147 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B0929 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011083  SeHA_C0104  DNA polymerase II  68.11 
 
 		 783 aa  1104    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1903  DNA polymerase II  71.55 
 
 		 786 aa  1151    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.856945 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00062  DNA polymerase II  69.25 
 
 		 783 aa  1127    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3539  DNA-directed DNA polymerase  69 
 
 		 783 aa  1124    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0570  DNA polymerase II  68.47 
 
 		 790 aa  1109    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0062  DNA polymerase II  68.87 
 
 		 783 aa  1122    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0283986  normal  0.967142 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4655  DNA polymerase II  95.7 
 
 		 791 aa  1572    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.230041  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2393  DNA polymerase II  70.54 
 
 		 786 aa  1140    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2273  DNA polymerase II  42.61 
 
 		 818 aa  659    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2621  DNA polymerase II  74.02 
 
 		 787 aa  1216    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00407821  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3658  DNA polymerase II  82.37 
 
 		 792 aa  1361    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0583295  normal  0.426144 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3628  DNA polymerase II  72.47 
 
 		 788 aa  1145    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2361  DNA polymerase II  73.64 
 
 		 787 aa  1212    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.168731  normal  0.46504 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4584  DNA polymerase II  73.86 
 
 		 788 aa  1203    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.657494  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3734  DNA polymerase II  73.83 
 
 		 787 aa  1221    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3002  DNA polymerase II  74.72 
 
 		 793 aa  1236    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.789945  normal  0.339701 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0103  DNA polymerase II  67.98 
 
 		 783 aa  1100    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.249231 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0109  DNA polymerase II  67.85 
 
 		 783 aa  1100    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.455197  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0065  DNA polymerase II  69 
 
 		 783 aa  1123    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4331  DNA polymerase II  75.6 
 
 		 794 aa  1253    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.333031 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1511  DNA polymerase II  46.89 
 
 		 794 aa  699    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000196312 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0929  DNA polymerase II  100 
 
 		 816 aa  1678    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.193818  normal  0.499363 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1645  DNA polymerase II  73.89 
 
 		 789 aa  1194    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0528782  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5012  DNA polymerase II  75.72 
 
 		 794 aa  1251    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3630  DNA polymerase II  47.58 
 
 		 786 aa  726    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5084  DNA polymerase II  74.46 
 
 		 788 aa  1238    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40120  DNA polymerase II  75.29 
 
 		 787 aa  1201    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5848  DNA polymerase II  75.72 
 
 		 794 aa  1251    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.595461  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0052  DNA polymerase II  68.87 
 
 		 783 aa  1122    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1857  DNA polymerase II  47.34 
 
 		 809 aa  743    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.885669  normal  0.10624 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01452  DNA polymerase II  42.59 
 
 		 790 aa  640    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6015  DNA polymerase II  56.68 
 
 		 795 aa  912    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0102  DNA polymerase II  68.11 
 
 		 783 aa  1103    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0607  DNA polymerase II  67.29 
 
 		 820 aa  1092    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.427603  normal  0.519282 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1514  DNA polymerase II  43.57 
 
 		 797 aa  635    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000185404  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3572  DNA polymerase II  72.84 
 
 		 786 aa  1152    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.252391 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3597  DNA polymerase II  69 
 
 		 783 aa  1124    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000326268 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003097  DNA polymerase II  50.57 
 
 		 787 aa  805    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000122511  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0831  DNA polymerase II  50.63 
 
 		 787 aa  790    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0134615  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0609  DNA polymerase II  69.53 
 
 		 790 aa  1117    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.231029  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3302  DNA polymerase II  70.29 
 
 		 786 aa  1138    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0835238 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3819  DNA polymerase II  71.34 
 
 		 788 aa  1145    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3400  DNA polymerase II  75.47 
 
 		 788 aa  1210    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3418  DNA polymerase II  74.65 
 
 		 789 aa  1211    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3234  DNA polymerase II  74.34 
 
 		 788 aa  1232    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.642975 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02749  DNA polymerase II  49.63 
 
 		 816 aa  798    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0064  DNA polymerase II  69 
 
 		 783 aa  1123    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.406876  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0062  DNA polymerase II  69 
 
 		 783 aa  1124    Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00931565  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0731  DNA polymerase II  76.78 
 
 		 787 aa  1238    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.13833  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2655  DNA polymerase II  43.23 
 
 		 799 aa  642    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.697172  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00061  hypothetical protein  69.25 
 
 		 783 aa  1127    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2142  DNA polymerase II  49.18 
 
 		 789 aa  785    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.249301  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5258  DNA polymerase II  74.24 
 
 		 791 aa  1223    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.946105  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2947  DNA polymerase II  74.65 
 
 		 789 aa  1212    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.670904 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1999  DNA polymerase II  71.23 
 
 		 786 aa  1147    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.449398  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3546  DNA polymerase II  74.65 
 
 		 789 aa  1212    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2469  DNA polymerase II  44.08 
 
 		 810 aa  634  1e-180  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00196726  hitchhiker  0.000569309 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2482  DNA polymerase II  43.63 
 
 		 795 aa  629  1e-179  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.205655  hitchhiker  0.00219855 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1820  DNA polymerase II  43.19 
 
 		 808 aa  628  1e-178  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2537  DNA polymerase II  44.08 
 
 		 810 aa  627  1e-178  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.132688  unclonable  0.0000408112 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2629  DNA polymerase II  43.64 
 
 		 810 aa  624  1e-177  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0639534  hitchhiker  0.0000529366 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1250  DNA polymerase II  45.33 
 
 		 801 aa  623  1e-177  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0167112  hitchhiker  0.000178487 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3085  DNA polymerase II  42.05 
 
 		 807 aa  623  1e-177  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000404512  hitchhiker  0.0000370941 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1567  DNA polymerase II  42.19 
 
 		 793 aa  618  1e-175  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000253112  hitchhiker  0.0000162261 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1630  DNA polymerase II  42.82 
 
 		 809 aa  605  9.999999999999999e-173  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00018706  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2724  DNA polymerase II  43.16 
 
 		 809 aa  608  9.999999999999999e-173  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000453184  hitchhiker  0.0000581945 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1653  DNA polymerase II  42.91 
 
 		 809 aa  608  9.999999999999999e-173  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.112928  normal  0.0896662 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1619  DNA polymerase II  42.79 
 
 		 809 aa  603  1.0000000000000001e-171  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000233393  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2629  DNA polymerase II  41.91 
 
 		 792 aa  598  1e-169  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.085046  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2428  DNA polymerase II  40.15 
 
 		 821 aa  585  1e-166  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.124227  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2210  DNA polymerase II  40.1 
 
 		 782 aa  546  1e-154  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.40989 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4180  DNA polymerase II  61.63 
 
 		 270 aa  344  5e-93  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.461299  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1049  DNA polymerase II  29.22 
 
 		 783 aa  203  9.999999999999999e-51  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0144376 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1320  DNA polymerase II  28.31 
 
 		 784 aa  194  4e-48  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.4978 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0961  DNA polymerase II  27.49 
 
 		 785 aa  192  2e-47  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1884  DNA polymerase II  27.86 
 
 		 786 aa  191  2.9999999999999997e-47  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.115615  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0616  hypothetical protein  28.89 
 
 		 796 aa  180  1e-43  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0393  DNA polymerase II  27.55 
 
 		 794 aa  178  5e-43  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1740  DNA polymerase B region  29.28 
 
 		 795 aa  175  2.9999999999999996e-42  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.883106  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0798  DNA polymerase B region  28.14 
 
 		 812 aa  172  3e-41  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.189737  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1108  DNA polymerase B region  27.88 
 
 		 821 aa  171  7e-41  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.42537  normal  0.497226 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1316  DNA-directed DNA polymerase  26.64 
 
 		 784 aa  167  5.9999999999999996e-40  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.198282  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1342  DNA polymerase Pol2  26.69 
 
 		 781 aa  165  4.0000000000000004e-39  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  unclonable  0.0000000227387  normal  0.522725 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1156  DNA polymerase B region  28.16 
 
 		 818 aa  161  4e-38  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.809491  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4181  DNA polymerase II  48.31 
 
 		 211 aa  161  5e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.554718  normal  0.912153 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0177  DNA polymerase B region  27.26 
 
 		 929 aa  160  1e-37  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1499  DNA-directed DNA polymerase  26.62 
 
 		 912 aa  156  2e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0375  DNA polymerase B region  28.11 
 
 		 1353 aa  153  1e-35  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2154  DNA polymerase II  25.24 
 
 		 783 aa  151  4e-35  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00000768017  hitchhiker  0.000641936 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1777  replicative DNA polymerase I  25.09 
 
 		 932 aa  150  1.0000000000000001e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.227569  normal  1 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_44713  predicted protein  26.82 
 
 		 982 aa  150  1.0000000000000001e-34  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1397  DNA polymerase Pol2  25.96 
 
 		 941 aa  144  7e-33  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.61356  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK00560  delta DNA polymerase, putative  25.7 
 
 		 1058 aa  142  3e-32  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1258  replicative DNA polymerase I  23.37 
 
 		 780 aa  141  4.999999999999999e-32  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_54677  DNA polymerase delta  25.45 
 
 		 1087 aa  138  5e-31  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0530  DNA polymerase Pol2  22.95 
 
 		 781 aa  137  7.000000000000001e-31  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1378  DNA polymerase Pol2  22.87 
 
 		 780 aa  134  5e-30  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00266736 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_297  predicted protein  23.74 
 
 		 990 aa  132  3e-29  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0400359  normal  0.313206 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10755  catalytic subunit of the DNA polymerase alpha-primase complex (Eurofung)  25.11 
 
 		 1459 aa  131  4.0000000000000003e-29  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07325  catalytic subunit of DNA polymerase delta (Eurofung)  25.49 
 
 		 1044 aa  131  6e-29  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>