171 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_4492 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_4492  lysine exporter protein LysE/YggA  100 
 
 		 222 aa  420  1e-117  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.948214  normal  0.885148 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3698  lysine exporter protein LysE/YggA  72.09 
 
 		 211 aa  259  2e-68  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2057  lysine exporter protein LysE/YggA  58.13 
 
 		 218 aa  209  3e-53  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.34805  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3748  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  40.1 
 
 		 201 aa  122  4e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2777  amino acid transporter LysE  39.05 
 
 		 212 aa  119  3e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21230  lysine efflux permease  43.87 
 
 		 205 aa  119  3e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0915178 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0657  lysine exporter protein LysE/YggA  38.16 
 
 		 203 aa  117  9.999999999999999e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.925476  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4165  lysine exporter protein LysE/YggA  38.81 
 
 		 203 aa  117  1.9999999999999998e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.547007  normal  0.28578 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2143  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  36.54 
 
 		 202 aa  115  5e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.281653  normal  0.178188 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2975  lysine exporter protein LysE/YggA  34.62 
 
 		 202 aa  114  8.999999999999998e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.967667  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2359  lysine exporter protein LysE/YggA  37.07 
 
 		 206 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.16555  normal  0.148285 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3408  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  43.07 
 
 		 217 aa  113  2.0000000000000002e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.554507  normal  0.0106718 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5931  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  40.21 
 
 		 227 aa  112  4.0000000000000004e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0411323 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2011  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  38.35 
 
 		 213 aa  112  5e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0310  lysine exporter protein LysE/YggA  36.63 
 
 		 202 aa  111  7.000000000000001e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4485  lysine exporter protein LysE/YggA  39.42 
 
 		 200 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.105145 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2387  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  36.1 
 
 		 202 aa  110  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00462504  hitchhiker  0.00355468 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12017  integral membrane protein  37.24 
 
 		 199 aa  110  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1449  LysE family translocator protein  33.49 
 
 		 215 aa  109  3e-23  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0643265  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2773  lysine exporter protein LysE/YggA  36.06 
 
 		 210 aa  108  4.0000000000000004e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0916  amino acid transporter LysE  37.8 
 
 		 204 aa  108  5e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4370  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  38.14 
 
 		 211 aa  108  5e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0159  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  31.94 
 
 		 276 aa  108  5e-23  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.798535 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2243  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  39.9 
 
 		 208 aa  108  6e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.229976  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1845  lysine exporter protein LysE/YggA  35.44 
 
 		 214 aa  108  6e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.142006  normal  0.0992171 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2124  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  41.67 
 
 		 209 aa  108  6e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0955  lysine exporter protein LysE/YggA  37.8 
 
 		 199 aa  108  7.000000000000001e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.599667  normal  0.584278 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1975  lysine exporter protein LysE/YggA  33.5 
 
 		 204 aa  107  1e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0270358  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3484  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  37.18 
 
 		 250 aa  106  2e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.324523 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4472  lysine exporter protein LysE/YggA  37.32 
 
 		 199 aa  106  3e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.301556 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1903  lysine exporter protein LysE/YggA  40.1 
 
 		 199 aa  106  3e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.334205 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4336  lysine exporter protein LysE/YggA  38.39 
 
 		 219 aa  106  3e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3862  putative transporter  36.59 
 
 		 216 aa  105  5e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1703  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  38.35 
 
 		 213 aa  105  6e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.110191  normal  0.952873 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2816  hypothetical protein  33.84 
 
 		 201 aa  105  7e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3694  lysine exporter protein LysE/YggA  40.31 
 
 		 216 aa  105  7e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.095431  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0982  lysine exporter protein LysE/YggA  37.02 
 
 		 199 aa  104  1e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000248105 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2508  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  38.25 
 
 		 211 aa  103  2e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3161  lysine exporter protein LysE/YggA  37.5 
 
 		 219 aa  103  2e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1830  lysine exporter protein LysE/YggA  37.19 
 
 		 204 aa  103  2e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000951158 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4362  transporter, LysE family  36.95 
 
 		 200 aa  103  3e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0394  lysine exporter protein LysE/YggA  36.92 
 
 		 196 aa  102  4e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2174  lysine exporter protein LysE/YggA  32.85 
 
 		 203 aa  102  4e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0221131  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1960  lysine exporter protein LysE/YggA  33.5 
 
 		 197 aa  102  4e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2433  lysine exporter protein (LysE/YggA)  32.37 
 
 		 202 aa  102  4e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.274749  hitchhiker  0.000341611 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0385  hypothetical protein  38.46 
 
 		 212 aa  102  5e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.394901 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2966  hypothetical protein  34.34 
 
 		 201 aa  102  6e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1651  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  40.19 
 
 		 219 aa  102  6e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.302942  normal  0.115475 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1506  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  36.63 
 
 		 205 aa  102  6e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4058  lysine exporter protein LysE/YggA  37.98 
 
 		 200 aa  101  9e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2963  basic amino acid exporter LysE  37.19 
 
 		 205 aa  101  1e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2837  lysine exporter protein LysE/YggA  35.75 
 
 		 216 aa  101  1e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.615074  normal  0.224283 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5299  lysine exporter protein LysE/YggA  33.33 
 
 		 206 aa  100  1e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3140  lysine exporter protein LysE/YggA  33.84 
 
 		 206 aa  100  2e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.466671  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4432  lysine exporter protein LysE/YggA  39.18 
 
 		 200 aa  100  2e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4177  lysine exporter protein LysE/YggA  39.71 
 
 		 208 aa  100  2e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  decreased coverage  0.00817144  normal  0.249821 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0373  lysine exporter protein LysE/YggA  35.38 
 
 		 202 aa  100  2e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0125208 
 
 
-
 
NC_004310  BR0674  amino acid transporter LysE  38.19 
 
 		 204 aa  99.8  3e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3649  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.02 
 
 		 207 aa  99.4  4e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3100  LysE family transporter  36.67 
 
 		 201 aa  98.6  7e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0629336  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0270  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  36 
 
 		 196 aa  98.6  8e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.440552 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0664  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  40 
 
 		 210 aa  98.2  9e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.207445  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3147  lysine exporter protein LysE/YggA  33.33 
 
 		 206 aa  98.2  9e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.294591  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2865  L-lysine exporter, putative  32.67 
 
 		 206 aa  97.8  1e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4488  lysine exporter protein LysE/YggA  34.67 
 
 		 206 aa  97.8  1e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1890  lysine exporter protein LysE/YggA  36 
 
 		 209 aa  97.4  1e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.34738  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0272  lysine exporter protein LysE/YggA  38.61 
 
 		 199 aa  97.8  1e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5006  lysine exporter protein LysE/YggA  33.33 
 
 		 206 aa  97.8  1e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0282  lysine exporter protein LysE/YggA  38.61 
 
 		 199 aa  97.8  1e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.299374  normal  0.22617 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0263  lysine exporter protein LysE/YggA  38.61 
 
 		 199 aa  97.8  1e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.991169 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2988  L-lysine exporter, putative  34.65 
 
 		 208 aa  97.4  2e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5124  lysine exporter protein LysE/YggA  32.83 
 
 		 206 aa  96.3  3e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5735  lysine exporter protein LysE/YggA  32.83 
 
 		 206 aa  96.3  3e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.289905 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3883  arginine exporter protein  34.83 
 
 		 204 aa  95.5  5e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0029  LysE family protein  34.48 
 
 		 206 aa  95.1  7e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1537  LysE family protein  34.48 
 
 		 206 aa  95.1  7e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1182  LysE family protein  34.48 
 
 		 206 aa  95.1  7e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.899031  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1462  LysE family protein  34.48 
 
 		 206 aa  95.1  7e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0049  LysE family protein  34.48 
 
 		 206 aa  95.1  7e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.751253  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0035  LysE family translocator protein  34.48 
 
 		 206 aa  95.1  7e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0035  LysE family protein  34.48 
 
 		 206 aa  95.1  7e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.780183  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0712  lysine exporter protein  38.73 
 
 		 208 aa  95.1  8e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2024  hypothetical protein  33.83 
 
 		 202 aa  94  1e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.806346  normal  0.294176 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0033  LysE family protein  34.48 
 
 		 206 aa  94.4  1e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2343  lysine exporter protein LysE/YggA  31.68 
 
 		 204 aa  94.4  1e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.581715  hitchhiker  0.000000535695 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2415  lysine exporter protein LysE/YggA  31.68 
 
 		 204 aa  94  2e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.33094  hitchhiker  0.00103645 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4248  hypothetical protein  39.09 
 
 		 209 aa  93.6  2e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.142678 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0413  CmeB  33 
 
 		 207 aa  93.2  2e-18  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20760  L-lysine exporter  36.41 
 
 		 204 aa  92.8  3e-18  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0668  amino acid transporter LysE  38.69 
 
 		 204 aa  93.2  3e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.484173  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1653  lysine exporter protein LysE/YggA  31.68 
 
 		 204 aa  92.8  4e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.255522  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2593  lysine exporter protein LysE/YggA  30.69 
 
 		 205 aa  92.4  4e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000430755  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3927  arginine exporter protein  35.32 
 
 		 205 aa  92.8  4e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.481327  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3686  arginine exporter protein  34.83 
 
 		 204 aa  92  6e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03559  hypothetical protein  31.09 
 
 		 194 aa  92  6e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5077  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  40.62 
 
 		 195 aa  92  7e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1699  lysine exporter protein LysE/YggA  31.19 
 
 		 213 aa  91.7  8e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.333091  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3122  lysine exporter protein LysE/YggA  38.07 
 
 		 199 aa  91.7  8e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.77034  hitchhiker  0.00328484 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1397  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  36.55 
 
 		 211 aa  90.1  2e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2670  lysine exporter protein LysE/YggA  30.69 
 
 		 205 aa  90.9  2e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0000865788  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>