More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHAB381_0114 on replicon NC_009714
Organism: Campylobacter hominis ATCC BAA-381



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009714  CHAB381_0114  chorismate synthase  100 
 
 		 366 aa  736    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1741  chorismate synthase  63.84 
 
 		 356 aa  471  1e-132  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2064  chorismate synthase  63.93 
 
 		 354 aa  468  1.0000000000000001e-131  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1806  chorismate synthase  60.82 
 
 		 362 aa  444  1e-123  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1625  chorismate synthase  60.82 
 
 		 362 aa  441  9.999999999999999e-123  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.511164  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1994  chorismate synthase  60.55 
 
 		 362 aa  441  9.999999999999999e-123  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1974  chorismate synthase  61.48 
 
 		 358 aa  431  1e-120  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1493  chorismate synthase  57.1 
 
 		 362 aa  421  1e-117  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2023  chorismate synthase  57.38 
 
 		 358 aa  400  9.999999999999999e-111  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1408  chorismate synthase  47.47 
 
 		 353 aa  327  1.0000000000000001e-88  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.422248 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0858  chorismate synthase  47.46 
 
 		 366 aa  327  2.0000000000000001e-88  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  5.52804e-17  unclonable  0.0000000936669 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1814  chorismate synthase  47.61 
 
 		 367 aa  326  4.0000000000000003e-88  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2090  chorismate synthase  48.73 
 
 		 354 aa  326  5e-88  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0281395  normal  0.0647066 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1538  chorismate synthase  47.88 
 
 		 366 aa  325  1e-87  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11018  chorismate synthase  47.77 
 
 		 354 aa  319  5e-86  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.659111  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02755  chorismate synthase  46.72 
 
 		 365 aa  317  3e-85  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0341392  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3150  chorismate synthase  45.98 
 
 		 373 aa  315  9.999999999999999e-85  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2091  chorismate synthase  45.38 
 
 		 371 aa  313  2.9999999999999996e-84  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3074  chorismate synthase  45.76 
 
 		 376 aa  313  2.9999999999999996e-84  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1541  chorismate synthase  46.48 
 
 		 366 aa  313  3.9999999999999997e-84  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2877  chorismate synthase  46.89 
 
 		 354 aa  310  2e-83  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1525  chorismate synthase  45.07 
 
 		 385 aa  310  2.9999999999999997e-83  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0632175 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03114  chorismate synthase  44.26 
 
 		 384 aa  308  8e-83  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2797  chorismate synthase  45.6 
 
 		 368 aa  308  9e-83  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4576  chorismate synthase  45.61 
 
 		 352 aa  308  1.0000000000000001e-82  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.348099  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2168  chorismate synthase  44.82 
 
 		 361 aa  308  1.0000000000000001e-82  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1226  chorismate synthase  44.03 
 
 		 366 aa  307  2.0000000000000002e-82  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0161922 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002863  chorismate synthase  44.26 
 
 		 361 aa  306  3e-82  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2466  chorismate synthase  44.73 
 
 		 361 aa  305  6e-82  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.358807  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1018  chorismate synthase  45.3 
 
 		 362 aa  305  6e-82  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2171  chorismate synthase  45.33 
 
 		 359 aa  304  1.0000000000000001e-81  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1568  chorismate synthase  44.66 
 
 		 364 aa  302  5.000000000000001e-81  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2244  chorismate synthase  45.74 
 
 		 365 aa  302  6.000000000000001e-81  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2149  chorismate synthase  44.41 
 
 		 355 aa  300  2e-80  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0529344  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1740  chorismate synthase  43.06 
 
 		 368 aa  300  3e-80  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.544591 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1296  chorismate synthase  44.89 
 
 		 334 aa  299  4e-80  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.576188  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1438  chorismate synthase  44.51 
 
 		 365 aa  299  6e-80  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2938  chorismate synthase  41.35 
 
 		 369 aa  299  7e-80  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1360  chorismate synthase  44.6 
 
 		 366 aa  298  7e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.767963  normal  0.499065 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3619  chorismate synthase  43.14 
 
 		 361 aa  298  8e-80  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000281464  normal  0.087707 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2752  chorismate synthase  44.66 
 
 		 364 aa  298  1e-79  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.200726  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2769  chorismate synthase  44.66 
 
 		 364 aa  298  1e-79  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.116753  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1569  chorismate synthase  45.17 
 
 		 366 aa  298  1e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.453683  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2846  chorismate synthase  44.66 
 
 		 364 aa  298  1e-79  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000803726 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1607  chorismate synthase  44.66 
 
 		 364 aa  298  1e-79  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.131097  normal  0.360545 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1012  chorismate synthase  45.38 
 
 		 366 aa  298  1e-79  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2451  chorismate synthase  44.66 
 
 		 364 aa  297  2e-79  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2767  chorismate synthase  44.32 
 
 		 366 aa  296  3e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4957  chorismate synthase  43.98 
 
 		 389 aa  296  3e-79  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2159  chorismate synthase  45.17 
 
 		 365 aa  296  3e-79  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0369  chorismate synthase  42.31 
 
 		 360 aa  296  4e-79  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1438  chorismate synthase  44.57 
 
 		 366 aa  295  6e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2137  chorismate synthase  46.02 
 
 		 361 aa  295  6e-79  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.146002  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1972  chorismate synthase  42.37 
 
 		 363 aa  295  7e-79  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3161  chorismate synthase  45.3 
 
 		 364 aa  295  7e-79  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1640  chorismate synthase  42.37 
 
 		 363 aa  295  7e-79  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000503125 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1564  chorismate synthase  46.31 
 
 		 328 aa  295  1e-78  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1257  chorismate synthase  47.01 
 
 		 370 aa  294  1e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.234528  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01260  chorismate synthase  43.87 
 
 		 367 aa  294  1e-78  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1241  chorismate synthase  43.87 
 
 		 366 aa  294  2e-78  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1481  chorismate synthase  44.03 
 
 		 369 aa  294  2e-78  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.470447  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0946  chorismate synthase  44.03 
 
 		 369 aa  294  2e-78  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.718045  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2251  chorismate synthase  48.18 
 
 		 352 aa  293  2e-78  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2811  chorismate synthase  46.02 
 
 		 361 aa  293  2e-78  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.655428  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0401  chorismate synthase  43.87 
 
 		 369 aa  294  2e-78  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0762  chorismate synthase  44.03 
 
 		 430 aa  294  2e-78  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0691461  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4112  chorismate synthase  41.55 
 
 		 363 aa  294  2e-78  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.356503  normal  0.0141233 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0161  chorismate synthase  44.17 
 
 		 373 aa  294  2e-78  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.900075  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1405  chorismate synthase  45.58 
 
 		 361 aa  293  3e-78  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.47258  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2222  chorismate synthase  48.04 
 
 		 352 aa  293  3e-78  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1537  chorismate synthase  43.63 
 
 		 364 aa  293  3e-78  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1138  chorismate synthase  46.15 
 
 		 369 aa  293  3e-78  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.26701  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1987  chorismate synthase  45.17 
 
 		 366 aa  293  3e-78  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1657  chorismate synthase  45.17 
 
 		 366 aa  293  3e-78  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.112196  normal  0.0287757 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0377  chorismate synthase  45.58 
 
 		 361 aa  293  3e-78  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2470  chorismate synthase  43.84 
 
 		 361 aa  293  3e-78  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1514  chorismate synthase  45.58 
 
 		 361 aa  293  3e-78  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.85122  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1713  chorismate synthase  44.03 
 
 		 369 aa  293  4e-78  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.193941  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1689  chorismate synthase  44.03 
 
 		 369 aa  293  4e-78  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.537327  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1867  chorismate synthase  44.03 
 
 		 369 aa  293  4e-78  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0797858  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1789  chorismate synthase  44.32 
 
 		 366 aa  293  4e-78  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.681987  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2614  chorismate synthase  44.03 
 
 		 369 aa  292  5e-78  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0666  chorismate synthase  42.9 
 
 		 366 aa  291  9e-78  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0639836  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1868  chorismate synthase  44.14 
 
 		 373 aa  291  9e-78  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.423516  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2573  chorismate synthase  44.89 
 
 		 361 aa  291  1e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3374  chorismate synthase  44.89 
 
 		 361 aa  291  1e-77  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2626  chorismate synthase  44.89 
 
 		 361 aa  291  1e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000317199 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1381  chorismate synthase  43.75 
 
 		 366 aa  291  1e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.674702 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0978  chorismate synthase  44.02 
 
 		 366 aa  291  1e-77  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1460  chorismate synthase  44.02 
 
 		 366 aa  291  1e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1345  chorismate synthase  46.74 
 
 		 361 aa  290  2e-77  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.607384  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0977  chorismate synthase  46.48 
 
 		 371 aa  290  2e-77  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4605  chorismate synthase  44.6 
 
 		 366 aa  290  2e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0590951  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2995  chorismate synthase  43.34 
 
 		 365 aa  290  3e-77  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.212385 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1952  chorismate synthase  42.18 
 
 		 358 aa  290  3e-77  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2737  chorismate synthase  44.89 
 
 		 361 aa  290  3e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2524  chorismate synthase  44.89 
 
 		 361 aa  290  3e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1341  chorismate synthase  43.48 
 
 		 366 aa  290  3e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2613  chorismate synthase  44.89 
 
 		 361 aa  290  3e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.730292  normal  0.55052 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2623  chorismate synthase  43.3 
 
 		 366 aa  289  4e-77  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>