More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B0138 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007952  Bxe_B0138  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 305 aa  624  1e-178  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5625  putative transcriptional regulator  47.77 
 
 		 298 aa  284  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.290257  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64780  putative transcriptional regulator  48.11 
 
 		 298 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.166653  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0307  LysR family transcriptional regulator  42.56 
 
 		 308 aa  256  4e-67  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.291876  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1897  LysR family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 295 aa  237  2e-61  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0520736  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2495  LysR family transcriptional regulator  41.58 
 
 		 306 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.025453  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3526  LysR family transcriptional regulator  41.24 
 
 		 306 aa  212  5.999999999999999e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0893193 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3900  LysR family transcriptional regulator  41.24 
 
 		 305 aa  212  7.999999999999999e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.447965 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5356  LysR family transcriptional regulator  41.24 
 
 		 306 aa  212  7.999999999999999e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.556999 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3620  LysR family transcriptional regulator  40.89 
 
 		 305 aa  210  2e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00938056  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5074  LysR family transcriptional regulator  38.83 
 
 		 306 aa  207  2e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.322448 
 
 
-
 
NC_003296  RS05202  transcription regulator protein  39.86 
 
 		 304 aa  205  7e-52  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.0000103081  normal  0.0105317 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2155  transcriptional regulator, LysR family  39.86 
 
 		 316 aa  205  1e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0328  LysR family transcriptional regulator  39.66 
 
 		 306 aa  204  1e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2106  LysR family transcriptional regulator  39.25 
 
 		 317 aa  204  2e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.544571  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5073  LysR family transcriptional regulator  41.58 
 
 		 306 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.255466 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6114  transcriptional regulator, LysR family  36.33 
 
 		 316 aa  196  3e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.689302  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2311  LysR family transcriptional regulator  35.64 
 
 		 316 aa  193  3e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00615396  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0163  LysR family transcriptional regulator  38.14 
 
 		 432 aa  192  6e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000224126 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4718  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  36.9 
 
 		 300 aa  190  2.9999999999999997e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0979  LysR family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 301 aa  188  8e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00025121 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1092  transcriptional regulatory DNA-binding transcription regulator protein  34.9 
 
 		 300 aa  183  4.0000000000000006e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1003  LysR family transcriptional regulator  36.54 
 
 		 315 aa  182  6e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0969  LysR family transcriptional regulator  38.01 
 
 		 313 aa  182  8.000000000000001e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.233069  normal  0.0392284 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6228  LysR family transcriptional regulator  34.34 
 
 		 345 aa  181  2e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.196745  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6397  LysR family transcriptional regulator  34.34 
 
 		 320 aa  181  2e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6630  LysR family transcriptional regulator  34.34 
 
 		 320 aa  181  2e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.466638  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0257  LysR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 331 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.885703 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2994  LysR family transcriptional regulator  35.76 
 
 		 310 aa  180  2.9999999999999997e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3588  LysR family transcriptional regulator  37.28 
 
 		 301 aa  179  4e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.443778 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0801  LysR family transcriptional regulator  35.12 
 
 		 309 aa  178  1e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4455  LysR family transcriptional regulator  35.93 
 
 		 307 aa  178  1e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.326178 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1550  LysR family transcriptional regulator  34.9 
 
 		 333 aa  178  1e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.135746  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4622  LysR family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 314 aa  177  3e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5350  transcriptional regulator, LysR family  35.37 
 
 		 304 aa  175  9e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.57185  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4311  transcriptional regulator, LysR family  34.9 
 
 		 309 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.386764  normal  0.967846 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4643  LysR family transcriptional regulator  33.56 
 
 		 315 aa  174  1.9999999999999998e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0642  LysR family transcriptional regulator  35.23 
 
 		 309 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.915851  normal  0.108834 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0791  transcriptional regulator, LysR family  33.33 
 
 		 318 aa  174  1.9999999999999998e-42  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6434  LysR family transcriptional regulator  35 
 
 		 321 aa  172  6.999999999999999e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.455845 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2667  LysR family transcriptional regulator  33.11 
 
 		 301 aa  172  6.999999999999999e-42  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2490  LysR family transcriptional regulator  33.45 
 
 		 318 aa  171  2e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.234951  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2081  LysR family transcriptional regulator  33.11 
 
 		 308 aa  170  2e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3713  LysR family transcriptional regulator  33.78 
 
 		 320 aa  171  2e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0764365 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3064  LysR family transcriptional regulator  33.45 
 
 		 308 aa  170  3e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.935651  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01757  transcription regulator transcription regulator protein  33.77 
 
 		 321 aa  169  4e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.354836 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0352  transcriptional regulator, LysR family  33.45 
 
 		 299 aa  169  4e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2997  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 299 aa  169  6e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00848262 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2696  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 310 aa  168  1e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.600213  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0044  LysR family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 307 aa  168  1e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5507  transcriptional regulator, LysR family  33.45 
 
 		 301 aa  167  2e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.242052  normal  0.462948 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3259  LysR family transcriptional regulator  32.77 
 
 		 307 aa  167  2e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.48256  normal  0.503791 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2436  LysR family transcriptional regulator  32.77 
 
 		 308 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1481  LysR family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 308 aa  165  8e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2243  transcription regulator protein  36.04 
 
 		 326 aa  165  1.0000000000000001e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.145641  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0044  LysR family transcriptional regulator  34.93 
 
 		 307 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1544  LysR family transcriptional regulator  34 
 
 		 309 aa  165  1.0000000000000001e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1550  LysR family transcriptional regulator  34.93 
 
 		 307 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0054  LysR family transcriptional regulator  34.93 
 
 		 307 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1198  LysR family transcriptional regulator  34.93 
 
 		 307 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.601339  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6126  LysR family transcriptional regulator  32.01 
 
 		 301 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.936354  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0052  LysR family transcriptional regulator  34.93 
 
 		 307 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1942  LysR family transcriptional regulator  33.69 
 
 		 320 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000680141 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5270  LysR family transcriptional regulator  35.57 
 
 		 315 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.444493  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4664  transcriptional regulator, LysR family  34.36 
 
 		 305 aa  163  3e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0610677 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3088  LysR family transcriptional regulator  32.44 
 
 		 301 aa  163  3e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.991899 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0065  LysR family transcriptional regulator  34.59 
 
 		 307 aa  163  3e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.363781  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4532  transcriptional regulator, LysR family  34.36 
 
 		 305 aa  163  3e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.695585 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0737  LysR family transcriptional regulator  30.8 
 
 		 302 aa  163  4.0000000000000004e-39  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000210121 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5308  transcriptional regulator, LysR family  34.45 
 
 		 317 aa  162  6e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.459598  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1852  transcriptional regulator, LysR family  36.21 
 
 		 314 aa  162  6e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0106414 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6019  LysR family transcriptional regulator  32.01 
 
 		 303 aa  162  7e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.176233  normal  0.34418 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6400  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 306 aa  162  7e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.245407 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4334  LysR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 301 aa  161  1e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.106421  normal  0.740204 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2175  transcriptional regulator, LysR family  36.21 
 
 		 314 aa  162  1e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.415931  normal  0.0244247 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2685  putative transcriptional regulator  33.56 
 
 		 310 aa  160  3e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0437278  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31560  LysR family transcriptional regulator  33.56 
 
 		 310 aa  160  3e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.574653  hitchhiker  0.00349034 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5845  LysR family transcriptional regulator  36.03 
 
 		 301 aa  160  4e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.151621  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5015  LysR family transcriptional regulator  36.03 
 
 		 301 aa  160  4e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.305612  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6276  LysR family transcriptional regulator  34.56 
 
 		 317 aa  159  7e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0594796  normal  0.485366 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3652  LysR family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 314 aa  159  8e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0641656 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68550  LysR family transcriptional regulator  33.11 
 
 		 302 aa  158  9e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.505107 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4567  LysR family transcriptional regulator  34.24 
 
 		 332 aa  158  9e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.227329  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5527  LysR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 306 aa  158  1e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5891  LysR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 306 aa  158  1e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.384931  normal  0.980568 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2440  LysR family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 311 aa  157  2e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.554767  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1230  LysR family transcriptional regulator  32.34 
 
 		 332 aa  157  2e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.121818  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2999  transcriptional regulator, LysR family  33.67 
 
 		 333 aa  157  2e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.4449  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2826  transcriptional regulator MexT  32.75 
 
 		 304 aa  157  3e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.663633  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2744  transcriptional regulator, LysR family  32.55 
 
 		 309 aa  156  3e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.546413  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3150  LysR family transcriptional regulator  34.01 
 
 		 299 aa  156  3e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.266522  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2111  LysR family transcriptional regulator  33.45 
 
 		 297 aa  156  3e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4889  LysR family transcriptional regulator  31.46 
 
 		 309 aa  157  3e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2863  LysR family transcriptional regulator  32.75 
 
 		 304 aa  156  4e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3034  LysR family transcriptional regulator  35.35 
 
 		 301 aa  156  4e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0386168  normal  0.816732 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3222  LysR family transcriptional regulator  35.35 
 
 		 301 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2473  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  32.89 
 
 		 309 aa  155  6e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.470422  normal  0.100008 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5082  LysR family transcriptional regulator  35.35 
 
 		 301 aa  155  6e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2956  LysR family transcriptional regulator  32.75 
 
 		 304 aa  155  7e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.801513 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0378  LysR family transcriptional regulator  33.45 
 
 		 298 aa  155  8e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>