More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_6554 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_6554  aminotransferase class-III  100 
 
 		 376 aa  772    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4207  aminotransferase class-III  77.96 
 
 		 377 aa  593  1e-168  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.144309  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3083  aminotransferase  68.87 
 
 		 383 aa  543  1e-153  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1153  aminotransferase class-III  63.17 
 
 		 377 aa  491  9.999999999999999e-139  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4419  aminotransferase class-III  63.71 
 
 		 378 aa  493  9.999999999999999e-139  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3433  aminotransferase class-III  55.35 
 
 		 379 aa  429  1e-119  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.790855  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0739  acetylornithine aminotransferase  40.84 
 
 		 386 aa  264  2e-69  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.791606  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1164  acetylornithine aminotransferase  38.36 
 
 		 398 aa  259  7e-68  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.581434  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3029  acetylornithine aminotransferase  41.21 
 
 		 410 aa  257  3e-67  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.51469  normal  0.939431 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3572  acetylornithine aminotransferase  39.31 
 
 		 404 aa  256  7e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.331421 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2464  acetylornithine aminotransferase  39.43 
 
 		 392 aa  255  1.0000000000000001e-66  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3011  acetylornithine aminotransferase  38.52 
 
 		 404 aa  252  7e-66  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0982  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  37.5 
 
 		 410 aa  251  1e-65  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1041  acetylornithine aminotransferase  38.62 
 
 		 390 aa  248  1e-64  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.370932  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1596  acetylornithine aminotransferase  40.16 
 
 		 386 aa  247  2e-64  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0946  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  38.13 
 
 		 398 aa  244  1.9999999999999999e-63  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.104291  normal  0.0999204 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0906  acetylornithine aminotransferase  38.86 
 
 		 402 aa  244  1.9999999999999999e-63  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1901  acetylornithine aminotransferase  37.63 
 
 		 400 aa  243  3e-63  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.133726  normal  0.687258 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2618  acetylornithine aminotransferase  36.48 
 
 		 400 aa  242  7.999999999999999e-63  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00459682  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3962  acetylornithine aminotransferase  37.89 
 
 		 386 aa  242  7.999999999999999e-63  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00766837  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1452  acetylornithine aminotransferase  37.83 
 
 		 402 aa  240  2.9999999999999997e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0068  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  40.62 
 
 		 375 aa  240  2.9999999999999997e-62  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.413029  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2826  acetylornithine aminotransferase  36.24 
 
 		 386 aa  239  8e-62  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1758  aminotransferase class-III  36.51 
 
 		 384 aa  238  2e-61  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3309  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  35.5 
 
 		 393 aa  238  2e-61  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2079  acetylornithine aminotransferase  37.99 
 
 		 391 aa  236  4e-61  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2121  acetylornithine aminotransferase  36.13 
 
 		 404 aa  236  5.0000000000000005e-61  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.00994118  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2912  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  36.17 
 
 		 400 aa  236  6e-61  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.386564  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4200  acetylornithine aminotransferase  37.89 
 
 		 386 aa  235  1.0000000000000001e-60  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2358  acetylornithine aminotransferase  36.77 
 
 		 400 aa  235  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.284538  normal  0.840689 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2429  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  37.27 
 
 		 393 aa  234  1.0000000000000001e-60  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1102  acetylornithine aminotransferase  37.3 
 
 		 394 aa  234  1.0000000000000001e-60  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5468  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  37.47 
 
 		 436 aa  234  2.0000000000000002e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0529885 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0353  acetylornithine aminotransferase  38.34 
 
 		 395 aa  233  5e-60  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00220895 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1784  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  36.62 
 
 		 385 aa  232  8.000000000000001e-60  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.74918  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3708  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  35.51 
 
 		 412 aa  232  1e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.339324  normal  0.0114471 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1499  aminotransferase class-III  36.39 
 
 		 375 aa  231  1e-59  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0947  aminotransferase class-III  36.39 
 
 		 395 aa  231  1e-59  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0679656  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0871  acetylornithine aminotransferase  35.45 
 
 		 403 aa  231  1e-59  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4636  acetylornithine aminotransferase  36.31 
 
 		 395 aa  231  1e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.621133  normal  0.175641 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0348  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  36.97 
 
 		 395 aa  231  1e-59  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.276087 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2676  acetylornithine aminotransferase  37.91 
 
 		 391 aa  231  1e-59  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2204  acetylornithine aminotransferase  37.17 
 
 		 390 aa  230  3e-59  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22300  acetylornithine/succinylornithine aminotransferase  37.99 
 
 		 425 aa  230  3e-59  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.271521  normal  0.79569 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0813  acetylornithine aminotransferase  38.21 
 
 		 431 aa  229  5e-59  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.470435  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3172  acetylornithine aminotransferase  37.37 
 
 		 444 aa  229  5e-59  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.22064  normal  0.239102 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4263  acetylornithine aminotransferase  36.84 
 
 		 386 aa  229  5e-59  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1775  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  38.23 
 
 		 411 aa  229  7e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.664584  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1866  acetylornithine aminotransferase  40.22 
 
 		 400 aa  229  7e-59  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1566  acetylornithine aminotransferase  37.27 
 
 		 395 aa  228  1e-58  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3040  acetylornithine aminotransferase  37.11 
 
 		 389 aa  228  1e-58  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2898  acetylornithine aminotransferase  37.11 
 
 		 389 aa  228  1e-58  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3003  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  35.59 
 
 		 427 aa  228  1e-58  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0483  acetylornithine aminotransferase  38.07 
 
 		 395 aa  228  1e-58  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0533  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  35.68 
 
 		 394 aa  228  2e-58  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0660  acetylornithine aminotransferase  38.16 
 
 		 394 aa  227  3e-58  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0997  acetylornithine aminotransferase  37.37 
 
 		 386 aa  227  3e-58  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3884  acetylornithine aminotransferase  37.11 
 
 		 386 aa  226  6e-58  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3033  acetylornithine aminotransferase  37.83 
 
 		 390 aa  226  6e-58  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.850335  normal  0.390329 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2429  acetylornithine aminotransferase  36.72 
 
 		 398 aa  225  8e-58  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0245  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  37.3 
 
 		 405 aa  224  1e-57  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.110716  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0775  aminotransferase class-III  36.41 
 
 		 376 aa  225  1e-57  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.50348 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0368  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  36.76 
 
 		 406 aa  224  1e-57  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3704  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  37.3 
 
 		 405 aa  224  1e-57  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0481  acetylornithine transaminase protein  37.83 
 
 		 402 aa  224  2e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2287  acetylornithine aminotransferase  36.27 
 
 		 402 aa  224  2e-57  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.194315 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1901  acetylornithine and succinylornithine aminotransferases  36.81 
 
 		 374 aa  224  2e-57  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0285  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  36.25 
 
 		 413 aa  224  2e-57  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3947  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  37.3 
 
 		 405 aa  224  2e-57  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3002  acetylornithine aminotransferase  36.46 
 
 		 398 aa  224  2e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.555766  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2195  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  36.46 
 
 		 403 aa  224  2e-57  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2179  acetylornithine aminotransferase  36.01 
 
 		 398 aa  223  3e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.569965  normal  0.442274 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4153  acetylornithine aminotransferase  36.84 
 
 		 386 aa  223  4e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2649  acetylornithine aminotransferase  35.51 
 
 		 423 aa  223  4e-57  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.46775  normal  0.4632 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4033  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  36.5 
 
 		 408 aa  223  6e-57  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.327701  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0063  acetylornithine and succinylornithine aminotransferases  34.46 
 
 		 396 aa  223  6e-57  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.857354  normal  0.372491 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1291  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  35.37 
 
 		 393 aa  222  7e-57  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0338748 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0591  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  37.47 
 
 		 410 aa  222  7e-57  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1736  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  37.47 
 
 		 410 aa  222  7e-57  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.143405  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2847  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  37.47 
 
 		 410 aa  222  7e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4239  acetylornithine aminotransferase  36.32 
 
 		 386 aa  222  7e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2866  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  37.47 
 
 		 410 aa  222  7e-57  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2785  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  37.47 
 
 		 410 aa  222  7e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2425  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  37.47 
 
 		 410 aa  222  7e-57  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.725646  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0151  acetylornithine aminotransferase  36.55 
 
 		 399 aa  222  8e-57  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0406  acetylornithine aminotransferase  35.31 
 
 		 388 aa  222  8e-57  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0570  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  35.31 
 
 		 388 aa  222  8e-57  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3876  acetylornithine aminotransferase  36.32 
 
 		 386 aa  222  8e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3854  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  36.25 
 
 		 408 aa  222  8e-57  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02293  acetylornithine transaminase protein  38.03 
 
 		 408 aa  222  9e-57  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2727  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  37.47 
 
 		 410 aa  222  9e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0426  acetylornithine aminotransferase  37.43 
 
 		 396 aa  221  9.999999999999999e-57  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0269327  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2493  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  35.84 
 
 		 397 aa  221  1.9999999999999999e-56  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1346  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  36.75 
 
 		 399 aa  221  1.9999999999999999e-56  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5154  acetylornithine aminotransferase  34.51 
 
 		 426 aa  221  1.9999999999999999e-56  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000762221 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4037  acetylornithine aminotransferase  36.32 
 
 		 386 aa  220  3e-56  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4352  acetylornithine aminotransferase  36.32 
 
 		 386 aa  220  3e-56  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.200619  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0886  acetylornithine transaminase protein  35.68 
 
 		 392 aa  220  3e-56  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0996794  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1787  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  36.96 
 
 		 409 aa  220  3e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1830  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  36.95 
 
 		 395 aa  220  3e-56  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.991221  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>