92 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCV52592_1651 on replicon NC_009715
Organism: Campylobacter curvus 525.92



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009715  CCV52592_1651  hypothetical protein  100 
 
 
171 aa  352  2e-96  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.000000147979  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1217  Thioredoxin domain protein  35.29 
 
 
179 aa  108  5e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0173  hypothetical protein  34.17 
 
 
168 aa  80.1  0.00000000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0855  Fis family transcriptional regulator  44.16 
 
 
130 aa  68.6  0.00000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1185  Thioredoxin domain  43.75 
 
 
125 aa  60.1  0.00000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0435  thioredoxin domain-containing protein  38.96 
 
 
125 aa  57.8  0.00000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2957  thioredoxin family protein  43.08 
 
 
125 aa  57  0.0000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1908  Thioredoxin domain protein  27.56 
 
 
128 aa  56.2  0.0000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0411093  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0517  thioredoxin-related protein  43.75 
 
 
125 aa  56.2  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3645  thioredoxin domain-containing protein  36.76 
 
 
135 aa  55.8  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.890766 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0150  thioredoxin domain-containing protein  39.06 
 
 
127 aa  54.7  0.0000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1025  thioredoxin-related  37.33 
 
 
129 aa  52.4  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3604  thioredoxin domain-containing protein  35.21 
 
 
127 aa  52.4  0.000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.453711 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0589  thioredoxin domain-containing protein  30.07 
 
 
128 aa  52  0.000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2577  thioredoxin  26.83 
 
 
162 aa  51.6  0.000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.09641  normal  0.051891 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1878  Thioredoxin domain protein  39.06 
 
 
125 aa  51.6  0.000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2886  thioredoxin domain-containing protein  30.09 
 
 
133 aa  50.8  0.000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2862  hypothetical protein  30.59 
 
 
142 aa  50.4  0.00001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.816123  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2547  hypothetical protein  30.59 
 
 
142 aa  50.4  0.00001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0275  thioredoxin family protein  33.33 
 
 
169 aa  49.7  0.00002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1087  Thioredoxin domain protein  37.5 
 
 
129 aa  50.1  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.826113  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2283  thioredoxin  24.79 
 
 
173 aa  49.3  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000888091  normal  0.229948 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1048  thioredoxin domain-containing protein  37.7 
 
 
331 aa  48.9  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.157412  normal  0.991017 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2781  thioredoxin  33.87 
 
 
87 aa  48.5  0.00005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.528601  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2362  thioredoxin  25 
 
 
144 aa  47.8  0.00008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1995  thioredoxin  25 
 
 
144 aa  47.8  0.00008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3683  thioredoxin-related  39.34 
 
 
329 aa  47.4  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.418332  normal  0.641891 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4016  thioredoxin domain protein  39.34 
 
 
140 aa  47  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.698342  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4956  thioredoxin  34.38 
 
 
106 aa  45.8  0.0003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.183907 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4906  thioredoxin  34.38 
 
 
106 aa  45.8  0.0003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.803641  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1976  thioredoxin  35.38 
 
 
109 aa  45.8  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4442  thioredoxin  34.38 
 
 
119 aa  45.1  0.0004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.553221 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3336  thioredoxin  27.85 
 
 
259 aa  45.4  0.0004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.17955  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1420  thioredoxin  32.47 
 
 
157 aa  44.7  0.0006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.669095  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4105  Thioredoxin domain protein  36.07 
 
 
321 aa  44.7  0.0006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.118303  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3607  thioredoxin domain-containing protein  36.67 
 
 
300 aa  44.7  0.0006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.150797 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1625  thioredoxin  31.25 
 
 
107 aa  44.7  0.0007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0473  thioredoxin  31.25 
 
 
107 aa  44.7  0.0007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.319728  normal  0.0128632 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3822  putative thioredoxin  28.68 
 
 
164 aa  43.9  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.644902  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2256  thioredoxin  31.03 
 
 
105 aa  43.5  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00435277 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3958  thioredoxin  29.73 
 
 
106 aa  43.5  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2792  thioredoxin  35.38 
 
 
307 aa  43.9  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.336164  normal  0.284427 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4059  thioredoxin domain-containing protein  34.43 
 
 
130 aa  43.9  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.653805  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1276  thioredoxin domain protein  33.33 
 
 
337 aa  43.5  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3988  thioredoxin domain-containing protein  35 
 
 
300 aa  43.1  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000709703 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0633  thiol-disulfide isomerase/thioredoxin  27.63 
 
 
205 aa  42.7  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0261257  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4067  thioredoxin  34.29 
 
 
107 aa  43.1  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2353  thioredoxin  27.68 
 
 
165 aa  43.1  0.002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000000260475  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4099  thioredoxin  29.9 
 
 
324 aa  42.7  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.809641  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2376  thioredoxin-related  30.65 
 
 
286 aa  42.7  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.036483  normal  0.757224 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3886  Thioredoxin domain protein  36.51 
 
 
312 aa  42.7  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.54182  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4260  thioredoxin  32.31 
 
 
105 aa  43.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.910277 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3582  thioredoxin  34.38 
 
 
107 aa  42.4  0.003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.968394  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4174  thioredoxin  29.69 
 
 
107 aa  42.4  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0093  thioredoxin  23.76 
 
 
106 aa  42.7  0.003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00548015 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1305  thioredoxin  29.41 
 
 
235 aa  42.4  0.003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.277929  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0062  thioredoxin  32.81 
 
 
117 aa  42.4  0.003  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3594  thioredoxin  24.27 
 
 
257 aa  42.4  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0521557 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0822  thioredoxin  33.33 
 
 
310 aa  42.4  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.606093  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0520  thioredoxin  27.27 
 
 
145 aa  42  0.004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.609436  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3630  cell surface glycoprotein (S-layer protein)  25.17 
 
 
500 aa  42  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4285  thioredoxin  29.73 
 
 
106 aa  42  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.395722  normal  0.497891 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1679  thioredoxin  25.61 
 
 
98 aa  42  0.004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0306  putative thioredoxin  34.25 
 
 
305 aa  42  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.351153 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0664  Thioredoxin domain protein  34.43 
 
 
282 aa  41.6  0.005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000362321  hitchhiker  0.00000255831 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08920  thioredoxin  30.68 
 
 
102 aa  42  0.005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.0000942681  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3919  thioredoxin  32.89 
 
 
103 aa  41.6  0.005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.566246  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3232  thioredoxin domain-containing protein  29.27 
 
 
285 aa  41.6  0.005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.941804  normal  0.328637 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3617  thioredoxin  31.08 
 
 
173 aa  41.6  0.006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0370437  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3596  thioredoxin  26.04 
 
 
150 aa  41.2  0.006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.854397  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1675  thioredoxin  26.92 
 
 
110 aa  41.6  0.006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.140064  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0268  thioredoxin  32.88 
 
 
306 aa  41.6  0.006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.223768  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3378  thioredoxin  30.43 
 
 
107 aa  41.6  0.006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.197201  normal  0.553993 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0504  thioredoxin  27.27 
 
 
145 aa  41.6  0.006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0235096 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7798  thioredoxin  34.33 
 
 
146 aa  41.6  0.006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.449565  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1129  thioredoxin  29.23 
 
 
105 aa  41.2  0.007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0264  thioredoxin-related  32.88 
 
 
305 aa  41.2  0.007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.569758 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1746  thioredoxin  25.3 
 
 
110 aa  41.2  0.007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0427  thioredoxin family protein  29.13 
 
 
165 aa  41.2  0.007  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0156232  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1160  thioredoxin  29.23 
 
 
105 aa  41.2  0.007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0193016  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1865  thioredoxin  34.92 
 
 
306 aa  40.8  0.008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.938725 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0777  thioredoxin domain-containing protein  35.38 
 
 
111 aa  41.2  0.008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.387986  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28500  thioredoxin  26.6 
 
 
299 aa  41.2  0.008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.173246 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1818  thioredoxin  34.43 
 
 
293 aa  40.8  0.008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0314014 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3241  thioredoxin  33.33 
 
 
107 aa  41.2  0.008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_37354  predicted protein  29.58 
 
 
131 aa  40.8  0.009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0644454  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1038  thioredoxin  30.59 
 
 
277 aa  40.8  0.009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1982  thioredoxin  32.84 
 
 
317 aa  40.8  0.009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  decreased coverage  0.00653306  normal  0.106397 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3775  thioredoxin  32.88 
 
 
324 aa  40.8  0.009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.467472 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1925  Thioredoxin domain-containing protein  33.33 
 
 
299 aa  40.8  0.009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1332  thioredoxin  28.41 
 
 
159 aa  40.8  0.01  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.636016  normal  0.90337 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3325  Thioredoxin domain protein  30.77 
 
 
176 aa  40.8  0.01  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000131659 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>