More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCC13826_1466 on replicon NC_009802
Organism: Campylobacter concisus 13826



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009802  CCC13826_1466  putative integral membrane protein  100 
 
 		 296 aa  586  1e-166  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0201  cation-efflux system membrane protein  66.89 
 
 		 296 aa  405  1.0000000000000001e-112  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1708  response regulator receiver  52.35 
 
 		 295 aa  302  5.000000000000001e-81  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1488  response regulator receiver domain-containing protein  48.66 
 
 		 299 aa  276  3e-73  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.47127  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0408  response regulator receiver domain-containing protein  51.68 
 
 		 296 aa  268  8.999999999999999e-71  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0244  conserved hypothetical protein, putative two-component response regulator  48.99 
 
 		 291 aa  256  4e-67  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1595  DNA-binding response regulator, putative  48.48 
 
 		 295 aa  237  1e-61  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1962  DNA-binding response regulator, putative  48.48 
 
 		 295 aa  237  1e-61  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1780  DNA-binding response regulator, putative  47.81 
 
 		 295 aa  235  8e-61  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.756985  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0745  two-component regulator  34.17 
 
 		 223 aa  67.4  0.0000000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.802142  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1693  two-component regulator  35 
 
 		 223 aa  66.6  0.0000000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0000232098  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4882  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.96 
 
 		 224 aa  66.6  0.0000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0664  two component transcriptional regulator  30 
 
 		 237 aa  66.2  0.0000000006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1559  response regulator receiver  31.2 
 
 		 228 aa  66.2  0.0000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1629  two-component response regulator  31.25 
 
 		 228 aa  66.2  0.0000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.128663 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1228  two component transcriptional regulator, winged helix family protein  31.86 
 
 		 218 aa  65.9  0.0000000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.169339 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0242  two-component regulator  35.83 
 
 		 223 aa  65.5  0.0000000009  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.20879  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1934  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 476 aa  65.1  0.000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.808753  normal  0.132653 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1581  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  32.74 
 
 		 223 aa  64.7  0.000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.304003  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1185  response regulator receiver  30.97 
 
 		 225 aa  64.3  0.000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0086  two component transcriptional regulator, winged helix family  28.28 
 
 		 223 aa  64.3  0.000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000430601  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4117  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  28.03 
 
 		 465 aa  63.5  0.000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.167574 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0235  response regulator receiver  33.33 
 
 		 223 aa  63.9  0.000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2101  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  35.71 
 
 		 228 aa  63.9  0.000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2388  heavy metal response regulator  35.71 
 
 		 228 aa  63.9  0.000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.000142984  normal  0.119734 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1478  two component transcriptional regulator  33.05 
 
 		 240 aa  63.5  0.000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000111909  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0247  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  27.07 
 
 		 467 aa  63.5  0.000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3098  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  34.29 
 
 		 491 aa  63.2  0.000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2215  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  34.23 
 
 		 228 aa  63.2  0.000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0029  DNA-binding response regulator CzrR  35.29 
 
 		 224 aa  62.8  0.000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000398254 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0043  two component heavy metal response transcriptional regulator  35.29 
 
 		 224 aa  62.8  0.000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.216902  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0555  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  28.93 
 
 		 457 aa  62.8  0.000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1389  two component heavy metal response transcriptional regulator  29.27 
 
 		 225 aa  62.8  0.000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.717226  normal  0.091392 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0043  two component heavy metal response transcriptional regulator  35.29 
 
 		 224 aa  62.8  0.000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.955175  hitchhiker  0.00039578 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0046  two component heavy metal response transcriptional regulator  35.29 
 
 		 224 aa  62.8  0.000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.398344  normal  0.151204 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3049  two component transcriptional regulator  33.33 
 
 		 224 aa  62.4  0.000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42680  sigma54-dependent response regulator, CbrB  29.23 
 
 		 466 aa  62.8  0.000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2255  two component transcriptional regulator  32.14 
 
 		 224 aa  62.4  0.000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.39138  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1764  DNA-binding response regulator  25 
 
 		 224 aa  62.4  0.000000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2487  two component transcriptional regulator  36.36 
 
 		 224 aa  62  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.431556  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0528  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.17 
 
 		 230 aa  62  0.00000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1946  transcriptional regulatory protein PhoP  32.14 
 
 		 224 aa  62  0.00000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5224  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  29.27 
 
 		 225 aa  62  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.57611  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1351  response regulator receiver protein  32.28 
 
 		 141 aa  62  0.00000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000171187  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2379  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 446 aa  61.6  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.373235  normal  0.0399931 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0465  two component transcriptional regulator, winged helix family  30.65 
 
 		 225 aa  62  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1580  two component transcriptional regulator  32.14 
 
 		 227 aa  62  0.00000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.128837 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1655  two component transcriptional regulator  32.14 
 
 		 227 aa  62  0.00000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.014875  hitchhiker  0.000274191 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2586  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.28 
 
 		 227 aa  62  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0130561 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1724  two component transcriptional regulator  32.14 
 
 		 227 aa  62  0.00000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.235921 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1625  DNA-binding response regulator CsrR  29.05 
 
 		 229 aa  61.6  0.00000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.137799  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0373  two component transcriptional regulator, winged helix family  27.27 
 
 		 237 aa  61.2  0.00000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0495  two component, sigma-54 specific, Fis family transcriptional regulator  33.06 
 
 		 456 aa  60.8  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3450  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  35.65 
 
 		 448 aa  61.2  0.00000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0010  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.66 
 
 		 508 aa  61.6  0.00000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0502065  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3516  two component transcriptional regulator  32.74 
 
 		 222 aa  61.2  0.00000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.796525  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4933  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.51 
 
 		 224 aa  61.2  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.742602  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0980  response regulator receiver domain-containing protein  33.83 
 
 		 223 aa  61.2  0.00000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.0000790444  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3454  two component transcriptional regulator, winged helix family  30.4 
 
 		 223 aa  61.2  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5304  two component transcriptional regulator, winged helix family  30.09 
 
 		 221 aa  61.6  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1850  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.04 
 
 		 224 aa  61.2  0.00000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0826767  hitchhiker  0.000859255 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0009  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.19 
 
 		 509 aa  61.2  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.923259 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2056  DNA-binding response regulator  38.39 
 
 		 227 aa  60.8  0.00000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.413172  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2474  heavy metal response regulator  27.15 
 
 		 223 aa  60.5  0.00000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2494  two component transcriptional regulator  33.04 
 
 		 227 aa  60.8  0.00000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.178511  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1969  response regulator receiver domain-containing protein  31.86 
 
 		 219 aa  60.5  0.00000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.478098  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2501  two component transcriptional regulator  33.04 
 
 		 227 aa  60.8  0.00000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3980  DNA-binding transcriptional regulator BasR  24.84 
 
 		 220 aa  60.8  0.00000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000564215  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3931  two component transcriptional regulator  27.78 
 
 		 221 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2212  DNA-binding response regulator  38.39 
 
 		 227 aa  60.8  0.00000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2977  response regulator receiver domain-containing protein  25.81 
 
 		 303 aa  60.5  0.00000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.13601 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2614  two component transcriptional regulator  33.04 
 
 		 227 aa  60.8  0.00000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0109329 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1358  two component response regulator  35.09 
 
 		 224 aa  60.5  0.00000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.333715  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3251  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  26.19 
 
 		 465 aa  60.8  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2240  DNA-binding response regulator  38.39 
 
 		 227 aa  60.8  0.00000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.85177e-28 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0010  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.19 
 
 		 511 aa  60.5  0.00000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3741  DNA-binding transcriptional regulator BasR  24.84 
 
 		 220 aa  60.8  0.00000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5210  two component response regulator  32.43 
 
 		 241 aa  60.5  0.00000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0354  DNA-binding response regulator  35.14 
 
 		 229 aa  60.5  0.00000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00000041064  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3589  two component transcriptional regulator  27.78 
 
 		 221 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.106176  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1913  two component transcriptional regulator, winged helix family  28.57 
 
 		 221 aa  60.5  0.00000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0680  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  27.87 
 
 		 418 aa  60.5  0.00000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.736075  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3607  DNA-binding transcriptional regulator BasR  24.84 
 
 		 220 aa  60.8  0.00000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000202279  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2062  two component transcriptional regulator  31.03 
 
 		 228 aa  60.5  0.00000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0133309  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0008  sensory box histidine kinase/response regulator  30.77 
 
 		 516 aa  60.1  0.00000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3997  two component transcriptional regulator, winged helix family  31.2 
 
 		 227 aa  60.5  0.00000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003617  DNA-binding response regulator  31.86 
 
 		 218 aa  60.1  0.00000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.831618  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2192  two component heavy metal response transcriptional regulator  29.66 
 
 		 230 aa  60.5  0.00000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0376  DNA-binding response regulator IrlR  29.82 
 
 		 230 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.083776  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2960  two component heavy metal response transcriptional regulator  31.25 
 
 		 227 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2480  DNA-binding heavy metal response regulator  29.66 
 
 		 230 aa  60.5  0.00000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000187636  normal  0.518539 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3919  two component transcriptional regulator, winged helix family  31.2 
 
 		 227 aa  60.5  0.00000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0187  two component transcriptional regulator  33.91 
 
 		 227 aa  60.1  0.00000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2290  two component transcriptional regulator  35.45 
 
 		 224 aa  60.5  0.00000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2084  DNA-binding heavy metal response regulator  30.36 
 
 		 230 aa  60.1  0.00000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000771382  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4326  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  33.63 
 
 		 222 aa  60.1  0.00000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0885545 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2915  sigma-54 dependent DNA-binding response regulator  32 
 
 		 457 aa  60.1  0.00000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4800  heavy metal response regulator  31.25 
 
 		 224 aa  59.7  0.00000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00185939 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1103  DNA-binding response regulator IrlR  29.82 
 
 		 230 aa  60.1  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0630149  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1701  DNA-binding response regulator  36.28 
 
 		 230 aa  60.1  0.00000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00672994  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>