50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_4992 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010676  Bphyt_4992  putative peptidoglycan-binding LysM  100 
 
 		 484 aa  968    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.911035  normal  0.0172735 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1660  putative peptidoglycan-binding LysM  85.54 
 
 		 484 aa  810    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0342216 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1456  LysM domain-containing protein  51.95 
 
 		 448 aa  432  1e-120  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0426  LysM domain-containing protein  51.95 
 
 		 448 aa  432  1e-120  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.718442  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1437  peptidoglycan-binding LysM  54.69 
 
 		 453 aa  432  1e-120  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1665  lysM domain-containing protein  51.95 
 
 		 454 aa  432  1e-120  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1317  peptidoglycan-binding LysM  54.23 
 
 		 453 aa  434  1e-120  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0955  peptidoglycan-binding LysM  54.69 
 
 		 453 aa  432  1e-120  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.310452  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1687  lysM domain-containing protein  51.95 
 
 		 454 aa  432  1e-120  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.482886  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0737  LysM domain-containing protein  51.95 
 
 		 448 aa  432  1e-120  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.990238  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1878  peptidoglycan-binding LysM  54.46 
 
 		 446 aa  434  1e-120  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0622625 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2637  LysM domain-containing protein  52.79 
 
 		 454 aa  434  1e-120  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1356  peptidoglycan-binding LysM  53.99 
 
 		 453 aa  435  1e-120  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.53849  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0923  LysM domain-containing protein  51.95 
 
 		 454 aa  432  1e-120  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4581  peptidoglycan-binding LysM  54.93 
 
 		 453 aa  429  1e-119  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0994346  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1842  LysM domain-containing protein  51.72 
 
 		 454 aa  430  1e-119  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1415  peptidoglycan-binding LysM  53.99 
 
 		 453 aa  426  1e-118  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1074  signal peptide protein  32.1 
 
 		 568 aa  142  9.999999999999999e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.107534  normal  0.60277 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0431  peptidoglycan-binding LysM  27.64 
 
 		 543 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000410197  normal  0.723763 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4163  hypothetical protein  30.07 
 
 		 556 aa  132  9e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.868125  normal  0.304031 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4942  peptidoglycan-binding LysM  31.71 
 
 		 558 aa  129  9.000000000000001e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1005  Peptidoglycan-binding LysM  30.51 
 
 		 559 aa  125  1e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0784845  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2915  Peptidoglycan-binding LysM  29.02 
 
 		 566 aa  124  3e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1169  peptidoglycan-binding LysM  30.42 
 
 		 554 aa  124  5e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000824633  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5417  peptidoglycan-binding LysM  30.17 
 
 		 591 aa  122  9.999999999999999e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0940  Peptidoglycan-binding LysM  30.56 
 
 		 559 aa  122  1.9999999999999998e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.147374 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4741  peptidoglycan-binding LysM  30.63 
 
 		 394 aa  117  3.9999999999999997e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2531  peptidoglycan-binding LysM  28.09 
 
 		 548 aa  113  8.000000000000001e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.796598  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1070  hypothetical protein  34.91 
 
 		 335 aa  106  1e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11650  hypothetical protein  35.51 
 
 		 333 aa  104  3e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.220034  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0582  hypothetical protein  27.81 
 
 		 463 aa  103  5e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000319564  normal  0.0200907 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0038  putative periplasmic protein  30.17 
 
 		 290 aa  62.4  0.00000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0958409  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0282  anti-FecI sigma factor, FecR  40.74 
 
 		 1381 aa  62  0.00000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0334  hypothetical protein  32.17 
 
 		 664 aa  61.2  0.00000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0299  anti-FecI sigma factor, FecR  37.4 
 
 		 1334 aa  60.5  0.00000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18170  hypothetical protein  32.26 
 
 		 378 aa  54.7  0.000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000581203  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1219  hypothetical protein  31.09 
 
 		 586 aa  52.4  0.00002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1970  hypothetical protein  29.91 
 
 		 348 aa  52.4  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000904058  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2166  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  37.88 
 
 		 954 aa  51.2  0.00004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.16902  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2196  hypothetical protein  29.14 
 
 		 213 aa  51.2  0.00005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.596477 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0012  hypothetical protein  28.68 
 
 		 717 aa  49.3  0.0001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2621  hypothetical protein  30.07 
 
 		 287 aa  47.8  0.0005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.829749  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0378  hypothetical protein  30 
 
 		 292 aa  47.4  0.0006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1985  hypothetical protein  25.99 
 
 		 924 aa  47  0.0007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.063002  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2717  hypothetical protein  26.86 
 
 		 412 aa  47  0.0008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.920172  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3500  hypothetical protein  29.92 
 
 		 452 aa  45.4  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.496991  normal  0.934019 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1523  hypothetical protein  26.45 
 
 		 412 aa  45.1  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.03932e-19 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2701  FecR protein  27.1 
 
 		 1237 aa  43.5  0.008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0375839  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2370  TPR repeat-containing protein  27.1 
 
 		 1272 aa  43.5  0.01  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0364694 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5894  anti-FecI sigma factor, FecR  35.65 
 
 		 353 aa  43.5  0.01  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>