More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_1153 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_1153  aminotransferase class-III  100 
 
 		 377 aa  775    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4419  aminotransferase class-III  79.09 
 
 		 378 aa  624  1e-178  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3083  aminotransferase  63.88 
 
 		 383 aa  486  1e-136  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6554  aminotransferase class-III  63.17 
 
 		 376 aa  473  1e-132  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4207  aminotransferase class-III  59.36 
 
 		 377 aa  462  1e-129  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.144309  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3433  aminotransferase class-III  58.42 
 
 		 379 aa  439  9.999999999999999e-123  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.790855  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1164  acetylornithine aminotransferase  40.79 
 
 		 398 aa  275  1.0000000000000001e-72  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.581434  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3011  acetylornithine aminotransferase  40.67 
 
 		 404 aa  273  3e-72  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3572  acetylornithine aminotransferase  40.92 
 
 		 404 aa  271  1e-71  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.331421 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0946  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  42.11 
 
 		 398 aa  268  8e-71  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.104291  normal  0.0999204 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2464  acetylornithine aminotransferase  42.93 
 
 		 392 aa  265  7e-70  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2121  acetylornithine aminotransferase  40.36 
 
 		 404 aa  265  1e-69  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.00994118  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1452  acetylornithine aminotransferase  39.9 
 
 		 402 aa  256  3e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0906  acetylornithine aminotransferase  40.22 
 
 		 402 aa  255  8e-67  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2079  acetylornithine aminotransferase  39.53 
 
 		 391 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3029  acetylornithine aminotransferase  41.03 
 
 		 410 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.51469  normal  0.939431 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3636  acetylornithine aminotransferase  39.21 
 
 		 397 aa  254  2.0000000000000002e-66  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2358  acetylornithine aminotransferase  40.52 
 
 		 400 aa  251  1e-65  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.284538  normal  0.840689 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0739  acetylornithine aminotransferase  39.47 
 
 		 386 aa  251  2e-65  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.791606  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0226  acetylornithine aminotransferase  38.95 
 
 		 396 aa  250  3e-65  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3309  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  39.08 
 
 		 393 aa  250  3e-65  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0871  acetylornithine aminotransferase  38.23 
 
 		 403 aa  249  4e-65  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0982  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  38.96 
 
 		 410 aa  249  4e-65  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1596  acetylornithine aminotransferase  38.36 
 
 		 386 aa  248  1e-64  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1041  acetylornithine aminotransferase  37.69 
 
 		 390 aa  248  1e-64  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.370932  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1901  acetylornithine aminotransferase  38.54 
 
 		 400 aa  247  2e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.133726  normal  0.687258 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2912  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  37.33 
 
 		 400 aa  247  2e-64  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.386564  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2204  acetylornithine aminotransferase  38.7 
 
 		 390 aa  247  3e-64  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0353  acetylornithine aminotransferase  39.37 
 
 		 395 aa  246  4.9999999999999997e-64  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00220895 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3741  acetylornithine aminotransferase  37.89 
 
 		 397 aa  244  9.999999999999999e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2618  acetylornithine aminotransferase  39.43 
 
 		 400 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00459682  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0274  acetylornithine aminotransferase  38.28 
 
 		 396 aa  244  1.9999999999999999e-63  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.110157  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1830  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  38.01 
 
 		 395 aa  243  3.9999999999999997e-63  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.991221  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1566  acetylornithine aminotransferase  38.32 
 
 		 395 aa  243  5e-63  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2676  acetylornithine aminotransferase  36.72 
 
 		 391 aa  243  5e-63  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0348  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  38.32 
 
 		 395 aa  243  5e-63  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.276087 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3708  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  37.85 
 
 		 412 aa  243  5e-63  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.339324  normal  0.0114471 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0570  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  39.06 
 
 		 388 aa  242  7e-63  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0406  acetylornithine aminotransferase  39.06 
 
 		 388 aa  242  7e-63  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1866  acetylornithine aminotransferase  38.46 
 
 		 400 aa  242  7.999999999999999e-63  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4636  acetylornithine aminotransferase  39.52 
 
 		 395 aa  241  1e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.621133  normal  0.175641 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0947  aminotransferase class-III  38.54 
 
 		 395 aa  241  1e-62  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0679656  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0503  acetylornithine aminotransferase  38.81 
 
 		 376 aa  241  2e-62  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1784  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  37.67 
 
 		 385 aa  240  2.9999999999999997e-62  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.74918  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1758  aminotransferase class-III  36.9 
 
 		 384 aa  240  2.9999999999999997e-62  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1102  acetylornithine aminotransferase  38.34 
 
 		 394 aa  239  6.999999999999999e-62  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1710  acetylornithine aminotransferase  37.28 
 
 		 392 aa  238  9e-62  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0925352  hitchhiker  0.00335003 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0775  aminotransferase class-III  37.27 
 
 		 376 aa  238  1e-61  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.50348 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3150  acetylornithine aminotransferase  39.16 
 
 		 399 aa  238  1e-61  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1040  acetylornithine aminotransferase  37.56 
 
 		 385 aa  237  2e-61  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000111021  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1072  acetylornithine aminotransferase  37.05 
 
 		 385 aa  237  2e-61  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0280572  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0483  acetylornithine aminotransferase  37.89 
 
 		 395 aa  237  2e-61  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3172  acetylornithine aminotransferase  39.14 
 
 		 444 aa  237  3e-61  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.22064  normal  0.239102 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0701  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  37.22 
 
 		 410 aa  236  3e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0520056  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1409  acetylornithine transaminase protein  37.95 
 
 		 396 aa  236  4e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.111439  normal  0.291313 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2414  acetylornithine aminotransferase  37.18 
 
 		 396 aa  236  6e-61  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2613  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  37.93 
 
 		 375 aa  236  7e-61  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0151  acetylornithine aminotransferase  36.48 
 
 		 399 aa  235  1.0000000000000001e-60  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1180  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  36.96 
 
 		 410 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0150  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  37.6 
 
 		 405 aa  234  2.0000000000000002e-60  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1901  acetylornithine and succinylornithine aminotransferases  37.25 
 
 		 374 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2440  acetylornithine aminotransferase  37.11 
 
 		 388 aa  233  3e-60  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.493949  normal  0.0446911 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4291  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  36.46 
 
 		 410 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2288  acetylornithine and succinylornithine aminotransferases  37.3 
 
 		 396 aa  233  4.0000000000000004e-60  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.37355  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4200  acetylornithine aminotransferase  37.7 
 
 		 386 aa  233  5e-60  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1775  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  36.96 
 
 		 411 aa  233  5e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.664584  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0313  acetylornithine aminotransferase  35.87 
 
 		 380 aa  233  5e-60  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2165  acetylornithine transaminase protein  36.92 
 
 		 401 aa  233  6e-60  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0009  acetylornithine transaminase protein  37.43 
 
 		 401 aa  232  7.000000000000001e-60  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1291  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  36.34 
 
 		 393 aa  232  9e-60  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0338748 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2287  acetylornithine aminotransferase  36.17 
 
 		 402 aa  232  9e-60  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.194315 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5468  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  38.21 
 
 		 436 aa  231  1e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0529885 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0481  acetylornithine transaminase protein  37.37 
 
 		 402 aa  231  1e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3962  acetylornithine aminotransferase  36.51 
 
 		 386 aa  232  1e-59  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00766837  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0394  acetylornithine transaminase protein  37.66 
 
 		 403 aa  231  2e-59  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1558  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  38.06 
 
 		 411 aa  231  2e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.751074  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1851  acetylornithine aminotransferase  40.16 
 
 		 394 aa  231  2e-59  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002275  acetylornithine aminotransferase/N-succinyl-L,L-diaminopimelate aminotransferase/succinylornithine transaminase  38.22 
 
 		 403 aa  231  2e-59  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1499  aminotransferase class-III  36.16 
 
 		 375 aa  231  2e-59  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1157  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  36.46 
 
 		 410 aa  231  2e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.861166  normal  0.0351204 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1260  acetylornithine aminotransferase  40.39 
 
 		 399 aa  231  2e-59  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.161601 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1061  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  36.71 
 
 		 410 aa  231  2e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.964628  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1696  bifunctional succinylornithine transaminase/acetylornithine transaminase  37.59 
 
 		 406 aa  231  2e-59  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0185  acetylornithine transaminase protein  37.85 
 
 		 399 aa  230  3e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.372078 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1218  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  35.98 
 
 		 402 aa  230  3e-59  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.525687  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3158  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  39.29 
 
 		 416 aa  230  3e-59  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00079  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  38.28 
 
 		 403 aa  230  4e-59  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2300  acetylornithine and succinylornithine aminotransferases  39.73 
 
 		 394 aa  230  4e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6536  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  37.97 
 
 		 397 aa  229  4e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.396008  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0640  acetylornithine aminotransferase  37.37 
 
 		 403 aa  229  4e-59  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.41902  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3105  acetylornithine transaminase protein  37.04 
 
 		 393 aa  229  5e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.546024  normal  0.0590877 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3146  aminotransferase class-III  38.98 
 
 		 408 aa  229  5e-59  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.733649  normal  0.0499094 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1907  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  36.41 
 
 		 387 aa  229  6e-59  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0119007  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1371  acetylornithine aminotransferase  36.41 
 
 		 379 aa  229  6e-59  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1416  acetylornithine aminotransferase  35.41 
 
 		 415 aa  229  6e-59  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0956406 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2923  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  38.5 
 
 		 411 aa  229  8e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.689777  normal  0.779049 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7457  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  38.16 
 
 		 397 aa  228  1e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.484657  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0660  acetylornithine aminotransferase  37.63 
 
 		 394 aa  228  1e-58  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0533  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  37.53 
 
 		 394 aa  228  1e-58  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0301  acetylornithine transaminase protein  36.95 
 
 		 403 aa  228  2e-58  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.171719  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>