178 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_09363 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014230  CA2559_09363  putative methyltransferase  100 
 
 
227 aa  466  9.999999999999999e-131  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.182013  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0485  methyltransferase type 11  49.79 
 
 
235 aa  223  2e-57  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0660  Methyltransferase type 11  47.64 
 
 
234 aa  214  9.999999999999999e-55  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0102  Methyltransferase type 11  40 
 
 
232 aa  174  8e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0888112  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0963  SAM-dependent methyltransferase  40.34 
 
 
239 aa  165  5.9999999999999996e-40  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.679672  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3934  Methyltransferase type 11  27.62 
 
 
259 aa  65.5  0.0000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.229133  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4493  hypothetical protein  24 
 
 
235 aa  65.1  0.0000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.809793  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1121  methyltransferase type 11  34.78 
 
 
195 aa  65.1  0.0000000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.510449  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1767  hypothetical protein  24.89 
 
 
239 aa  59.3  0.00000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  decreased coverage  0.00475072 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2259  methyltransferase type 11  34.29 
 
 
196 aa  58.5  0.00000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2092  hypothetical protein  27.95 
 
 
240 aa  57.8  0.0000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.516307 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1966  methyltransferase type 11  28.99 
 
 
215 aa  58.2  0.0000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000755977  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0655  D-alanine--D-alanine ligase  29.13 
 
 
663 aa  55.5  0.0000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.24382  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2230  methyltransferase  39.13 
 
 
236 aa  53.5  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000502541  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2899  hypothetical protein  39.13 
 
 
236 aa  53.1  0.000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000010502  normal  0.0506013 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2276  methyltransferase  32.38 
 
 
236 aa  52.8  0.000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  4.19659e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2579  hypothetical protein  37.68 
 
 
236 aa  52.8  0.000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000213687  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4063  Methyltransferase type 11  23.87 
 
 
319 aa  52.4  0.000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.355877 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2504  hypothetical protein  32.38 
 
 
236 aa  52.4  0.000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2308  hypothetical protein  37.68 
 
 
236 aa  52  0.000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000011894  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2483  hypothetical protein  37.68 
 
 
236 aa  52  0.000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000363722  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1722  methyltransferase type 12  26.88 
 
 
575 aa  52  0.000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0792321 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2514  hypothetical protein  37.68 
 
 
222 aa  52  0.000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000000941617  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2453  MCP methyltransferase, CheR-type  28.07 
 
 
247 aa  50.4  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000207695  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14890  Methyltransferase type 11  26.32 
 
 
276 aa  50.8  0.00002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.223529  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3055  methyltransferase type 11  26.61 
 
 
249 aa  50.8  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0287567  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4886  methyltransferase type 12  29.5 
 
 
259 aa  50.8  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2437  hypothetical protein  32.67 
 
 
236 aa  50.4  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000255199  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1911  Methyltransferase type 11  31.58 
 
 
231 aa  50.1  0.00003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2494  methyltransferase type 11  31.07 
 
 
254 aa  49.3  0.00004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.162443  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1543  methyltransferase type 11  25.2 
 
 
259 aa  49.3  0.00005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2775  Methyltransferase type 11  28.24 
 
 
277 aa  49.3  0.00005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2920  Methyltransferase type 12  29.13 
 
 
223 aa  48.9  0.00006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.79301  hitchhiker  0.00140451 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0197  Methyltransferase type 11  40.91 
 
 
197 aa  49.3  0.00006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.746837  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23050  methyltransferase family protein  39.73 
 
 
410 aa  48.9  0.00007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.294181 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1855  methyltransferase type 11  24.78 
 
 
232 aa  48.9  0.00007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000126246  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1394  methyltransferase type 11  30.84 
 
 
248 aa  48.9  0.00007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1440  methyltransferase type 11  28.97 
 
 
248 aa  48.5  0.00008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0464  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  32.1 
 
 
259 aa  48.5  0.00009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0186  Methyltransferase type 11  39.39 
 
 
197 aa  48.5  0.00009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1379  Methyltransferase type 11  28.81 
 
 
251 aa  47.8  0.0001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0788  hypothetical protein  25 
 
 
249 aa  48.1  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000039768  hitchhiker  0.00000215266 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1888  methyltransferase type 11  36.71 
 
 
209 aa  47.8  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1959  methyltransferase type 11  27.88 
 
 
244 aa  48.1  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11406  transferase  39.13 
 
 
212 aa  48.1  0.0001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000309281  normal  0.307952 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0509  methyltransferase type 11  33.33 
 
 
210 aa  47.8  0.0001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2289  methyltransferase type 11  41.51 
 
 
236 aa  48.1  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000192074  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0933  methyltransferase type 12  41.54 
 
 
208 aa  47.4  0.0002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.275777  hitchhiker  0.00155248 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1149  Methyltransferase type 11  24.3 
 
 
241 aa  47.4  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000285461  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1330  Methyltransferase type 11  27.97 
 
 
252 aa  47.4  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4227  hypothetical protein  25 
 
 
249 aa  46.6  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0061415  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4065  methyltransferase  25 
 
 
249 aa  46.6  0.0003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000132189  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4075  methyltransferase  25 
 
 
249 aa  46.6  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000412904  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1544  Methyltransferase type 11  25.81 
 
 
200 aa  46.6  0.0003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.580406  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4555  hypothetical protein  25 
 
 
249 aa  46.6  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000250123  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4135  methyltransferase type 11  27.35 
 
 
243 aa  46.6  0.0003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.399461  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4351  hypothetical protein  25 
 
 
249 aa  46.6  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000420898 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4449  hypothetical protein  25 
 
 
249 aa  46.6  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0469644  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1569  Methyltransferase type 12  29.63 
 
 
258 aa  46.6  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000138849  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10570  benzoquinone methyltransferase  33.73 
 
 
241 aa  46.6  0.0003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.175539  normal  0.480356 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0712  Methyltransferase type 11  34.67 
 
 
246 aa  46.6  0.0003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0896  methyltransferase, putative  28.67 
 
 
262 aa  46.2  0.0004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2098  hypothetical protein  51.22 
 
 
194 aa  46.2  0.0004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.379159  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3590  methyltransferase type 12  26.42 
 
 
253 aa  46.2  0.0004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.698799  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2753  methyltransferase type 12  24.72 
 
 
231 aa  46.2  0.0004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.126222  hitchhiker  0.00760021 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0712  methyltransferase type 12  22.91 
 
 
209 aa  45.8  0.0005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.897231  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2470  methyltransferase type 11  29.25 
 
 
250 aa  45.8  0.0005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.28485  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0543  Methyltransferase type 11  26.12 
 
 
247 aa  45.8  0.0005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0726  methyltransferase type 12  22.91 
 
 
209 aa  45.8  0.0005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.204789  normal  0.0433618 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3732  Methyltransferase type 11  22.89 
 
 
274 aa  45.8  0.0005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0706  methyltransferase type 12  22.91 
 
 
209 aa  45.8  0.0005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0371032 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0193  methyltransferase type 12  41.94 
 
 
198 aa  45.8  0.0005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.111686 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3917  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 
243 aa  45.8  0.0005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4180  methyltransferase type 11  24.19 
 
 
249 aa  45.8  0.0005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00053003  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4410  hypothetical protein  25 
 
 
249 aa  45.4  0.0006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.422473  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3503  SAM-dependent methyltransferase  25.42 
 
 
287 aa  45.4  0.0006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0311533  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0379  methyltransferase type 11  32.43 
 
 
257 aa  45.4  0.0006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.292052  normal  0.0841223 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1001  methyltransferase type 11  28.43 
 
 
282 aa  45.8  0.0006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4462  hypothetical protein  25 
 
 
249 aa  45.8  0.0006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000536455  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0081  hypothetical protein  48.98 
 
 
390 aa  45.4  0.0007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.113144  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1113  Methyltransferase type 11  29.13 
 
 
252 aa  45.4  0.0007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.022337  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0736  tellurite resistance protein TehB  28.26 
 
 
208 aa  45.4  0.0007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.304393  normal  0.132387 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29120  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  28.97 
 
 
203 aa  45.4  0.0007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25940  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  26.09 
 
 
282 aa  45.4  0.0007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1411  Methyltransferase type 11  27.62 
 
 
246 aa  45.1  0.0008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.110905 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1748  methyltransferase type 11  33 
 
 
257 aa  45.1  0.0008  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.620852  normal  0.453754 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0463  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28.71 
 
 
250 aa  44.7  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3676  UbiE/COQ5 methyltransferase  25.16 
 
 
230 aa  45.1  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0791082 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2788  Methyltransferase type 11  26.72 
 
 
237 aa  44.7  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.125753  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2038  Methyltransferase type 11  28.77 
 
 
197 aa  44.7  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.678124 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1452  Methyltransferase type 11  38.89 
 
 
202 aa  44.7  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0105  methyltransferase type 11  25.23 
 
 
247 aa  45.1  0.001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.342387  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5435  methyltransferase type 12  26.42 
 
 
253 aa  44.7  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4293  Methyltransferase type 11  25.98 
 
 
305 aa  44.3  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.943104  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0587  Methyltransferase type 11  26.17 
 
 
220 aa  44.7  0.001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2902  Methyltransferase type 12  22.77 
 
 
248 aa  44.7  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000205015  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0358  methyltransferase type 11  28.57 
 
 
637 aa  44.7  0.001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000290663  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0400  methyltransferase type 11  42.86 
 
 
248 aa  44.7  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.555595  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3335  Methyltransferase type 12  23.65 
 
 
259 aa  43.9  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.15309  unclonable  0.0000000176588 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0592  methyltransferase type 11  40 
 
 
221 aa  43.9  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.499783  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>