240 aa  214  9.999999999999999e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0351202  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1265  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  44.98 
 
 
250 aa  213  9.999999999999999e-55  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0153826  normal  0.0123229 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1729  ABC transporter related protein  44.98 
 
 
250 aa  213  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000704293  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2007  ABC transporter related  43.48 
 
 
251 aa  213  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.069076  normal  0.0108344 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4901  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  47.16 
 
 
240 aa  213  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2622  ABC transporter related  44.54 
 
 
241 aa  213  1.9999999999999998e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0516  ABC transporter related  47.2 
 
 
216 aa  213  1.9999999999999998e-54  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3762  ABC transporter-related protein  45.95 
 
 
241 aa  213  1.9999999999999998e-54  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000558421  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1722  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  44.98 
 
 
250 aa  213  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.606951  normal  0.807623 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1229  ABC transporter related  45.41 
 
 
243 aa  213  1.9999999999999998e-54  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0911  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  47.16 
 
 
242 aa  213  1.9999999999999998e-54  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.233716  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2016  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  44.98 
 
 
250 aa  213  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00167792  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1924  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  45.18 
 
 
247 aa  213  1.9999999999999998e-54  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.467603  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2151  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  44.98 
 
 
250 aa  213  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00643103  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2691  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  44.98 
 
 
250 aa  213  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0086331  normal  0.026152 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0981  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  47.6 
 
 
242 aa  212  2.9999999999999995e-54  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4057  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  45.22 
 
 
240 aa  212  2.9999999999999995e-54  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000175078  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3903  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  45.22 
 
 
240 aa  212  2.9999999999999995e-54  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000661212  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4374  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  45.22 
 
 
240 aa  212  2.9999999999999995e-54  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00801919  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3394  ABC transporter related  44.1 
 
 
241 aa  212  2.9999999999999995e-54  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00476356  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4283  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  45.22 
 
 
240 aa  212  2.9999999999999995e-54  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000077342  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4704  ABC transporter-related protein  43.86 
 
 
257 aa  213  2.9999999999999995e-54  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.874551  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0726  ABC transporter related  45.95 
 
 
243 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.019566  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0887  ABC transporter related  48.46 
 
 
253 aa  212  2.9999999999999995e-54  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000314613  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0227  ABC transporter-like  42.36 
 
 
265 aa  212  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.244915  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1045  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  44.98 
 
 
250 aa  212  3.9999999999999995e-54  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00188517  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0652  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  45.02 
 
 
244 aa  212  3.9999999999999995e-54  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.219749  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1598  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  45.95 
 
 
240 aa  212  3.9999999999999995e-54  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.842708  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00776  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  44.59 
 
 
240 aa  212  4.9999999999999996e-54  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2833  ABC transporter related protein  44.59 
 
 
240 aa  212  4.9999999999999996e-54  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0462198  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4223  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  45.22 
 
 
240 aa  212  4.9999999999999996e-54  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00581903  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0878  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  44.59 
 
 
240 aa  212  4.9999999999999996e-54  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000303797  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0833  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  44.59 
 
 
240 aa  212  4.9999999999999996e-54  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.00000142512  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0958  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  44.59 
 
 
240 aa  212  4.9999999999999996e-54  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00478408  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00793  hypothetical protein  44.59 
 
 
240 aa  212  4.9999999999999996e-54  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0865  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  44.59 
 
 
240 aa  212  4.9999999999999996e-54  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000243659  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2539  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  44.59 
 
 
240 aa  212  4.9999999999999996e-54  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000650247  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2834  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  44.59 
 
 
240 aa  212  4.9999999999999996e-54  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.651413  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4172  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  45.22 
 
 
240 aa  212  4.9999999999999996e-54  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.183609 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1775  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  45.95 
 
 
240 aa  211  5.999999999999999e-54  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0021514  normal  0.116362 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3896  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  45.22 
 
 
240 aa  211  5.999999999999999e-54  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000617996  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>