50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A3974 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007951  Bxe_A3974  hypothetical protein  100 
 
 		 114 aa  238  1e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0863486 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0724  protein of unknown function DUF891  92.45 
 
 		 115 aa  209  1e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.967068  normal  0.26766 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4296  hypothetical protein  58.41 
 
 		 120 aa  150  5.9999999999999996e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4237  hypothetical protein  57.52 
 
 		 120 aa  146  8e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2999  hypothetical protein  56.88 
 
 		 112 aa  137  6e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.219413 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4188  putative cytoplasmic protein  57.69 
 
 		 105 aa  136  7.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4131  putative cytoplasmic protein  57.69 
 
 		 105 aa  136  8.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0025  hypothetical protein  54.9 
 
 		 112 aa  129  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.0000520365  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2103  protein of unknown function DUF891  54.21 
 
 		 112 aa  124  3e-28  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4386  hypothetical protein  52.21 
 
 		 116 aa  123  6e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1038  hypothetical protein  53.7 
 
 		 112 aa  123  1e-27  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3839  hypothetical protein  53.27 
 
 		 123 aa  122  2e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0135391  n/a   
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3516  hypothetical protein  52.78 
 
 		 113 aa  119  1.9999999999999998e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0117  hypothetical protein  48.25 
 
 		 118 aa  117  7.999999999999999e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0746  hypothetical protein  50.49 
 
 		 117 aa  114  3.9999999999999997e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.215681  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1227  hypothetical protein  49.53 
 
 		 117 aa  114  6e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.988714  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1110  hypothetical protein  47.66 
 
 		 117 aa  114  6e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.394957  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1200  hypothetical protein  50.5 
 
 		 117 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0186123  normal  0.644581 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1108  protein of unknown function DUF891  50.96 
 
 		 114 aa  112  2.0000000000000002e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.535364  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4347  hypothetical protein  53.33 
 
 		 107 aa  109  1.0000000000000001e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.230249  normal  0.629082 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1582  hypothetical protein  45 
 
 		 109 aa  107  7.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.464954  normal  0.0435717 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27830  hypothetical protein  55.29 
 
 		 103 aa  105  2e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4336  hypothetical protein  51.72 
 
 		 91 aa  102  2e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1023  hypothetical protein  44.86 
 
 		 108 aa  94.7  3e-19  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.395575  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0550  protein of unknown function DUF891  49.48 
 
 		 102 aa  90.1  8e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1359  hypothetical protein  55.88 
 
 		 69 aa  78.6  0.00000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3691  hypothetical protein  37.04 
 
 		 123 aa  77.4  0.00000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2998  hypothetical protein  41.11 
 
 		 125 aa  76.6  0.0000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.553466 
 
 
-
 
NC_007615  Nmul_B2803  hypothetical protein  37.14 
 
 		 128 aa  73.6  0.0000000000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0767  protein of unknown function DUF891  43.81 
 
 		 134 aa  73.6  0.0000000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.291185  normal  0.0218259 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0998  hypothetical protein  54.55 
 
 		 73 aa  70.9  0.000000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007617  Nmul_D2815  hypothetical protein  40.45 
 
 		 128 aa  68.9  0.00000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.342274  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4351  protein of unknown function DUF891  41.76 
 
 		 127 aa  66.6  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.102654  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3746  hypothetical protein  33.61 
 
 		 121 aa  65.1  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0644286  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0936  hypothetical protein  40.23 
 
 		 119 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.464426  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1131  protein of unknown function DUF891  40.23 
 
 		 121 aa  61.2  0.000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3842  hypothetical protein  41.67 
 
 		 123 aa  60.5  0.000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2509  hypothetical protein  38.37 
 
 		 127 aa  59.7  0.00000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.406225  normal  0.110118 
 
 
-
 
NC_010514  Mrad2831_6395  hypothetical protein  35.23 
 
 		 138 aa  54.3  0.0000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1884  hypothetical protein  30.28 
 
 		 127 aa  54.3  0.0000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.440545  normal  0.626168 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1384  hypothetical protein  33.73 
 
 		 113 aa  53.1  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.311049  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0732  hypothetical protein  27.59 
 
 		 117 aa  48.9  0.00002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0134513  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4451  hypothetical protein  27.45 
 
 		 127 aa  49.3  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3586  hypothetical protein  39.58 
 
 		 82 aa  46.2  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.487271  normal  0.441638 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3275  hypothetical protein  37.7 
 
 		 190 aa  44.3  0.0006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0275  hypothetical protein  38.6 
 
 		 71 aa  42.4  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000118934 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0292  hypothetical protein  38.6 
 
 		 71 aa  42  0.003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00028346  normal  0.248973 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4156  hypothetical protein  35.59 
 
 		 113 aa  41.6  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.355495  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3860  protein of unknown function DUF891  28.28 
 
 		 112 aa  40.8  0.006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0118  putative bacteriophage protein  31.87 
 
 		 106 aa  40  0.01  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.1352  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>