284 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_4838 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010676  Bphyt_4838  phenylalanine/histidine ammonia-lyase  100 
 
 		 549 aa  1078    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.132188 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1825  histidine ammonia-lyase  94.54 
 
 		 549 aa  981    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.26483 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5104  phenylalanine/histidine ammonia-lyase  86.48 
 
 		 534 aa  835    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.135455  normal  0.0115263 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5747  phenylalanine/histidine ammonia-lyase  76.06 
 
 		 497 aa  718    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5836  phenylalanine/histidine ammonia-lyase  77.62 
 
 		 497 aa  716    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6593  phenylalanine/histidine ammonia-lyase  76.26 
 
 		 497 aa  720    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.783722  normal  0.178286 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5619  phenylalanine/histidine ammonia-lyase  76.26 
 
 		 497 aa  726    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.75216  normal  0.2633 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6111  phenylalanine/histidine ammonia-lyase  76.06 
 
 		 497 aa  718    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6911  phenylalanine/histidine ammonia-lyase  59.26 
 
 		 495 aa  546  1e-154  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5918  phenylalanine/histidine ammonia-lyase  57.99 
 
 		 497 aa  542  1e-153  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.18522 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2586  histidine ammonia-lyase  61.4 
 
 		 504 aa  541  9.999999999999999e-153  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.206795  normal  0.158772 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0506  histidine ammonia-lyase  56.79 
 
 		 495 aa  510  1e-143  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5274  histidine ammonia-lyase  50.81 
 
 		 513 aa  460  9.999999999999999e-129  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4832  histidine ammonia-lyase  51.13 
 
 		 513 aa  455  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1260  histidine ammonia-lyase  50.78 
 
 		 523 aa  450  1e-125  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5827  putative histidine/phenylalanine ammonia-lyase  51.72 
 
 		 510 aa  449  1e-125  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0365  histidine ammonia-lyase  50.82 
 
 		 507 aa  442  1e-123  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.851279 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2648  histidine ammonia-lyase  51.21 
 
 		 500 aa  440  9.999999999999999e-123  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.186623  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67260  putative histidine/phenylalanine ammonia-lyase  52.16 
 
 		 510 aa  434  1e-120  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0799  histidine ammonia-lyase  49.8 
 
 		 507 aa  425  1e-117  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.873754 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2820  histidine ammonia-lyase  41.1 
 
 		 507 aa  354  2.9999999999999997e-96  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2170  histidine ammonia-lyase  40.68 
 
 		 508 aa  340  2.9999999999999998e-92  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0588  histidine ammonia-lyase  41.43 
 
 		 507 aa  340  5.9999999999999996e-92  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2378  histidine ammonia-lyase  43.76 
 
 		 509 aa  334  2e-90  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.43897  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0239  histidine ammonia-lyase  39.56 
 
 		 516 aa  322  9.999999999999999e-87  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0486483  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1637  histidine ammonia-lyase  43.51 
 
 		 506 aa  318  2e-85  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.798951 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0576  histidine ammonia-lyase  45.96 
 
 		 509 aa  313  3.9999999999999997e-84  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.00000203792  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0719  histidine ammonia-lyase  41.45 
 
 		 498 aa  306  8.000000000000001e-82  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.281657  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0916  histidine ammonia-lyase  40.8 
 
 		 511 aa  305  1.0000000000000001e-81  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2312  histidine ammonia-lyase  38.86 
 
 		 505 aa  303  4.0000000000000003e-81  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.01107  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3339  histidine ammonia-lyase  38.2 
 
 		 505 aa  300  5e-80  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000343122  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0281  histidine ammonia-lyase  38.83 
 
 		 508 aa  298  2e-79  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3405  histidine ammonia-lyase  37.55 
 
 		 505 aa  296  5e-79  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000956551  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3685  histidine ammonia-lyase  37.55 
 
 		 505 aa  296  6e-79  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000336671  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1556  histidine ammonia-lyase  37.77 
 
 		 505 aa  296  7e-79  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000269736  normal  0.0117376 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2730  histidine ammonia-lyase  43.49 
 
 		 499 aa  296  7e-79  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3760  histidine ammonia-lyase  37.55 
 
 		 506 aa  296  7e-79  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00715091  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2331  histidine ammonia-lyase  41.86 
 
 		 506 aa  296  9e-79  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.962359 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3680  histidine ammonia-lyase  37.55 
 
 		 505 aa  295  1e-78  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0108236  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3662  histidine ammonia-lyase  37.55 
 
 		 505 aa  295  1e-78  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3442  histidine ammonia-lyase  37.34 
 
 		 505 aa  295  2e-78  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0533045  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3712  histidine ammonia-lyase  37.34 
 
 		 505 aa  295  2e-78  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000019442  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3354  histidine ammonia-lyase  37.55 
 
 		 505 aa  294  4e-78  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.172835  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2100  histidine ammonia-lyase  42.59 
 
 		 514 aa  293  4e-78  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0193312  normal  0.149962 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6152  Histidine ammonia-lyase  42.28 
 
 		 515 aa  293  6e-78  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00526934 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2116  histidine ammonia-lyase  43.34 
 
 		 508 aa  293  8e-78  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00707629  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0008  histidine ammonia-lyase  36.62 
 
 		 504 aa  291  2e-77  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0008  histidine ammonia-lyase  36.62 
 
 		 504 aa  291  2e-77  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3094  histidine ammonia-lyase  40.85 
 
 		 513 aa  291  3e-77  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1658  histidine ammonia-lyase  40 
 
 		 526 aa  289  9e-77  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.180825  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1043  histidine ammonia-lyase  40.98 
 
 		 514 aa  288  1e-76  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.693412  normal  0.100833 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2046  histidine ammonia-lyase  43.16 
 
 		 508 aa  288  2e-76  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.034077  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1814  histidine ammonia-lyase  43.19 
 
 		 508 aa  288  2e-76  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3903  histidine ammonia-lyase  40.89 
 
 		 520 aa  286  5e-76  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.23664  normal  0.18215 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0908  histidine ammonia-lyase  41.16 
 
 		 497 aa  283  4.0000000000000003e-75  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3837  histidine ammonia-lyase  40.04 
 
 		 536 aa  283  7.000000000000001e-75  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.783362  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4837  histidine ammonia-lyase  38.43 
 
 		 510 aa  281  2e-74  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3001  histidine ammonia-lyase  40.28 
 
 		 534 aa  281  2e-74  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.463238  normal  0.112166 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1458  histidine ammonia-lyase  40.53 
 
 		 515 aa  281  3e-74  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0209656  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5482  histidine ammonia-lyase  39 
 
 		 507 aa  278  1e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.211889  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3619  histidine ammonia-lyase  41.65 
 
 		 514 aa  278  2e-73  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.30965  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1265  histidine ammonia-lyase  40.09 
 
 		 504 aa  277  3e-73  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0822  histidine ammonia-lyase  38.88 
 
 		 511 aa  276  5e-73  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000107913  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4446  histidine ammonia-lyase  37.5 
 
 		 510 aa  276  6e-73  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4251  histidine ammonia-lyase  38.48 
 
 		 513 aa  276  6e-73  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0103  histidine ammonia-lyase  38.48 
 
 		 513 aa  276  6e-73  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2646  histidine ammonia-lyase  41 
 
 		 518 aa  274  2.0000000000000002e-72  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0281382  normal  0.523313 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2642  histidine ammonia-lyase  41.22 
 
 		 518 aa  275  2.0000000000000002e-72  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.459699  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0080  histidine ammonia-lyase  38.64 
 
 		 513 aa  275  2.0000000000000002e-72  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0103  histidine ammonia-lyase  38.16 
 
 		 513 aa  274  3e-72  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0084  histidine ammonia-lyase  38.69 
 
 		 510 aa  274  3e-72  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1747  histidine ammonia-lyase  41.12 
 
 		 508 aa  274  3e-72  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000510266  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1264  histidine ammonia-lyase  37.97 
 
 		 506 aa  273  4.0000000000000004e-72  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2576  histidine ammonia-lyase  35.23 
 
 		 523 aa  273  4.0000000000000004e-72  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0098  histidine ammonia-lyase  38.27 
 
 		 513 aa  273  5.000000000000001e-72  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3756  histidine ammonia-lyase  37.7 
 
 		 510 aa  272  1e-71  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0185291 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1410  histidine ammonia-lyase  41.15 
 
 		 516 aa  271  2e-71  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0341381 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4168  histidine ammonia-lyase  37.25 
 
 		 510 aa  271  2.9999999999999997e-71  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0100  histidine ammonia-lyase  37.63 
 
 		 513 aa  270  4e-71  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0095  histidine ammonia-lyase  37.63 
 
 		 513 aa  270  4e-71  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0101  histidine ammonia-lyase  37.63 
 
 		 513 aa  270  4e-71  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1837  histidine ammonia-lyase  42.51 
 
 		 526 aa  270  5e-71  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0180395 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2006  histidine ammonia-lyase  36.86 
 
 		 522 aa  270  5e-71  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.34717  normal  0.214546 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02072  histidine ammonia-lyase  37.81 
 
 		 514 aa  270  5.9999999999999995e-71  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0886  histidine ammonia-lyase  38.62 
 
 		 506 aa  269  8e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0918  histidine ammonia-lyase  38.62 
 
 		 506 aa  269  8e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.19052  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0941  histidine ammonia-lyase  38.62 
 
 		 506 aa  269  8.999999999999999e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.895576 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1098  histidine ammonia-lyase  39.17 
 
 		 506 aa  269  8.999999999999999e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.489486  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2880  histidine ammonia-lyase  40.62 
 
 		 518 aa  269  1e-70  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0855  histidine ammonia-lyase  38.62 
 
 		 506 aa  269  1e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.628758  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5032  histidine ammonia-lyase  38.6 
 
 		 510 aa  268  2e-70  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0098  histidine ammonia-lyase  37.84 
 
 		 513 aa  268  2e-70  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1814  histidine ammonia-lyase  39.83 
 
 		 507 aa  268  2e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.74245  normal  0.102325 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0058  histidine ammonia-lyase  39.18 
 
 		 511 aa  268  2e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4906  histidine ammonia-lyase  38.4 
 
 		 510 aa  267  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.685103  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5831  histidine ammonia-lyase  40.67 
 
 		 524 aa  267  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5082  histidine ammonia-lyase  38.4 
 
 		 510 aa  267  4e-70  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.150624  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0432  histidine ammonia-lyase  37.73 
 
 		 510 aa  267  4e-70  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.44898  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1297  histidine ammonia-lyase  38.22 
 
 		 511 aa  266  5e-70  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0927091 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2189  histidine ammonia-lyase  39.21 
 
 		 507 aa  266  5e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0881955  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>