More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_09263 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014230  CA2559_09263  endonuclease III/Nth  100 
 
 		 218 aa  445  1.0000000000000001e-124  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.208041  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2438  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  78.8 
 
 		 218 aa  375  1e-103  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00334229  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2158  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  76.47 
 
 		 209 aa  337  9.999999999999999e-92  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02735  Endonuclease III/Nth  68.81 
 
 		 237 aa  321  7e-87  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2604  endonuclease III  69.27 
 
 		 227 aa  295  5e-79  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.324373  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1009  endonuclease III/Nth  61.34 
 
 		 217 aa  258  6e-68  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.544458  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08631  putative endonuclease  59.8 
 
 		 217 aa  257  9e-68  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0210  putative endonuclease  60.82 
 
 		 217 aa  256  1e-67  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2465  endonuclease III  54.59 
 
 		 220 aa  256  2e-67  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.341333 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08421  putative endonuclease  60.31 
 
 		 217 aa  256  2e-67  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.884282  hitchhiker  0.00457853 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1930  endonuclease III  59.31 
 
 		 216 aa  254  8e-67  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.491388  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08661  putative endonuclease  59.31 
 
 		 217 aa  252  4.0000000000000004e-66  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.659896  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0810  putative endonuclease  59.31 
 
 		 217 aa  251  5.000000000000001e-66  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0256487  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07791  putative endonuclease  57.35 
 
 		 217 aa  251  8.000000000000001e-66  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1489  endonuclease III  57.73 
 
 		 217 aa  251  8.000000000000001e-66  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.220134  normal  0.323214 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0549  endonuclease III  56.93 
 
 		 212 aa  247  1e-64  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.0850765 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17641  putative endonuclease  57.22 
 
 		 217 aa  233  2.0000000000000002e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.96532 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09581  putative endonuclease  53.09 
 
 		 217 aa  213  9.999999999999999e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.136749  hitchhiker  0.00149205 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1412  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  53.44 
 
 		 231 aa  204  6e-52  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.869538 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2991  endonuclease III  45.45 
 
 		 233 aa  164  1.0000000000000001e-39  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0970  endonuclease III  46.28 
 
 		 214 aa  162  4.0000000000000004e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.99745  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2331  endonuclease III  43.85 
 
 		 211 aa  161  8.000000000000001e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1931  endonuclease III  46.28 
 
 		 214 aa  160  2e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.514789  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2246  endonuclease III  45.74 
 
 		 214 aa  159  2e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.769441 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1336  endonuclease III  46.28 
 
 		 214 aa  160  2e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.70217  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1175  endonuclease III  46.28 
 
 		 214 aa  160  2e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1022  endonuclease III  46.28 
 
 		 214 aa  160  2e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.99743  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0843  endonuclease III  46.28 
 
 		 214 aa  160  2e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.667209  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1183  endonuclease III  46.28 
 
 		 214 aa  160  2e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.123601  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0305  endonuclease III  46.28 
 
 		 214 aa  160  2e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.77155  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1270  endonuclease III  42.19 
 
 		 215 aa  159  3e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2366  endonuclease III  45.5 
 
 		 214 aa  159  3e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.249238  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5669  endonuclease III / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  45.21 
 
 		 214 aa  159  4e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.40748  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0492  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase, endonuclease III  44.5 
 
 		 218 aa  159  4e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0222024 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2350  endonuclease III  45.21 
 
 		 214 aa  158  5e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.103385 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0510  endonuclease III  39.38 
 
 		 223 aa  157  9e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2109  endonuclease III  40.93 
 
 		 223 aa  157  1e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.171881  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1014  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  46.28 
 
 		 214 aa  157  1e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0604012  normal  0.969692 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0761  endonuclease III  45.2 
 
 		 197 aa  156  2e-37  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1715  endonuclease III  44.68 
 
 		 214 aa  157  2e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.104745  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2327  endonuclease III  44.68 
 
 		 214 aa  157  2e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2514  endonuclease III  41.47 
 
 		 231 aa  156  3e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0950  endonuclease III  44.68 
 
 		 214 aa  156  3e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.066309  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1889  endonuclease III  43.46 
 
 		 211 aa  154  9e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0789  endonuclease III  40.61 
 
 		 212 aa  154  1e-36  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.584526  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1005  endonuclease III protein  46.24 
 
 		 214 aa  154  1e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.248668  normal  0.180711 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1563  endonuclease III  43.46 
 
 		 211 aa  154  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0700228  normal  0.157438 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1472  endonuclease III  40.62 
 
 		 215 aa  154  1e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.822891  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1721  endonuclease III  43.46 
 
 		 211 aa  154  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.161227  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1623  endonuclease III  43.46 
 
 		 211 aa  154  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.475261  normal  0.347988 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2097  endonuclease III  44.97 
 
 		 214 aa  154  1e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.161318 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2070  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  43.98 
 
 		 213 aa  154  1e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.027671  normal  0.855553 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1551  endonuclease III  43.46 
 
 		 211 aa  154  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.651941  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2359  endonuclease III  44.92 
 
 		 213 aa  154  1e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2793  endonuclease III  41.71 
 
 		 211 aa  153  2e-36  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1844  endonuclease III  43.98 
 
 		 213 aa  153  2e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000031535  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01603  DNA glycosylase and apyrimidinic (AP) lyase (endonuclease III)  42.5 
 
 		 211 aa  152  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00133572  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2008  endonuclease III  42.5 
 
 		 211 aa  152  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00632932  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1566  endonuclease III  42.5 
 
 		 211 aa  152  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.263059  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0936  endonuclease III  45.7 
 
 		 214 aa  152  2.9999999999999998e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0591838 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1709  endonuclease III  42.5 
 
 		 211 aa  152  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.00510464  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1996  endonuclease III  42.5 
 
 		 211 aa  152  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0209025  normal  0.0823674 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1842  endonuclease III  42.5 
 
 		 211 aa  152  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000960215  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1822  endonuclease III  42.5 
 
 		 211 aa  152  2.9999999999999998e-36  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.692656  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01593  hypothetical protein  42.5 
 
 		 211 aa  152  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0014654  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0470  endonuclease III  38.83 
 
 		 235 aa  152  4e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1905  endonuclease III / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  43.46 
 
 		 213 aa  152  4e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1836  endonuclease III  43.98 
 
 		 213 aa  152  5e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.194851  normal  0.186741 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1046  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  44.09 
 
 		 214 aa  151  5.9999999999999996e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2939  endonuclease III  41.71 
 
 		 211 aa  151  8e-36  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2174  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  43.46 
 
 		 211 aa  151  8e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.660077  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2899  endonuclease III  43.62 
 
 		 213 aa  151  8.999999999999999e-36  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.786495  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1676  endonuclease III  39.58 
 
 		 215 aa  151  8.999999999999999e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3742  endonuclease III  39.58 
 
 		 215 aa  151  8.999999999999999e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.941778  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19210  endonuclease III/Nth  45.21 
 
 		 212 aa  150  1e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.24401  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0871  endonuclease III  44.68 
 
 		 214 aa  150  1e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.348794 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1169  endonuclease III/Nth  38.89 
 
 		 236 aa  150  1e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1869  endonuclease III  42.93 
 
 		 210 aa  150  1e-35  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1603  endonuclease III  39.06 
 
 		 215 aa  150  1e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0437  endonuclease III  40.45 
 
 		 246 aa  149  2e-35  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.186096 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1735  endonuclease III  41.49 
 
 		 215 aa  149  2e-35  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.61574  normal  0.277364 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2345  endonuclease III  42 
 
 		 211 aa  150  2e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0106344  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0932  endonuclease III  43.85 
 
 		 212 aa  150  2e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.577405  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2160  endonuclease III  42.93 
 
 		 211 aa  149  3e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.615191  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2038  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  42.93 
 
 		 212 aa  149  3e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3842  endonuclease III  45.76 
 
 		 254 aa  149  4e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.561189  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1456  endonuclease III  39.06 
 
 		 215 aa  149  4e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1428  endonuclease III  39.06 
 
 		 215 aa  149  4e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0645154  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1429  endonuclease III  39.06 
 
 		 215 aa  149  4e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.965291  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2562  endonuclease III  43.85 
 
 		 212 aa  149  4e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.560783  normal  0.0252184 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1570  endonuclease III  39.06 
 
 		 215 aa  149  4e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1641  endonuclease III  39.06 
 
 		 215 aa  149  4e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00426336 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1714  endonuclease III  39.06 
 
 		 215 aa  149  4e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.147583  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1155  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  42 
 
 		 210 aa  148  5e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1235  endonuclease III  43.92 
 
 		 214 aa  148  5e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.649386 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2059  endonuclease III  42.93 
 
 		 213 aa  148  5e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000403968  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1314  endonuclease III  41.29 
 
 		 230 aa  148  6e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0570319  normal  0.296572 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0463  endonuclease III  40.1 
 
 		 226 aa  148  6e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0687351  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2122  endonuclease III / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  41.27 
 
 		 212 aa  148  6e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.134945  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2106  endonuclease III  42.93 
 
 		 213 aa  147  9e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0792284  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>