More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_0794 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_0794  long-chain acyl-CoA thioester hydrolase  100 
 
 		 121 aa  248  2e-65  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.218996  normal  0.0133262 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7031  thioesterase superfamily protein  65.25 
 
 		 159 aa  174  4e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0529505  hitchhiker  0.00000000906305 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5067  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase domain protein  64.41 
 
 		 131 aa  171  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0461  thioesterase superfamily protein  64.41 
 
 		 131 aa  171  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5279  thioesterase superfamily protein  62.71 
 
 		 135 aa  169  1e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0551  hypothetical protein  63.56 
 
 		 134 aa  166  1e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05860  hypothetical protein  63.56 
 
 		 134 aa  166  1e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4135  thioesterase superfamily protein  63.25 
 
 		 160 aa  165  2e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1723  thioesterase superfamily protein  61.86 
 
 		 131 aa  164  2.9999999999999998e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5024  thioesterase superfamily protein  60.17 
 
 		 133 aa  163  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4975  thioesterase superfamily protein  60.17 
 
 		 133 aa  163  8e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.107166  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4848  thioesterase superfamily protein  60.17 
 
 		 133 aa  163  8e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.141512  normal  0.0891705 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0490  thioesterase superfamily protein  60.17 
 
 		 133 aa  162  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10248  thioesterase family protein domain protein  66.1 
 
 		 129 aa  162  1.0000000000000001e-39  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  hitchhiker  0.00150386  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20510  acyl-CoA hydrolase  59.48 
 
 		 150 aa  154  5.0000000000000005e-37  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4038  thioesterase superfamily protein  58.62 
 
 		 144 aa  153  8e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3832  thioesterase superfamily protein  58.62 
 
 		 144 aa  152  1e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1159  thioesterase superfamily protein  49.17 
 
 		 122 aa  137  7e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00426691 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1486  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  47.06 
 
 		 122 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1318  thioesterase superfamily protein  48.28 
 
 		 122 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1309  thioesterase superfamily protein  48.28 
 
 		 122 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.847429  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2765  thioesterase superfamily protein  47.41 
 
 		 122 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0173691  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2843  thioesterase superfamily protein  47.41 
 
 		 122 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0401638  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3041  thioesterase superfamily protein  48.28 
 
 		 122 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.957748  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2941  thioesterase superfamily protein  47.41 
 
 		 122 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.760683  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1240  thioesterase superfamily protein  47.41 
 
 		 122 aa  131  3e-30  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1345  thioesterase superfamily protein  48.28 
 
 		 122 aa  131  3e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1251  thioesterase superfamily protein  47.9 
 
 		 122 aa  128  2.0000000000000002e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.757255 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1353  thioesterase superfamily protein  45 
 
 		 122 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00045551 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2461  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  42.02 
 
 		 122 aa  118  3e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0101998  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1696  thioesterase family protein  48.74 
 
 		 125 aa  116  9.999999999999999e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.303934  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1342  thioesterase superfamily protein  49.58 
 
 		 135 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.181089  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02806  thioesterase family protein  48.74 
 
 		 141 aa  110  8.000000000000001e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0316832  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2800  thioesterase superfamily protein  38.66 
 
 		 122 aa  100  6e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0391  thioesterase superfamily protein  34.51 
 
 		 119 aa  70.5  0.000000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0221081  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1494  thioesterase superfamily protein  34.51 
 
 		 120 aa  68.9  0.00000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0134536  hitchhiker  0.0000450993 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2218  Acyl-CoA thioester hydrolase  33.04 
 
 		 143 aa  65.1  0.0000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0533799 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0941  thioesterase superfamily protein  38.26 
 
 		 119 aa  64.7  0.0000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1655  thioesterase superfamily protein  36.45 
 
 		 129 aa  63.9  0.0000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.904964  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2182  thioesterase superfamily protein  37.27 
 
 		 128 aa  62.8  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.745241 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2992  thioesterase superfamily protein  33.64 
 
 		 149 aa  62  0.000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.34104  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0724  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  33.33 
 
 		 118 aa  62.4  0.000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.218128  normal  0.79539 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2465  thioesterase superfamily protein  36.36 
 
 		 128 aa  62  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1614  thioesterase superfamily protein  36.52 
 
 		 129 aa  61.6  0.000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.00678446  normal  0.171125 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6255  acyl-CoA hydrolase  37.27 
 
 		 130 aa  62  0.000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0702037  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1088  thioesterase superfamily protein  34.23 
 
 		 154 aa  61.2  0.000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1510  long-chain acyl-CoA thioester hydrolase, putative  35.51 
 
 		 129 aa  60.8  0.000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1460  putative long-chain acyl-CoA thioester hydrolase  35.51 
 
 		 129 aa  60.8  0.000000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1772  thioesterase superfamily protein  32.11 
 
 		 139 aa  60.1  0.00000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.917959  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0966  thioesterase superfamily protein  33.64 
 
 		 136 aa  59.3  0.00000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1626  thioesterase superfamily protein  35.85 
 
 		 119 aa  58.9  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.928408  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2125  thioesterase superfamily protein  32.14 
 
 		 130 aa  57.8  0.00000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0621  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  33.94 
 
 		 135 aa  57.4  0.00000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0826  thioesterase superfamily protein  36.04 
 
 		 121 aa  56.6  0.0000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1900  thioesterase superfamily protein  33.64 
 
 		 130 aa  55.5  0.0000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1361  thioesterase superfamily protein  31.78 
 
 		 164 aa  55.1  0.0000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.104738  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0825  thioesterase superfamily protein  33.91 
 
 		 118 aa  55.5  0.0000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.216993  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0601  thioesterase superfamily protein  30.56 
 
 		 143 aa  54.7  0.0000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.71789 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3088  thioesterase superfamily protein  30.43 
 
 		 129 aa  55.1  0.0000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.941483 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3092  thioesterase superfamily protein  29.91 
 
 		 131 aa  54.3  0.0000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.440114 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0580  thioesterase superfamily protein  30.56 
 
 		 157 aa  54.3  0.0000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1416  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  33.04 
 
 		 176 aa  53.9  0.0000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.639059  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0349  thioesterase superfamily protein  35.14 
 
 		 151 aa  53.9  0.0000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000514338 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0650  thioesterase superfamily protein  29.41 
 
 		 270 aa  54.3  0.0000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1278  acyl-CoA hydrolase  34.55 
 
 		 136 aa  53.5  0.0000009  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.76332  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2507  thioesterase superfamily protein  33.64 
 
 		 134 aa  52.8  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.488114 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3417  major facilitator transporter  31.25 
 
 		 120 aa  53.1  0.000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.264659  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0209  thioesterase superfamily protein  30.91 
 
 		 133 aa  53.1  0.000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.873249 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2798  thioesterase superfamily protein  32.17 
 
 		 139 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.585089  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3231  hypothetical protein  31.25 
 
 		 120 aa  53.1  0.000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.127576  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4080  thioesterase superfamily protein  28.32 
 
 		 150 aa  53.1  0.000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.789165  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0385  thioesterase superfamily protein  31.62 
 
 		 142 aa  53.1  0.000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.125314  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2304  thioesterase superfamily protein  31.3 
 
 		 145 aa  53.1  0.000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1421  thioesterase superfamily protein  31.62 
 
 		 260 aa  53.5  0.000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000458727 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1866  thioesterase superfamily protein  30.63 
 
 		 145 aa  52.8  0.000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.806692  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1586  thioesterase superfamily protein  32.11 
 
 		 159 aa  52.8  0.000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00531862  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0336  thioesterase family protein  26.42 
 
 		 176 aa  52.4  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.000000518739  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2392  thioesterase superfamily protein  32.11 
 
 		 159 aa  52.8  0.000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.251578  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2462  thioesterase superfamily protein  32.11 
 
 		 159 aa  52.8  0.000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.146341  hitchhiker  0.00677922 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2555  thioesterase superfamily protein  29.36 
 
 		 159 aa  52.4  0.000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0159828  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0822  thioesterase superfamily protein  32.41 
 
 		 141 aa  52.8  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1607  thioesterase superfamily protein  30.97 
 
 		 162 aa  52.8  0.000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000128786 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001332  acyl-CoA hydrolase  30.36 
 
 		 161 aa  51.6  0.000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000629116  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0796  acyl-CoA thioester hydrolase, putative  29.25 
 
 		 157 aa  52  0.000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1875  thioesterase superfamily protein  32.14 
 
 		 139 aa  52  0.000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2709  thioesterase superfamily protein  33.93 
 
 		 150 aa  51.6  0.000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2645  thioesterase superfamily protein  28.07 
 
 		 141 aa  51.6  0.000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3174  thioesterase superfamily protein  28.83 
 
 		 165 aa  51.6  0.000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.364951  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2575  thioesterase superfamily protein  32.17 
 
 		 139 aa  52  0.000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.588276  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0172  thioesterase superfamily protein  27.68 
 
 		 313 aa  51.6  0.000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3818  thioesterase superfamily protein  29.57 
 
 		 151 aa  51.2  0.000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.268375  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1932  hypothetical protein  30.09 
 
 		 176 aa  51.2  0.000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2516  putative acyl-CoA hydrolase  30 
 
 		 158 aa  51.6  0.000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1966  hypothetical protein  30.09 
 
 		 176 aa  51.2  0.000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0769925  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0724  thioesterase superfamily protein  28.32 
 
 		 327 aa  51.2  0.000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.823012  hitchhiker  0.000000302759 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3494  thioesterase superfamily protein  31.13 
 
 		 146 aa  51.2  0.000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1763  thioesterase superfamily protein  31.19 
 
 		 159 aa  51.2  0.000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.159605  normal  0.426085 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2948  thioesterase superfamily protein  30.36 
 
 		 168 aa  50.8  0.000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.300986  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2569  thioesterase superfamily protein  31.19 
 
 		 159 aa  51.2  0.000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.029827  hitchhiker  0.00345212 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1720  thioesterase superfamily protein  31.19 
 
 		 159 aa  51.2  0.000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00965102  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>