More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_0907 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010681  Bphyt_0907  glycosyl transferase family 9  100 
 
 
382 aa  782    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3715  hypothetical protein  80.84 
 
 
382 aa  621  1e-177  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1574  glycosyl transferase family 9  33.16 
 
 
379 aa  200  3.9999999999999996e-50  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1756  glycosyl transferase family 9  30.95 
 
 
386 aa  189  5.999999999999999e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0677074  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2100  glycosyl transferase family protein  30.8 
 
 
361 aa  125  1e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0507  glycosyl transferase family protein  27 
 
 
406 aa  112  8.000000000000001e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1955  glycosyl transferase family 9  28.12 
 
 
354 aa  107  2e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1989  glycosyl transferase family 9  28.66 
 
 
357 aa  101  2e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1410  glycosyl transferase family protein  26.18 
 
 
367 aa  96.3  8e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.242936  normal  0.398938 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2231  glycosyl transferase family 9  27.97 
 
 
371 aa  95.1  2e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00858313 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0183  glycosyl transferase  26.49 
 
 
356 aa  89.4  9e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.151268  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0240  lipopolysaccharide core biosynthesis glycosyl transferase protein  26.49 
 
 
373 aa  89.4  9e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.394656  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0585  glycosyl transferase family protein  26.13 
 
 
406 aa  87.4  4e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1766  glycosyl transferase family protein  28.18 
 
 
318 aa  86.7  6e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.791628  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4832  lipopolysaccharide heptosyltransferase III, putative  25.83 
 
 
360 aa  86.7  7e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.329757  hitchhiker  0.0000441962 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1514  heptosyltransferase family protein  26.65 
 
 
363 aa  85.5  0.000000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0458019  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0375  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  29.38 
 
 
362 aa  85.5  0.000000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.66681 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5444  glycosyl transferase family protein  25.16 
 
 
358 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00929201 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1695  glycosyl transferase family protein  26.86 
 
 
336 aa  81.3  0.00000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2642  family 9 glycosyl transferase  37.07 
 
 
343 aa  80.9  0.00000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1699  glycosyl transferase family protein  23.91 
 
 
392 aa  80.5  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2311  glycosyl transferase family protein  23.91 
 
 
392 aa  80.5  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0849  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  25.67 
 
 
360 aa  80.9  0.00000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.539129  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0965  lipopolysaccharide heptosyltransferase III  24.92 
 
 
392 aa  79.7  0.00000000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.199318  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2334  glycosyl transferase family protein  23.57 
 
 
392 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0453286 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1567  glycosyl transferase family 9  28.88 
 
 
358 aa  79.3  0.0000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.029243 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5653  glycosyl transferase family protein  23.59 
 
 
404 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.680336  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1907  lipopolysaccharide core biosynthesis heptosyltransferase  33.05 
 
 
390 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0894  putative glycosyltransferase  30.91 
 
 
334 aa  78.6  0.0000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.619626  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1363  lipopolysaccharide core biosynthesis heptosyltransferase  33.05 
 
 
394 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.824879  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0818  lipopolysaccharide core biosynthesis heptosyltransferase  33.05 
 
 
390 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0333  lipopolysaccharide core biosynthesis heptosyltransferase  33.05 
 
 
390 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.801367  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1050  lipopolysaccharide core biosynthesis heptosyltransferase  33.05 
 
 
390 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.702156  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1212  putative lipopolysaccharide heptosyltransferase III  33.05 
 
 
390 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.677062  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0521  glycosyl transferase family protein  28.82 
 
 
354 aa  77.8  0.0000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1203  putative lipopolysaccharide heptosyltransferase III  33.05 
 
 
390 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0990  lipopolysaccharide core biosynthesis heptosyltransferase  33.33 
 
 
458 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17200  glycosyl transferase family 9  22.07 
 
 
360 aa  77.8  0.0000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2637  family 9 glycosyl transferase  25.95 
 
 
330 aa  77.4  0.0000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2461  ADP-heptose:LPS heptosyltransferase-like protein  32.12 
 
 
410 aa  76.6  0.0000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.171427  normal  0.165566 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0950  glycosyl transferase family 9  25 
 
 
340 aa  76.6  0.0000000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.74322  normal  0.160962 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2350  glycosyl transferase family protein  23.92 
 
 
475 aa  76.6  0.0000000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2230  glycosyl transferase family protein  23.92 
 
 
402 aa  76.6  0.0000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.408101  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5002  lipopolysaccharide heptosyltransferase  31.11 
 
 
354 aa  76.3  0.0000000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3479  glycosyl transferase family 9  25.34 
 
 
342 aa  75.9  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0329  glycosyl transferase family protein  21.66 
 
 
348 aa  75.9  0.000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0170  lipopolysaccharide heptosyltransferase III  22.62 
 
 
361 aa  75.1  0.000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.792363  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3949  lipopolysaccharide heptosyltransferase III  21.61 
 
 
361 aa  74.7  0.000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4827  ADP-heptose:LPS heptosyl transferase I  29.86 
 
 
323 aa  74.3  0.000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.155818  hitchhiker  0.000206401 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3226  glycosyl transferase family protein  24.49 
 
 
364 aa  74.7  0.000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0860  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  26.82 
 
 
339 aa  73.9  0.000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0715  glycosyl transferase family protein  25.44 
 
 
344 aa  73.6  0.000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0294212  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0084  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  35.88 
 
 
319 aa  73.6  0.000000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00990907  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0152  lipopolysaccharide heptosyltransferase III, putative  23.23 
 
 
367 aa  73.2  0.000000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3411  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  24.42 
 
 
368 aa  73.6  0.000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4383  glycosyl transferase family protein  34.71 
 
 
390 aa  72.8  0.000000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.764481  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2341  glycosyl transferase family protein  25.85 
 
 
390 aa  72.8  0.000000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4861  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  28.51 
 
 
352 aa  72.8  0.000000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.36371 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1248  glycosyl transferase family 9  28.14 
 
 
385 aa  72.4  0.00000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.9727 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1752  glycosyl transferase family protein  26.74 
 
 
317 aa  72  0.00000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.479662  normal  0.027192 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5245  glycosyl transferase family protein  31.93 
 
 
379 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0245525 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0714  O-antigen polymerase  24.92 
 
 
781 aa  72.8  0.00000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00459  lipopolysaccharide heptosyltransferase-1, putative  33.56 
 
 
359 aa  72.8  0.00000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0088  ADP-heptose:LPS heptosyl transferase I  40.62 
 
 
323 aa  71.6  0.00000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0341266  normal  0.158006 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4124  ADP-heptose:LPS heptosyl transferase I  38.39 
 
 
323 aa  72  0.00000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.815004  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18880  lipopolysaccharide heptosyltransferase III, putative  23.81 
 
 
348 aa  71.6  0.00000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0347069  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3958  ADP-heptose:LPS heptosyl transferase I  40.62 
 
 
323 aa  71.6  0.00000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0259947  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3832  ADP-heptose:LPS heptosyl transferase I  40.62 
 
 
323 aa  71.6  0.00000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000019224  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5746  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  35.14 
 
 
355 aa  71.6  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.887327  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4994  ADP-heptose:LPS heptosyl transferase I  38.39 
 
 
330 aa  71.6  0.00000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.041745  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2622  hypothetical protein  25.36 
 
 
349 aa  70.9  0.00000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0370  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  28.05 
 
 
352 aa  70.9  0.00000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.381359 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0785  glycosyl transferase family protein  24.49 
 
 
347 aa  71.2  0.00000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0710  glycosyl transferase family protein  35.29 
 
 
339 aa  70.5  0.00000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0566635  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0372  glycosyl transferase family protein  22.65 
 
 
369 aa  70.9  0.00000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4091  lipopolysaccharide heptosyltransferase III  25 
 
 
361 aa  70.1  0.00000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1775  lipopolysaccharide heptosyltransferase III, putative  26.56 
 
 
389 aa  70.5  0.00000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0175609  normal  0.113724 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2749  hypothetical protein  25.36 
 
 
349 aa  70.1  0.00000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66240  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  34.55 
 
 
354 aa  70.1  0.00000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0342  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  26.51 
 
 
352 aa  70.1  0.00000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.826178 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1910  heptosyltransferase family protein  34.86 
 
 
381 aa  69.7  0.00000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1360  heptosyltransferase family protein  34.86 
 
 
381 aa  69.7  0.00000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0552  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  22.07 
 
 
516 aa  70.1  0.00000000007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0367  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  26.51 
 
 
352 aa  70.1  0.00000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1209  heptosyltransferase  34.86 
 
 
381 aa  69.7  0.00000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0821  heptosyltransferase family protein  34.86 
 
 
359 aa  69.7  0.00000000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1482  heptosyltransferase family protein  22.68 
 
 
344 aa  69.7  0.00000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000479014  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4090  ADP-heptose:LPS heptosyl transferase I  27.49 
 
 
320 aa  69.7  0.00000000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0330  heptosyltransferase family protein  34.86 
 
 
359 aa  69.7  0.00000000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.638826  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3930  ADP-heptose:LPS heptosyl transferase I  31.85 
 
 
317 aa  69.7  0.00000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44850  lipopolysaccharide heptosyltransferase I, waaC  33.6 
 
 
354 aa  69.7  0.00000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.721697  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0580  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  32.12 
 
 
334 aa  69.7  0.00000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0447499 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1047  heptosyltransferase family protein  34.86 
 
 
359 aa  69.7  0.00000000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0607  glycosyl transferase family protein  28.57 
 
 
386 aa  69.3  0.00000000009  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1200  heptosyltransferase  34.86 
 
 
359 aa  69.7  0.00000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0062  ADP-heptose:LPS heptosyl transferase I  28.91 
 
 
321 aa  69.3  0.0000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0223597  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4148  ADP-heptose:LPS heptosyl transferase I  28.91 
 
 
321 aa  69.3  0.0000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4037  ADP-heptose:LPS heptosyl transferase I  31.85 
 
 
317 aa  69.3  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3611  glycosyl transferase family protein  24.31 
 
 
348 aa  69.3  0.0000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0068  ADP-heptose:LPS heptosyl transferase I  28.91 
 
 
321 aa  69.3  0.0000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0575052  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>