43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_2802 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_2802  b-glucosidase  100 
 
 		 345 aa  716    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.790099  normal  0.396341 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0211  glycoside hydrolase family protein  43.93 
 
 		 334 aa  130  3e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00263756  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0061  exported glycosyl hydrolase, family 16  35.43 
 
 		 264 aa  95.9  1e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.558429  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4600  glycoside hydrolase family protein  31.07 
 
 		 277 aa  91.3  2e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.52494  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5929  endo-1,3-1,4-beta-glycanase  36.36 
 
 		 268 aa  87.4  4e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4955  glycoside hydrolase family protein  28.42 
 
 		 269 aa  83.2  0.000000000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.126867 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2751  glycoside hydrolase family protein  32.97 
 
 		 272 aa  81.6  0.00000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4988  glycoside hydrolase family protein  28.19 
 
 		 372 aa  75.5  0.000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_25832  cell wall protein in family of putative glycosidases Probable xyloglucan endotransglucosylase/hydrolase  36.49 
 
 		 413 aa  74.3  0.000000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.623887  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1972  glycoside hydrolase family protein  28.8 
 
 		 260 aa  72.4  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.138476 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0648  glycoside hydrolase family protein  32.5 
 
 		 253 aa  68.2  0.0000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3662  glycoside hydrolase family protein  27.91 
 
 		 593 aa  65.5  0.000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2550  endo-beta-1,3-1,4-glycanase protein  28.21 
 
 		 260 aa  65.9  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.616769  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1209  licheninase  28.21 
 
 		 260 aa  65.9  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0812437 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2626  glycoside hydrolase family 16  33.89 
 
 		 283 aa  65.5  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.444573  normal  0.839532 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00933  extracellular cell wall glucanase Crf1/allergen Asp F9 (AFU_orthologue; AFUA_1G16190)  34.87 
 
 		 405 aa  64.7  0.000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0489883  normal  0.840082 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_4167  predicted protein  31.91 
 
 		 248 aa  65.1  0.000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.512731 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4793  glycoside hydrolase family protein  30.71 
 
 		 320 aa  58.5  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2825  glycoside hydrolase family protein  28.25 
 
 		 492 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03914  putative transglycosidase, GH16 family (Eurofung)  28.88 
 
 		 375 aa  57.8  0.0000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.349103 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0109  glycoside hydrolase family 16  28.43 
 
 		 276 aa  57.4  0.0000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0321176  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04515  putative transglycosidase, GH16 family (Eurofung)  29.28 
 
 		 435 aa  57  0.0000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.0000384453  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6294  glycoside hydrolase family protein  28.14 
 
 		 427 aa  53.1  0.000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.202957  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2809  glycoside hydrolase family protein  30 
 
 		 1321 aa  52.8  0.000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.149168  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1538  glycoside hydrolase family 16  32.93 
 
 		 423 aa  51.6  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_40512  predicted protein  25.97 
 
 		 346 aa  50.8  0.00003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4792  glycoside hydrolase family protein  26.62 
 
 		 608 aa  50.4  0.00005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06948  putative transglycosidase, GH16 family (Eurofung)  25.86 
 
 		 367 aa  49.7  0.00008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4931  glycoside hydrolase family 16  27.08 
 
 		 286 aa  49.3  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.454153  normal  0.64066 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_54681  endo-1,3-beta-glucosidase  32.79 
 
 		 1028 aa  48.9  0.0001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1590  glycoside hydrolase family 16  31.9 
 
 		 289 aa  48.5  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0592572 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5321  glycoside hydrolase family 16  32.95 
 
 		 426 aa  47.8  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.349726  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3100  glycoside hydrolase family 16  26.67 
 
 		 291 aa  47.8  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.194858 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2607  laminarinase  30.23 
 
 		 883 aa  47.4  0.0003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA05790  cell wall organization and biogenesis-related protein, putative  22.44 
 
 		 376 aa  46.6  0.0006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1690  glycoside hydrolase family 16  27.91 
 
 		 279 aa  46.2  0.0008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03053  putative transglycosidase, GH16 family (Eurofung)  27.33 
 
 		 364 aa  45.8  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.736555  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3395  Licheninase  30.18 
 
 		 588 aa  45.4  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.585681 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0451  Glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  27.64 
 
 		 627 aa  44.7  0.003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000399105  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0554  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  28.57 
 
 		 532 aa  43.5  0.006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1608  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  24.38 
 
 		 306 aa  42.7  0.009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1131  Glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  28.24 
 
 		 547 aa  42.7  0.01  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.232091  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1939  glycoside hydrolase family 16  27.61 
 
 		 566 aa  42.7  0.01  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000600804  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>