72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_4181 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_4181  DNA polymerase II  100 
 
 		 211 aa  426  1e-118  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.554718  normal  0.912153 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6015  DNA polymerase II  89.53 
 
 		 795 aa  313  9.999999999999999e-85  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0609  DNA polymerase II  52.25 
 
 		 790 aa  185  5e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.231029  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40120  DNA polymerase II  54.91 
 
 		 787 aa  181  8.000000000000001e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3400  DNA polymerase II  54.34 
 
 		 788 aa  178  4.999999999999999e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0570  DNA polymerase II  52.05 
 
 		 790 aa  177  9e-44  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3734  DNA polymerase II  52.63 
 
 		 787 aa  174  8e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3572  DNA polymerase II  52.05 
 
 		 786 aa  174  9e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.252391 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3546  DNA polymerase II  46.43 
 
 		 789 aa  172  2.9999999999999996e-42  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2947  DNA polymerase II  46.43 
 
 		 789 aa  172  2.9999999999999996e-42  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.670904 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3418  DNA polymerase II  45.92 
 
 		 789 aa  170  1e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0731  DNA polymerase II  49.71 
 
 		 787 aa  169  3e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.13833  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4584  DNA polymerase II  48.66 
 
 		 788 aa  168  6e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.657494  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5084  DNA polymerase II  51.98 
 
 		 788 aa  168  6e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5258  DNA polymerase II  50.85 
 
 		 791 aa  167  1e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.946105  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3234  DNA polymerase II  51.41 
 
 		 788 aa  167  1e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.642975 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1645  DNA polymerase II  49.12 
 
 		 789 aa  166  2e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0528782  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4655  DNA polymerase II  49.44 
 
 		 791 aa  165  5e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.230041  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5012  DNA polymerase II  50.28 
 
 		 794 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5848  DNA polymerase II  50.28 
 
 		 794 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.595461  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0064  DNA polymerase II  49.41 
 
 		 783 aa  162  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.406876  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3597  DNA polymerase II  49.41 
 
 		 783 aa  162  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000326268 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0052  DNA polymerase II  49.41 
 
 		 783 aa  162  4.0000000000000004e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4331  DNA polymerase II  49.72 
 
 		 794 aa  162  4.0000000000000004e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.333031 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3539  DNA-directed DNA polymerase  49.41 
 
 		 783 aa  162  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0062  DNA polymerase II  49.41 
 
 		 783 aa  162  5.0000000000000005e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00931565  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00061  hypothetical protein  49.41 
 
 		 783 aa  161  5.0000000000000005e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00062  DNA polymerase II  49.41 
 
 		 783 aa  161  5.0000000000000005e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3002  DNA polymerase II  50.28 
 
 		 793 aa  161  6e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.789945  normal  0.339701 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0929  DNA polymerase II  48.31 
 
 		 816 aa  161  7e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.193818  normal  0.499363 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3302  DNA polymerase II  47.37 
 
 		 786 aa  159  2e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0835238 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2393  DNA polymerase II  47.37 
 
 		 786 aa  160  2e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0065  DNA polymerase II  48.82 
 
 		 783 aa  159  2e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1999  DNA polymerase II  47.37 
 
 		 786 aa  159  3e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.449398  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0607  DNA polymerase II  46.78 
 
 		 820 aa  158  5e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.427603  normal  0.519282 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1903  DNA polymerase II  46.2 
 
 		 786 aa  157  8e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.856945 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0102  DNA polymerase II  48.24 
 
 		 783 aa  157  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0109  DNA polymerase II  48.24 
 
 		 783 aa  157  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.455197  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2361  DNA polymerase II  45.61 
 
 		 787 aa  157  2e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.168731  normal  0.46504 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0103  DNA polymerase II  48.24 
 
 		 783 aa  156  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.249231 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2621  DNA polymerase II  46.2 
 
 		 787 aa  155  4e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00407821  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0062  DNA polymerase II  47.06 
 
 		 783 aa  155  5.0000000000000005e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0283986  normal  0.967142 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0104  DNA polymerase II  47.65 
 
 		 783 aa  153  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3628  DNA polymerase II  43.86 
 
 		 788 aa  149  3e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3658  DNA polymerase II  47.43 
 
 		 792 aa  149  3e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0583295  normal  0.426144 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3819  DNA polymerase II  42.69 
 
 		 788 aa  145  3e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3630  DNA polymerase II  36.16 
 
 		 786 aa  99.8  3e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003097  DNA polymerase II  34.5 
 
 		 787 aa  95.1  7e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000122511  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0831  DNA polymerase II  35.63 
 
 		 787 aa  94  1e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0134615  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02749  DNA polymerase II  34.12 
 
 		 816 aa  92.4  5e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2273  DNA polymerase II  35.47 
 
 		 818 aa  91.7  8e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1857  DNA polymerase II  36.26 
 
 		 809 aa  90.9  1e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.885669  normal  0.10624 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1511  DNA polymerase II  33.14 
 
 		 794 aa  86.7  2e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000196312 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1514  DNA polymerase II  34.73 
 
 		 797 aa  81.3  0.00000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000185404  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2142  DNA polymerase II  33.33 
 
 		 789 aa  78.6  0.00000000000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.249301  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1619  DNA polymerase II  34.08 
 
 		 809 aa  78.2  0.00000000000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000233393  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1630  DNA polymerase II  34.08 
 
 		 809 aa  78.2  0.0000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00018706  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2724  DNA polymerase II  34.27 
 
 		 809 aa  77.4  0.0000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000453184  hitchhiker  0.0000581945 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1653  DNA polymerase II  34.08 
 
 		 809 aa  77.8  0.0000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.112928  normal  0.0896662 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2210  DNA polymerase II  33.12 
 
 		 782 aa  76.6  0.0000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.40989 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2537  DNA polymerase II  32 
 
 		 810 aa  76.6  0.0000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.132688  unclonable  0.0000408112 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2469  DNA polymerase II  32 
 
 		 810 aa  75.9  0.0000000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00196726  hitchhiker  0.000569309 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2629  DNA polymerase II  34.09 
 
 		 810 aa  75.5  0.0000000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0639534  hitchhiker  0.0000529366 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01452  DNA polymerase II  28.7 
 
 		 790 aa  73.2  0.000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1820  DNA polymerase II  36.64 
 
 		 808 aa  73.2  0.000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2629  DNA polymerase II  29.61 
 
 		 792 aa  69.7  0.00000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.085046  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1567  DNA polymerase II  30.72 
 
 		 793 aa  67.4  0.0000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000253112  hitchhiker  0.0000162261 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2428  DNA polymerase II  28.85 
 
 		 821 aa  66.6  0.0000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.124227  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1250  DNA polymerase II  33.33 
 
 		 801 aa  65.9  0.0000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0167112  hitchhiker  0.000178487 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3085  DNA polymerase II  29.07 
 
 		 807 aa  65.9  0.0000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000404512  hitchhiker  0.0000370941 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2655  DNA polymerase II  32.54 
 
 		 799 aa  65.5  0.0000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.697172  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2482  DNA polymerase II  31.78 
 
 		 795 aa  63.2  0.000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.205655  hitchhiker  0.00219855 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>