More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_3083 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_3083  aminotransferase  100 
 
 		 383 aa  786    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4207  aminotransferase class-III  70.56 
 
 		 377 aa  555  1e-157  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.144309  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6554  aminotransferase class-III  68.87 
 
 		 376 aa  522  1e-147  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4419  aminotransferase class-III  63.88 
 
 		 378 aa  490  1e-137  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1153  aminotransferase class-III  63.88 
 
 		 377 aa  486  1e-136  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3433  aminotransferase class-III  53.7 
 
 		 379 aa  421  1e-117  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.790855  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3029  acetylornithine aminotransferase  38.73 
 
 		 410 aa  259  7e-68  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.51469  normal  0.939431 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1164  acetylornithine aminotransferase  37.31 
 
 		 398 aa  253  5.000000000000001e-66  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.581434  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0982  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  37.34 
 
 		 410 aa  251  1e-65  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3011  acetylornithine aminotransferase  36.9 
 
 		 404 aa  251  2e-65  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2618  acetylornithine aminotransferase  37.6 
 
 		 400 aa  250  3e-65  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00459682  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0906  acetylornithine aminotransferase  36.39 
 
 		 402 aa  249  6e-65  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3572  acetylornithine aminotransferase  37.15 
 
 		 404 aa  249  8e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.331421 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1452  acetylornithine aminotransferase  38.52 
 
 		 402 aa  248  9e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1901  acetylornithine aminotransferase  37.24 
 
 		 400 aa  248  2e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.133726  normal  0.687258 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2121  acetylornithine aminotransferase  36.36 
 
 		 404 aa  244  3e-63  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.00994118  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2358  acetylornithine aminotransferase  37.6 
 
 		 400 aa  243  6e-63  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.284538  normal  0.840689 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3708  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  37.18 
 
 		 412 aa  242  9e-63  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.339324  normal  0.0114471 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0947  aminotransferase class-III  38.58 
 
 		 395 aa  241  1e-62  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0679656  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2464  acetylornithine aminotransferase  37.18 
 
 		 392 aa  240  4e-62  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4636  acetylornithine aminotransferase  36.97 
 
 		 395 aa  238  1e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.621133  normal  0.175641 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1041  acetylornithine aminotransferase  35.03 
 
 		 390 aa  238  1e-61  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.370932  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2079  acetylornithine aminotransferase  36.43 
 
 		 391 aa  237  2e-61  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2912  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  37.66 
 
 		 400 aa  238  2e-61  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.386564  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2179  acetylornithine aminotransferase  35.44 
 
 		 398 aa  236  6e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.569965  normal  0.442274 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2429  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  35.53 
 
 		 393 aa  235  1.0000000000000001e-60  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0068  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  39.02 
 
 		 375 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.413029  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1566  acetylornithine aminotransferase  38.56 
 
 		 395 aa  233  4.0000000000000004e-60  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1346  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  38.11 
 
 		 399 aa  233  4.0000000000000004e-60  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0353  acetylornithine aminotransferase  39.39 
 
 		 395 aa  233  5e-60  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00220895 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0483  acetylornithine aminotransferase  39.13 
 
 		 395 aa  232  8.000000000000001e-60  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3033  acetylornithine aminotransferase  37.56 
 
 		 390 aa  232  9e-60  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.850335  normal  0.390329 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0871  acetylornithine aminotransferase  36.94 
 
 		 403 aa  231  1e-59  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1710  acetylornithine aminotransferase  36.73 
 
 		 392 aa  230  3e-59  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0925352  hitchhiker  0.00335003 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1499  aminotransferase class-III  35.73 
 
 		 375 aa  230  4e-59  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0533  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  35.52 
 
 		 394 aa  230  4e-59  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2676  acetylornithine aminotransferase  34.87 
 
 		 391 aa  229  5e-59  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3172  acetylornithine aminotransferase  36.81 
 
 		 444 aa  228  1e-58  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.22064  normal  0.239102 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3002  acetylornithine aminotransferase  34.77 
 
 		 398 aa  228  1e-58  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.555766  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2429  acetylornithine aminotransferase  34.77 
 
 		 398 aa  228  2e-58  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2195  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  39.67 
 
 		 403 aa  228  2e-58  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0151  acetylornithine aminotransferase  36.02 
 
 		 399 aa  227  3e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1866  acetylornithine aminotransferase  40.69 
 
 		 400 aa  227  3e-58  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0946  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  35.28 
 
 		 398 aa  226  4e-58  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.104291  normal  0.0999204 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0570  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  36.78 
 
 		 388 aa  226  4e-58  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0739  acetylornithine aminotransferase  37.34 
 
 		 386 aa  226  4e-58  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.791606  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0406  acetylornithine aminotransferase  36.78 
 
 		 388 aa  226  4e-58  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1596  acetylornithine aminotransferase  37.18 
 
 		 386 aa  226  5.0000000000000005e-58  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2204  acetylornithine aminotransferase  36.24 
 
 		 390 aa  224  2e-57  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1784  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  36.41 
 
 		 385 aa  223  4e-57  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.74918  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5468  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  36.58 
 
 		 436 aa  222  8e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0529885 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3309  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  36.13 
 
 		 393 aa  221  1.9999999999999999e-56  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2287  acetylornithine aminotransferase  36.02 
 
 		 402 aa  219  5e-56  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.194315 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3962  acetylornithine aminotransferase  34.55 
 
 		 386 aa  219  6e-56  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00766837  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4200  acetylornithine aminotransferase  35.77 
 
 		 386 aa  218  1e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3636  acetylornithine aminotransferase  34.77 
 
 		 397 aa  218  1e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1901  acetylornithine and succinylornithine aminotransferases  36.91 
 
 		 374 aa  218  1e-55  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0640  acetylornithine aminotransferase  37.34 
 
 		 403 aa  217  2e-55  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.41902  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0660  acetylornithine aminotransferase  36.22 
 
 		 394 aa  218  2e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0226  acetylornithine aminotransferase  35.46 
 
 		 396 aa  218  2e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1740  acetylornithine aminotransferase  37 
 
 		 414 aa  218  2e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00212917 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0426  acetylornithine aminotransferase  35.99 
 
 		 396 aa  217  2.9999999999999998e-55  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0269327  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1830  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  35.88 
 
 		 395 aa  217  2.9999999999999998e-55  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.991221  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1851  acetylornithine aminotransferase  37.72 
 
 		 394 aa  216  4e-55  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1758  aminotransferase class-III  33.96 
 
 		 384 aa  216  4e-55  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2826  acetylornithine aminotransferase  33.68 
 
 		 386 aa  216  4e-55  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2288  acetylornithine and succinylornithine aminotransferases  35.22 
 
 		 396 aa  216  5e-55  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.37355  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3040  acetylornithine aminotransferase  35.9 
 
 		 389 aa  216  7e-55  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2028  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  36.2 
 
 		 399 aa  216  8e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.832641  normal  0.501384 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0274  acetylornithine aminotransferase  36.25 
 
 		 396 aa  215  9e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.110157  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1072  acetylornithine aminotransferase  36.71 
 
 		 385 aa  215  9.999999999999999e-55  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0280572  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1102  acetylornithine aminotransferase  35.45 
 
 		 394 aa  214  1.9999999999999998e-54  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3173  acetylornithine aminotransferase  36.06 
 
 		 398 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.324258  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0063  acetylornithine and succinylornithine aminotransferases  34.27 
 
 		 396 aa  214  2.9999999999999995e-54  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.857354  normal  0.372491 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34500  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  38.08 
 
 		 406 aa  213  3.9999999999999995e-54  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2898  acetylornithine aminotransferase  35.64 
 
 		 389 aa  213  4.9999999999999996e-54  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3741  acetylornithine aminotransferase  34.26 
 
 		 397 aa  213  5.999999999999999e-54  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4239  acetylornithine aminotransferase  34.99 
 
 		 386 aa  213  5.999999999999999e-54  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1040  acetylornithine aminotransferase  36.71 
 
 		 385 aa  213  5.999999999999999e-54  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000111021  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02850  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  37.14 
 
 		 399 aa  211  1e-53  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000577952  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0772  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  35.37 
 
 		 399 aa  211  2e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.200689  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3158  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  35.84 
 
 		 416 aa  211  2e-53  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1696  bifunctional succinylornithine transaminase/acetylornithine transaminase  40.36 
 
 		 406 aa  211  2e-53  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2613  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  34.84 
 
 		 375 aa  211  2e-53  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4263  acetylornithine aminotransferase  34.73 
 
 		 386 aa  211  2e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0997  acetylornithine aminotransferase  34.73 
 
 		 386 aa  210  3e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2838  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  37.93 
 
 		 393 aa  210  3e-53  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0375409  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3150  acetylornithine aminotransferase  36.04 
 
 		 399 aa  209  5e-53  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0245  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  39.82 
 
 		 405 aa  209  6e-53  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.110716  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3527  acetylornithine aminotransferase  35.62 
 
 		 395 aa  209  6e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.327175  normal  0.819815 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3704  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  39.82 
 
 		 405 aa  209  6e-53  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2493  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  36.18 
 
 		 397 aa  209  6e-53  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3947  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  39.76 
 
 		 405 aa  209  7e-53  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0348  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  35.66 
 
 		 395 aa  209  7e-53  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.276087 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2649  acetylornithine aminotransferase  36.84 
 
 		 423 aa  209  8e-53  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.46775  normal  0.4632 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0285  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  34.99 
 
 		 413 aa  208  1e-52  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1218  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  33.25 
 
 		 402 aa  208  1e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.525687  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2138  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  36.71 
 
 		 383 aa  207  2e-52  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0368  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  37.09 
 
 		 406 aa  207  2e-52  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00079  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  40.12 
 
 		 403 aa  207  2e-52  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>