284 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_03915 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014230  CA2559_03915  histidine ammonia-lyase  100 
 
 
511 aa  1047    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.699156  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1047  Histidine ammonia-lyase  65.31 
 
 
502 aa  684    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1109  histidine ammonia-lyase  70.24 
 
 
506 aa  740    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1853  Histidine ammonia-lyase  55.82 
 
 
512 aa  600  1e-170  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2124  histidine ammonia-lyase  56.49 
 
 
513 aa  578  1.0000000000000001e-163  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1999  Histidine ammonia-lyase  51.79 
 
 
509 aa  550  1e-155  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0239  histidine ammonia-lyase  38.21 
 
 
516 aa  334  3e-90  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0486483  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2170  histidine ammonia-lyase  37.58 
 
 
508 aa  320  3e-86  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2312  histidine ammonia-lyase  35.64 
 
 
505 aa  317  4e-85  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.01107  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0281  histidine ammonia-lyase  35.76 
 
 
508 aa  314  1.9999999999999998e-84  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3760  histidine ammonia-lyase  35.42 
 
 
506 aa  311  2e-83  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00715091  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1556  histidine ammonia-lyase  35.62 
 
 
505 aa  311  2e-83  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000269736  normal  0.0117376 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1265  histidine ammonia-lyase  36.01 
 
 
504 aa  310  5e-83  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3662  histidine ammonia-lyase  35.42 
 
 
505 aa  309  8e-83  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3442  histidine ammonia-lyase  35.23 
 
 
505 aa  308  1.0000000000000001e-82  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0533045  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3712  histidine ammonia-lyase  35.23 
 
 
505 aa  308  1.0000000000000001e-82  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000019442  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3339  histidine ammonia-lyase  35.03 
 
 
505 aa  308  1.0000000000000001e-82  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000343122  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2820  histidine ammonia-lyase  34.24 
 
 
507 aa  306  4.0000000000000004e-82  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3680  histidine ammonia-lyase  35.23 
 
 
505 aa  307  4.0000000000000004e-82  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0108236  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0916  histidine ammonia-lyase  35.14 
 
 
511 aa  306  7e-82  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3685  histidine ammonia-lyase  35.9 
 
 
505 aa  306  7e-82  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000336671  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3354  histidine ammonia-lyase  35.03 
 
 
505 aa  305  1.0000000000000001e-81  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.172835  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3405  histidine ammonia-lyase  35.7 
 
 
505 aa  304  2.0000000000000002e-81  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000956551  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0719  histidine ammonia-lyase  36.04 
 
 
498 aa  303  4.0000000000000003e-81  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.281657  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2092  histidine ammonia-lyase  35.64 
 
 
535 aa  294  2e-78  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00926159 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3574  histidine ammonia-lyase  33.73 
 
 
523 aa  293  5e-78  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.183418  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0008  histidine ammonia-lyase  34.78 
 
 
504 aa  292  8e-78  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0008  histidine ammonia-lyase  34.78 
 
 
504 aa  292  8e-78  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0231  histidine ammonia-lyase  35.33 
 
 
533 aa  292  9e-78  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3256  histidine ammonia-lyase  33.14 
 
 
523 aa  289  1e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.06186 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0588  histidine ammonia-lyase  34.91 
 
 
507 aa  286  5.999999999999999e-76  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1777  histidine ammonia-lyase  35.83 
 
 
505 aa  286  5.999999999999999e-76  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.229891  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1458  histidine ammonia-lyase  31.47 
 
 
515 aa  284  3.0000000000000004e-75  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0209656  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0886  histidine ammonia-lyase  30.29 
 
 
506 aa  281  2e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1739  histidine ammonia-lyase  34 
 
 
540 aa  281  2e-74  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0504276  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0855  histidine ammonia-lyase  30.29 
 
 
506 aa  281  2e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.628758  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0918  histidine ammonia-lyase  30.29 
 
 
506 aa  281  2e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.19052  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0941  histidine ammonia-lyase  30.39 
 
 
506 aa  281  3e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.895576 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0827  histidine ammonia-lyase  30.1 
 
 
506 aa  280  6e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.294508  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3903  histidine ammonia-lyase  33.14 
 
 
520 aa  279  1e-73  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.23664  normal  0.18215 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03126  histidine ammonia-lyase  31.62 
 
 
538 aa  278  2e-73  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.840651  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2378  histidine ammonia-lyase  32.09 
 
 
509 aa  278  2e-73  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.43897  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1747  histidine ammonia-lyase  31.51 
 
 
508 aa  276  5e-73  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000510266  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3005  histidine ammonia-lyase  31.6 
 
 
507 aa  273  4.0000000000000004e-72  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.36207 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5958  histidine ammonia-lyase  30.89 
 
 
512 aa  272  9e-72  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.436548  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1410  histidine ammonia-lyase  33.07 
 
 
516 aa  272  1e-71  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0341381 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1264  histidine ammonia-lyase  31.35 
 
 
506 aa  271  2e-71  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0850  histidine ammonia-lyase  31.69 
 
 
519 aa  270  2.9999999999999997e-71  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.03365 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1637  histidine ammonia-lyase  33.93 
 
 
506 aa  270  4e-71  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.798951 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4629  histidine ammonia-lyase  33.08 
 
 
528 aa  270  5e-71  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3901  histidine ammonia-lyase  30.98 
 
 
511 aa  268  2e-70  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.912183  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4658  histidine ammonia-lyase  32.11 
 
 
511 aa  266  8e-70  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0234611  normal  0.0199218 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4833  histidine ammonia-lyase  30.43 
 
 
515 aa  265  1e-69  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.63081 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1814  histidine ammonia-lyase  33.82 
 
 
508 aa  265  1e-69  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2046  histidine ammonia-lyase  33.82 
 
 
508 aa  265  2e-69  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.034077  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2576  histidine ammonia-lyase  31.49 
 
 
523 aa  263  4e-69  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2116  histidine ammonia-lyase  33.61 
 
 
508 aa  264  4e-69  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00707629  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3385  histidine ammonia-lyase  34 
 
 
518 aa  263  4e-69  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0129  histidine ammonia-lyase  36.11 
 
 
489 aa  263  6e-69  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2331  histidine ammonia-lyase  32.61 
 
 
506 aa  263  6e-69  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.962359 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1160  histidine ammonia-lyase  32.59 
 
 
544 aa  263  6.999999999999999e-69  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.480862  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0366  histidine ammonia-lyase  30.89 
 
 
510 aa  262  8.999999999999999e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.814528 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5482  histidine ammonia-lyase  32.03 
 
 
507 aa  262  8.999999999999999e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.211889  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5275  histidine ammonia-lyase  30.63 
 
 
515 aa  262  1e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1331  histidine ammonia-lyase  32.01 
 
 
506 aa  262  1e-68  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0796  histidine ammonia-lyase  32.74 
 
 
506 aa  261  1e-68  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0432  histidine ammonia-lyase  31.55 
 
 
510 aa  262  1e-68  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.44898  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1038  histidine ammonia-lyase  30.08 
 
 
515 aa  261  3e-68  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.116739  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2730  histidine ammonia-lyase  33.79 
 
 
499 aa  260  4e-68  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5032  histidine ammonia-lyase  31.67 
 
 
510 aa  260  5.0000000000000005e-68  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4906  histidine ammonia-lyase  31.67 
 
 
510 aa  259  7e-68  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.685103  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2646  histidine ammonia-lyase  30.51 
 
 
518 aa  259  9e-68  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0281382  normal  0.523313 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2985  histidine ammonia-lyase  31.08 
 
 
511 aa  259  1e-67  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.981657  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1335  histidine ammonia-lyase  31.61 
 
 
506 aa  258  2e-67  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004070  putative histidine ammonia-lyase protein  35.12 
 
 
517 aa  258  2e-67  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5082  histidine ammonia-lyase  31.67 
 
 
510 aa  258  2e-67  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.150624  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0576  histidine ammonia-lyase  30.34 
 
 
509 aa  258  2e-67  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.00000203792  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003723  histidine ammonia-lyase  30.36 
 
 
511 aa  258  2e-67  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00913143  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0822  histidine ammonia-lyase  31.26 
 
 
511 aa  258  2e-67  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000107913  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1932  histidine ammonia-lyase  32.59 
 
 
520 aa  257  3e-67  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4837  histidine ammonia-lyase  31.29 
 
 
510 aa  257  3e-67  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2880  histidine ammonia-lyase  31.41 
 
 
518 aa  257  3e-67  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1658  histidine ammonia-lyase  32.7 
 
 
526 aa  257  4e-67  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.180825  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1297  histidine ammonia-lyase  30.22 
 
 
511 aa  256  5e-67  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0927091 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4040  histidine ammonia-lyase  33.7 
 
 
524 aa  255  1.0000000000000001e-66  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2474  histidine ammonia-lyase  31.03 
 
 
518 aa  255  1.0000000000000001e-66  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4069  histidine ammonia-lyase  30.3 
 
 
511 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.790613  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1301  histidine ammonia-lyase  31.21 
 
 
514 aa  254  2.0000000000000002e-66  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6451  histidine ammonia-lyase  30.69 
 
 
515 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2097  putative phenylalanine and histidine ammonia-lyase  34.04 
 
 
511 aa  254  2.0000000000000002e-66  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02072  histidine ammonia-lyase  29.96 
 
 
514 aa  254  3e-66  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5927  histidine ammonia-lyase  32.74 
 
 
511 aa  253  4.0000000000000004e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.14133 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1603  histidine ammonia-lyase  33.11 
 
 
507 aa  253  5.000000000000001e-66  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.329412  normal  0.712329 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5061  Histidine ammonia-lyase  33.68 
 
 
715 aa  253  8.000000000000001e-66  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.14793  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2550  histidine ammonia-lyase  29.96 
 
 
513 aa  253  8.000000000000001e-66  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3619  histidine ammonia-lyase  33.92 
 
 
514 aa  252  9.000000000000001e-66  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.30965  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0324  histidine ammonia-lyase  33.76 
 
 
497 aa  252  1e-65  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1820  histidine ammonia-lyase  28.96 
 
 
530 aa  251  1e-65  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.175616  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11158  histidine ammonia-lyase  33.66 
 
 
503 aa  252  1e-65  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.926565  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1022  histidine ammonia-lyase  31.34 
 
 
509 aa  251  1e-65  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>