193 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A2441 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007951  Bxe_A2441  putative recombinase, transposition resolvase, TnpR  100 
 
 		 199 aa  404  1.0000000000000001e-112  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.273719 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3315  resolvase, N-terminal:resolvase helix-turn-helix region  70.85 
 
 		 200 aa  283  9e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5372  Resolvase domain  40.72 
 
 		 210 aa  123  2e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.925185 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0279  recombinase  36.73 
 
 		 248 aa  114  8.999999999999998e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.000482548  n/a   
 
 
-
 
NC_011889  Mnod_7752  Resolvase domain protein  40.51 
 
 		 214 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6448  Resolvase domain protein  36.65 
 
 		 211 aa  100  1e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43160  Resolvase-like protein  36.13 
 
 		 189 aa  85.5  5e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2494  resolvase domain-containing protein  35.23 
 
 		 191 aa  76.3  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003898  resolvase putative  32.5 
 
 		 202 aa  75.9  0.0000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1762  resolvase-like protein  33.68 
 
 		 192 aa  71.6  0.000000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2781  resolvase domain-containing protein  32.47 
 
 		 190 aa  71.6  0.000000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.183587  normal  0.43479 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2374  resolvase domain-containing protein  33.68 
 
 		 192 aa  71.6  0.000000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1326  resolvase domain-containing protein  34.57 
 
 		 180 aa  70.5  0.00000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006366  plpl0043  hypothetical protein  30.68 
 
 		 188 aa  70.1  0.00000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4663  resolvase domain-containing protein  33.33 
 
 		 197 aa  68.9  0.00000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.94015  n/a   
 
 
-
 
NC_010373  M446_7006  hypothetical protein  32.99 
 
 		 183 aa  68.6  0.00000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3231  transposon Tn2501 resolvase  33.16 
 
 		 191 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3112  Resolvase domain protein  32.98 
 
 		 184 aa  67.4  0.0000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1803  resolvase domain-containing protein  30.93 
 
 		 193 aa  66.6  0.0000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2322  resolvase domain-containing protein  29.55 
 
 		 186 aa  66.2  0.0000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0105  resolvase, N-terminal:resolvase helix-turn-helix region  35.26 
 
 		 192 aa  65.1  0.0000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3928  resolvase domain-containing protein  32.26 
 
 		 191 aa  65.1  0.0000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.272515  hitchhiker  0.0000753359 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2427  resolvase domain-containing protein  30.93 
 
 		 193 aa  64.7  0.0000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0929457  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1284  transposon Tn2501 resolvase  30.57 
 
 		 191 aa  64.7  0.0000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.1264  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2351  resolvase-like protein  31.75 
 
 		 235 aa  64.7  0.0000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.329475 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0037  transposon Tn21 resolvase  28.96 
 
 		 205 aa  64.7  0.0000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.335597 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4379  resolvase-like protein  32.47 
 
 		 197 aa  63.9  0.000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.907706  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4555  resolvase-like protein  32.47 
 
 		 197 aa  63.9  0.000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.849085  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3982  resolvase domain-containing protein  29.55 
 
 		 201 aa  64.3  0.000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.364011  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0631  resolvase domain-containing protein  29.55 
 
 		 201 aa  64.3  0.000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25710  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  33.85 
 
 		 201 aa  63.5  0.000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004307  resolvase N-terminal domain protein  32.47 
 
 		 190 aa  63.2  0.000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.179008  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0204  transposon resolvase  29.81 
 
 		 191 aa  62.8  0.000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000159954 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0166  Resolvase domain protein  31.58 
 
 		 188 aa  62.8  0.000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2680  resolvase domain-containing protein  27.87 
 
 		 185 aa  62.8  0.000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3829  resolvase domain-containing protein  27.87 
 
 		 185 aa  62.8  0.000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3846  resolvase domain-containing protein  27.87 
 
 		 185 aa  62.8  0.000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.40246  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1914  resolvase domain-containing protein  27.87 
 
 		 185 aa  62.8  0.000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1256  resolvase domain-containing protein  27.87 
 
 		 185 aa  62.8  0.000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.249423  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3464  resolvase domain-containing protein  27.87 
 
 		 185 aa  62.4  0.000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3170  resolvase domain-containing protein  28.92 
 
 		 200 aa  62  0.000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00430122 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0438  putative resolvase  28.57 
 
 		 318 aa  62.4  0.000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010374  M446_7059  hypothetical protein  30.57 
 
 		 183 aa  60.8  0.00000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006578  pBT9727_0065  DNA recombinase  28.11 
 
 		 203 aa  60.1  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1811  Resolvase domain protein  30.32 
 
 		 183 aa  60.1  0.00000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0297206  hitchhiker  0.00833685 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0466  Resolvase domain  31.63 
 
 		 205 aa  60.1  0.00000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.418385  normal  0.0169839 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3652  resolvase, N-terminal  31.5 
 
 		 192 aa  59.3  0.00000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000770175  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1494  resolvase-like protein  28.49 
 
 		 186 aa  59.7  0.00000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.493325 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6187  resolvase-like protein  28.98 
 
 		 186 aa  59.3  0.00000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0984609  hitchhiker  0.0000107923 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4473  serine-based site-specific recombinase activity TnpR  27.84 
 
 		 186 aa  59.3  0.00000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0992302  decreased coverage  0.00348712 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4599  serine-based site-specific recombinase activity TnpR  27.84 
 
 		 186 aa  59.3  0.00000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000321893  hitchhiker  0.00456228 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15430  putative resolvase, essential for transposition  27.84 
 
 		 186 aa  59.3  0.00000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  7.34084e-16  unclonable  6.55355e-22 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1206  Resolvase domain protein  27.27 
 
 		 186 aa  58.9  0.00000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4598  Resolvase domain protein  31.02 
 
 		 188 aa  58.5  0.00000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5336  transposon Tn21 resolvase  30.95 
 
 		 129 aa  58.5  0.00000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2003  transposon Tn2501 resolvase  30.26 
 
 		 222 aa  58.2  0.00000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00181715  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2033  resolvase domain-containing protein  29.03 
 
 		 192 aa  58.2  0.00000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.188765  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2319  resolvase, putative  35.61 
 
 		 137 aa  57.8  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.000512602  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4319  resolvase domain-containing protein  27.89 
 
 		 186 aa  57.4  0.0000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0053  transposon Tn21 resolvase  27.89 
 
 		 186 aa  57.4  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.509225 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4266  resolvase domain-containing protein  31.68 
 
 		 231 aa  57.4  0.0000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.000000000120246  unclonable  5.20349e-19 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1397  Resolvase domain protein  31.63 
 
 		 209 aa  57.4  0.0000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.954133  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3655  Resolvase domain protein  29.44 
 
 		 212 aa  57  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0554731  normal  0.301287 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1125  resolvase domain-containing protein  30.89 
 
 		 184 aa  57.4  0.0000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.577602  n/a   
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4794  resolvase domain-containing protein  31.37 
 
 		 193 aa  57  0.0000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0955  Resolvase domain protein  31.87 
 
 		 194 aa  56.2  0.0000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3355  resolvase domain-containing protein  36.48 
 
 		 301 aa  56.6  0.0000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0978291  normal  0.274195 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0222  transposon resolvase  28.37 
 
 		 199 aa  55.8  0.0000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000952158 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0123  putative resolvase  27.09 
 
 		 206 aa  56.6  0.0000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  6.922970000000001e-26 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3135  resolvase TnpR  28.49 
 
 		 217 aa  55.5  0.0000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2132  resolvase domain-containing protein  31.28 
 
 		 198 aa  55.1  0.0000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0356691 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4352  Resolvase domain protein  27.37 
 
 		 186 aa  54.7  0.0000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00813261  normal  1 
 
 
-
 
NC_011665  Sbal223_4489  Resolvase domain protein  27.37 
 
 		 186 aa  54.7  0.0000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000146883  normal  1 
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0011  resolvase, putative  27.84 
 
 		 181 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0687  site-specific recombinase, DNA invertase Pin related protein  27.94 
 
 		 200 aa  54.3  0.000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.731539  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1754  site-specific recombinase resolvase family protein PinR  27.36 
 
 		 196 aa  54.3  0.000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0427296  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4764  resolvase domain-containing protein  30.11 
 
 		 189 aa  53.9  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013518  Sterm_4140  Resolvase domain protein  29.33 
 
 		 217 aa  53.9  0.000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00204948  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01504  predicted site-specific recombinase  27.36 
 
 		 196 aa  53.5  0.000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.133152  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2272  Resolvase domain protein  27.36 
 
 		 196 aa  53.5  0.000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.861059  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0471  resolvase  31.25 
 
 		 197 aa  53.1  0.000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01515  hypothetical protein  27.36 
 
 		 196 aa  53.5  0.000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.088804  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2113  resolvase domain-containing protein  27.36 
 
 		 196 aa  53.5  0.000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0120982  normal  1 
 
 
-
 
NC_011314  VSAL_p320_03  resolvase  29.7 
 
 		 209 aa  53.5  0.000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01345  predicted site-specific recombinase  27.09 
 
 		 196 aa  53.1  0.000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01357  hypothetical protein  27.09 
 
 		 196 aa  53.1  0.000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3670  resolvase domain-containing protein  30.89 
 
 		 185 aa  52.8  0.000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1635  site-specific recombinase resolvase family protein PinR  27.36 
 
 		 196 aa  52.8  0.000003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00540929  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2100  Resolvase domain protein  27.59 
 
 		 196 aa  52.4  0.000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000956779  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3572  Resolvase domain protein  29.29 
 
 		 213 aa  52.8  0.000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000252709  hitchhiker  0.00189094 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4223  resolvase domain-containing protein  30.26 
 
 		 194 aa  52.8  0.000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.150601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1021  resolvase domain-containing protein  29.41 
 
 		 230 aa  52.8  0.000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.0963583 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2381  Resolvase domain  29.84 
 
 		 196 aa  52.4  0.000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2264  resolvase-like protein  29.17 
 
 		 183 aa  52  0.000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0723164  hitchhiker  0.00531394 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1006  Resolvase domain protein  29.95 
 
 		 189 aa  51.6  0.000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0884  Resolvase domain protein  27.96 
 
 		 187 aa  51.6  0.000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00000364698  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0216  transposon resolvase  27.4 
 
 		 199 aa  51.6  0.000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.159168 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1325  resolvase domain-containing protein  29.94 
 
 		 192 aa  51.6  0.000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_44  putative resolvase  25.62 
 
 		 211 aa  51.6  0.000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0377389  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2095  Resolvase domain protein  29.79 
 
 		 203 aa  51.6  0.000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>