140 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_C0906 on replicon NC_007953
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007953  Bxe_C0906  hypothetical protein  100 
 
 		 385 aa  797    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.60282  normal  0.197591 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3195  hypothetical protein  65.19 
 
 		 420 aa  526  1e-148  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.304739  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1933  hypothetical protein  64.68 
 
 		 385 aa  526  1e-148  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4831  hypothetical protein  63.64 
 
 		 386 aa  517  1.0000000000000001e-145  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.857401  normal  0.718277 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5486  hypothetical protein  62.34 
 
 		 390 aa  505  9.999999999999999e-143  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.416451  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2389  hypothetical protein  62.86 
 
 		 390 aa  503  1e-141  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0856  hypothetical protein  60.37 
 
 		 386 aa  499  1e-140  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0714  hypothetical protein  58.44 
 
 		 385 aa  453  1.0000000000000001e-126  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3150  hypothetical protein  56.92 
 
 		 386 aa  449  1e-125  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.202569  normal  0.775857 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5609  hypothetical protein  52.51 
 
 		 400 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.675144  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5973  hypothetical protein  52.51 
 
 		 400 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0578676  hitchhiker  0.00100227 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3412  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase-like protein  51.84 
 
 		 381 aa  394  1e-108  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0456561 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3425  hypothetical protein  45.26 
 
 		 387 aa  341  1e-92  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.4734  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2118  protein of unknown function DUF1100 hydrolase family protein  39.59 
 
 		 383 aa  259  7e-68  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0478  protein of unknown function DUF1100, hydrolase family protein  37.34 
 
 		 388 aa  248  9e-65  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1547  hypothetical protein  29.31 
 
 		 384 aa  172  9e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.26317  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1228  hypothetical protein  34.11 
 
 		 403 aa  155  1e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.395886  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1544  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase related protein  28.42 
 
 		 448 aa  126  6e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000180144  normal  0.131474 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4695  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl- peptidase related protein  29.97 
 
 		 406 aa  126  8.000000000000001e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1005  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase related protein  29.58 
 
 		 434 aa  125  2e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2676  hypothetical protein  27.18 
 
 		 401 aa  123  7e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0890  protein of unknown function DUF1100, hydrolase family protein  30.06 
 
 		 357 aa  118  1.9999999999999998e-25  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.712139  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2113  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase related protein  28.07 
 
 		 474 aa  110  3e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1853  hypothetical protein  29.03 
 
 		 417 aa  108  2e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0967  alpha/beta fold family hydrolase  24.93 
 
 		 388 aa  105  1e-21  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0613  protein of unknown function DUF1100, hydrolase family protein  29.38 
 
 		 383 aa  102  1e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2308  hypothetical protein  31.3 
 
 		 399 aa  102  1e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.14665  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1530  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase related protein  27.06 
 
 		 463 aa  100  5e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6210  Acetyl xylan esterase  24.41 
 
 		 402 aa  95.5  1e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4476  protein of unknown function DUF1100, hydrolase family protein  29.79 
 
 		 376 aa  94.7  2e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3159  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl peptidase  26.92 
 
 		 420 aa  93.2  7e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0736  hypothetical protein  26.4 
 
 		 396 aa  88.6  2e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1811  hypothetical protein  30.32 
 
 		 399 aa  88.2  2e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.369907  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4305  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase-like protein  29.18 
 
 		 413 aa  85.5  0.000000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0350755  normal  0.767198 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0716  hypothetical protein  26.4 
 
 		 396 aa  84.7  0.000000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2957  hypothetical protein  27.4 
 
 		 418 aa  83.6  0.000000000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.85194  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25070  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  26.3 
 
 		 406 aa  81.3  0.00000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.351879  normal  1 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5460  protein of unknown function DUF1100 hydrolase family protein  25.25 
 
 		 424 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.528765  normal  0.198358 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4482  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase-like  26.86 
 
 		 358 aa  80.5  0.00000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4716  hypothetical protein  24.11 
 
 		 406 aa  73.9  0.000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5182  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl peptidase  33.91 
 
 		 423 aa  72.8  0.00000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0219  hypothetical protein  24.73 
 
 		 400 aa  67.8  0.0000000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.431687  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1275  alpha/beta fold family hydrolase  21.84 
 
 		 378 aa  67.8  0.0000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2193  hypothetical protein  22.19 
 
 		 402 aa  67  0.0000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2165  hypothetical protein  22.19 
 
 		 402 aa  66.2  0.0000000009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2344  alpha/beta fold family hydrolase  22.85 
 
 		 374 aa  63.9  0.000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.946949  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1554  alpha/beta hydrolase fold  28.87 
 
 		 359 aa  60.8  0.00000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1866  fermentation/respiration switch protein  29.71 
 
 		 415 aa  60.5  0.00000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000738572  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0601  dienelactone hydrolase  26.96 
 
 		 259 aa  59.3  0.0000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0886  alpha/beta fold family hydrolase  21.71 
 
 		 373 aa  59.3  0.0000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3405  alpha/beta hydrolase fold  28.32 
 
 		 357 aa  56.6  0.0000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4700  hypothetical protein  24.22 
 
 		 377 aa  54.3  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.14251  normal  0.0502097 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0644  alpha/beta hydrolase fold-containing protein  27.93 
 
 		 364 aa  53.1  0.000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.283453 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1578  dienelactone hydrolase  24.42 
 
 		 255 aa  52.8  0.000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2790  peptidase S15  30.39 
 
 		 297 aa  52.8  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.23186 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3940  hypothetical protein  30 
 
 		 418 aa  52  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.0000344769  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4244  peptidase S15  30.25 
 
 		 256 aa  51.2  0.00003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.100247  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3188  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  28.74 
 
 		 612 aa  50.4  0.00004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1427  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  28.99 
 
 		 682 aa  50.4  0.00005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6187  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  26.13 
 
 		 656 aa  49.7  0.00008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.317055 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0751  Dipeptidylaminopeptidase/acylaminoacyl- peptidase -like protein  27.71 
 
 		 720 aa  49.7  0.00009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00616106  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0498  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  33.85 
 
 		 575 aa  49.3  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0154886  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0267  hypothetical protein  26.72 
 
 		 318 aa  49.3  0.0001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.586637  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004270  hypothetical protein  27.71 
 
 		 415 aa  48.5  0.0002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.291288  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2888  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  28.9 
 
 		 678 aa  48.5  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0760896  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1497  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  26.26 
 
 		 682 aa  48.5  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1533  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  26.26 
 
 		 682 aa  48.5  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5100  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  27.73 
 
 		 635 aa  48.5  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0976  fermentation/respiration switch protein  26.7 
 
 		 413 aa  48.9  0.0002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0209  putative prolyl oligopeptidase family protein  27.27 
 
 		 652 aa  48.5  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2848  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  26.26 
 
 		 682 aa  48.5  0.0002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000237688 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2658  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  28.23 
 
 		 642 aa  48.9  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.55127  normal  0.367777 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0191  prolyl oligopeptidase family protein, putative  28.17 
 
 		 652 aa  48.1  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3931  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  24.63 
 
 		 695 aa  48.1  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0988778 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2704  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  25.4 
 
 		 660 aa  47.8  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00329778  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2774  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  26.24 
 
 		 677 aa  47.4  0.0004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4828  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  25.61 
 
 		 607 aa  47.4  0.0004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09171  conidial pigment biosynthesis protein Ayg1 (AFU_orthologue; AFUA_2G17550)  33.33 
 
 		 300 aa  47.4  0.0005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1119  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  28.9 
 
 		 688 aa  47.4  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.734549  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2038  peptidase S15  29.77 
 
 		 306 aa  47.4  0.0005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.907978  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0497  BAAT/Acyl-CoA thioester hydrolase  27.92 
 
 		 326 aa  47.4  0.0005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.702531  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2478  hypothetical protein  37.21 
 
 		 442 aa  47  0.0006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.991617 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0143  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  26.47 
 
 		 645 aa  47  0.0006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1503  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  25.76 
 
 		 682 aa  47  0.0006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0003  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  25.32 
 
 		 665 aa  47  0.0006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1595  hypothetical protein  21.83 
 
 		 260 aa  47  0.0006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.010794  unclonable  1.4999500000000002e-23 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3530  Dipeptidylaminopeptidase/acylaminoacyl- peptidase -like protein  26.98 
 
 		 649 aa  47  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00138387  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0248  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  22.22 
 
 		 631 aa  46.6  0.0006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2168  hypothetical protein  22.98 
 
 		 498 aa  46.6  0.0007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.79256  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35650  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl peptidase  28.57 
 
 		 697 aa  46.6  0.0007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0160  prolyl oligopeptidase family protein  26.62 
 
 		 655 aa  46.2  0.0009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1156  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  24.75 
 
 		 643 aa  46.2  0.0009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1006  protein of unknown function DUF1100, hydrolase family protein  24.41 
 
 		 438 aa  46.2  0.0009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.342716 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1970  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  25 
 
 		 652 aa  46.2  0.0009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0646557  normal  0.172612 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0167  prolyl oligopeptidase family protein  25.97 
 
 		 655 aa  45.8  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0165  prolyl oligopeptidase family protein  25.97 
 
 		 654 aa  45.8  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2955  fermentation/respiration switch protein  28.24 
 
 		 419 aa  45.8  0.001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.283852  normal  0.148271 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0400  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  27.64 
 
 		 607 aa  45.8  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2014  conserved hypothetical signal peptide protein  28.48 
 
 		 345 aa  45.8  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.354348  normal  0.746698 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0187  putative prolyl oligopeptidase family protein  25.97 
 
 		 654 aa  45.8  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>