47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCV52592_0353 on replicon NC_009715
Organism: Campylobacter curvus 525.92



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009715  CCV52592_0353  putative pyruvate kinase  100 
 
 
160 aa  326  8e-89  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4378  hypothetical protein  52.85 
 
 
174 aa  133  9e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  6.032150000000001e-23 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0282  pyruvate kinase  52.03 
 
 
174 aa  131  5e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.788036  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4739  hypothetical protein  49.24 
 
 
158 aa  130  6.999999999999999e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  hitchhiker  0.006335 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3628  hypothetical protein  49.24 
 
 
158 aa  130  6.999999999999999e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1020  hypothetical protein  50 
 
 
158 aa  130  7.999999999999999e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.253072 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5544  hypothetical protein  48.48 
 
 
158 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.596432  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0951  hypothetical protein  51.22 
 
 
174 aa  129  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5482  hypothetical protein  50.82 
 
 
175 aa  125  3e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000608961 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4731  protein of unknown function DUF1486  48.3 
 
 
155 aa  122  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4899  hypothetical protein  43.41 
 
 
162 aa  112  3e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.561738 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0069  hypothetical protein  42.64 
 
 
157 aa  110  8.000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5449  hypothetical protein  42.64 
 
 
162 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.744205 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5237  hypothetical protein  43.9 
 
 
157 aa  107  6e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5622  hypothetical protein  43.9 
 
 
157 aa  107  6e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0377786 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4608  hypothetical protein  43.09 
 
 
157 aa  105  2e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.2163  hitchhiker  0.0000946441 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0238  protein of unknown function DUF1486  38.24 
 
 
157 aa  103  1e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5599  hypothetical protein  39.84 
 
 
151 aa  101  4e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.465916  normal  0.0959248 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2880  hypothetical protein  39.06 
 
 
129 aa  90.5  9e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0708  hypothetical protein  37.3 
 
 
141 aa  89  3e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.877907  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10133  hypothetical protein  36.59 
 
 
125 aa  79  0.00000000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2881  hypothetical protein  35.33 
 
 
150 aa  78.6  0.00000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1476  hypothetical protein  34.92 
 
 
127 aa  77  0.00000000000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1397  protein of unknown function DUF1486  40.18 
 
 
155 aa  75.5  0.0000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.137743  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001568  possible membrane protein  34.21 
 
 
125 aa  73.2  0.000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5094  hypothetical protein  32.79 
 
 
130 aa  71.6  0.000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1315  hypothetical protein  34.4 
 
 
254 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000687545 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1495  protein of unknown function DUF1486  30.08 
 
 
255 aa  67.8  0.00000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.692441  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2361  hypothetical protein  34 
 
 
247 aa  63.5  0.000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.643964 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1955  hypothetical protein  33.04 
 
 
164 aa  63.5  0.000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.252213  hitchhiker  0.00353589 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6507  protein of unknown function DUF1486  31.11 
 
 
133 aa  63.2  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.199296  normal  0.262757 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4656  putative lipoprotein  35.17 
 
 
287 aa  63.5  0.000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0150127  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2199  hypothetical protein  30.88 
 
 
288 aa  60.1  0.00000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.944581  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4696  hypothetical protein  30.25 
 
 
122 aa  57.8  0.00000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0528913  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3606  hypothetical protein  33.99 
 
 
288 aa  57.4  0.00000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3038  hypothetical protein  29.23 
 
 
253 aa  56.2  0.0000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4898  hypothetical protein  36.67 
 
 
253 aa  55.8  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3274  putative lipoprotein  39.33 
 
 
287 aa  54.7  0.0000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.896395  normal  0.0865941 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4311  hypothetical protein  29.27 
 
 
255 aa  53.1  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.819022  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2434  hypothetical protein  31.01 
 
 
276 aa  52.4  0.000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.355928  normal  0.0191811 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5315  hypothetical protein  25.22 
 
 
139 aa  49.3  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.747889  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2545  protein of unknown function DUF1486  23.58 
 
 
139 aa  46.2  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2666  protein of unknown function DUF1486  26.61 
 
 
142 aa  45.1  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5527  protein of unknown function DUF1486  26.27 
 
 
135 aa  44.3  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.848344  hitchhiker  0.000266853 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5064  hypothetical protein  27.43 
 
 
131 aa  44.7  0.0006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.639568  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3812  putative lipoprotein  35 
 
 
280 aa  43.1  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2852  hypothetical protein  32.1 
 
 
254 aa  42  0.004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000042395 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>