More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CFF8240_0410 on replicon NC_008599
Organism: Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009802  CCC13826_1468  thiamine biosynthesis protein ThiC  71.03 
 
 		 431 aa  664    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.000710454  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1486  thiamine biosynthesis protein ThiC  73.52 
 
 		 460 aa  696    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.680107  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0672  thiamine biosynthesis protein ThiC  77.3 
 
 		 449 aa  726    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.936222  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0410  thiamine biosynthesis protein ThiC  100 
 
 		 450 aa  937    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.130506  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1278  thiamine biosynthesis protein ThiC  63.95 
 
 		 453 aa  607  9.999999999999999e-173  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000117733  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3442  thiamine biosynthesis protein ThiC  64.97 
 
 		 460 aa  598  1e-170  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.309449  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1908  thiamine biosynthesis protein ThiC  64.97 
 
 		 459 aa  599  1e-170  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000137704 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2662  thiamine biosynthesis protein ThiC  64.97 
 
 		 460 aa  598  1e-170  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3734  thiamine biosynthesis protein ThiC  63.84 
 
 		 473 aa  593  1e-168  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0619415 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3220  thiamine biosynthesis protein ThiC  64.04 
 
 		 458 aa  589  1e-167  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.182052 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18041  thiamine biosynthesis protein ThiC  63.41 
 
 		 456 aa  585  1e-166  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0357  thiamine biosynthesis protein ThiC  63.34 
 
 		 457 aa  587  1e-166  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17991  thiamine biosynthesis protein ThiC  63.18 
 
 		 456 aa  583  1.0000000000000001e-165  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18211  thiamine biosynthesis protein ThiC  63.18 
 
 		 456 aa  581  1.0000000000000001e-165  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.443876  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1704  thiamine biosynthesis protein ThiC  62.95 
 
 		 456 aa  580  1e-164  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4020  thiamine biosynthesis protein ThiC  63.11 
 
 		 457 aa  579  1e-164  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2167  thiamine biosynthesis protein ThiC  59.87 
 
 		 468 aa  576  1.0000000000000001e-163  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.188885  normal  0.78966 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1103  thiamine biosynthesis protein ThiC  61.87 
 
 		 453 aa  576  1.0000000000000001e-163  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.000141621  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0167  thiamine biosynthesis protein ThiC  62.65 
 
 		 466 aa  575  1.0000000000000001e-163  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0123  thiamine biosynthesis protein ThiC  62.65 
 
 		 484 aa  575  1.0000000000000001e-163  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0039044 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1096  thiamine biosynthesis protein ThiC  62.73 
 
 		 456 aa  576  1.0000000000000001e-163  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0295127  normal  0.0112677 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1643  thiamine biosynthesis protein ThiC  62.59 
 
 		 463 aa  575  1.0000000000000001e-163  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2216  thiamine biosynthesis protein ThiC  62.59 
 
 		 463 aa  575  1.0000000000000001e-163  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.455315  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2304  thiamine biosynthesis protein ThiC  62.59 
 
 		 463 aa  575  1.0000000000000001e-163  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.463018  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17361  thiamine biosynthesis protein ThiC  61.02 
 
 		 459 aa  565  1e-160  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01971  thiamine biosynthesis protein ThiC  61.02 
 
 		 459 aa  565  1e-160  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2307  thiamine biosynthesis protein ThiC  59.5 
 
 		 489 aa  563  1.0000000000000001e-159  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.35999 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2464  thiamine biosynthesis protein ThiC  59.17 
 
 		 486 aa  562  1.0000000000000001e-159  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1188  thiamine biosynthesis protein ThiC  59.4 
 
 		 466 aa  553  1e-156  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20631  thiamine biosynthesis protein ThiC  59.86 
 
 		 466 aa  554  1e-156  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.017014  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2653  thiamine biosynthesis protein ThiC  58.29 
 
 		 573 aa  535  1e-151  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2272  thiamine biosynthesis protein ThiC  57.27 
 
 		 666 aa  536  1e-151  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3762  thiamine biosynthesis protein ThiC  58.63 
 
 		 586 aa  532  1e-150  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4374  thiamine biosynthesis protein ThiC  57.56 
 
 		 631 aa  531  1e-150  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.701948  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3870  thiamine biosynthesis protein ThiC  57.11 
 
 		 655 aa  532  1e-150  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4407  thiamine biosynthesis protein ThiC  57.33 
 
 		 631 aa  530  1e-149  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.679063  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5341  thiamine biosynthesis protein ThiC  58.39 
 
 		 586 aa  530  1e-149  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4908  thiamine biosynthesis protein ThiC  58.39 
 
 		 586 aa  530  1e-149  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4920  thiamine biosynthesis protein ThiC  58.39 
 
 		 586 aa  530  1e-149  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0086  thiamine biosynthesis protein ThiC  56.6 
 
 		 691 aa  530  1e-149  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1249  thiamine biosynthesis protein ThiC  58.08 
 
 		 562 aa  529  1e-149  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2392  thiamine biosynthesis protein ThiC  56.89 
 
 		 680 aa  531  1e-149  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.494213 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5612  thiamine biosynthesis protein ThiC  58.39 
 
 		 586 aa  530  1e-149  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.188984  hitchhiker  0.0000000000000085296 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5316  thiamine biosynthesis protein ThiC  58.39 
 
 		 586 aa  530  1e-149  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.03557e-31 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4494  thiamine biosynthesis protein ThiC  57.33 
 
 		 631 aa  529  1e-149  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0642711  normal  0.0188033 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5018  thiamine biosynthesis protein ThiC  58.16 
 
 		 586 aa  529  1e-149  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0284  thiamine biosynthesis protein ThiC  57.33 
 
 		 647 aa  529  1e-149  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00835607 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5347  thiamine biosynthesis protein ThiC  58.39 
 
 		 586 aa  529  1e-149  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.479602  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0220  thiamine biosynthesis protein ThiC  56.34 
 
 		 646 aa  530  1e-149  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.464551  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3400  thiamine biosynthesis protein ThiC  58.14 
 
 		 561 aa  529  1e-149  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.557374  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4496  thiamine biosynthesis protein ThiC  57.33 
 
 		 631 aa  529  1e-149  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000124533 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0216  thiamine biosynthesis protein ThiC  56.13 
 
 		 651 aa  529  1e-149  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5398  thiamine biosynthesis protein ThiC  58.39 
 
 		 586 aa  530  1e-149  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.507246  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5076  thiamine biosynthesis protein ThiC  58.16 
 
 		 586 aa  528  1e-148  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0455  thiamine biosynthesis protein ThiC  56.89 
 
 		 681 aa  525  1e-148  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000571171 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4570  thiamine biosynthesis protein ThiC  57.11 
 
 		 631 aa  526  1e-148  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0133622 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0207  thiamine biosynthesis protein ThiC  56.89 
 
 		 630 aa  525  1e-148  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0365925 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5463  thiamine biosynthesis protein ThiC  58.16 
 
 		 586 aa  528  1e-148  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0529454  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0374  thiamine biosynthesis protein ThiC  57.77 
 
 		 573 aa  525  1e-148  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3853  thiamine biosynthesis protein ThiC  56.89 
 
 		 681 aa  525  1e-148  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0347  thiamine biosynthesis protein ThiC  57.11 
 
 		 681 aa  526  1e-148  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4485  thiamine biosynthesis protein ThiC  56.89 
 
 		 631 aa  525  1e-148  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1603  thiamine biosynthesis protein ThiC  55.36 
 
 		 607 aa  525  1e-148  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.517064  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03871  thiamine biosynthesis protein ThiC  56.89 
 
 		 631 aa  524  1e-147  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4000  thiamine biosynthesis protein ThiC  56.89 
 
 		 631 aa  523  1e-147  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2710  thiamine biosynthesis protein ThiC  55.43 
 
 		 624 aa  523  1e-147  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5702  thiamine biosynthesis protein ThiC  56.28 
 
 		 627 aa  522  1e-147  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2096  thiamine biosynthesis protein ThiC  55.56 
 
 		 683 aa  523  1e-147  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4536  thiamine biosynthesis protein ThiC  56.67 
 
 		 631 aa  521  1e-147  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4228  thiamine biosynthesis protein ThiC  56.89 
 
 		 631 aa  523  1e-147  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0093  thiamine biosynthesis protein ThiC  56.38 
 
 		 628 aa  524  1e-147  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.447286  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03824  hypothetical protein  56.89 
 
 		 631 aa  524  1e-147  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4031  thiamine biosynthesis protein ThiC  56.89 
 
 		 631 aa  524  1e-147  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0125326 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4442  thiamine biosynthesis protein ThiC  56.89 
 
 		 631 aa  524  1e-147  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000546852 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0829  thiamine biosynthesis protein ThiC  55.51 
 
 		 617 aa  523  1e-147  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.510545  normal  0.639262 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5462  thiamine biosynthesis protein ThiC  56.89 
 
 		 631 aa  524  1e-147  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.416651 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2227  thiamine biosynthesis protein ThiC  58.12 
 
 		 605 aa  518  1e-146  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000308788 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0113  thiamine biosynthesis protein ThiC  54.21 
 
 		 631 aa  518  1e-146  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.285617 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3661  thiamine biosynthesis protein ThiC  55.51 
 
 		 614 aa  518  1e-146  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00146  thiamine biosynthesis protein ThiC  55.85 
 
 		 642 aa  521  1e-146  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.839696  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02603  thiamine biosynthesis protein ThiC  55.78 
 
 		 625 aa  518  1e-146  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002072  thiamin biosynthesis protein ThiC  54.67 
 
 		 646 aa  519  1e-146  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0148  thiamine biosynthesis protein ThiC  54.41 
 
 		 630 aa  518  1e-146  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0383  thiamine biosynthesis protein ThiC  57.04 
 
 		 652 aa  519  1e-146  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3318  thiamine biosynthesis protein ThiC  54.92 
 
 		 635 aa  519  1e-146  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5222  thiamine biosynthesis protein ThiC  55 
 
 		 567 aa  520  1e-146  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00366  thiamine biosynthesis protein ThiC  54.89 
 
 		 646 aa  521  1e-146  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3642  thiamine biosynthesis protein ThiC  54.92 
 
 		 635 aa  519  1e-146  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2592  thiamine biosynthesis protein ThiC  55.33 
 
 		 652 aa  519  1e-146  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.135026 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65740  thiamine biosynthesis protein ThiC  56.06 
 
 		 627 aa  521  1e-146  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0052  thiamine biosynthesis protein ThiC  56.47 
 
 		 585 aa  519  1e-146  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.187685  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5609  thiamine biosynthesis protein ThiC  56.47 
 
 		 606 aa  518  1.0000000000000001e-145  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.567176  decreased coverage  0.000155826 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2971  thiamine biosynthesis protein ThiC  55.29 
 
 		 614 aa  517  1.0000000000000001e-145  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.103817  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0132  thiamine biosynthesis protein ThiC  55.63 
 
 		 917 aa  516  1.0000000000000001e-145  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.436618  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2285  thiamine biosynthesis protein ThiC  54.9 
 
 		 635 aa  517  1.0000000000000001e-145  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0369  thiamine biosynthesis protein ThiC  55.88 
 
 		 638 aa  515  1.0000000000000001e-145  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0896  thiamine biosynthesis protein ThiC  54.63 
 
 		 647 aa  515  1.0000000000000001e-145  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.116715  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2013  thiamine biosynthesis protein ThiC  55.11 
 
 		 652 aa  515  1.0000000000000001e-145  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.715705  normal  0.547634 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0240  thiamine biosynthesis protein ThiC  54.95 
 
 		 630 aa  517  1.0000000000000001e-145  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.211755 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2201  thiamine biosynthesis protein ThiC  54.89 
 
 		 666 aa  517  1.0000000000000001e-145  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>