More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_5272 on replicon NC_007950
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007950  Bpro_5272  short chain enoyl-CoA hydratase  100 
 
 
262 aa  532  1e-150  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000022289  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2749  short chain enoyl-CoA hydratase  67.82 
 
 
262 aa  373  1e-102  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.439722  normal  0.238533 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1772  enoyl-CoA hydratase/isomerase  54.98 
 
 
268 aa  271  7e-72  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0766393  normal  0.0633742 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2287  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  35.91 
 
 
260 aa  171  1e-41  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.867439  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2585  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  35.14 
 
 
260 aa  168  1e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1908  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.08 
 
 
259 aa  166  5e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3557  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.08 
 
 
259 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.203643  normal  0.505075 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2252  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.88 
 
 
259 aa  163  3e-39  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2014  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.15 
 
 
259 aa  162  4.0000000000000004e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.162316  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2864  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.63 
 
 
258 aa  161  1e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2662  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.97 
 
 
259 aa  161  1e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4640  enoyl-CoA hydratase  36.86 
 
 
257 aa  157  2e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.774216  normal  0.012557 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3005  short chain enoyl-CoA hydratase  36.5 
 
 
259 aa  157  2e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.717917 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2001  short chain enoyl-CoA hydratase  33.98 
 
 
259 aa  155  5.0000000000000005e-37  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3574  enoyl-CoA hydratase  36.33 
 
 
257 aa  155  6e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000415637 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1762  short chain enoyl-CoA hydratase  37.31 
 
 
267 aa  155  7e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0266496  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4172  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.23 
 
 
258 aa  154  2e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.863442  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1034  short chain enoyl-CoA hydratase  36.96 
 
 
256 aa  153  2e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0524652  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1877  short chain enoyl-CoA hydratase  32.94 
 
 
262 aa  154  2e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0147635  normal  0.173046 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1738  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.66 
 
 
259 aa  153  2.9999999999999998e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0269497 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1815  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.48 
 
 
268 aa  152  4e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1595  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.88 
 
 
265 aa  152  4e-36  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR2184  enoyl-CoA hydratase  34.77 
 
 
257 aa  152  5e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.182901  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2097  enoyl-CoA hydratase  34.77 
 
 
257 aa  152  5e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00356109  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1545  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.43 
 
 
258 aa  152  5.9999999999999996e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0176  short chain enoyl-CoA hydratase  36.95 
 
 
257 aa  151  8e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.212196  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4369  enoyl-CoA hydratase  37.89 
 
 
257 aa  152  8e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0156166 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0382  short chain enoyl-CoA hydratase  36.95 
 
 
257 aa  151  1e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.123728  hitchhiker  0.00785699 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2899  enoyl-CoA hydratase  33.98 
 
 
258 aa  150  2e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00000000596096  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2626  enoyl-CoA hydratase  33.07 
 
 
263 aa  150  3e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0588068 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2850  enoyl-CoA hydratase  34.48 
 
 
258 aa  149  4e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  unclonable  0.00000000000104318  normal  0.652493 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2031  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  33.07 
 
 
260 aa  149  4e-35  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3010  enoyl-CoA hydratase  36.78 
 
 
258 aa  149  5e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.0000686819  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1380  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.17 
 
 
260 aa  148  7e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.871476 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2866  short chain enoyl-CoA hydratase  33.59 
 
 
257 aa  148  8e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.18512  normal  0.106284 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2603  short chain enoyl-CoA hydratase  33.98 
 
 
263 aa  148  8e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.167852  normal  0.240881 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0749  phenylacetate degradation, enoyl-CoA hydratase paaB  34.24 
 
 
263 aa  148  1.0000000000000001e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.71459  normal  0.616105 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3801  short chain enoyl-CoA hydratase  34.12 
 
 
258 aa  147  1.0000000000000001e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0161017  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0876  enoyl-CoA hydratase  36.29 
 
 
258 aa  147  1.0000000000000001e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00000377465  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2808  enoyl-CoA hydratase  33.06 
 
 
262 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000147189 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10710  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.94 
 
 
258 aa  146  3e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11088  enoyl-CoA hydratase  36.58 
 
 
257 aa  146  3e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0399052  normal  0.611468 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0614  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.77 
 
 
262 aa  146  3e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.246951  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1806  enoyl-CoA hydratase  34.88 
 
 
262 aa  146  4.0000000000000006e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.595083  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0423  short chain enoyl-CoA hydratase  34.48 
 
 
259 aa  146  4.0000000000000006e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0401  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.81 
 
 
260 aa  145  5e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0715  enoyl-CoA hydratase  33.2 
 
 
257 aa  145  7.0000000000000006e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.000436418  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0855  short chain enoyl-CoA hydratase  36.64 
 
 
263 aa  145  8.000000000000001e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.248089  normal  0.692759 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2872  enoyl-CoA hydratase  35.63 
 
 
258 aa  145  9e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  unclonable  0.000000338858  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2833  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.66 
 
 
260 aa  145  9e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.511976  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1572  short chain enoyl-CoA hydratase  33.46 
 
 
259 aa  144  1e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000150745  normal  0.335046 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1781  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.64 
 
 
260 aa  144  1e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.655694  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3661  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.63 
 
 
258 aa  144  1e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.57083  hitchhiker  9.492269999999999e-21 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2613  enoyl-CoA hydratase  32.3 
 
 
263 aa  144  1e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.870505  normal  0.148892 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0453  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  33.72 
 
 
662 aa  144  1e-33  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.840152  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1434  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  33.59 
 
 
662 aa  143  2e-33  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0508311  normal  0.0451179 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6299  short chain enoyl-CoA hydratase  35.63 
 
 
266 aa  144  2e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4560  short chain enoyl-CoA hydratase  36.11 
 
 
256 aa  144  2e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.127005  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4231  enoyl-CoA hydratase  34.51 
 
 
257 aa  144  2e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.89202 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6902  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.98 
 
 
258 aa  144  2e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.174698  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4387  enoyl-CoA hydratase  34.51 
 
 
257 aa  144  2e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4156  enoyl-CoA hydratase  34.51 
 
 
257 aa  144  2e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0717  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.17 
 
 
258 aa  143  3e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1036  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.07 
 
 
258 aa  143  3e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2607  enoyl-CoA hydratase  34.42 
 
 
262 aa  142  4e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.43779  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI00240  enoyl-CoA hydratase, putative  34.01 
 
 
283 aa  142  5e-33  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0589051  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1122  short chain enoyl-CoA hydratase  33.98 
 
 
262 aa  142  5e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2905  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.72 
 
 
260 aa  142  6e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2476  enoyl-CoA hydratase  31.91 
 
 
263 aa  142  6e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0841  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  33.33 
 
 
662 aa  142  7e-33  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3370  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.82 
 
 
258 aa  141  8e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1306  short chain enoyl-CoA hydratase  33.46 
 
 
263 aa  140  9.999999999999999e-33  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0288681 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1573  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.82 
 
 
259 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0661339  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3162  enoyl-CoA hydratase  33.33 
 
 
258 aa  141  9.999999999999999e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000276465  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2515  enoyl-CoA hydratase  33.95 
 
 
262 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1079  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  34.63 
 
 
256 aa  140  1.9999999999999998e-32  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.209168 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2071  short chain enoyl-CoA hydratase  31.4 
 
 
260 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000637715  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2444  enoyl-CoA hydratase  33.99 
 
 
260 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3163  enoyl-CoA hydratase  32.16 
 
 
280 aa  140  1.9999999999999998e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000989513  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0266  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.27 
 
 
265 aa  139  3e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0235599 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0239  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.29 
 
 
258 aa  139  3e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2933  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.96 
 
 
259 aa  140  3e-32  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.143661  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3623  short chain enoyl-CoA hydratase  34.96 
 
 
277 aa  140  3e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2302  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.2 
 
 
261 aa  140  3e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2628  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.38 
 
 
261 aa  139  3e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4681  enoyl-CoA hydratase  34.77 
 
 
260 aa  140  3e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.417656  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0790  enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase  28.79 
 
 
260 aa  139  3.9999999999999997e-32  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1843  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.03 
 
 
257 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0607617  normal  0.0948943 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2217  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.03 
 
 
257 aa  139  4.999999999999999e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.47616  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3369  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.59 
 
 
262 aa  139  4.999999999999999e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.186723  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3521  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.03 
 
 
257 aa  139  4.999999999999999e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.759702  normal  0.0494202 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2036  enoyl-CoA hydratase  34.38 
 
 
257 aa  139  6e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.26077  normal  0.189819 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1831  enoyl-CoA hydratase  32.16 
 
 
261 aa  139  6e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.728696  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3571  enoyl-CoA hydratase  33.59 
 
 
264 aa  139  6e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  hitchhiker  0.00545367  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2359  enoyl-CoA hydratase  33.95 
 
 
262 aa  139  6e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.599517  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1899  enoyl-CoA hydratase  33.59 
 
 
258 aa  138  7e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00000141088  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0544  enoyl-CoA hydratase  33.59 
 
 
258 aa  138  7e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  unclonable  0.0000000212345  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3563  enoyl-CoA hydratase  33.59 
 
 
258 aa  138  7e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0000000063446  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0930  enoyl-CoA hydratase  33.59 
 
 
258 aa  138  7e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000000286464  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0632  enoyl-CoA hydratase  33.59 
 
 
258 aa  138  7e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000040968  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>