More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_2220 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010681  Bphyt_2220  Chromate transporter  100 
 
 		 190 aa  370  1e-102  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2051  chromate efflux pump  90 
 
 		 190 aa  336  9.999999999999999e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.159095  normal  0.149204 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6229  Chromate transporter  44.44 
 
 		 214 aa  115  3e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2453  chromate transporter  43.17 
 
 		 202 aa  111  5e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0902  chromate transporter  40.94 
 
 		 203 aa  111  8.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.913951 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0461  chromate transporter  40.94 
 
 		 203 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0940  chromate transporter  40.94 
 
 		 203 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4042  chromate transporter  40.35 
 
 		 203 aa  108  6e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.522407  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0903  Chromate transporter  37.2 
 
 		 192 aa  107  8.000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0253551  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4012  Chromate transporter  40.26 
 
 		 198 aa  105  3e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0832  Chromate transporter  36.59 
 
 		 192 aa  105  3e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.974224 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2355  chromate transporter  36.63 
 
 		 185 aa  105  5e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3737  Chromate transporter  36.46 
 
 		 197 aa  104  7e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0979  hypothetical protein  37.28 
 
 		 193 aa  104  8e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0709181 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4022  chromate transporter  35.14 
 
 		 203 aa  102  4e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.100233 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6104  putative chromate transport protein  34.08 
 
 		 198 aa  100  1e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0480  chromate transporter  31.98 
 
 		 178 aa  95.5  4e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.461938  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2518  chromate transporter  37.87 
 
 		 193 aa  95.5  4e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.266281  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4177  chromate transporter  29.61 
 
 		 208 aa  93.2  2e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.639548  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0282  chromate transporter  36.79 
 
 		 199 aa  92.4  3e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0294  chromate transporter  36.79 
 
 		 199 aa  92.4  3e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3386  chromate transporter  36.77 
 
 		 187 aa  91.3  9e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0166  chromate transporter  31.41 
 
 		 187 aa  90.5  1e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2085  chromate transport protein  35.75 
 
 		 199 aa  90.1  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.581224  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0254  chromate transport protein, putative  36.76 
 
 		 199 aa  90.1  2e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.744133  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3609  chromate transporter  38.22 
 
 		 185 aa  90.1  2e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3340  chromate transporter  35.75 
 
 		 199 aa  90.1  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3056  chromate transporter  35.26 
 
 		 204 aa  89.7  2e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3008  chromate transport protein ChrA  35.75 
 
 		 199 aa  90.1  2e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0479  chromate transporter  37.06 
 
 		 185 aa  88.6  5e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2921  chromate transporter  34.74 
 
 		 204 aa  87.8  9e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.501142 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1744  chromate transport protein  33.85 
 
 		 195 aa  85.9  3e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1522  chromate transporter  36.36 
 
 		 188 aa  86.3  3e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.189226  normal  0.0899131 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2204  CHR transporter  34.43 
 
 		 196 aa  86.3  3e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.577966 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2308  chromate transporter  32.96 
 
 		 191 aa  85.1  6e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.987746  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04080  Chromate transporter  27.54 
 
 		 199 aa  84.7  7e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1615  Chromate transporter  38.59 
 
 		 202 aa  84.7  7e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2259  chromate transporter  37.37 
 
 		 202 aa  84.3  9e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.793655  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6791  Chromate transporter  35.43 
 
 		 189 aa  84  0.000000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0341176  hitchhiker  0.00000131878 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3481  Chromate transporter  39.2 
 
 		 188 aa  83.2  0.000000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00575906  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0714  Chromate transporter  32.97 
 
 		 185 aa  83.2  0.000000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.690294  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3014  chromate transporter  33.15 
 
 		 198 aa  82.4  0.000000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.642179 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2397  chromate transporter  37.29 
 
 		 226 aa  82  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.356356  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3011  chromate transporter  37.29 
 
 		 226 aa  82  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5139  chromate transporter  29.83 
 
 		 394 aa  81.6  0.000000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.396318  normal  0.758776 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1601  chromate transporter  32.94 
 
 		 443 aa  81.6  0.000000000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.646731  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2826  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  33.83 
 
 		 382 aa  81.6  0.000000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0842  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  32.58 
 
 		 395 aa  81.3  0.000000000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.530668  normal  0.664708 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3030  chromate transporter  36.93 
 
 		 226 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2836  chromate transporter  33.9 
 
 		 189 aa  79.3  0.00000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0231  Chromate transporter  31.54 
 
 		 172 aa  79.3  0.00000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00100976  normal  0.689221 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0435  Chromate transporter  31.33 
 
 		 209 aa  79.7  0.00000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2447  chromate transporter  28.99 
 
 		 397 aa  79  0.00000000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3006  chromate transporter  35.8 
 
 		 208 aa  78.6  0.00000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2361  chromate transporter  26.32 
 
 		 179 aa  78.6  0.00000000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5590  chromate transporter  34.59 
 
 		 390 aa  78.2  0.00000000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5954  chromate transporter  34.59 
 
 		 390 aa  78.2  0.00000000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0766957 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2756  chromate transporter  32.8 
 
 		 199 aa  77.8  0.00000000000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0192  Chromate transporter  26.86 
 
 		 176 aa  77.4  0.0000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1449  chromate transporter  33.95 
 
 		 428 aa  77.4  0.0000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.474038 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3865  chromate transporter  35.88 
 
 		 390 aa  76.6  0.0000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6455  chromate transporter  33.83 
 
 		 390 aa  76.3  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6357  chromate transporter  34.46 
 
 		 212 aa  76.3  0.0000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.37637  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2360  chromate transporter  31.52 
 
 		 172 aa  75.1  0.0000000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3060  chromate transporter  33.33 
 
 		 449 aa  75.1  0.0000000000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.904181  normal  1 
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2622  chromate transporter  32.06 
 
 		 393 aa  74.7  0.0000000000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1226  chromate transporter  30.53 
 
 		 418 aa  74.7  0.0000000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.904057 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1742  chromate transporter  33.33 
 
 		 213 aa  74.7  0.0000000000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4416  chromate transporter  33.33 
 
 		 202 aa  74.7  0.0000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.925487  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3378  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  32.26 
 
 		 392 aa  74.7  0.0000000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1904  chromate transporter  29.94 
 
 		 203 aa  74.3  0.0000000000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.226148  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3251  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  33.73 
 
 		 390 aa  74.3  0.0000000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2732  chromate transporter  30.56 
 
 		 184 aa  73.9  0.000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2503  chromate transporter  30.83 
 
 		 399 aa  73.9  0.000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.124594 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2556  chromate transporter  28.19 
 
 		 450 aa  73.2  0.000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0100116 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0084  chromate ion transporter protein ChrA  32.48 
 
 		 396 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0285  chromate transporter  28.57 
 
 		 446 aa  73.2  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1212  chromate transport protein  32.48 
 
 		 188 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0381  chromate transport protein  30.82 
 
 		 199 aa  73.2  0.000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1495  chromate transport protein  32.48 
 
 		 188 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3198  chromate transporter  25.99 
 
 		 392 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3574  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  33.14 
 
 		 390 aa  73.6  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.851055 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2143  Chromate transporter  30.43 
 
 		 200 aa  73.6  0.000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000134101  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2215  chromate transport protein  25.82 
 
 		 183 aa  73.6  0.000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.356625  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1521  chromate transporter  27.22 
 
 		 401 aa  72.8  0.000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.404287  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1563  chromate resistance transport protein  32.48 
 
 		 396 aa  72.8  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0103  Chromate transporter  30.94 
 
 		 179 aa  72.8  0.000000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000375668  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0073  chromate resistance transport protein  32.48 
 
 		 396 aa  72.4  0.000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0067  chromate ion transporter protein ChrA  32.48 
 
 		 396 aa  72.8  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2155  chromate transporter, permease component  26.71 
 
 		 385 aa  72  0.000000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5053  chromate transporter  27.22 
 
 		 392 aa  71.6  0.000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.568452  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0555  chromate transporter  31.47 
 
 		 401 aa  71.6  0.000000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0311274 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6202  chromate transporter  26.04 
 
 		 401 aa  71.6  0.000000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0320947 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2215  Chromate transporter  31.72 
 
 		 196 aa  71.2  0.000000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.735807  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0727  Chromate transporter  35.59 
 
 		 185 aa  70.5  0.00000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000305738 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1914  chromate transporter  36.94 
 
 		 361 aa  70.9  0.00000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.448688  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1494  chromate transport protein  32.67 
 
 		 187 aa  70.5  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1211  chromate transport protein  32.67 
 
 		 187 aa  70.5  0.00000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3159  chromate transporter  28.18 
 
 		 450 aa  70.9  0.00000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.896141  normal  0.125861 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1002  chromate transporter  31.54 
 
 		 171 aa  70.9  0.00000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.815212  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>