285 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B1825 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010623  Bphy_5104  phenylalanine/histidine ammonia-lyase  85.49 
 
 
534 aa  834    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.135455  normal  0.0115263 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1825  histidine ammonia-lyase  100 
 
 
549 aa  1086    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.26483 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5747  phenylalanine/histidine ammonia-lyase  76.26 
 
 
497 aa  721    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5836  phenylalanine/histidine ammonia-lyase  77.41 
 
 
497 aa  717    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6111  phenylalanine/histidine ammonia-lyase  76.26 
 
 
497 aa  721    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5619  phenylalanine/histidine ammonia-lyase  76.46 
 
 
497 aa  731    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.75216  normal  0.2633 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4838  phenylalanine/histidine ammonia-lyase  94.54 
 
 
549 aa  942    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.132188 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6593  phenylalanine/histidine ammonia-lyase  76.46 
 
 
497 aa  724    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.783722  normal  0.178286 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6911  phenylalanine/histidine ammonia-lyase  59.26 
 
 
495 aa  550  1e-155  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5918  phenylalanine/histidine ammonia-lyase  58.2 
 
 
497 aa  547  1e-154  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.18522 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2586  histidine ammonia-lyase  61.19 
 
 
504 aa  540  9.999999999999999e-153  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.206795  normal  0.158772 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0506  histidine ammonia-lyase  56.58 
 
 
495 aa  513  1e-144  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5274  histidine ammonia-lyase  51.42 
 
 
513 aa  468  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1260  histidine ammonia-lyase  51.82 
 
 
523 aa  465  9.999999999999999e-131  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4832  histidine ammonia-lyase  51.55 
 
 
513 aa  459  9.999999999999999e-129  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5827  putative histidine/phenylalanine ammonia-lyase  51.92 
 
 
510 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2648  histidine ammonia-lyase  52.23 
 
 
500 aa  451  1e-125  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.186623  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0365  histidine ammonia-lyase  51.02 
 
 
507 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.851279 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67260  putative histidine/phenylalanine ammonia-lyase  51.32 
 
 
510 aa  435  1e-121  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0799  histidine ammonia-lyase  49.8 
 
 
507 aa  428  1e-118  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.873754 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2820  histidine ammonia-lyase  40.83 
 
 
507 aa  348  1e-94  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0588  histidine ammonia-lyase  41.08 
 
 
507 aa  340  2.9999999999999998e-92  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2170  histidine ammonia-lyase  40.04 
 
 
508 aa  334  3e-90  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2378  histidine ammonia-lyase  43.13 
 
 
509 aa  333  5e-90  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.43897  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0239  histidine ammonia-lyase  39.82 
 
 
516 aa  327  3e-88  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0486483  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1637  histidine ammonia-lyase  43.86 
 
 
506 aa  318  1e-85  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.798951 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0576  histidine ammonia-lyase  46.33 
 
 
509 aa  311  2.9999999999999997e-83  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.00000203792  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0916  histidine ammonia-lyase  41.27 
 
 
511 aa  310  4e-83  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0719  histidine ammonia-lyase  41.42 
 
 
498 aa  309  8e-83  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.281657  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2730  histidine ammonia-lyase  43.4 
 
 
499 aa  303  7.000000000000001e-81  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2312  histidine ammonia-lyase  38.65 
 
 
505 aa  301  2e-80  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.01107  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0281  histidine ammonia-lyase  38.91 
 
 
508 aa  300  3e-80  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2116  histidine ammonia-lyase  43.49 
 
 
508 aa  297  3e-79  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00707629  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2046  histidine ammonia-lyase  43.86 
 
 
508 aa  295  2e-78  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.034077  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1814  histidine ammonia-lyase  43.13 
 
 
508 aa  294  2e-78  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3339  histidine ammonia-lyase  37.98 
 
 
505 aa  295  2e-78  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000343122  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3903  histidine ammonia-lyase  41.47 
 
 
520 aa  294  3e-78  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.23664  normal  0.18215 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1043  histidine ammonia-lyase  41.1 
 
 
514 aa  292  1e-77  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.693412  normal  0.100833 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0008  histidine ammonia-lyase  36.34 
 
 
504 aa  292  1e-77  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0008  histidine ammonia-lyase  36.34 
 
 
504 aa  292  1e-77  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3405  histidine ammonia-lyase  37.45 
 
 
505 aa  291  2e-77  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000956551  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3685  histidine ammonia-lyase  37.45 
 
 
505 aa  291  2e-77  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000336671  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3662  histidine ammonia-lyase  37.42 
 
 
505 aa  290  3e-77  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2331  histidine ammonia-lyase  41.85 
 
 
506 aa  291  3e-77  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.962359 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3760  histidine ammonia-lyase  37.34 
 
 
506 aa  290  4e-77  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00715091  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1556  histidine ammonia-lyase  37.63 
 
 
505 aa  290  4e-77  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000269736  normal  0.0117376 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3094  histidine ammonia-lyase  40.64 
 
 
513 aa  290  5.0000000000000004e-77  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3680  histidine ammonia-lyase  37.34 
 
 
505 aa  290  5.0000000000000004e-77  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0108236  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3442  histidine ammonia-lyase  37.2 
 
 
505 aa  290  5.0000000000000004e-77  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0533045  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1658  histidine ammonia-lyase  39.92 
 
 
526 aa  290  5.0000000000000004e-77  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.180825  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3712  histidine ammonia-lyase  37.2 
 
 
505 aa  290  5.0000000000000004e-77  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000019442  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3354  histidine ammonia-lyase  37.34 
 
 
505 aa  289  7e-77  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.172835  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2100  histidine ammonia-lyase  41.87 
 
 
514 aa  289  9e-77  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0193312  normal  0.149962 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3837  histidine ammonia-lyase  40.61 
 
 
536 aa  288  2.9999999999999996e-76  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.783362  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0908  histidine ammonia-lyase  40.75 
 
 
497 aa  285  2.0000000000000002e-75  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5482  histidine ammonia-lyase  38.8 
 
 
507 aa  283  5.000000000000001e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.211889  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1265  histidine ammonia-lyase  40.3 
 
 
504 aa  283  5.000000000000001e-75  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6152  Histidine ammonia-lyase  41.06 
 
 
515 aa  282  1e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00526934 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2576  histidine ammonia-lyase  35.86 
 
 
523 aa  281  3e-74  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1410  histidine ammonia-lyase  41.53 
 
 
516 aa  278  2e-73  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0341381 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3619  histidine ammonia-lyase  41.45 
 
 
514 aa  277  3e-73  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.30965  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1458  histidine ammonia-lyase  40.12 
 
 
515 aa  278  3e-73  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0209656  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1264  histidine ammonia-lyase  37.97 
 
 
506 aa  276  5e-73  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3001  histidine ammonia-lyase  39.88 
 
 
534 aa  276  9e-73  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.463238  normal  0.112166 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1814  histidine ammonia-lyase  39.58 
 
 
507 aa  275  2.0000000000000002e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.74245  normal  0.102325 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4837  histidine ammonia-lyase  37.93 
 
 
510 aa  275  2.0000000000000002e-72  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2646  histidine ammonia-lyase  40.17 
 
 
518 aa  273  5.000000000000001e-72  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0281382  normal  0.523313 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0103  histidine ammonia-lyase  37.89 
 
 
513 aa  273  5.000000000000001e-72  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4251  histidine ammonia-lyase  37.89 
 
 
513 aa  273  6e-72  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1747  histidine ammonia-lyase  41.07 
 
 
508 aa  273  7e-72  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000510266  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1098  histidine ammonia-lyase  38.92 
 
 
506 aa  273  7e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.489486  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0822  histidine ammonia-lyase  38.46 
 
 
511 aa  273  8.000000000000001e-72  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000107913  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0103  histidine ammonia-lyase  37.53 
 
 
513 aa  272  9e-72  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4446  histidine ammonia-lyase  37.09 
 
 
510 aa  272  9e-72  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0886  histidine ammonia-lyase  38.41 
 
 
506 aa  272  1e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0855  histidine ammonia-lyase  38.41 
 
 
506 aa  272  1e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.628758  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0918  histidine ammonia-lyase  38.41 
 
 
506 aa  272  1e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.19052  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0080  histidine ammonia-lyase  38 
 
 
513 aa  272  1e-71  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1603  histidine ammonia-lyase  37.27 
 
 
507 aa  271  1e-71  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.329412  normal  0.712329 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0941  histidine ammonia-lyase  38.41 
 
 
506 aa  272  1e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.895576 
 
 
-
 
NC_002950  PG0324  histidine ammonia-lyase  35.65 
 
 
497 aa  271  2e-71  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2088  histidine ammonia-lyase  39.18 
 
 
507 aa  271  2e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.358963  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2189  histidine ammonia-lyase  39.18 
 
 
507 aa  271  2e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0881955  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0098  histidine ammonia-lyase  37.68 
 
 
513 aa  271  2.9999999999999997e-71  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4040  histidine ammonia-lyase  38.9 
 
 
524 aa  270  4e-71  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0084  histidine ammonia-lyase  38.4 
 
 
510 aa  270  4e-71  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1297  histidine ammonia-lyase  37.99 
 
 
511 aa  270  4e-71  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0927091 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4833  histidine ammonia-lyase  37.53 
 
 
515 aa  270  5e-71  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.63081 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0827  histidine ammonia-lyase  38.2 
 
 
506 aa  268  1e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.294508  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2642  histidine ammonia-lyase  40.33 
 
 
518 aa  268  2e-70  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.459699  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4168  histidine ammonia-lyase  37.01 
 
 
510 aa  268  2e-70  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2880  histidine ammonia-lyase  39.58 
 
 
518 aa  268  2e-70  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2550  histidine ammonia-lyase  39.29 
 
 
513 aa  268  2.9999999999999995e-70  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0100  histidine ammonia-lyase  37.34 
 
 
513 aa  267  2.9999999999999995e-70  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0095  histidine ammonia-lyase  37.34 
 
 
513 aa  267  2.9999999999999995e-70  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0101  histidine ammonia-lyase  37.34 
 
 
513 aa  267  2.9999999999999995e-70  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0058  histidine ammonia-lyase  38.64 
 
 
511 aa  267  4e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2211  histidine ammonia-lyase  38.97 
 
 
507 aa  267  4e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5831  histidine ammonia-lyase  40.21 
 
 
524 aa  267  4e-70  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0432  histidine ammonia-lyase  37.5 
 
 
510 aa  266  5.999999999999999e-70  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.44898  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>