More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_0324 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_0324  TldD/PmbA family protein  100 
 
 		 449 aa  887    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0326  TldD/PmbA family protein  96.66 
 
 		 449 aa  860    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0071  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  35.48 
 
 		 447 aa  261  1e-68  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.208063  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0057  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  36.53 
 
 		 435 aa  261  1e-68  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1709  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  35.49 
 
 		 441 aa  257  3e-67  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1049  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  31.92 
 
 		 457 aa  237  3e-61  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000445588  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1482  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  33.26 
 
 		 442 aa  230  5e-59  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000528913  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0200  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  31.92 
 
 		 435 aa  222  9e-57  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.06513  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1002  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  31.76 
 
 		 447 aa  222  9.999999999999999e-57  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0202  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  32.14 
 
 		 435 aa  222  9.999999999999999e-57  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0734503  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2060  pmbA protein, putative  29.66 
 
 		 446 aa  217  2.9999999999999998e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.525901  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0947  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  30.05 
 
 		 445 aa  216  5.9999999999999996e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.250758  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1775  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  29.37 
 
 		 446 aa  204  3e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000351423 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1541  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  27.63 
 
 		 450 aa  201  1.9999999999999998e-50  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0734056 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2696  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  28.84 
 
 		 462 aa  201  1.9999999999999998e-50  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.781892  normal  0.389793 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2442  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  28.9 
 
 		 446 aa  201  1.9999999999999998e-50  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1030  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  31.55 
 
 		 442 aa  197  3e-49  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1709  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  29.33 
 
 		 445 aa  195  1e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0311479  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0661  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  27.52 
 
 		 445 aa  190  4e-47  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2382  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  29.58 
 
 		 438 aa  189  9e-47  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0352  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  33.82 
 
 		 452 aa  184  2.0000000000000003e-45  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.678191  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0543  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  28.03 
 
 		 446 aa  184  2.0000000000000003e-45  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0776  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  29.93 
 
 		 437 aa  178  2e-43  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.58521  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4625  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  29.28 
 
 		 444 aa  164  3e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4760  microcin-processing peptidase 1  28.78 
 
 		 460 aa  161  3e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.447651  normal  0.0115347 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1348  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  29.73 
 
 		 446 aa  160  4e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2764  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  28.89 
 
 		 446 aa  156  6e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0882  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  28.7 
 
 		 436 aa  153  5e-36  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1165  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  29.93 
 
 		 444 aa  151  2e-35  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.860051  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2178  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  30.7 
 
 		 446 aa  149  1.0000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2130  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  30.93 
 
 		 446 aa  149  1.0000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1475  DNA gyrase modulator peptidase U62  29.11 
 
 		 453 aa  148  2.0000000000000003e-34  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0009  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  30.65 
 
 		 462 aa  148  2.0000000000000003e-34  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3530  PmbA/TldD family protein  28.01 
 
 		 436 aa  147  3e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.314475  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3343  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  26.84 
 
 		 453 aa  145  2e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0433792  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06836  peptidase  24.94 
 
 		 447 aa  144  3e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000861  predicted Zn-dependent protease  26.33 
 
 		 447 aa  142  9.999999999999999e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000133704  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002397  PmbA protein  27.71 
 
 		 447 aa  139  7e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1234  pmbA protein  29.91 
 
 		 444 aa  138  2e-31  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0553  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  28.6 
 
 		 437 aa  138  2e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0193  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  27.11 
 
 		 441 aa  138  2e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.26115  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0413  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  27.99 
 
 		 450 aa  137  4e-31  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.207758  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4708  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  30.51 
 
 		 465 aa  137  5e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1164  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  27.47 
 
 		 470 aa  135  9.999999999999999e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1852  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  31.65 
 
 		 465 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.405759  decreased coverage  0.000697877 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1210  TldD/PmbA family protein  28.99 
 
 		 440 aa  136  9.999999999999999e-31  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0502  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  26.89 
 
 		 433 aa  135  9.999999999999999e-31  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.350832  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0597  microcin-processing peptidase 1  26.1 
 
 		 447 aa  135  1.9999999999999998e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0775  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  27.72 
 
 		 462 aa  134  3.9999999999999996e-30  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.861031  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01893  PmbA  25.22 
 
 		 455 aa  134  3.9999999999999996e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1346  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  30.3 
 
 		 465 aa  133  6.999999999999999e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.200432  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2896  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  23.79 
 
 		 455 aa  132  9e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2263  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  24.03 
 
 		 481 aa  132  1.0000000000000001e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00176392  decreased coverage  0.00000000093987 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0390  microcin-processing peptidase 1  30.35 
 
 		 444 aa  132  1.0000000000000001e-29  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.248859  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2637  tldD protein  24.03 
 
 		 481 aa  132  1.0000000000000001e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0997282  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2560  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  29.52 
 
 		 479 aa  132  2.0000000000000002e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.206592  normal  0.703309 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2720  microcin-processing peptidase 2  26.36 
 
 		 460 aa  130  4.0000000000000003e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03671  peptidase PmbA  26.81 
 
 		 447 aa  130  4.0000000000000003e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4112  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  31.31 
 
 		 465 aa  130  5.0000000000000004e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0755  microcin-processing peptidase 1  28.7 
 
 		 440 aa  130  5.0000000000000004e-29  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0600  pmbA protein  31.4 
 
 		 448 aa  130  6e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2361  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  27.74 
 
 		 448 aa  130  6e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0753  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  31.4 
 
 		 448 aa  130  6e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0158404 
 
 
-
 
NC_002936  DET0526  pmbA/tldD family protein  26.46 
 
 		 433 aa  129  8.000000000000001e-29  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0575  microcin-processing peptidase 1  29.1 
 
 		 452 aa  129  9.000000000000001e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.580246  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0557  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  28.95 
 
 		 474 aa  129  9.000000000000001e-29  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0089  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  27.47 
 
 		 458 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0732  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  27.25 
 
 		 458 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.285912 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1735  hypothetical protein  27.16 
 
 		 452 aa  128  2.0000000000000002e-28  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1289  putative modulator of DNA gyrase  27.07 
 
 		 446 aa  128  2.0000000000000002e-28  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.387477 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1132  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  26.8 
 
 		 441 aa  128  2.0000000000000002e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0798905  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1014  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  27.11 
 
 		 438 aa  127  3e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00863088  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4713  peptidase PmbA  25.23 
 
 		 450 aa  127  3e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1519  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  26.58 
 
 		 460 aa  127  3e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000701587 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0414  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  25.71 
 
 		 455 aa  127  3e-28  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.273882  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1186  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  27.25 
 
 		 458 aa  127  3e-28  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04103  predicted peptidase required for the maturation and secretion of the antibiotic peptide MccB17  25.46 
 
 		 450 aa  127  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04067  hypothetical protein  25.46 
 
 		 450 aa  127  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.853589  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4488  peptidase PmbA  25.46 
 
 		 446 aa  127  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5754  peptidase PmbA  25.46 
 
 		 446 aa  127  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4849  peptidase PmbA  25.46 
 
 		 446 aa  127  4.0000000000000003e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4805  peptidase PmbA  25.46 
 
 		 446 aa  127  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3759  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  25.46 
 
 		 450 aa  127  5e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3776  peptidase PmbA  25.4 
 
 		 450 aa  127  5e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2721  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  25 
 
 		 460 aa  127  5e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2241  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  29.25 
 
 		 427 aa  127  5e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2179  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  29.25 
 
 		 427 aa  126  6e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0434  microcin-processing peptidase 1  30.3 
 
 		 445 aa  126  7e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4534  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  29.25 
 
 		 443 aa  125  1e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.333963 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2232  microcin-processing peptidase 1  27.58 
 
 		 446 aa  125  1e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.352601  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0474  PmbA protein  25.49 
 
 		 455 aa  125  1e-27  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.184246  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0639  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  24.22 
 
 		 453 aa  125  1e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.169541 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1735  hypothetical protein  26.92 
 
 		 452 aa  125  2e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0660  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  25.73 
 
 		 464 aa  125  2e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0650  pmbA protein  28.8 
 
 		 448 aa  125  2e-27  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.501682  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1308  modulator of DNA gyrase  25.38 
 
 		 456 aa  124  3e-27  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0323  TldD/PmbA family protein  28.85 
 
 		 461 aa  124  3e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0422  peptidase PmbA  24.94 
 
 		 450 aa  124  4e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0383  pmbA protein  26.03 
 
 		 444 aa  124  4e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.976724  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4783  peptidase PmbA  25.4 
 
 		 446 aa  124  4e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.137949  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>