More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_6921 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010676  Bphyt_6921  transcriptional regulator, IclR family  100 
 
 		 262 aa  536  9.999999999999999e-153  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.095189  normal  0.134919 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2965  IclR family transcriptional regulator  97.71 
 
 		 272 aa  525  1e-148  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4303  IclR family transcriptional regulator  85.71 
 
 		 270 aa  460  9.999999999999999e-129  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1611  IclR family transcriptional regulator  76.65 
 
 		 292 aa  398  9.999999999999999e-111  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0636  IclR family transcriptional regulator  75.1 
 
 		 274 aa  393  1e-108  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5394  IclR family transcriptional regulator  76.61 
 
 		 274 aa  393  1e-108  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.340198 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2367  IclR family transcriptional regulator  75.1 
 
 		 300 aa  394  1e-108  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.314257  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1074  IclR family transcriptional regulator  75.1 
 
 		 274 aa  393  1e-108  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0830  IclR family transcriptional regulator  75.1 
 
 		 274 aa  393  1e-108  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1794  IclR family transcriptional regulator  75.1 
 
 		 274 aa  393  1e-108  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.353439  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4847  IclR family transcriptional regulator  76.61 
 
 		 300 aa  393  1e-108  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0298139  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1151  IclR family transcriptional regulator  75.1 
 
 		 274 aa  393  1e-108  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.82938  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3282  IclR family transcriptional regulator  75 
 
 		 257 aa  385  1e-106  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0217163 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4749  IclR family transcriptional regulator  72.33 
 
 		 257 aa  380  1e-105  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5338  IclR family transcriptional regulator  72.33 
 
 		 257 aa  380  1e-105  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5523  IclR family transcriptional regulator  72.33 
 
 		 257 aa  380  1e-105  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2201  IclR family transcriptional regulator  71.71 
 
 		 315 aa  379  1e-104  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2877  IclR family transcriptional regulator  71.32 
 
 		 274 aa  378  1e-104  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0370  IclR family transcriptional regulator  70.93 
 
 		 274 aa  376  1e-103  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.013251  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1747  IclR family transcriptional regulator  70.93 
 
 		 274 aa  376  1e-103  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.273271  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1233  IclR family transcriptional regulator  70.93 
 
 		 274 aa  375  1e-103  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00230944  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0136  IclR family transcriptional regulator  73.68 
 
 		 257 aa  376  1e-103  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.731827  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1560  IclR family transcriptional regulator  70.93 
 
 		 308 aa  375  1e-103  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.552414  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2994  IclR family transcriptional regulator  70.93 
 
 		 308 aa  375  1e-103  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0847126  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0411  IclR family transcriptional regulator  70.93 
 
 		 308 aa  375  1e-103  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1090  regulatory proteins, IclR  61.13 
 
 		 253 aa  315  3e-85  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.102092 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3127  IclR family transcriptional regulator  59.11 
 
 		 279 aa  307  1.0000000000000001e-82  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2272  IclR family transcriptional regulator  63.04 
 
 		 256 aa  302  3.0000000000000004e-81  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.344477  hitchhiker  0.000000361839 
 
 
-
 
NC_004310  BR0234  IclR family transcriptional regulator  50.81 
 
 		 264 aa  242  3.9999999999999997e-63  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0227  IclR family transcriptional regulator  50.41 
 
 		 259 aa  240  2e-62  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0308  regulatory protein IclR  50.81 
 
 		 259 aa  239  2e-62  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6042  transcriptional regulator, IclR family  47.83 
 
 		 261 aa  238  9e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7200  transcriptional regulator, IclR family  47.83 
 
 		 261 aa  233  3e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.07043 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4980  regulatory protein IclR  47.41 
 
 		 260 aa  232  4.0000000000000004e-60  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.057245  normal  0.0161062 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3400  IclR family transcriptional regulator  43.6 
 
 		 268 aa  224  1e-57  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.279316  normal  0.966908 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2281  regulatory proteins, IclR  42.26 
 
 		 288 aa  191  1e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.864202  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0816  IclR family transcriptional regulator  41.26 
 
 		 289 aa  171  1e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6756  IclR family transcriptional regulator  38.87 
 
 		 285 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.152181  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0188  regulatory proteins, IclR  39.64 
 
 		 271 aa  159  4e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1542  IclR family transcriptional regulator  38.4 
 
 		 260 aa  156  3e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.58926 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2487  transcriptional regulator KdgR  37.25 
 
 		 258 aa  151  8.999999999999999e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.823978  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02755  transcriptional regulator  39.47 
 
 		 258 aa  146  3e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0796  IclR family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 252 aa  144  2e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.060065  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2434  IclR family transcriptional regulator  36 
 
 		 272 aa  138  1e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1548  IclR family transcriptional regulator  36.16 
 
 		 256 aa  135  7.000000000000001e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.88716 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2760  regulatory protein IclR  34.65 
 
 		 259 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1960  IclR family transcriptional regulator  32.27 
 
 		 256 aa  105  8e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.124593  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1258  IclR family transcriptional regulator  29.92 
 
 		 255 aa  101  1e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000210097 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2531  transcriptional regulator, IclR family  27.31 
 
 		 259 aa  91.3  2e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1911  transcriptional regulator, IclR family  25.54 
 
 		 256 aa  87.8  2e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0417  IclR family transcriptional regulator  31 
 
 		 268 aa  87  3e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.116242 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2373  transcriptional regulator, IclR family  26.29 
 
 		 261 aa  82.4  0.000000000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2164  transcriptional regulator, IclR family  32.24 
 
 		 277 aa  82  0.000000000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.851841  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1981  transcriptional regulator KdgR  28.51 
 
 		 263 aa  81.3  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.364283  normal  0.0913734 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1289  transcriptional regulator KdgR  28.51 
 
 		 263 aa  81.3  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000107384  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5397  transcriptional regulator, IclR family  25.5 
 
 		 261 aa  82  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.429612  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2043  transcriptional regulator KdgR  28.51 
 
 		 263 aa  81.3  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.374419  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1985  transcriptional regulator KdgR  28.51 
 
 		 263 aa  81.3  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.364862  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1473  transcriptional regulator KdgR  28.51 
 
 		 263 aa  81.3  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0115946  normal  0.370857 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0134  IclR family transcriptional regulator  26.34 
 
 		 268 aa  80.5  0.00000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.272177  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2056  transcriptional regulator KdgR  27.78 
 
 		 263 aa  80.1  0.00000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000211216  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3689  IclR family transcriptional regulator  25.68 
 
 		 278 aa  79  0.00000000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.230342  normal  0.909085 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0759  IclR family transcriptional regulator  24.69 
 
 		 261 aa  78.6  0.00000000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.46118e-16  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01798  predicted DNA-binding transcriptional regulator  27.78 
 
 		 263 aa  77.8  0.0000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.440803  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2095  transcriptional regulator KdgR  27.78 
 
 		 263 aa  77.8  0.0000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000995956  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01786  hypothetical protein  27.78 
 
 		 263 aa  77.8  0.0000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.633166  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1360  transcriptional regulator KdgR  27.78 
 
 		 263 aa  77.8  0.0000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000169219  normal  0.0136372 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1918  transcriptional regulator KdgR  27.78 
 
 		 263 aa  77.8  0.0000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000201259  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2559  transcriptional regulator KdgR  27.78 
 
 		 263 aa  77.8  0.0000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000361362  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1805  IclR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 263 aa  77.8  0.0000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.954449  normal  0.233357 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4081  IclR family transcriptional regulator  26.94 
 
 		 291 aa  77.8  0.0000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1912  IclR family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 283 aa  76.3  0.0000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3857  transcriptional regulator, IclR family  27.42 
 
 		 287 aa  76.6  0.0000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2397  regulatory protein, IclR  25 
 
 		 263 aa  75.9  0.0000000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.162621  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3965  IclR family transcriptional regulator  24.76 
 
 		 264 aa  75.5  0.0000000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2380  IclR family transcriptional regulator  28.31 
 
 		 254 aa  75.5  0.0000000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.102909  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1166  IclR family transcriptional regulator  25.97 
 
 		 271 aa  74.7  0.000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0022  transcriptional regulator, IclR family  28.25 
 
 		 267 aa  74.7  0.000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0957  IclR family transcriptional regulator  27.07 
 
 		 295 aa  74.3  0.000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0004  regulatory proteins, IclR  27.8 
 
 		 267 aa  73.9  0.000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.915259 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2850  IclR family transcriptional regulator  25.98 
 
 		 260 aa  73.6  0.000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000441287  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2225  Transcriptional regulator IclR  28.12 
 
 		 249 aa  72.8  0.000000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4531  IclR family transcriptional regulator  27.83 
 
 		 283 aa  72.4  0.000000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.924227  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0779  transcriptional regulator IclR  26.12 
 
 		 278 aa  72  0.00000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4386  transcriptional regulator, IclR family  25.56 
 
 		 257 aa  71.2  0.00000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  4.7103e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2702  transcriptional regulator, IclR family  23.45 
 
 		 254 aa  70.5  0.00000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2653  transcriptional regulator  27.1 
 
 		 263 aa  70.1  0.00000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.618751  normal  0.01576 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4237  IclR family transcriptional regulator  25.32 
 
 		 286 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2208  transcriptional regulator, IclR family  25.1 
 
 		 290 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1301  IclR family transcriptional regulator  25 
 
 		 316 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1683  transcriptional regulator  26.29 
 
 		 263 aa  70.1  0.00000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1340  IclR family transcriptional regulator  25 
 
 		 316 aa  69.7  0.00000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0968  IclR family transcriptional regulator  25 
 
 		 316 aa  69.7  0.00000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2490  IclR family transcriptional regulator  25 
 
 		 316 aa  69.7  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0323  IclR family transcriptional regulator  25 
 
 		 316 aa  69.7  0.00000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0600  IclR family transcriptional regulator  25 
 
 		 316 aa  69.7  0.00000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0614585  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1793  IclR family transcriptional regulator  26.29 
 
 		 263 aa  70.1  0.00000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1229  IclR family transcriptional regulator  25 
 
 		 316 aa  69.7  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1949  transcriptional regulator, IclR family  25.35 
 
 		 263 aa  68.9  0.00000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00482853  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2177  transcriptional regulator, IclR family  26.92 
 
 		 263 aa  68.9  0.00000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00508287  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>