More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_4335 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_4335  extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 526 aa  1078    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.83307  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4344  extracellular solute-binding protein  52.55 
 
 		 526 aa  553  1e-156  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.133353  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4458  opine ABC transporter, periplasmic binding protein, putative  50.66 
 
 		 526 aa  545  1e-154  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.124294  hitchhiker  0.0000632484 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2475  extracellular solute-binding protein  49.33 
 
 		 521 aa  507  9.999999999999999e-143  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0955412  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8162  ABC transporter substrate binding protein (peptide)  45.05 
 
 		 522 aa  444  1e-123  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.164688  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0239  extracellular solute-binding protein  30 
 
 		 529 aa  209  1e-52  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.884064 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1135  4-phytase  30.6 
 
 		 520 aa  186  8e-46  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00134056  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0161  extracellular solute-binding protein family 5  32.55 
 
 		 505 aa  175  1.9999999999999998e-42  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2454  extracellular solute-binding protein  32.98 
 
 		 528 aa  171  4e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.269908  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3174  dipeptide ABC transporter substrate-binding protein  28.23 
 
 		 523 aa  159  1e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0836  ABC peptide transporter, periplasmic ligand binding protein  29.35 
 
 		 520 aa  158  2e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.385717  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0271  extracellular solute-binding protein family 5  27.35 
 
 		 516 aa  158  3e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.848307  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1319  extracellular solute-binding protein family 5  29.08 
 
 		 521 aa  156  8e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0396363  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3130  extracellular solute-binding protein family 5  29.15 
 
 		 520 aa  155  1e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.777715  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4203  extracellular solute-binding protein  28.85 
 
 		 520 aa  155  1e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.237738  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4163  extracellular solute-binding protein  28.85 
 
 		 520 aa  155  1e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0633493  decreased coverage  0.00226863 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3003  extracellular solute-binding protein family 5  28.78 
 
 		 516 aa  155  1e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1253  extracellular solute-binding protein family 5  28.6 
 
 		 517 aa  155  1e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.245274  normal  0.49371 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3353  extracellular solute-binding protein  28.85 
 
 		 520 aa  155  2e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.587262  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1113  dipeptide ABC transporter periplasmic dipeptide-binding protein, putative  28.57 
 
 		 520 aa  154  5e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.322522  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1867  dipeptide/oligopeptide/nickel ABC periplasmic ligand-binding protein  28.71 
 
 		 520 aa  152  1e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.30378  normal  0.527518 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3863  extracellular solute-binding protein family 5  28.54 
 
 		 523 aa  151  3e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00142419 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1926  extracellular solute-binding protein  31.52 
 
 		 518 aa  151  3e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.293523  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4225  extracellular solute-binding protein  27.99 
 
 		 520 aa  151  3e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4591  extracellular solute-binding protein  28.75 
 
 		 517 aa  151  3e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0777489  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0008  extracellular solute-binding protein family 5  27.83 
 
 		 544 aa  150  5e-35  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00260142  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1380  substate-binding periplasmic (PBP) ABC transporter protein  27.24 
 
 		 517 aa  150  7e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.630202  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2957  4-phytase  29.69 
 
 		 520 aa  150  7e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1988  ABC peptide transporter, periplasmic ligand binding protein  26.41 
 
 		 505 aa  150  7e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.693495  normal  0.584075 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0009  extracellular solute-binding protein family 5  28.31 
 
 		 544 aa  149  8e-35  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.327799  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4243  solute-binding family 5 protein  27.38 
 
 		 521 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3391  extracellular solute-binding protein  26.37 
 
 		 512 aa  148  3e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3401  extracellular solute-binding protein  26.37 
 
 		 512 aa  148  3e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.475057 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3453  extracellular solute-binding protein  26.37 
 
 		 512 aa  148  3e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0954042  normal  0.238639 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5142  4-phytase  29.73 
 
 		 531 aa  147  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.303319  normal  0.0209906 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4390  solute-binding family 5 protein  27.14 
 
 		 521 aa  147  4.0000000000000006e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4231  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  27.14 
 
 		 521 aa  147  4.0000000000000006e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4729  solute-binding family 5 protein  27.14 
 
 		 521 aa  147  4.0000000000000006e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1751  extracellular solute-binding protein  28.11 
 
 		 538 aa  147  4.0000000000000006e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.150343  normal  0.0954392 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4608  extracellular solute-binding protein  27.14 
 
 		 521 aa  147  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2587  extracellular solute-binding protein family 5  28.6 
 
 		 502 aa  147  6e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0139  extracellular solute-binding protein  30.34 
 
 		 520 aa  146  8.000000000000001e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.382397 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2645  4-phytase  25.21 
 
 		 532 aa  146  9e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.292677  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1658  extracellular solute-binding protein  28.96 
 
 		 516 aa  146  9e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.710594  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4052  extracellular solute-binding protein  27.84 
 
 		 520 aa  146  1e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.544759  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2761  extracellular solute-binding protein  26.69 
 
 		 515 aa  146  1e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.364418  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1234  extracellular solute-binding protein  28.23 
 
 		 538 aa  145  2e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.871598  normal  0.318753 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0263  extracellular solute-binding protein family 5  26.63 
 
 		 516 aa  145  2e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0801202  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3571  extracellular solute-binding protein  27.84 
 
 		 520 aa  145  2e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.57508  normal  0.258108 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3773  extracellular solute-binding protein  27.29 
 
 		 510 aa  145  2e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.434805  normal  0.505457 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1551  extracellular solute-binding protein  28.51 
 
 		 512 aa  144  3e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0626  extracellular solute-binding protein  28.03 
 
 		 510 aa  145  3e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.797506  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1408  extracellular solute-binding protein  32.94 
 
 		 518 aa  144  4e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00741999  normal  0.0556416 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3431  extracellular solute-binding protein  27.86 
 
 		 531 aa  144  5e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000878954 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0975  putative dipeptide ABC transporter periplasmic dipeptide-binding protein  27.59 
 
 		 520 aa  144  5e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.124849  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1359  putative glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein  27.59 
 
 		 520 aa  144  5e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.442837  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0324  putative ABC transporter substrate-binding protein  27.59 
 
 		 520 aa  144  5e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1768  putative glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein  27.59 
 
 		 520 aa  144  5e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.852283  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0402  putative glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein  27.59 
 
 		 520 aa  144  5e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0238  putative glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein  27.59 
 
 		 520 aa  144  5e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1853  putative binding protein YliB  27.59 
 
 		 520 aa  144  5e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0212  extracellular solute-binding protein  28.85 
 
 		 538 aa  143  7e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0260102  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1433  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  27.27 
 
 		 538 aa  143  8e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.948157  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1652  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  26.42 
 
 		 511 aa  143  8e-33  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.2387  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2097  4-phytase  28.66 
 
 		 546 aa  143  9e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000775897  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3275  hypothetical protein  28.28 
 
 		 540 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.349389  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3103  extracellular solute-binding protein  27.78 
 
 		 519 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.376049  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5111  ABC transporter periplasmic binding protein  27.64 
 
 		 532 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.914948  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0094  extracellular solute-binding protein  27.58 
 
 		 498 aa  142  1.9999999999999998e-32  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5641  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  28.97 
 
 		 508 aa  142  1.9999999999999998e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.543478  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0890  glutathione-binding protein GsiB  28.4 
 
 		 512 aa  142  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.362875  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5067  extracellular solute-binding protein  27.43 
 
 		 495 aa  142  1.9999999999999998e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.68424  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16530  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  26.03 
 
 		 510 aa  142  1.9999999999999998e-32  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.564688 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3988  extracellular solute-binding protein  26.8 
 
 		 540 aa  141  3e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3255  ABC peptide transporter, periplasmic binding protein  26.8 
 
 		 540 aa  141  3e-32  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.433609  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2408  extracellular solute-binding protein  29.7 
 
 		 505 aa  141  3e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.000286915  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58360  putative binding protein component of ABC transpor  27.85 
 
 		 532 aa  141  3e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2032  ABC transporter, periplasmic binding protein  30.52 
 
 		 524 aa  140  3.9999999999999997e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.662418  normal  0.30348 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3243  extracellular solute-binding protein  28.01 
 
 		 509 aa  140  4.999999999999999e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.649697  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0888  glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein GsiB  28.06 
 
 		 512 aa  140  4.999999999999999e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3158  extracellular solute-binding protein  26.5 
 
 		 535 aa  140  4.999999999999999e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0387  extracellular solute-binding protein family 5  28.42 
 
 		 503 aa  140  4.999999999999999e-32  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000000219856  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0468  extracellular solute-binding protein family 5  25.82 
 
 		 528 aa  140  6e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0381  extracellular solute-binding protein  28.57 
 
 		 531 aa  140  6e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.265556 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1352  extracellular solute-binding protein family 5  27.81 
 
 		 534 aa  140  6e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4426  extracellular solute-binding protein  27.05 
 
 		 520 aa  140  7e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0855  glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein GsiB  28.06 
 
 		 512 aa  140  7.999999999999999e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1000  glutathione-binding protein GsiB  28.19 
 
 		 512 aa  140  7.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1324  extracellular solute-binding protein  29.2 
 
 		 512 aa  139  8.999999999999999e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.725738 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0979  glutathione-binding protein GsiB  27.99 
 
 		 512 aa  139  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4250  peptide ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  25.82 
 
 		 528 aa  139  1e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.146199 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0950  glutathione-binding protein GsiB  27.99 
 
 		 512 aa  139  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.981703  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0917  glutathione-binding protein GsiB  27.99 
 
 		 512 aa  139  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1189  extracellular solute-binding protein family 5  29.26 
 
 		 497 aa  139  2e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0901  glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein GsiB  27.86 
 
 		 512 aa  138  2e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0453  4-phytase  28.39 
 
 		 526 aa  139  2e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000132073  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3596  extracellular solute-binding protein  27.03 
 
 		 526 aa  138  2e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3248  ABC peptide transporter, periplasmic binding protein  30.28 
 
 		 503 aa  139  2e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.336639  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3713  putative ABC transporter (substrate binding component)  27.97 
 
 		 516 aa  138  2e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0183  extracellular solute-binding protein  27.04 
 
 		 532 aa  139  2e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>