173 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_C0076 on replicon NC_007953
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007953  Bxe_C0076  putative phosphatidylserine decarboxylase  100 
 
 		 416 aa  862    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.946324  hitchhiker  0.00170285 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5255  phosphatidylserine decarboxylase-related  70.65 
 
 		 416 aa  615  1e-175  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0410798 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1997  putative phosphatidylserine decarboxylase  67.68 
 
 		 433 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1018  putative phosphatidylserine decarboxylase  67.68 
 
 		 433 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1306  putative phosphatidylserine decarboxylase  67.68 
 
 		 433 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3176  putative phosphatidylserine decarboxylase  66.58 
 
 		 430 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2283  putative phosphatidylserine decarboxylase  67.68 
 
 		 433 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.808737  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3048  putative phosphatidylserine decarboxylase  67.27 
 
 		 433 aa  552  1e-156  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.65507  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1394  phosphatidylserine decarboxylase precursor  67.01 
 
 		 433 aa  550  1e-155  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.319599  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6081  phosphatidylserine decarboxylase-related  63.94 
 
 		 416 aa  543  1e-153  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.134121 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1338  phosphatidylserine decarboxylase-related  63.94 
 
 		 437 aa  541  1e-153  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.305133  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6491  phosphatidylserine decarboxylase-related  64.18 
 
 		 437 aa  543  1e-153  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00510821  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5602  phosphatidylserine decarboxylase-related  64.37 
 
 		 415 aa  531  1e-150  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.549592 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6332  phosphatidylserine decarboxylase-related  63.88 
 
 		 415 aa  526  1e-148  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0687307 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5484  phosphatidylserine decarboxylase-related  62.65 
 
 		 413 aa  523  1e-147  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000459221 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1269  phosphatidylserine decarboxylase-related  43.75 
 
 		 436 aa  345  1e-93  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.00492454  normal  0.0230075 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_11161  phosphatidylserine decarboxylase family protein (AFU_orthologue; AFUA_7G01730)  38.1 
 
 		 446 aa  289  8e-77  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4108  phosphatidylserine decarboxylase-related  36.14 
 
 		 456 aa  272  6e-72  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0750226  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4860  phosphatidylserine decarboxylase-related protein  37.86 
 
 		 430 aa  264  2e-69  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0399088 
 
 
-
 
NC_006670  CNA08120  Phosphatidylserine decarboxylase, putative  40.17 
 
 		 436 aa  257  3e-67  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.109519  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0966  phosphatidylserine decarboxylase-related  31.42 
 
 		 474 aa  226  8e-58  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0979  phosphatidylserine decarboxylase-related  31.65 
 
 		 474 aa  223  3e-57  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.81581  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3578  phosphatidylserine decarboxylase-related protein  31.22 
 
 		 417 aa  175  1.9999999999999998e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.142154  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1617  hypothetical protein  58.91 
 
 		 159 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20791  hypothetical protein  30.45 
 
 		 397 aa  101  2e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ02200  phosphatidylserine decarboxylase, putative  29.27 
 
 		 1264 aa  100  4e-20  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03188  phosphatidylserine decarboxylase Psd2, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G13970)  28.36 
 
 		 1053 aa  99.8  8e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.927453 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_40695  phosphatidylserine decarboxylase  31.42 
 
 		 1064 aa  98.2  2e-19  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.350595  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0072  phosphatidylserine decarboxylase  33.18 
 
 		 301 aa  95.5  1e-18  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07385  conserved hypothetical protein  29.91 
 
 		 406 aa  92.8  9e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006686  CND04930  conserved hypothetical protein  30.39 
 
 		 409 aa  88.6  2e-16  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0033  phosphatidylserine decarboxylase  31 
 
 		 294 aa  87.4  5e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.484885  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07989  phosphatidylserine decarboxylase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G16930)  29.18 
 
 		 347 aa  86.7  7e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.167037  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3539  phosphatidylserine decarboxylase  25.62 
 
 		 298 aa  84.7  0.000000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.100756  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2462  phosphatidylserine decarboxylase  29.35 
 
 		 259 aa  84.7  0.000000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0788063  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0033  phosphatidylserine decarboxylase  26.18 
 
 		 294 aa  84  0.000000000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1772  phosphatidylserine decarboxylase-related protein  30.84 
 
 		 392 aa  81.6  0.00000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.839794  normal  0.123461 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0989  phosphatidylserine decarboxylase  30.53 
 
 		 264 aa  82  0.00000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4189  phosphatidylserine decarboxylase  28.75 
 
 		 262 aa  82  0.00000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2613  phosphatidylserine decarboxylase  26.56 
 
 		 300 aa  80.5  0.00000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4419  phosphatidylserine decarboxylase  29.17 
 
 		 254 aa  77.4  0.0000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4235  phosphatidylserine decarboxylase  29.17 
 
 		 262 aa  77.4  0.0000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4083  phosphatidylserine decarboxylase  29.17 
 
 		 262 aa  77  0.0000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4471  phosphatidylserine decarboxylase  29.17 
 
 		 262 aa  77  0.0000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.584125  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4360  phosphatidylserine decarboxylase  29.17 
 
 		 262 aa  77  0.0000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4565  phosphatidylserine decarboxylase  29.17 
 
 		 262 aa  77.4  0.0000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0779  phosphatidylserine decarboxylase  29.58 
 
 		 262 aa  77  0.0000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.121288  hitchhiker  0.00256748 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4073  phosphatidylserine decarboxylase  29.82 
 
 		 262 aa  76.3  0.0000000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.293375  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4458  phosphatidylserine decarboxylase  29.17 
 
 		 262 aa  76.3  0.0000000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.183359  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1976  phosphatidylserine decarboxylase  26.38 
 
 		 306 aa  75.9  0.000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.129589 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3483  phosphatidylserine decarboxylase  30.8 
 
 		 286 aa  73.6  0.000000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.645642  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3064  phosphatidylserine decarboxylase  27.39 
 
 		 261 aa  73.6  0.000000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0588  phosphatidylserine decarboxylase  27.9 
 
 		 292 aa  72  0.00000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0111413 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3289  phosphatidylserine decarboxylase  28.51 
 
 		 289 aa  71.6  0.00000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3441  phosphatidylserine decarboxylase  27.9 
 
 		 292 aa  71.2  0.00000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2679  phosphatidylserine decarboxylase  27.34 
 
 		 286 aa  70.5  0.00000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00549  phosphatidylserine decarboxylase  26.24 
 
 		 325 aa  70.5  0.00000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0589  phosphatidylserine decarboxylase  27.54 
 
 		 292 aa  69.7  0.0000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00103153 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3549  phosphatidylserine decarboxylase  28.75 
 
 		 287 aa  69.3  0.0000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0557  phosphatidylserine decarboxylase  26.97 
 
 		 286 aa  68.2  0.0000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.122246 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0549  phosphatidylserine decarboxylase  27.71 
 
 		 292 aa  67  0.0000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0096877  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3902  phosphatidylserine decarboxylase  27.71 
 
 		 292 aa  67.4  0.0000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.355127  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3719  phosphatidylserine decarboxylase  27.71 
 
 		 292 aa  67  0.0000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3776  phosphatidylserine decarboxylase  27.71 
 
 		 292 aa  67.4  0.0000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4961  phosphatidylserine decarboxylase  27.02 
 
 		 287 aa  67  0.0000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.989114  normal  0.392503 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1551  phosphatidylserine decarboxylase-related  24 
 
 		 368 aa  66.6  0.0000000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0183935  normal  0.0668406 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2955  phosphatidylserine decarboxylase  28.27 
 
 		 294 aa  66.2  0.0000000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.223762  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4908  phosphatidylserine decarboxylase  26.61 
 
 		 287 aa  65.9  0.000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07440  phosphatidylserine decarboxylase  27.75 
 
 		 286 aa  65.5  0.000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3034  phosphatidylserine decarboxylase  26.91 
 
 		 287 aa  65.5  0.000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.749088  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4784  phosphatidylserine decarboxylase  26.61 
 
 		 287 aa  65.5  0.000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2095  phosphatidylserine decarboxylase  27.78 
 
 		 303 aa  65.1  0.000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1409  phosphatidylserine decarboxylase  28.69 
 
 		 288 aa  63.9  0.000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.360233  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0788  phosphatidylserine decarboxylase  26.29 
 
 		 287 aa  63.9  0.000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.234745  hitchhiker  0.000512313 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4180  phosphatidylserine decarboxylase  25.5 
 
 		 287 aa  63.5  0.000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2643  phosphatidylserine decarboxylase  25.96 
 
 		 286 aa  63.2  0.000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.270157  hitchhiker  0.000349127 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65500  phosphatidylserine decarboxylase  28.07 
 
 		 289 aa  62  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0621  phosphatidylserine decarboxylase  27.02 
 
 		 286 aa  62  0.00000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1652  phosphatidylserine decarboxylase-related  25.91 
 
 		 298 aa  61.6  0.00000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.967613  normal  0.178004 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3319  phosphatidylserine decarboxylase  25.44 
 
 		 288 aa  61.6  0.00000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00181452  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4700  phosphatidylserine decarboxylase  26.91 
 
 		 287 aa  61.2  0.00000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.551192  normal  0.933822 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1961  phosphatidylserine decarboxylase-related  27.62 
 
 		 288 aa  60.8  0.00000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.23874  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5686  phosphatidylserine decarboxylase  28.07 
 
 		 289 aa  60.5  0.00000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4955  rhodanese domain protein/phosphatidylserine decarboxylase  26.02 
 
 		 613 aa  60.1  0.00000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0559  bifunctional thiosulfate sulfurtransferase/phosphatidylserine decarboxylase  26.02 
 
 		 610 aa  59.3  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1846  phosphatidylserine decarboxylase  25.58 
 
 		 284 aa  59.3  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.028301 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3214  phosphatidylserine decarboxylase  25.66 
 
 		 289 aa  59.3  0.0000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0842821  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3747  phosphatidylserine decarboxylase  27.78 
 
 		 296 aa  58.5  0.0000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2692  phosphatidylserine decarboxylase-related  26.84 
 
 		 334 aa  58.5  0.0000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1332  phosphatidylserine decarboxylase  24.35 
 
 		 259 aa  58.9  0.0000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0598  phosphatidylserine decarboxylase  24.88 
 
 		 303 aa  58.2  0.0000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0026541  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2529  phosphatidylserine decarboxylase  31.02 
 
 		 280 aa  58.2  0.0000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.159773  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0509  phosphatidylserine decarboxylase  25.81 
 
 		 286 aa  57.4  0.0000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0592417  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2218  phosphatidylserine decarboxylase  27.88 
 
 		 277 aa  57  0.0000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.127421  normal  0.151921 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0681  phosphatidylserine decarboxylase  27.93 
 
 		 289 aa  56.6  0.0000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4870  phosphatidylserine decarboxylase  25.65 
 
 		 284 aa  57  0.0000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.900073 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2036  phosphatidylserine decarboxylase  27.5 
 
 		 283 aa  55.8  0.000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1668  phosphatidylserine decarboxylase  27.39 
 
 		 293 aa  55.8  0.000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.284597  normal  0.919849 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0474  phosphatidylserine decarboxylase  27.52 
 
 		 304 aa  55.8  0.000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2741  phosphatidylserine decarboxylase  26.18 
 
 		 285 aa  56.2  0.000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000722964  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>