More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_4419 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_4419  aminotransferase class-III  100 
 
 		 378 aa  773    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1153  aminotransferase class-III  79.09 
 
 		 377 aa  624  1e-178  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3083  aminotransferase  63.88 
 
 		 383 aa  490  1e-137  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6554  aminotransferase class-III  63.71 
 
 		 376 aa  474  1e-132  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4207  aminotransferase class-III  61.73 
 
 		 377 aa  471  1e-132  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.144309  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3433  aminotransferase class-III  56.84 
 
 		 379 aa  441  1e-123  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.790855  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1164  acetylornithine aminotransferase  41.36 
 
 		 398 aa  279  7e-74  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.581434  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3011  acetylornithine aminotransferase  42.55 
 
 		 404 aa  279  7e-74  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3572  acetylornithine aminotransferase  42.93 
 
 		 404 aa  276  4e-73  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.331421 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3029  acetylornithine aminotransferase  41.67 
 
 		 410 aa  272  8.000000000000001e-72  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.51469  normal  0.939431 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0906  acetylornithine aminotransferase  41.98 
 
 		 402 aa  270  2.9999999999999997e-71  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0226  acetylornithine aminotransferase  41.47 
 
 		 396 aa  265  8.999999999999999e-70  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1596  acetylornithine aminotransferase  41.94 
 
 		 386 aa  264  2e-69  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2464  acetylornithine aminotransferase  41.88 
 
 		 392 aa  264  2e-69  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0982  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  39.23 
 
 		 410 aa  264  2e-69  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1901  acetylornithine aminotransferase  40.27 
 
 		 400 aa  262  8.999999999999999e-69  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.133726  normal  0.687258 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3636  acetylornithine aminotransferase  41.47 
 
 		 397 aa  261  2e-68  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3309  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  37.8 
 
 		 393 aa  259  4e-68  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1452  acetylornithine aminotransferase  41.49 
 
 		 402 aa  259  5.0000000000000005e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2079  acetylornithine aminotransferase  39.9 
 
 		 391 aa  257  2e-67  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2121  acetylornithine aminotransferase  40.52 
 
 		 404 aa  256  3e-67  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.00994118  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3741  acetylornithine aminotransferase  40.84 
 
 		 397 aa  256  4e-67  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2358  acetylornithine aminotransferase  40.21 
 
 		 400 aa  255  7e-67  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.284538  normal  0.840689 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2288  acetylornithine and succinylornithine aminotransferases  39.22 
 
 		 396 aa  255  7e-67  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.37355  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3708  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  38.22 
 
 		 412 aa  255  1.0000000000000001e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.339324  normal  0.0114471 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1041  acetylornithine aminotransferase  38.76 
 
 		 390 aa  253  3e-66  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.370932  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1758  aminotransferase class-III  37.74 
 
 		 384 aa  253  4.0000000000000004e-66  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0871  acetylornithine aminotransferase  37.7 
 
 		 403 aa  253  4.0000000000000004e-66  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0739  acetylornithine aminotransferase  39.95 
 
 		 386 aa  252  7e-66  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.791606  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2618  acetylornithine aminotransferase  38.69 
 
 		 400 aa  252  9.000000000000001e-66  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00459682  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2912  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  39.57 
 
 		 400 aa  252  9.000000000000001e-66  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.386564  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0947  aminotransferase class-III  38.54 
 
 		 395 aa  251  1e-65  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0679656  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5468  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  40 
 
 		 436 aa  251  1e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0529885 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3962  acetylornithine aminotransferase  39.37 
 
 		 386 aa  251  2e-65  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00766837  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2204  acetylornithine aminotransferase  37.67 
 
 		 390 aa  250  3e-65  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4636  acetylornithine aminotransferase  37.56 
 
 		 395 aa  249  4e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.621133  normal  0.175641 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3172  acetylornithine aminotransferase  39.3 
 
 		 444 aa  249  5e-65  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.22064  normal  0.239102 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3158  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  39.41 
 
 		 416 aa  249  6e-65  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0481  acetylornithine transaminase protein  39.69 
 
 		 402 aa  249  7e-65  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1784  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  39.84 
 
 		 385 aa  249  8e-65  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.74918  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2826  acetylornithine aminotransferase  38.22 
 
 		 386 aa  248  1e-64  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0151  acetylornithine aminotransferase  39.01 
 
 		 399 aa  248  1e-64  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00079  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  39.04 
 
 		 403 aa  248  1e-64  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4200  acetylornithine aminotransferase  38.9 
 
 		 386 aa  246  3e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002275  acetylornithine aminotransferase/N-succinyl-L,L-diaminopimelate aminotransferase/succinylornithine transaminase  38.68 
 
 		 403 aa  247  3e-64  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0660  acetylornithine aminotransferase  41.22 
 
 		 394 aa  246  4e-64  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0127  acetylornithine transaminase protein  39.19 
 
 		 399 aa  246  4e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.383449 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1260  acetylornithine aminotransferase  40.28 
 
 		 399 aa  245  8e-64  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.161601 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0946  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  41.11 
 
 		 398 aa  244  9.999999999999999e-64  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.104291  normal  0.0999204 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0353  acetylornithine aminotransferase  38.7 
 
 		 395 aa  245  9.999999999999999e-64  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00220895 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1710  acetylornithine aminotransferase  38.44 
 
 		 392 aa  245  9.999999999999999e-64  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0925352  hitchhiker  0.00335003 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0394  acetylornithine transaminase protein  39.79 
 
 		 403 aa  244  1.9999999999999999e-63  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0640  acetylornithine aminotransferase  39.13 
 
 		 403 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.41902  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1566  acetylornithine aminotransferase  38.18 
 
 		 395 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1102  acetylornithine aminotransferase  39.1 
 
 		 394 aa  244  1.9999999999999999e-63  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3173  acetylornithine aminotransferase  39.02 
 
 		 398 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.324258  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2613  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  37.97 
 
 		 375 aa  244  3e-63  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0313  acetylornithine aminotransferase  36.68 
 
 		 380 aa  244  3e-63  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2676  acetylornithine aminotransferase  37.92 
 
 		 391 aa  243  3.9999999999999997e-63  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3150  acetylornithine aminotransferase  40.68 
 
 		 399 aa  243  3.9999999999999997e-63  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0842  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  38.11 
 
 		 399 aa  243  5e-63  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0215856 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3105  acetylornithine transaminase protein  38.71 
 
 		 393 aa  243  6e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.546024  normal  0.0590877 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7457  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  38.76 
 
 		 397 aa  242  6e-63  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.484657  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34500  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  39.2 
 
 		 406 aa  242  6e-63  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4263  acetylornithine aminotransferase  38.9 
 
 		 386 aa  241  1e-62  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0009  acetylornithine transaminase protein  40.76 
 
 		 401 aa  242  1e-62  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0063  acetylornithine and succinylornithine aminotransferases  37.17 
 
 		 396 aa  241  1e-62  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.857354  normal  0.372491 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0533  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  38.68 
 
 		 394 aa  241  2e-62  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1500  acetylornithine aminotransferase  40.16 
 
 		 423 aa  241  2e-62  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000760659 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6536  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  38.83 
 
 		 397 aa  240  2.9999999999999997e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.396008  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0274  acetylornithine aminotransferase  36.95 
 
 		 396 aa  240  2.9999999999999997e-62  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.110157  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2493  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  38.38 
 
 		 397 aa  239  5e-62  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0301  acetylornithine transaminase protein  38.72 
 
 		 403 aa  239  6.999999999999999e-62  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.171719  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0314  acetylornithine transaminase protein  38.72 
 
 		 403 aa  239  6.999999999999999e-62  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2287  acetylornithine aminotransferase  36.2 
 
 		 402 aa  239  6.999999999999999e-62  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.194315 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1830  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  37.37 
 
 		 395 aa  238  9e-62  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.991221  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2429  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  37.34 
 
 		 393 aa  238  2e-61  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2195  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  36.87 
 
 		 403 aa  238  2e-61  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2440  acetylornithine aminotransferase  37.92 
 
 		 388 aa  237  2e-61  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.493949  normal  0.0446911 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1094  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  38.6 
 
 		 387 aa  238  2e-61  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0483  acetylornithine aminotransferase  38.03 
 
 		 395 aa  237  2e-61  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1409  acetylornithine transaminase protein  39.02 
 
 		 396 aa  237  3e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.111439  normal  0.291313 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0775  aminotransferase class-III  35.6 
 
 		 376 aa  237  3e-61  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.50348 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1072  acetylornithine aminotransferase  37.76 
 
 		 385 aa  236  3e-61  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0280572  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0348  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  36.77 
 
 		 395 aa  237  3e-61  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.276087 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4239  acetylornithine aminotransferase  40.16 
 
 		 386 aa  236  4e-61  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1698  acetylornithine aminotransferase  37.11 
 
 		 394 aa  236  4e-61  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0406  acetylornithine aminotransferase  37.72 
 
 		 388 aa  236  5.0000000000000005e-61  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2300  acetylornithine and succinylornithine aminotransferases  38.44 
 
 		 394 aa  236  5.0000000000000005e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2028  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  39.25 
 
 		 399 aa  236  5.0000000000000005e-61  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.832641  normal  0.501384 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0570  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  37.72 
 
 		 388 aa  236  5.0000000000000005e-61  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3146  aminotransferase class-III  37.77 
 
 		 408 aa  236  6e-61  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.733649  normal  0.0499094 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1040  acetylornithine aminotransferase  38.02 
 
 		 385 aa  236  7e-61  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000111021  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1129  acetylornithine aminotransferase  40.29 
 
 		 375 aa  235  7e-61  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1901  acetylornithine and succinylornithine aminotransferases  37.82 
 
 		 374 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3854  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  36.57 
 
 		 408 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3002  acetylornithine aminotransferase  37.67 
 
 		 398 aa  234  1.0000000000000001e-60  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.555766  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0068  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  36.36 
 
 		 375 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.413029  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0321  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  37.7 
 
 		 391 aa  235  1.0000000000000001e-60  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4033  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  38.04 
 
 		 408 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.327701  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>